Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FUB8

Protein Details
Accession V5FUB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-386ATEPERTRPSRGRKRHYDENSFVGHydrophilic
398-424AMYSNSESGKKRRKKDNIPRGPPMPERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-418GKKRRKKDNIPRG
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSVPVSTTSYQAGPLSPSSPAAGSFKATHPPPSIHTPQTPTSPPLMSVNYASSFTTTQASPGQATTSQTAPLSSPPSSTPMSTQLSQQPTVAATNSFPTPASSVSGHLMGTSSAEDLENAEKSGPMTDAHRSDHDRQQTGGQQKYSATVKSEGAMDVDGETGASRNEFTLSSLEKDFGPAFHLCKTFVNVCCVNAMLPLIAHTMTGPDPGWDLVSLYGLGPIAKSVARTDPVTGEKINRLRKSYEGKLKGLGLAGRNKPVKHDPGAPGGLRDLTMWPEEEWQNQKVSGKEIQVADLDSAFYKLQMKAMKMEPGTVPNHEFWEDALGHEKPMKHAGPGDSKKVSAAATPNATRQPSQPNGTPTATEPERTRPSRGRKRHYDENSFVGYGEGYADDDDDAMYSNSESGKKRRKKDNIPRGPPMPERSGSYGVGMFGIGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.17
4 0.18
5 0.17
6 0.17
7 0.17
8 0.18
9 0.17
10 0.19
11 0.21
12 0.23
13 0.29
14 0.3
15 0.34
16 0.35
17 0.37
18 0.38
19 0.44
20 0.48
21 0.46
22 0.5
23 0.49
24 0.49
25 0.52
26 0.51
27 0.45
28 0.43
29 0.38
30 0.34
31 0.34
32 0.32
33 0.27
34 0.26
35 0.26
36 0.23
37 0.23
38 0.22
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.18
43 0.14
44 0.15
45 0.17
46 0.19
47 0.17
48 0.17
49 0.19
50 0.18
51 0.21
52 0.2
53 0.18
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.16
58 0.18
59 0.2
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.22
64 0.23
65 0.23
66 0.21
67 0.24
68 0.28
69 0.27
70 0.3
71 0.33
72 0.36
73 0.36
74 0.34
75 0.28
76 0.25
77 0.25
78 0.22
79 0.15
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.08
113 0.1
114 0.15
115 0.17
116 0.19
117 0.23
118 0.28
119 0.32
120 0.38
121 0.43
122 0.4
123 0.38
124 0.4
125 0.43
126 0.44
127 0.44
128 0.38
129 0.32
130 0.31
131 0.34
132 0.31
133 0.26
134 0.21
135 0.19
136 0.19
137 0.18
138 0.19
139 0.15
140 0.13
141 0.12
142 0.1
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.15
169 0.16
170 0.15
171 0.16
172 0.19
173 0.21
174 0.21
175 0.25
176 0.22
177 0.21
178 0.21
179 0.2
180 0.17
181 0.12
182 0.11
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.05
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.15
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.2
223 0.26
224 0.33
225 0.32
226 0.33
227 0.33
228 0.38
229 0.43
230 0.46
231 0.49
232 0.46
233 0.45
234 0.44
235 0.43
236 0.38
237 0.32
238 0.26
239 0.2
240 0.23
241 0.23
242 0.27
243 0.3
244 0.29
245 0.32
246 0.35
247 0.36
248 0.32
249 0.37
250 0.34
251 0.37
252 0.4
253 0.36
254 0.31
255 0.27
256 0.24
257 0.17
258 0.15
259 0.1
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.13
265 0.13
266 0.17
267 0.2
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.24
272 0.21
273 0.24
274 0.24
275 0.21
276 0.24
277 0.23
278 0.23
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.13
283 0.12
284 0.08
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.14
291 0.17
292 0.18
293 0.21
294 0.24
295 0.29
296 0.26
297 0.28
298 0.25
299 0.26
300 0.27
301 0.25
302 0.25
303 0.21
304 0.23
305 0.21
306 0.2
307 0.16
308 0.18
309 0.16
310 0.14
311 0.18
312 0.16
313 0.16
314 0.19
315 0.19
316 0.17
317 0.23
318 0.23
319 0.2
320 0.24
321 0.29
322 0.36
323 0.4
324 0.44
325 0.39
326 0.39
327 0.38
328 0.35
329 0.3
330 0.23
331 0.23
332 0.21
333 0.25
334 0.27
335 0.3
336 0.33
337 0.34
338 0.32
339 0.32
340 0.36
341 0.37
342 0.4
343 0.42
344 0.42
345 0.46
346 0.45
347 0.43
348 0.36
349 0.38
350 0.34
351 0.32
352 0.3
353 0.33
354 0.41
355 0.43
356 0.48
357 0.49
358 0.59
359 0.67
360 0.75
361 0.77
362 0.79
363 0.84
364 0.88
365 0.88
366 0.87
367 0.8
368 0.76
369 0.7
370 0.59
371 0.5
372 0.4
373 0.3
374 0.2
375 0.16
376 0.1
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.11
390 0.16
391 0.21
392 0.3
393 0.41
394 0.49
395 0.59
396 0.68
397 0.77
398 0.83
399 0.89
400 0.91
401 0.92
402 0.92
403 0.91
404 0.85
405 0.82
406 0.78
407 0.73
408 0.68
409 0.59
410 0.56
411 0.53
412 0.52
413 0.45
414 0.4
415 0.34
416 0.28
417 0.25
418 0.2