Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GAD9

Protein Details
Accession V5GAD9    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-119LALRRRTASHNVKRVPRRLRARAKREMIEDHydrophilic
149-173NAKTKARRAASKSKREKEMRKLLSDHydrophilic
180-219QIAPRVPKIKKNKLSHPAPAESKFKKRQRGKTWLPTHMFHHydrophilic
798-821GSQSSAQKGKKQKQSQNQNQTQSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-114RRRTASHNVKRVPRRLRARAKR
127-132RRRKPT
136-169RLRLETARRLQGLNAKTKARRAASKSKREKEMRK
183-210PRVPKIKKNKLSHPAPAESKFKKRQRGK
349-355RKAKKPR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MALTQPSKRKSAFPNSGGGRDDSAAARKRAKTYDARALAVQTSDAALSATGELDVAAFVGAREFEIRALEAGMQRSKAALTSRAFQKVPLALRRRTASHNVKRVPRRLRARAKREMIEDNTPTVTARRRKPTQLLRLRLETARRLQGLNAKTKARRAASKSKREKEMRKLLSDEGIHSFQIAPRVPKIKKNKLSHPAPAESKFKKRQRGKTWLPTHMFHAKRAHMTTAKEPLWRFAVPLSPTEKSYRPTHRAAGARGAVAWDVSYMSTIQLEGSEASLESVLRTVGVAGDEAWGTKGTKWRQGTRSLVAWVFEHEGEKKPIAPVTFIWCARSASEDVEMTDAGDQSGPRKAKKPRERLFIRVHPSAFLQLWNELLEVSKRQNPPVMVEDLRFEIGSIDITGPGATEALVGALKPVQDDGKEFPKDSPEATWSSLLGVTNPSSLPQNAILAFSISDPRLQFPPRKVKPPTSEESMNDLAILLASWPPDRTQTPAALFDRPVRLAAARQLPSQKAINRRRTLAGAGTDPSPQPSDPRIPVLVLASKPGIMAKNSNAQGTWTVLLPWKCVTPVWYSLMYHPLSSGGNPRFGGLKEQRQLAFEVGEPWFPGDFPGTQAGWQWGLREREEAKNEWERRPKGRRTEFDSIDIGNGSKGEIGRGWACDWERLVEGPPKAAVTASDDSVAQKDSDKTKDADKEAAETSKEDSNKLNTLLPQGLHQLTSTVAHRIINHLSGPLPADLQSHLDKPALATVKISLFNRGTPTPRARVYRLPTTDDKLRQQWLAVASAPTPAKTASKTNGSQSSAQKGKKQKQSQNQNQTQSTASEQEQRDEARRRLAASLLTESTEAGLDTDAERTAYLPIPPEEDLIGFVTTGNYNLSEGKGTGIGSILVSKVTHSAKNSVKDNGKGKAREQRMCIVRSAGERVGRLGVWEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.62
3 0.65
4 0.6
5 0.52
6 0.44
7 0.34
8 0.33
9 0.27
10 0.3
11 0.32
12 0.34
13 0.4
14 0.43
15 0.48
16 0.51
17 0.55
18 0.56
19 0.58
20 0.64
21 0.61
22 0.59
23 0.54
24 0.52
25 0.46
26 0.37
27 0.29
28 0.19
29 0.15
30 0.12
31 0.11
32 0.09
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.05
47 0.05
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.14
57 0.16
58 0.2
59 0.22
60 0.21
61 0.21
62 0.21
63 0.2
64 0.21
65 0.21
66 0.23
67 0.23
68 0.3
69 0.37
70 0.42
71 0.42
72 0.4
73 0.42
74 0.41
75 0.46
76 0.47
77 0.48
78 0.46
79 0.52
80 0.56
81 0.54
82 0.54
83 0.57
84 0.59
85 0.62
86 0.68
87 0.69
88 0.75
89 0.8
90 0.83
91 0.82
92 0.81
93 0.81
94 0.82
95 0.85
96 0.87
97 0.87
98 0.88
99 0.87
100 0.82
101 0.77
102 0.75
103 0.69
104 0.66
105 0.59
106 0.51
107 0.44
108 0.38
109 0.33
110 0.28
111 0.31
112 0.32
113 0.38
114 0.46
115 0.51
116 0.59
117 0.68
118 0.75
119 0.78
120 0.8
121 0.8
122 0.76
123 0.75
124 0.71
125 0.65
126 0.6
127 0.56
128 0.52
129 0.5
130 0.45
131 0.41
132 0.4
133 0.43
134 0.44
135 0.46
136 0.45
137 0.45
138 0.46
139 0.51
140 0.56
141 0.54
142 0.56
143 0.55
144 0.61
145 0.65
146 0.73
147 0.79
148 0.79
149 0.84
150 0.85
151 0.86
152 0.85
153 0.86
154 0.82
155 0.76
156 0.72
157 0.64
158 0.61
159 0.52
160 0.44
161 0.38
162 0.32
163 0.27
164 0.24
165 0.22
166 0.17
167 0.23
168 0.23
169 0.21
170 0.25
171 0.34
172 0.36
173 0.44
174 0.53
175 0.58
176 0.65
177 0.7
178 0.75
179 0.76
180 0.8
181 0.8
182 0.76
183 0.72
184 0.68
185 0.65
186 0.63
187 0.59
188 0.62
189 0.64
190 0.64
191 0.68
192 0.72
193 0.78
194 0.79
195 0.84
196 0.85
197 0.86
198 0.87
199 0.86
200 0.8
201 0.71
202 0.67
203 0.65
204 0.56
205 0.51
206 0.49
207 0.43
208 0.44
209 0.45
210 0.45
211 0.4
212 0.42
213 0.42
214 0.44
215 0.42
216 0.41
217 0.4
218 0.37
219 0.37
220 0.33
221 0.28
222 0.21
223 0.25
224 0.22
225 0.26
226 0.27
227 0.25
228 0.27
229 0.3
230 0.31
231 0.29
232 0.36
233 0.41
234 0.42
235 0.45
236 0.47
237 0.5
238 0.52
239 0.5
240 0.49
241 0.42
242 0.36
243 0.32
244 0.28
245 0.21
246 0.16
247 0.14
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.09
283 0.16
284 0.19
285 0.26
286 0.32
287 0.39
288 0.42
289 0.49
290 0.52
291 0.49
292 0.49
293 0.44
294 0.4
295 0.33
296 0.29
297 0.23
298 0.2
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.16
303 0.18
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.18
308 0.17
309 0.17
310 0.15
311 0.18
312 0.23
313 0.23
314 0.23
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.22
319 0.17
320 0.13
321 0.15
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.08
329 0.06
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.13
334 0.15
335 0.16
336 0.24
337 0.32
338 0.42
339 0.52
340 0.62
341 0.64
342 0.73
343 0.76
344 0.76
345 0.77
346 0.74
347 0.7
348 0.63
349 0.55
350 0.46
351 0.41
352 0.36
353 0.27
354 0.2
355 0.15
356 0.11
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.11
365 0.17
366 0.17
367 0.18
368 0.22
369 0.22
370 0.24
371 0.26
372 0.28
373 0.22
374 0.21
375 0.22
376 0.19
377 0.19
378 0.15
379 0.12
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.08
405 0.11
406 0.17
407 0.18
408 0.19
409 0.19
410 0.22
411 0.22
412 0.21
413 0.19
414 0.15
415 0.16
416 0.17
417 0.16
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.09
423 0.09
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.08
432 0.09
433 0.08
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.07
441 0.09
442 0.08
443 0.1
444 0.13
445 0.15
446 0.18
447 0.24
448 0.35
449 0.36
450 0.44
451 0.46
452 0.51
453 0.56
454 0.58
455 0.55
456 0.49
457 0.49
458 0.42
459 0.44
460 0.37
461 0.3
462 0.24
463 0.19
464 0.14
465 0.11
466 0.09
467 0.04
468 0.03
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.08
474 0.09
475 0.12
476 0.13
477 0.16
478 0.17
479 0.22
480 0.23
481 0.22
482 0.23
483 0.22
484 0.22
485 0.2
486 0.19
487 0.14
488 0.13
489 0.12
490 0.16
491 0.2
492 0.19
493 0.21
494 0.24
495 0.24
496 0.26
497 0.29
498 0.28
499 0.32
500 0.4
501 0.48
502 0.47
503 0.49
504 0.48
505 0.46
506 0.43
507 0.36
508 0.29
509 0.2
510 0.19
511 0.18
512 0.17
513 0.15
514 0.15
515 0.13
516 0.11
517 0.12
518 0.14
519 0.18
520 0.18
521 0.2
522 0.2
523 0.19
524 0.19
525 0.18
526 0.18
527 0.14
528 0.14
529 0.11
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.11
534 0.09
535 0.11
536 0.12
537 0.19
538 0.2
539 0.2
540 0.19
541 0.18
542 0.18
543 0.18
544 0.16
545 0.09
546 0.09
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.13
551 0.12
552 0.12
553 0.12
554 0.13
555 0.13
556 0.16
557 0.18
558 0.19
559 0.19
560 0.2
561 0.25
562 0.23
563 0.2
564 0.17
565 0.15
566 0.13
567 0.14
568 0.2
569 0.16
570 0.19
571 0.19
572 0.19
573 0.2
574 0.2
575 0.27
576 0.25
577 0.31
578 0.31
579 0.35
580 0.36
581 0.35
582 0.36
583 0.29
584 0.24
585 0.16
586 0.16
587 0.13
588 0.12
589 0.11
590 0.11
591 0.1
592 0.09
593 0.09
594 0.08
595 0.07
596 0.09
597 0.12
598 0.11
599 0.11
600 0.12
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.13
605 0.16
606 0.19
607 0.19
608 0.23
609 0.25
610 0.3
611 0.33
612 0.33
613 0.33
614 0.41
615 0.44
616 0.47
617 0.53
618 0.51
619 0.57
620 0.65
621 0.67
622 0.68
623 0.74
624 0.73
625 0.72
626 0.77
627 0.7
628 0.64
629 0.58
630 0.47
631 0.38
632 0.32
633 0.23
634 0.14
635 0.11
636 0.08
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.09
642 0.11
643 0.12
644 0.12
645 0.15
646 0.15
647 0.17
648 0.17
649 0.16
650 0.16
651 0.15
652 0.18
653 0.2
654 0.19
655 0.18
656 0.18
657 0.17
658 0.16
659 0.15
660 0.12
661 0.13
662 0.14
663 0.14
664 0.14
665 0.14
666 0.14
667 0.15
668 0.16
669 0.1
670 0.11
671 0.14
672 0.19
673 0.22
674 0.24
675 0.25
676 0.3
677 0.36
678 0.36
679 0.37
680 0.33
681 0.33
682 0.32
683 0.34
684 0.28
685 0.22
686 0.22
687 0.23
688 0.23
689 0.21
690 0.21
691 0.23
692 0.25
693 0.26
694 0.26
695 0.22
696 0.26
697 0.27
698 0.24
699 0.21
700 0.23
701 0.22
702 0.19
703 0.18
704 0.15
705 0.13
706 0.15
707 0.14
708 0.12
709 0.13
710 0.14
711 0.15
712 0.18
713 0.19
714 0.19
715 0.18
716 0.17
717 0.16
718 0.16
719 0.17
720 0.14
721 0.12
722 0.11
723 0.11
724 0.11
725 0.14
726 0.16
727 0.15
728 0.16
729 0.16
730 0.16
731 0.15
732 0.21
733 0.2
734 0.18
735 0.17
736 0.18
737 0.21
738 0.25
739 0.25
740 0.24
741 0.23
742 0.25
743 0.29
744 0.3
745 0.3
746 0.34
747 0.39
748 0.39
749 0.45
750 0.48
751 0.48
752 0.53
753 0.56
754 0.58
755 0.56
756 0.56
757 0.54
758 0.55
759 0.59
760 0.56
761 0.56
762 0.51
763 0.51
764 0.45
765 0.42
766 0.4
767 0.33
768 0.3
769 0.25
770 0.21
771 0.18
772 0.22
773 0.22
774 0.18
775 0.17
776 0.16
777 0.17
778 0.19
779 0.24
780 0.24
781 0.31
782 0.34
783 0.4
784 0.45
785 0.46
786 0.5
787 0.49
788 0.53
789 0.53
790 0.54
791 0.55
792 0.58
793 0.64
794 0.69
795 0.74
796 0.75
797 0.78
798 0.86
799 0.89
800 0.9
801 0.89
802 0.87
803 0.79
804 0.71
805 0.62
806 0.53
807 0.45
808 0.37
809 0.31
810 0.31
811 0.3
812 0.3
813 0.32
814 0.33
815 0.38
816 0.42
817 0.43
818 0.43
819 0.44
820 0.44
821 0.42
822 0.42
823 0.37
824 0.33
825 0.35
826 0.27
827 0.26
828 0.24
829 0.22
830 0.2
831 0.16
832 0.12
833 0.08
834 0.07
835 0.07
836 0.07
837 0.09
838 0.08
839 0.08
840 0.08
841 0.09
842 0.11
843 0.12
844 0.13
845 0.16
846 0.17
847 0.2
848 0.21
849 0.21
850 0.19
851 0.18
852 0.18
853 0.16
854 0.15
855 0.11
856 0.11
857 0.11
858 0.1
859 0.11
860 0.11
861 0.09
862 0.1
863 0.12
864 0.12
865 0.12
866 0.12
867 0.13
868 0.14
869 0.13
870 0.12
871 0.12
872 0.11
873 0.1
874 0.11
875 0.09
876 0.09
877 0.09
878 0.09
879 0.15
880 0.18
881 0.22
882 0.23
883 0.32
884 0.38
885 0.45
886 0.49
887 0.52
888 0.55
889 0.59
890 0.62
891 0.62
892 0.64
893 0.61
894 0.63
895 0.65
896 0.67
897 0.66
898 0.65
899 0.66
900 0.65
901 0.63
902 0.58
903 0.52
904 0.47
905 0.44
906 0.45
907 0.41
908 0.37
909 0.36
910 0.35
911 0.34
912 0.3
913 0.27