Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5HSW5

Protein Details
Accession V5HSW5    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-227DYTRRRFDDREHRRRRDRGEBasic
287-308DDGDRRRRFRERSPHVPRRNEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-198RRR
220-221RR
247-255RNRSRRGKR
292-301RRRFRERSPH
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MEVASAPQYQNDPNVTSNAMDTTMDIDMDLDLGPLPEPEAIETEQDPMQASAVAEEGTVDHLEEDATYEKVHVRGVDELATSDIKQFATEHFNVEEPSRIEWIDDTSANIVYSSAEVGLQALAALTQVGVEDASALPYLRLRSAKTLSSHPDSVLQVRSAVKTDKKKPRAHEASRFYLMHPEHDPRERLRREFSERRRHGGRDDSEGDYTRRRFDDREHRRRRDRGEEEGFSAGMYDDEPSDADRGRNRSRRGKRAELFPDRDDESGRLRGRSASPGRDLLDEDSRDDGDRRRRFRERSPHVPRRNEGRELFPSNGSDSNSRELFPNKTASTYLKKELFPTKTASNHRRSDAFDAADETAESLAKRITVPLVDGAHDQDTSRRNANVELFPQSGGNGVSIRGAAAQDSGLSIRGAANGLSIKGRGASVRELFPSKYGNNAGKELFSDKLEGRGGRRRKAEDMFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.24
5 0.2
6 0.17
7 0.14
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.1
13 0.09
14 0.08
15 0.09
16 0.08
17 0.06
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.11
27 0.12
28 0.14
29 0.15
30 0.17
31 0.16
32 0.17
33 0.17
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.17
62 0.18
63 0.19
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.2
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.22
80 0.22
81 0.22
82 0.24
83 0.18
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.16
89 0.18
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.1
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.02
113 0.02
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.07
125 0.09
126 0.11
127 0.13
128 0.14
129 0.19
130 0.22
131 0.27
132 0.27
133 0.32
134 0.35
135 0.38
136 0.38
137 0.32
138 0.34
139 0.31
140 0.31
141 0.27
142 0.22
143 0.19
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.21
148 0.25
149 0.32
150 0.42
151 0.5
152 0.58
153 0.63
154 0.66
155 0.73
156 0.76
157 0.76
158 0.76
159 0.72
160 0.69
161 0.67
162 0.63
163 0.52
164 0.48
165 0.4
166 0.33
167 0.3
168 0.27
169 0.26
170 0.29
171 0.31
172 0.28
173 0.38
174 0.39
175 0.39
176 0.41
177 0.43
178 0.48
179 0.56
180 0.62
181 0.64
182 0.63
183 0.66
184 0.65
185 0.6
186 0.55
187 0.54
188 0.46
189 0.42
190 0.42
191 0.38
192 0.35
193 0.35
194 0.33
195 0.29
196 0.27
197 0.23
198 0.21
199 0.21
200 0.2
201 0.27
202 0.37
203 0.43
204 0.54
205 0.61
206 0.68
207 0.75
208 0.8
209 0.79
210 0.78
211 0.71
212 0.69
213 0.65
214 0.58
215 0.52
216 0.46
217 0.39
218 0.28
219 0.23
220 0.14
221 0.07
222 0.06
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.11
232 0.17
233 0.25
234 0.32
235 0.38
236 0.47
237 0.56
238 0.64
239 0.68
240 0.72
241 0.68
242 0.71
243 0.74
244 0.72
245 0.68
246 0.59
247 0.55
248 0.46
249 0.42
250 0.34
251 0.26
252 0.21
253 0.23
254 0.23
255 0.21
256 0.2
257 0.22
258 0.22
259 0.3
260 0.3
261 0.27
262 0.28
263 0.31
264 0.31
265 0.3
266 0.29
267 0.23
268 0.24
269 0.21
270 0.19
271 0.18
272 0.17
273 0.17
274 0.17
275 0.2
276 0.25
277 0.32
278 0.36
279 0.43
280 0.5
281 0.55
282 0.63
283 0.69
284 0.68
285 0.71
286 0.78
287 0.8
288 0.82
289 0.83
290 0.77
291 0.76
292 0.73
293 0.68
294 0.59
295 0.55
296 0.53
297 0.5
298 0.48
299 0.4
300 0.35
301 0.3
302 0.31
303 0.26
304 0.22
305 0.2
306 0.22
307 0.21
308 0.21
309 0.21
310 0.22
311 0.23
312 0.24
313 0.27
314 0.23
315 0.24
316 0.26
317 0.28
318 0.32
319 0.33
320 0.37
321 0.36
322 0.36
323 0.39
324 0.46
325 0.45
326 0.4
327 0.41
328 0.4
329 0.43
330 0.52
331 0.55
332 0.55
333 0.57
334 0.57
335 0.56
336 0.54
337 0.53
338 0.48
339 0.41
340 0.33
341 0.31
342 0.29
343 0.25
344 0.22
345 0.15
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.15
358 0.16
359 0.16
360 0.17
361 0.18
362 0.17
363 0.17
364 0.16
365 0.17
366 0.19
367 0.22
368 0.25
369 0.24
370 0.24
371 0.28
372 0.33
373 0.33
374 0.32
375 0.34
376 0.31
377 0.3
378 0.29
379 0.25
380 0.21
381 0.16
382 0.14
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.1
404 0.11
405 0.12
406 0.13
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.15
413 0.21
414 0.23
415 0.26
416 0.3
417 0.32
418 0.32
419 0.33
420 0.35
421 0.29
422 0.32
423 0.36
424 0.38
425 0.39
426 0.41
427 0.4
428 0.35
429 0.37
430 0.34
431 0.29
432 0.24
433 0.24
434 0.21
435 0.25
436 0.29
437 0.29
438 0.33
439 0.4
440 0.47
441 0.52
442 0.59
443 0.59
444 0.62