Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FGJ8

Protein Details
Accession V5FGJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSTRALRKLQKQREQEAQRAHydrophilic
75-108PKPASIPTTAPKKKNRKKKSKKKASKSTEDGHPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-100APKKKNRKKKSKKKASK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MSTRALRKLQKQREQEAQRAALQEDEEQADSSEDEVETQPSKPKFNAFDLLNAGGDEDEESDEAPVETAPQPSEPKPASIPTTAPKKKNRKKKSKKKASKSTEDGHPGTDDAELDEIDKALKELSAGQGPSTAANESAVRLENAQKSQFPKTADEVLSIEPKFLNAVNEMRKLFGNVALESFDQPAGTSTGRRRDRNREMVDLGRALTGAYSPASRGQSLAGVALRRNVLMQGKDEWPRAPSGGLGMEVVEKLPTGATVYKILHNPSYEDVQRQFDMCVESMDPQRLIHLLQYNPYHISTLLQVSDIAKHQGDHAVSADLLERALFNIGRSAHSSFGNQLKEGKARLEFKHAANRELWLVGWRYIANLGMKGTWRTAYEWAKLLLSLDLDDPYCINLLIDHLALRGRQYENFVELCTQTLFSELWEKFPNIQCSLALAYLRLDKPKECREQLRLAMLRYPWVFCKLAQELDVQPMPKRIWGKMPPTQSQELLCELYIARAKDLWNTPEVISLIVEVADTLPEKEEPVEPPEITLDIARHVVLSDIPSVTTHLPGRFLSGRISASDPLPPYDSEAFRQQSDPTPSYLAQTAELGRPQWLRDLMDQLNNGMLHFPRFRRDGDEELTEEDVPPGDETEHEDSDRHPSRENQALLRQWLLGSGLENLQDFLRQHGVDRGNWGDAVGFSPLIDYVEALGVFEPESVRHDLLHGPVREAVGDIVVEMLEDELQLLYDEANDDSLSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.8
3 0.77
4 0.71
5 0.65
6 0.59
7 0.52
8 0.44
9 0.37
10 0.31
11 0.25
12 0.24
13 0.21
14 0.18
15 0.18
16 0.16
17 0.15
18 0.14
19 0.13
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.24
27 0.25
28 0.29
29 0.3
30 0.36
31 0.38
32 0.42
33 0.48
34 0.42
35 0.44
36 0.44
37 0.44
38 0.37
39 0.31
40 0.26
41 0.18
42 0.16
43 0.11
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.09
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.17
58 0.21
59 0.22
60 0.31
61 0.29
62 0.3
63 0.31
64 0.35
65 0.35
66 0.34
67 0.36
68 0.35
69 0.45
70 0.49
71 0.54
72 0.6
73 0.68
74 0.75
75 0.82
76 0.86
77 0.87
78 0.91
79 0.94
80 0.95
81 0.95
82 0.97
83 0.97
84 0.97
85 0.95
86 0.94
87 0.91
88 0.86
89 0.83
90 0.8
91 0.7
92 0.6
93 0.51
94 0.4
95 0.33
96 0.27
97 0.18
98 0.11
99 0.11
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.08
111 0.11
112 0.15
113 0.16
114 0.15
115 0.17
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.14
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.1
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.13
128 0.18
129 0.22
130 0.25
131 0.27
132 0.29
133 0.32
134 0.37
135 0.4
136 0.37
137 0.35
138 0.36
139 0.4
140 0.37
141 0.35
142 0.31
143 0.3
144 0.32
145 0.29
146 0.25
147 0.18
148 0.17
149 0.16
150 0.15
151 0.15
152 0.12
153 0.18
154 0.22
155 0.27
156 0.27
157 0.28
158 0.27
159 0.27
160 0.25
161 0.22
162 0.2
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.16
168 0.16
169 0.13
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.14
176 0.18
177 0.28
178 0.35
179 0.42
180 0.48
181 0.56
182 0.65
183 0.71
184 0.71
185 0.67
186 0.64
187 0.61
188 0.57
189 0.47
190 0.38
191 0.27
192 0.22
193 0.16
194 0.12
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.15
217 0.15
218 0.17
219 0.19
220 0.23
221 0.27
222 0.28
223 0.26
224 0.23
225 0.23
226 0.22
227 0.18
228 0.14
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.08
245 0.11
246 0.13
247 0.16
248 0.18
249 0.2
250 0.2
251 0.2
252 0.2
253 0.19
254 0.22
255 0.2
256 0.21
257 0.22
258 0.23
259 0.23
260 0.21
261 0.2
262 0.17
263 0.18
264 0.14
265 0.13
266 0.11
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.12
276 0.15
277 0.14
278 0.18
279 0.19
280 0.2
281 0.21
282 0.21
283 0.18
284 0.13
285 0.14
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.13
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.2
324 0.2
325 0.18
326 0.19
327 0.19
328 0.2
329 0.2
330 0.19
331 0.18
332 0.22
333 0.23
334 0.29
335 0.3
336 0.3
337 0.38
338 0.37
339 0.35
340 0.3
341 0.3
342 0.23
343 0.2
344 0.17
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.11
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.16
364 0.19
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.19
369 0.18
370 0.17
371 0.11
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.13
396 0.14
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.14
401 0.13
402 0.13
403 0.1
404 0.1
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.14
410 0.13
411 0.16
412 0.17
413 0.18
414 0.21
415 0.26
416 0.29
417 0.23
418 0.24
419 0.21
420 0.21
421 0.21
422 0.18
423 0.13
424 0.09
425 0.09
426 0.13
427 0.14
428 0.15
429 0.15
430 0.16
431 0.23
432 0.31
433 0.37
434 0.37
435 0.41
436 0.45
437 0.5
438 0.51
439 0.53
440 0.47
441 0.41
442 0.4
443 0.35
444 0.33
445 0.27
446 0.26
447 0.18
448 0.2
449 0.2
450 0.17
451 0.22
452 0.21
453 0.21
454 0.21
455 0.22
456 0.19
457 0.22
458 0.23
459 0.18
460 0.17
461 0.19
462 0.19
463 0.2
464 0.21
465 0.19
466 0.26
467 0.32
468 0.38
469 0.41
470 0.47
471 0.48
472 0.51
473 0.52
474 0.45
475 0.39
476 0.34
477 0.3
478 0.25
479 0.19
480 0.15
481 0.12
482 0.14
483 0.16
484 0.14
485 0.12
486 0.13
487 0.13
488 0.18
489 0.22
490 0.21
491 0.19
492 0.21
493 0.2
494 0.22
495 0.22
496 0.17
497 0.13
498 0.11
499 0.1
500 0.08
501 0.07
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.08
511 0.1
512 0.11
513 0.15
514 0.18
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.16
519 0.15
520 0.14
521 0.11
522 0.09
523 0.1
524 0.09
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.11
535 0.11
536 0.14
537 0.15
538 0.14
539 0.17
540 0.16
541 0.22
542 0.21
543 0.22
544 0.21
545 0.21
546 0.21
547 0.21
548 0.24
549 0.2
550 0.19
551 0.22
552 0.2
553 0.19
554 0.2
555 0.18
556 0.2
557 0.24
558 0.24
559 0.23
560 0.3
561 0.3
562 0.29
563 0.31
564 0.28
565 0.31
566 0.37
567 0.35
568 0.3
569 0.31
570 0.3
571 0.31
572 0.32
573 0.25
574 0.18
575 0.19
576 0.19
577 0.18
578 0.19
579 0.17
580 0.18
581 0.19
582 0.19
583 0.22
584 0.22
585 0.22
586 0.23
587 0.29
588 0.29
589 0.32
590 0.32
591 0.27
592 0.28
593 0.25
594 0.23
595 0.19
596 0.16
597 0.16
598 0.21
599 0.22
600 0.24
601 0.26
602 0.28
603 0.33
604 0.37
605 0.39
606 0.38
607 0.41
608 0.37
609 0.37
610 0.37
611 0.3
612 0.25
613 0.2
614 0.16
615 0.12
616 0.11
617 0.1
618 0.08
619 0.08
620 0.13
621 0.18
622 0.2
623 0.2
624 0.2
625 0.2
626 0.3
627 0.37
628 0.33
629 0.31
630 0.34
631 0.4
632 0.48
633 0.5
634 0.46
635 0.46
636 0.5
637 0.49
638 0.46
639 0.4
640 0.31
641 0.28
642 0.24
643 0.17
644 0.13
645 0.12
646 0.12
647 0.13
648 0.13
649 0.13
650 0.12
651 0.15
652 0.14
653 0.16
654 0.2
655 0.18
656 0.2
657 0.27
658 0.3
659 0.28
660 0.33
661 0.33
662 0.29
663 0.29
664 0.27
665 0.2
666 0.17
667 0.17
668 0.13
669 0.1
670 0.08
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.07
676 0.07
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.08
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.07
686 0.12
687 0.15
688 0.15
689 0.15
690 0.17
691 0.19
692 0.25
693 0.33
694 0.3
695 0.28
696 0.3
697 0.3
698 0.28
699 0.26
700 0.21
701 0.13
702 0.12
703 0.1
704 0.08
705 0.07
706 0.06
707 0.05
708 0.06
709 0.04
710 0.04
711 0.05
712 0.04
713 0.05
714 0.05
715 0.06
716 0.05
717 0.06
718 0.08
719 0.07
720 0.09