Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2ARF3

Protein Details
Accession B2ARF3    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-65TEFTKARKAKGLKKAKGKATDSHydrophilic
307-331SDSDDKSKTKTKKSTKTKANSDTSAHydrophilic
413-441LIVTRGKGFTKEKNKKKKGSYRGGRIDTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-61KARKAKGLKKAKGK
419-434KGFTKEKNKKKKGSYR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG pan:PODANSg3093  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKDKKVKADKVTKSTPAATQLPAQLLDLVEKFLSEHDFTEAHTEFTKARKAKGLKKAKGKATDSTLESVFQAWETSKAKASSDDDSSSSNESDSSSSSDSDSDSDSDSESDSDDVEMADAPADSESSDSSSSSESSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSDSSDSESESESEEEKKPAASNPLKRKATSESSDSSSEDSSGSDSEKEKPAAKKQKTATAKAESSSSESSSDSSSDSSSSSDSSSSDSSSDSDSSSSDSSSDSDSSDSDSSDSDSSDSEDVAEEAAKVPLPDSSDDSSSDSSSDSDSDSDSDDKSKTKTKKSTKTKANSDTSASGSSNSSATLNGSTSPKVFPVSTFAPLPPDPFVKTNNRGKGASVKEEKVPFSRVNRNIKVDPKFADNSFAGEDWGRKAHEDLIVTRGKGFTKEKNKKKKGSYRGGRIDTGLQLGIKFDDDGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.66
3 0.6
4 0.56
5 0.5
6 0.43
7 0.4
8 0.38
9 0.35
10 0.32
11 0.29
12 0.24
13 0.21
14 0.22
15 0.18
16 0.16
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.16
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.23
28 0.22
29 0.2
30 0.19
31 0.2
32 0.19
33 0.24
34 0.32
35 0.28
36 0.31
37 0.38
38 0.46
39 0.54
40 0.62
41 0.69
42 0.68
43 0.77
44 0.82
45 0.82
46 0.83
47 0.77
48 0.73
49 0.68
50 0.66
51 0.58
52 0.52
53 0.44
54 0.35
55 0.32
56 0.26
57 0.2
58 0.14
59 0.12
60 0.1
61 0.15
62 0.17
63 0.18
64 0.22
65 0.23
66 0.23
67 0.27
68 0.3
69 0.27
70 0.3
71 0.3
72 0.26
73 0.27
74 0.28
75 0.26
76 0.23
77 0.19
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.15
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.1
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.12
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.23
165 0.27
166 0.35
167 0.44
168 0.54
169 0.55
170 0.54
171 0.55
172 0.52
173 0.51
174 0.45
175 0.39
176 0.32
177 0.34
178 0.35
179 0.32
180 0.28
181 0.21
182 0.18
183 0.14
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.1
190 0.12
191 0.15
192 0.17
193 0.21
194 0.25
195 0.34
196 0.42
197 0.44
198 0.49
199 0.48
200 0.55
201 0.56
202 0.57
203 0.53
204 0.49
205 0.47
206 0.4
207 0.39
208 0.3
209 0.29
210 0.24
211 0.19
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.1
257 0.11
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.08
276 0.09
277 0.12
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.18
282 0.18
283 0.16
284 0.16
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.17
300 0.25
301 0.3
302 0.38
303 0.48
304 0.56
305 0.66
306 0.75
307 0.82
308 0.84
309 0.87
310 0.87
311 0.86
312 0.82
313 0.74
314 0.67
315 0.6
316 0.52
317 0.45
318 0.35
319 0.27
320 0.21
321 0.19
322 0.15
323 0.13
324 0.11
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.11
330 0.13
331 0.13
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.16
337 0.14
338 0.18
339 0.2
340 0.21
341 0.22
342 0.21
343 0.24
344 0.24
345 0.26
346 0.22
347 0.22
348 0.22
349 0.23
350 0.28
351 0.31
352 0.39
353 0.47
354 0.52
355 0.53
356 0.51
357 0.51
358 0.55
359 0.52
360 0.53
361 0.5
362 0.45
363 0.47
364 0.5
365 0.51
366 0.45
367 0.44
368 0.4
369 0.41
370 0.49
371 0.51
372 0.58
373 0.62
374 0.65
375 0.67
376 0.7
377 0.69
378 0.64
379 0.58
380 0.53
381 0.51
382 0.45
383 0.44
384 0.35
385 0.32
386 0.29
387 0.27
388 0.22
389 0.19
390 0.2
391 0.18
392 0.21
393 0.18
394 0.17
395 0.19
396 0.21
397 0.24
398 0.25
399 0.24
400 0.28
401 0.31
402 0.31
403 0.3
404 0.29
405 0.26
406 0.29
407 0.33
408 0.36
409 0.44
410 0.54
411 0.64
412 0.73
413 0.82
414 0.85
415 0.91
416 0.91
417 0.91
418 0.91
419 0.91
420 0.91
421 0.91
422 0.87
423 0.78
424 0.7
425 0.63
426 0.54
427 0.46
428 0.36
429 0.27
430 0.21
431 0.2
432 0.18
433 0.15