Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FIG3

Protein Details
Accession V5FIG3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
412-439DSQRAKDKEWWSKLRRVRQALNVKAPKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-441RRVRQALNVKAPKKSK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 12.666, cyto_nucl 10.333, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYALVTKKRKFNRVLDSLSKPPSSDVAAKTTNDVPASITRTATLPSIKKVRVSGSENDPLVIRTSVTNVSRPSSSSSTAVRPNFVPWDRERFLERLETFRRVDKWSSKPSAVNEVEWAKRGWSCTDTERVSCVGGCGGSVVVKLPDELDELDGYDIEKVEERKEVRAKLVEEYTKLLSEGHGLTCPWRNKGCDATIHRLQLANPDVAISGLKARYYNLVKMESKLPARERVEIPEDFNLEGTVRILPPEFYAQKNNKGKSEVQAPDSQDQEAAKGIVSSKETAQNINRSAFALAFFGWDTVSDGTAGLAGCGACFRRLGLWMYKPKENGELTVYEKLNVVAEHMDYCPWVNKATQSGSGKKSERIEDLYNGWELLAQAIKTKHRRLVRSTGSEITKDIDTSSIDGMSQDGDSQRAKDKEWWSKLRRVRQALNVKAPKKSKPVHSSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.79
3 0.77
4 0.75
5 0.74
6 0.71
7 0.63
8 0.53
9 0.45
10 0.39
11 0.36
12 0.35
13 0.31
14 0.32
15 0.35
16 0.35
17 0.37
18 0.37
19 0.36
20 0.3
21 0.27
22 0.23
23 0.24
24 0.29
25 0.27
26 0.24
27 0.21
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.25
32 0.23
33 0.29
34 0.37
35 0.38
36 0.4
37 0.42
38 0.44
39 0.45
40 0.47
41 0.46
42 0.46
43 0.51
44 0.48
45 0.45
46 0.4
47 0.33
48 0.31
49 0.25
50 0.18
51 0.11
52 0.14
53 0.19
54 0.21
55 0.24
56 0.24
57 0.26
58 0.26
59 0.27
60 0.3
61 0.28
62 0.29
63 0.28
64 0.29
65 0.32
66 0.39
67 0.39
68 0.35
69 0.32
70 0.33
71 0.38
72 0.37
73 0.36
74 0.32
75 0.4
76 0.39
77 0.4
78 0.41
79 0.35
80 0.34
81 0.38
82 0.35
83 0.34
84 0.38
85 0.4
86 0.38
87 0.42
88 0.43
89 0.39
90 0.44
91 0.44
92 0.48
93 0.53
94 0.56
95 0.54
96 0.55
97 0.53
98 0.57
99 0.49
100 0.42
101 0.37
102 0.37
103 0.34
104 0.32
105 0.29
106 0.21
107 0.21
108 0.22
109 0.2
110 0.17
111 0.19
112 0.21
113 0.28
114 0.29
115 0.28
116 0.28
117 0.26
118 0.25
119 0.22
120 0.18
121 0.12
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.14
149 0.15
150 0.22
151 0.27
152 0.28
153 0.29
154 0.33
155 0.33
156 0.32
157 0.36
158 0.31
159 0.27
160 0.28
161 0.25
162 0.21
163 0.2
164 0.16
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.11
172 0.18
173 0.2
174 0.21
175 0.23
176 0.23
177 0.25
178 0.3
179 0.3
180 0.31
181 0.35
182 0.38
183 0.39
184 0.39
185 0.37
186 0.33
187 0.31
188 0.29
189 0.26
190 0.19
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.13
203 0.14
204 0.17
205 0.17
206 0.22
207 0.22
208 0.24
209 0.26
210 0.24
211 0.24
212 0.25
213 0.24
214 0.27
215 0.28
216 0.31
217 0.29
218 0.29
219 0.32
220 0.29
221 0.29
222 0.23
223 0.22
224 0.18
225 0.17
226 0.14
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.22
240 0.25
241 0.35
242 0.41
243 0.43
244 0.4
245 0.42
246 0.42
247 0.38
248 0.44
249 0.37
250 0.33
251 0.36
252 0.36
253 0.35
254 0.34
255 0.3
256 0.22
257 0.2
258 0.17
259 0.13
260 0.1
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.17
269 0.17
270 0.21
271 0.24
272 0.27
273 0.29
274 0.29
275 0.28
276 0.23
277 0.23
278 0.2
279 0.16
280 0.11
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.07
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.11
306 0.15
307 0.19
308 0.27
309 0.35
310 0.39
311 0.43
312 0.43
313 0.42
314 0.45
315 0.4
316 0.34
317 0.28
318 0.27
319 0.27
320 0.32
321 0.31
322 0.25
323 0.24
324 0.22
325 0.21
326 0.18
327 0.15
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.15
340 0.2
341 0.22
342 0.29
343 0.32
344 0.38
345 0.4
346 0.47
347 0.47
348 0.47
349 0.49
350 0.46
351 0.44
352 0.43
353 0.43
354 0.39
355 0.39
356 0.36
357 0.31
358 0.27
359 0.22
360 0.17
361 0.14
362 0.12
363 0.12
364 0.09
365 0.14
366 0.18
367 0.26
368 0.33
369 0.38
370 0.44
371 0.5
372 0.56
373 0.59
374 0.66
375 0.68
376 0.68
377 0.67
378 0.67
379 0.62
380 0.57
381 0.5
382 0.42
383 0.33
384 0.26
385 0.21
386 0.16
387 0.14
388 0.15
389 0.15
390 0.13
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.13
399 0.14
400 0.17
401 0.25
402 0.26
403 0.29
404 0.35
405 0.44
406 0.51
407 0.6
408 0.68
409 0.66
410 0.74
411 0.8
412 0.82
413 0.82
414 0.8
415 0.78
416 0.78
417 0.82
418 0.82
419 0.84
420 0.83
421 0.77
422 0.77
423 0.74
424 0.72
425 0.71
426 0.69
427 0.69