Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5HXJ1

Protein Details
Accession V5HXJ1    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-106VDGFQFTRPTKPKKAKASVTETIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-121KRGRP
184-193PRRKRGKPSK
226-250RNKEMRTDKAKKGQRRSSLGMRGRR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013218  Dsn1/Mis13  
Gene Ontology GO:0000444  C:MIS12/MIND type complex  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08202  MIS13  
Amino Acid Sequences MSTTVITTSSTKLTRREPLRAIDMATSQAQTRPASSSAQDTGKGKRARGAAKTREDAAAVNTSANGRSGRAMENKRKADYDEDVDGFQFTRPTKPKKAKASVTETIEEEPAQQRSPKRGRPAKSRTEAITNGVTEGTTKVNGTSNGRGRRRSSRIPSAEPDRVSEEPSRPTRKFDDIDSLPAEPRRKRGKPSKSGTTNNAFMSPEPSQPGTSKIALPAADTPVIRRNKEMRTDKAKKGQRRSSLGMRGRRASSLIDSGASNGGKTPLEERGYPGIERNTDTLLAALPHKEVNAADFYKHIASDLPEPRRMRQLLTWCATRAMGDKPSGSRSDDESARLAARVIQEELLEDFANVSELSDWFDRQETEPPAVVVKKPNPKNIQNAEKIKELEEQIQRLQNERHSLNALSRTPSIPPTKSLQPERQTERSRGKSDSQSLETQDIDASLLDPSQRDLIAILNPAPQQTGTNRRRTQKSPADILSNTTISAVSSRLSQVTSSLAPTLDSFAAGVHDIELYRSTADKVSSQVLRICAERLEERDMQNSLERLEIEGDADEAEEKARVRIRREKPTDVSLVLGALSRLEKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.51
3 0.57
4 0.57
5 0.59
6 0.61
7 0.58
8 0.53
9 0.46
10 0.41
11 0.36
12 0.32
13 0.26
14 0.21
15 0.21
16 0.23
17 0.21
18 0.21
19 0.22
20 0.22
21 0.24
22 0.25
23 0.27
24 0.29
25 0.3
26 0.33
27 0.32
28 0.36
29 0.42
30 0.44
31 0.4
32 0.41
33 0.46
34 0.49
35 0.56
36 0.6
37 0.6
38 0.65
39 0.67
40 0.64
41 0.58
42 0.51
43 0.42
44 0.36
45 0.31
46 0.23
47 0.19
48 0.18
49 0.18
50 0.17
51 0.19
52 0.16
53 0.12
54 0.14
55 0.16
56 0.21
57 0.3
58 0.39
59 0.47
60 0.56
61 0.6
62 0.61
63 0.6
64 0.57
65 0.54
66 0.5
67 0.45
68 0.41
69 0.37
70 0.34
71 0.32
72 0.3
73 0.25
74 0.2
75 0.19
76 0.14
77 0.22
78 0.3
79 0.37
80 0.47
81 0.57
82 0.66
83 0.72
84 0.81
85 0.81
86 0.81
87 0.82
88 0.79
89 0.73
90 0.66
91 0.57
92 0.49
93 0.41
94 0.32
95 0.26
96 0.22
97 0.19
98 0.19
99 0.22
100 0.24
101 0.34
102 0.43
103 0.47
104 0.54
105 0.61
106 0.67
107 0.74
108 0.8
109 0.8
110 0.78
111 0.76
112 0.68
113 0.66
114 0.59
115 0.52
116 0.46
117 0.36
118 0.3
119 0.25
120 0.21
121 0.15
122 0.15
123 0.13
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.16
129 0.2
130 0.26
131 0.33
132 0.42
133 0.47
134 0.5
135 0.53
136 0.6
137 0.63
138 0.65
139 0.65
140 0.66
141 0.68
142 0.69
143 0.7
144 0.68
145 0.66
146 0.57
147 0.5
148 0.45
149 0.39
150 0.37
151 0.34
152 0.3
153 0.31
154 0.38
155 0.44
156 0.4
157 0.44
158 0.45
159 0.48
160 0.46
161 0.42
162 0.43
163 0.36
164 0.4
165 0.37
166 0.33
167 0.29
168 0.31
169 0.34
170 0.27
171 0.34
172 0.4
173 0.42
174 0.51
175 0.6
176 0.66
177 0.71
178 0.77
179 0.79
180 0.78
181 0.79
182 0.75
183 0.7
184 0.63
185 0.54
186 0.48
187 0.37
188 0.29
189 0.29
190 0.24
191 0.2
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.22
197 0.2
198 0.19
199 0.18
200 0.17
201 0.19
202 0.17
203 0.18
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.15
209 0.2
210 0.24
211 0.24
212 0.26
213 0.3
214 0.33
215 0.43
216 0.48
217 0.49
218 0.55
219 0.63
220 0.65
221 0.69
222 0.71
223 0.69
224 0.73
225 0.73
226 0.7
227 0.69
228 0.68
229 0.67
230 0.69
231 0.68
232 0.65
233 0.6
234 0.56
235 0.5
236 0.45
237 0.38
238 0.3
239 0.24
240 0.19
241 0.16
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.1
248 0.08
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.12
254 0.14
255 0.14
256 0.17
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.14
266 0.13
267 0.13
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.08
289 0.15
290 0.21
291 0.24
292 0.29
293 0.3
294 0.31
295 0.37
296 0.36
297 0.31
298 0.29
299 0.34
300 0.35
301 0.37
302 0.37
303 0.31
304 0.31
305 0.29
306 0.25
307 0.19
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.15
312 0.16
313 0.19
314 0.19
315 0.19
316 0.17
317 0.18
318 0.21
319 0.21
320 0.21
321 0.19
322 0.19
323 0.18
324 0.17
325 0.13
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.17
352 0.17
353 0.18
354 0.19
355 0.18
356 0.2
357 0.2
358 0.2
359 0.2
360 0.25
361 0.33
362 0.37
363 0.46
364 0.51
365 0.54
366 0.62
367 0.65
368 0.66
369 0.65
370 0.67
371 0.61
372 0.58
373 0.54
374 0.46
375 0.42
376 0.35
377 0.33
378 0.31
379 0.3
380 0.29
381 0.33
382 0.31
383 0.31
384 0.32
385 0.29
386 0.31
387 0.29
388 0.28
389 0.26
390 0.27
391 0.27
392 0.31
393 0.28
394 0.25
395 0.26
396 0.25
397 0.24
398 0.29
399 0.3
400 0.25
401 0.27
402 0.29
403 0.34
404 0.4
405 0.46
406 0.49
407 0.5
408 0.57
409 0.61
410 0.66
411 0.63
412 0.64
413 0.67
414 0.66
415 0.63
416 0.59
417 0.58
418 0.56
419 0.59
420 0.57
421 0.52
422 0.47
423 0.45
424 0.44
425 0.38
426 0.3
427 0.23
428 0.17
429 0.13
430 0.1
431 0.08
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.1
442 0.11
443 0.13
444 0.13
445 0.15
446 0.16
447 0.16
448 0.16
449 0.14
450 0.15
451 0.19
452 0.29
453 0.33
454 0.43
455 0.49
456 0.57
457 0.63
458 0.66
459 0.7
460 0.69
461 0.7
462 0.67
463 0.64
464 0.61
465 0.55
466 0.54
467 0.48
468 0.38
469 0.3
470 0.23
471 0.2
472 0.14
473 0.14
474 0.11
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.14
483 0.15
484 0.15
485 0.15
486 0.13
487 0.13
488 0.14
489 0.16
490 0.12
491 0.11
492 0.1
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.09
497 0.07
498 0.08
499 0.07
500 0.08
501 0.1
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.12
506 0.13
507 0.15
508 0.16
509 0.17
510 0.23
511 0.24
512 0.26
513 0.28
514 0.28
515 0.29
516 0.28
517 0.27
518 0.22
519 0.25
520 0.26
521 0.26
522 0.29
523 0.32
524 0.33
525 0.36
526 0.36
527 0.34
528 0.34
529 0.32
530 0.27
531 0.24
532 0.22
533 0.19
534 0.2
535 0.18
536 0.15
537 0.13
538 0.13
539 0.1
540 0.1
541 0.09
542 0.07
543 0.08
544 0.09
545 0.09
546 0.14
547 0.2
548 0.25
549 0.32
550 0.42
551 0.51
552 0.6
553 0.68
554 0.72
555 0.72
556 0.74
557 0.72
558 0.62
559 0.55
560 0.44
561 0.37
562 0.28
563 0.23
564 0.15
565 0.12