Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5G9U5

Protein Details
Accession V5G9U5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24VSKPASQPPKMKRPPPFVQTHydrophilic
62-87VNGTNNRPIQRPKKEMPKPNEPASRLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAVSKPASQPPKMKRPPPFVQTGVNGVKPSQPSASPSSASKRLPGAGQPLSSSSAGGSAVNGTNNRPIQRPKKEMPKPNEPASRLQRPSTRTSVAEADRRISKKFPEPYVKTTSYILKKYSKCPPSLIIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMLEELLRAGVRFYEGCLIVRVVDHKSVSAQKSKASVTSTDENNSPFSIHNYNQHVTPSAYVPYPKQNQTIPEKPDGRSSGASGSGTDTKTTDDSAASGKQSESNDKTPEKQPSQKPRVFTTVLHPTPRSLYAELTLLSTTPDPRAVNKKPAAPNGASRTPSTSGPQPSSISTNATDRGPPAKRQKMLVEPHELHECESKLVRALAPPLFLDPVDSLEATRDLLRFLESPLHRDSPPSPKTRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTVSAATGAAKTAAVDDAGGVAPFEPRFSRFKTLENIRLQHEEKAKREHERKLQQDHIKRQQQEQERERRRAMEQRQAEEHAKEEARRQQLAAQQAQAQLAAQQNRHPIAQANGMGQVSQGPQSSPVVRNQTPHNTSSPLVGSSMGTQAGVPMTMTASAQGAGSPPRPPSALQHAHPGVMAHPMAASRSQQGQSRNGTPQMSHGTPSMPQATPVMRNVTPTQRMSHGSPNASSMAPTPVMGHAMMGTPQMGNGMGLTPQQQLLLQQRQQQLLAQQGLGHGQFTPQQIAQMQANMHAQQNIQSHQQHMMQPHQAQPNQHHQQQQQHNASMQKLQSQQAYQAQLMRAQLVQMQMAQQQNHGQQQHHQGSPPQMTPQQQQQQQMLLNAAQANGGHLPQNFQGMAMNQRYQQLYQQRLLRLRQEMAQRYMPEYGPPTQYPPQIAQQYGPGLERSARTWVHELMRRERESAQQQQQRASQVAAVQAQAMQQQQQNMMHGGMGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.77
3 0.77
4 0.79
5 0.82
6 0.79
7 0.78
8 0.7
9 0.67
10 0.62
11 0.61
12 0.56
13 0.5
14 0.44
15 0.37
16 0.38
17 0.33
18 0.33
19 0.28
20 0.25
21 0.27
22 0.33
23 0.36
24 0.33
25 0.36
26 0.4
27 0.44
28 0.44
29 0.43
30 0.4
31 0.38
32 0.39
33 0.39
34 0.4
35 0.37
36 0.37
37 0.35
38 0.33
39 0.34
40 0.31
41 0.26
42 0.18
43 0.15
44 0.14
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.24
53 0.29
54 0.31
55 0.34
56 0.42
57 0.49
58 0.58
59 0.65
60 0.67
61 0.73
62 0.81
63 0.85
64 0.83
65 0.84
66 0.81
67 0.82
68 0.82
69 0.74
70 0.74
71 0.73
72 0.75
73 0.68
74 0.66
75 0.63
76 0.59
77 0.63
78 0.6
79 0.56
80 0.47
81 0.46
82 0.48
83 0.47
84 0.49
85 0.44
86 0.42
87 0.45
88 0.46
89 0.45
90 0.41
91 0.42
92 0.44
93 0.5
94 0.55
95 0.58
96 0.62
97 0.65
98 0.71
99 0.67
100 0.59
101 0.55
102 0.54
103 0.51
104 0.49
105 0.48
106 0.48
107 0.5
108 0.55
109 0.62
110 0.6
111 0.55
112 0.55
113 0.56
114 0.54
115 0.57
116 0.56
117 0.51
118 0.52
119 0.52
120 0.5
121 0.49
122 0.44
123 0.41
124 0.36
125 0.34
126 0.3
127 0.3
128 0.36
129 0.33
130 0.38
131 0.36
132 0.4
133 0.38
134 0.34
135 0.33
136 0.28
137 0.27
138 0.22
139 0.19
140 0.15
141 0.16
142 0.18
143 0.19
144 0.17
145 0.18
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.14
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.14
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.19
181 0.25
182 0.28
183 0.33
184 0.32
185 0.31
186 0.35
187 0.36
188 0.35
189 0.31
190 0.29
191 0.28
192 0.33
193 0.32
194 0.31
195 0.31
196 0.29
197 0.28
198 0.26
199 0.21
200 0.16
201 0.18
202 0.21
203 0.21
204 0.27
205 0.31
206 0.32
207 0.32
208 0.33
209 0.31
210 0.26
211 0.26
212 0.2
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.25
218 0.31
219 0.33
220 0.34
221 0.35
222 0.4
223 0.47
224 0.53
225 0.49
226 0.51
227 0.52
228 0.49
229 0.53
230 0.49
231 0.44
232 0.37
233 0.34
234 0.28
235 0.26
236 0.25
237 0.18
238 0.19
239 0.19
240 0.18
241 0.18
242 0.16
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.1
248 0.1
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.16
255 0.18
256 0.24
257 0.27
258 0.3
259 0.35
260 0.36
261 0.4
262 0.42
263 0.49
264 0.48
265 0.52
266 0.57
267 0.63
268 0.71
269 0.69
270 0.67
271 0.62
272 0.62
273 0.55
274 0.47
275 0.43
276 0.43
277 0.44
278 0.44
279 0.4
280 0.34
281 0.34
282 0.35
283 0.31
284 0.22
285 0.19
286 0.17
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.13
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.12
297 0.12
298 0.16
299 0.25
300 0.29
301 0.37
302 0.39
303 0.46
304 0.48
305 0.53
306 0.53
307 0.46
308 0.48
309 0.46
310 0.48
311 0.41
312 0.37
313 0.36
314 0.33
315 0.32
316 0.28
317 0.27
318 0.26
319 0.27
320 0.29
321 0.26
322 0.25
323 0.27
324 0.25
325 0.22
326 0.19
327 0.19
328 0.18
329 0.17
330 0.16
331 0.15
332 0.22
333 0.22
334 0.28
335 0.36
336 0.42
337 0.43
338 0.46
339 0.49
340 0.5
341 0.54
342 0.52
343 0.5
344 0.44
345 0.44
346 0.45
347 0.4
348 0.33
349 0.3
350 0.26
351 0.19
352 0.18
353 0.16
354 0.13
355 0.14
356 0.13
357 0.11
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.12
365 0.12
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.09
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.16
382 0.15
383 0.18
384 0.21
385 0.24
386 0.22
387 0.24
388 0.27
389 0.29
390 0.35
391 0.39
392 0.43
393 0.48
394 0.55
395 0.63
396 0.68
397 0.61
398 0.62
399 0.59
400 0.59
401 0.53
402 0.47
403 0.39
404 0.3
405 0.27
406 0.19
407 0.15
408 0.07
409 0.05
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.04
419 0.05
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.07
452 0.11
453 0.14
454 0.2
455 0.2
456 0.23
457 0.3
458 0.35
459 0.41
460 0.42
461 0.41
462 0.38
463 0.41
464 0.39
465 0.37
466 0.39
467 0.36
468 0.35
469 0.4
470 0.41
471 0.44
472 0.49
473 0.51
474 0.53
475 0.57
476 0.61
477 0.6
478 0.66
479 0.65
480 0.68
481 0.7
482 0.7
483 0.68
484 0.63
485 0.61
486 0.6
487 0.61
488 0.62
489 0.62
490 0.63
491 0.63
492 0.66
493 0.63
494 0.58
495 0.53
496 0.53
497 0.5
498 0.49
499 0.46
500 0.45
501 0.46
502 0.47
503 0.45
504 0.36
505 0.31
506 0.26
507 0.22
508 0.2
509 0.22
510 0.25
511 0.27
512 0.27
513 0.26
514 0.26
515 0.29
516 0.34
517 0.31
518 0.26
519 0.24
520 0.25
521 0.24
522 0.2
523 0.16
524 0.13
525 0.15
526 0.16
527 0.15
528 0.16
529 0.19
530 0.21
531 0.21
532 0.18
533 0.16
534 0.16
535 0.19
536 0.18
537 0.15
538 0.16
539 0.16
540 0.15
541 0.13
542 0.12
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.07
547 0.08
548 0.1
549 0.14
550 0.14
551 0.19
552 0.24
553 0.25
554 0.27
555 0.31
556 0.38
557 0.38
558 0.38
559 0.35
560 0.31
561 0.3
562 0.3
563 0.26
564 0.17
565 0.15
566 0.13
567 0.11
568 0.1
569 0.11
570 0.08
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.05
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.06
587 0.07
588 0.09
589 0.11
590 0.11
591 0.12
592 0.13
593 0.14
594 0.18
595 0.26
596 0.3
597 0.29
598 0.37
599 0.36
600 0.35
601 0.35
602 0.3
603 0.21
604 0.18
605 0.17
606 0.09
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.1
611 0.1
612 0.09
613 0.13
614 0.16
615 0.19
616 0.23
617 0.28
618 0.32
619 0.35
620 0.37
621 0.36
622 0.35
623 0.31
624 0.32
625 0.32
626 0.28
627 0.25
628 0.22
629 0.2
630 0.2
631 0.23
632 0.22
633 0.16
634 0.16
635 0.17
636 0.19
637 0.2
638 0.22
639 0.24
640 0.2
641 0.23
642 0.26
643 0.3
644 0.33
645 0.32
646 0.32
647 0.3
648 0.34
649 0.34
650 0.39
651 0.37
652 0.33
653 0.32
654 0.32
655 0.3
656 0.27
657 0.24
658 0.17
659 0.15
660 0.13
661 0.13
662 0.12
663 0.11
664 0.12
665 0.11
666 0.1
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.07
671 0.07
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.13
687 0.2
688 0.27
689 0.29
690 0.36
691 0.4
692 0.41
693 0.41
694 0.39
695 0.34
696 0.33
697 0.3
698 0.23
699 0.19
700 0.18
701 0.2
702 0.18
703 0.16
704 0.09
705 0.09
706 0.12
707 0.13
708 0.16
709 0.14
710 0.16
711 0.16
712 0.19
713 0.19
714 0.18
715 0.17
716 0.17
717 0.19
718 0.19
719 0.2
720 0.18
721 0.18
722 0.2
723 0.24
724 0.23
725 0.26
726 0.27
727 0.27
728 0.29
729 0.34
730 0.32
731 0.32
732 0.35
733 0.35
734 0.37
735 0.42
736 0.46
737 0.44
738 0.44
739 0.46
740 0.51
741 0.52
742 0.54
743 0.54
744 0.52
745 0.59
746 0.65
747 0.7
748 0.65
749 0.61
750 0.6
751 0.56
752 0.53
753 0.48
754 0.4
755 0.36
756 0.34
757 0.34
758 0.34
759 0.31
760 0.35
761 0.36
762 0.38
763 0.33
764 0.33
765 0.31
766 0.3
767 0.29
768 0.26
769 0.2
770 0.17
771 0.18
772 0.15
773 0.14
774 0.12
775 0.13
776 0.17
777 0.21
778 0.21
779 0.21
780 0.25
781 0.29
782 0.35
783 0.36
784 0.32
785 0.35
786 0.45
787 0.49
788 0.46
789 0.44
790 0.41
791 0.46
792 0.49
793 0.45
794 0.39
795 0.37
796 0.4
797 0.42
798 0.48
799 0.49
800 0.49
801 0.53
802 0.5
803 0.51
804 0.49
805 0.46
806 0.39
807 0.3
808 0.28
809 0.23
810 0.2
811 0.16
812 0.13
813 0.14
814 0.12
815 0.12
816 0.13
817 0.12
818 0.15
819 0.15
820 0.19
821 0.17
822 0.16
823 0.18
824 0.17
825 0.24
826 0.26
827 0.27
828 0.25
829 0.3
830 0.32
831 0.3
832 0.36
833 0.38
834 0.39
835 0.43
836 0.48
837 0.51
838 0.55
839 0.59
840 0.58
841 0.54
842 0.51
843 0.51
844 0.54
845 0.54
846 0.53
847 0.54
848 0.49
849 0.47
850 0.48
851 0.42
852 0.37
853 0.34
854 0.33
855 0.32
856 0.32
857 0.36
858 0.37
859 0.4
860 0.4
861 0.4
862 0.44
863 0.44
864 0.44
865 0.38
866 0.37
867 0.37
868 0.35
869 0.33
870 0.25
871 0.21
872 0.23
873 0.24
874 0.21
875 0.25
876 0.24
877 0.27
878 0.3
879 0.34
880 0.39
881 0.44
882 0.48
883 0.51
884 0.6
885 0.58
886 0.57
887 0.54
888 0.55
889 0.57
890 0.61
891 0.62
892 0.6
893 0.61
894 0.64
895 0.66
896 0.62
897 0.55
898 0.45
899 0.37
900 0.32
901 0.34
902 0.29
903 0.25
904 0.21
905 0.19
906 0.19
907 0.2
908 0.2
909 0.19
910 0.2
911 0.23
912 0.28
913 0.29
914 0.31
915 0.29
916 0.28