Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5G0U8

Protein Details
Accession V5G0U8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-308KEIKEQHRRRRAGENSKRKNTRNHDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-300QHRRRRAGENSKRK
Subcellular Location(s) cyto 8.5, mito 8, cyto_nucl 6.5, pero 4, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013921  Mediator_Med20  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08612  Med20  
Amino Acid Sequences MAITGVFFIPSNPNAPSALPTLTERLRSVFAEEPIPIGRWALEHKLMRDTPSCLPASAHAPNPVPKPKYMQFLSLTHYANHGFIYATEATDLPHGTAAAGASHRQTPLPGTLSAAGTPQSQAQSPTAVAGGATPSSTASQSGMIMRTVPLPSYGPLFQHFMRACEPFWCHRHTVTVPAGVVYDIGDFRIRIGDVRQTLPQARARGTVVEVEWKGSSPLTASSSPTNPDEDSSDSGVDVTAEALDDNEIDAEYALAAQLIRDLWSQLGIEGAREAILVPDVGKEIKEQHRRRRAGENSKRKNTRNHDDEEGWGWWDIEEDKNPDVGVDLARQYMKIFRFNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.21
4 0.2
5 0.19
6 0.18
7 0.19
8 0.24
9 0.25
10 0.28
11 0.26
12 0.26
13 0.27
14 0.26
15 0.29
16 0.28
17 0.27
18 0.27
19 0.26
20 0.25
21 0.24
22 0.25
23 0.2
24 0.16
25 0.14
26 0.13
27 0.17
28 0.2
29 0.25
30 0.27
31 0.29
32 0.36
33 0.38
34 0.4
35 0.39
36 0.38
37 0.34
38 0.37
39 0.36
40 0.28
41 0.28
42 0.26
43 0.29
44 0.29
45 0.28
46 0.27
47 0.29
48 0.33
49 0.4
50 0.45
51 0.42
52 0.4
53 0.44
54 0.44
55 0.5
56 0.47
57 0.46
58 0.42
59 0.42
60 0.45
61 0.43
62 0.4
63 0.31
64 0.32
65 0.27
66 0.23
67 0.2
68 0.16
69 0.1
70 0.09
71 0.13
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.12
78 0.12
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.15
95 0.16
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.17
100 0.17
101 0.15
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.12
143 0.14
144 0.13
145 0.2
146 0.2
147 0.19
148 0.2
149 0.21
150 0.19
151 0.19
152 0.22
153 0.2
154 0.22
155 0.24
156 0.23
157 0.22
158 0.26
159 0.24
160 0.27
161 0.24
162 0.23
163 0.2
164 0.19
165 0.19
166 0.14
167 0.13
168 0.08
169 0.06
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.12
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.18
184 0.19
185 0.23
186 0.26
187 0.23
188 0.22
189 0.22
190 0.22
191 0.21
192 0.2
193 0.18
194 0.14
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.12
202 0.11
203 0.07
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.16
209 0.17
210 0.2
211 0.2
212 0.2
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.19
218 0.18
219 0.17
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.08
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.16
271 0.26
272 0.37
273 0.45
274 0.55
275 0.65
276 0.7
277 0.73
278 0.76
279 0.77
280 0.77
281 0.8
282 0.8
283 0.8
284 0.86
285 0.9
286 0.85
287 0.85
288 0.84
289 0.83
290 0.79
291 0.74
292 0.71
293 0.65
294 0.63
295 0.57
296 0.48
297 0.38
298 0.32
299 0.26
300 0.18
301 0.17
302 0.16
303 0.16
304 0.19
305 0.21
306 0.22
307 0.23
308 0.22
309 0.21
310 0.2
311 0.17
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.17
316 0.18
317 0.19
318 0.19
319 0.24
320 0.25