Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FTM5

Protein Details
Accession V5FTM5    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-354GTPVRRKKRKGAMTNPSAYSHydrophilic
435-462LSGWTDRSKETRRKGAKAKRGKNGNEAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-344RRKKRK
443-457KETRRKGAKAKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MAPKKQWINKKSATTYQLFHRSQNDPLIHDPEAQDRILFPVSKPRNSASSESGESSSSKPIKHLADLEQELDTSSVRKNEGEAANYGIFYDDTRYDYMQHLRELGGGGGNSYFIEVAQPKAKGKGKKLEDALRDDLTLDDSVSEFGGASVYGSEYGSVYDGRSTASSYVKKPTYQDQQDVPDVIAGFKPDMDPRLREVLEALEDEAYVDEDDDIFGDLTKEGEEVDPAEWEDSLFDNDDEDDGWESDATEKAPVQKSVSDSKPKDEAQEDSSHDETAPGELPSEGAPVPDMKPEDGDWMREFAKFKKDSKSKATAAAPTESERRTAASTMFTAGGTPVRRKKRKGAMTNPSAYSMTSSSLARTEGLRLLDDRFEKVEALYSLDEEGEEYEDSMSMVSGMTGMTGVTGVSHAPSFVSQSGNVPLRSDFDDVMDSFLSGWTDRSKETRRKGAKAKRGKNGNEAIGIKMLDEVRQGLGPARVPGKVSGNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.62
3 0.62
4 0.64
5 0.56
6 0.54
7 0.52
8 0.49
9 0.5
10 0.55
11 0.48
12 0.42
13 0.45
14 0.46
15 0.4
16 0.4
17 0.37
18 0.34
19 0.34
20 0.3
21 0.26
22 0.21
23 0.23
24 0.24
25 0.23
26 0.18
27 0.26
28 0.33
29 0.37
30 0.4
31 0.39
32 0.41
33 0.44
34 0.48
35 0.43
36 0.42
37 0.41
38 0.4
39 0.38
40 0.34
41 0.31
42 0.28
43 0.32
44 0.29
45 0.26
46 0.26
47 0.31
48 0.33
49 0.35
50 0.38
51 0.34
52 0.4
53 0.41
54 0.41
55 0.34
56 0.31
57 0.27
58 0.24
59 0.18
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.16
66 0.23
67 0.26
68 0.27
69 0.26
70 0.28
71 0.27
72 0.26
73 0.25
74 0.17
75 0.14
76 0.12
77 0.14
78 0.1
79 0.12
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.2
84 0.26
85 0.26
86 0.26
87 0.25
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.19
92 0.14
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.04
101 0.08
102 0.08
103 0.11
104 0.15
105 0.17
106 0.18
107 0.26
108 0.33
109 0.36
110 0.43
111 0.49
112 0.51
113 0.56
114 0.62
115 0.62
116 0.61
117 0.61
118 0.58
119 0.49
120 0.43
121 0.36
122 0.3
123 0.24
124 0.19
125 0.12
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.05
132 0.04
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.15
153 0.18
154 0.2
155 0.27
156 0.28
157 0.3
158 0.31
159 0.37
160 0.41
161 0.43
162 0.45
163 0.42
164 0.44
165 0.44
166 0.42
167 0.34
168 0.25
169 0.2
170 0.17
171 0.13
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.11
178 0.13
179 0.14
180 0.16
181 0.22
182 0.22
183 0.21
184 0.2
185 0.18
186 0.17
187 0.16
188 0.13
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.16
243 0.19
244 0.25
245 0.29
246 0.33
247 0.32
248 0.34
249 0.38
250 0.37
251 0.36
252 0.32
253 0.29
254 0.24
255 0.28
256 0.27
257 0.26
258 0.26
259 0.23
260 0.21
261 0.19
262 0.15
263 0.12
264 0.11
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.1
277 0.11
278 0.09
279 0.11
280 0.11
281 0.17
282 0.16
283 0.18
284 0.17
285 0.18
286 0.19
287 0.2
288 0.22
289 0.18
290 0.27
291 0.28
292 0.31
293 0.39
294 0.45
295 0.48
296 0.54
297 0.59
298 0.52
299 0.55
300 0.55
301 0.49
302 0.45
303 0.41
304 0.35
305 0.29
306 0.32
307 0.26
308 0.23
309 0.19
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.13
319 0.11
320 0.11
321 0.13
322 0.13
323 0.19
324 0.26
325 0.36
326 0.43
327 0.48
328 0.57
329 0.63
330 0.71
331 0.76
332 0.78
333 0.78
334 0.8
335 0.81
336 0.72
337 0.64
338 0.54
339 0.44
340 0.35
341 0.25
342 0.18
343 0.14
344 0.13
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.14
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.17
356 0.2
357 0.21
358 0.2
359 0.19
360 0.18
361 0.18
362 0.17
363 0.19
364 0.15
365 0.17
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.1
401 0.11
402 0.13
403 0.12
404 0.15
405 0.22
406 0.26
407 0.26
408 0.24
409 0.23
410 0.24
411 0.27
412 0.27
413 0.2
414 0.18
415 0.21
416 0.19
417 0.21
418 0.18
419 0.15
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.1
424 0.11
425 0.13
426 0.15
427 0.17
428 0.25
429 0.34
430 0.42
431 0.51
432 0.6
433 0.65
434 0.72
435 0.81
436 0.83
437 0.85
438 0.86
439 0.87
440 0.86
441 0.88
442 0.84
443 0.83
444 0.8
445 0.73
446 0.7
447 0.61
448 0.53
449 0.46
450 0.41
451 0.31
452 0.27
453 0.23
454 0.17
455 0.17
456 0.16
457 0.15
458 0.15
459 0.16
460 0.16
461 0.19
462 0.2
463 0.23
464 0.24
465 0.24
466 0.25
467 0.29