Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5G360

Protein Details
Accession V5G360    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-122ALKKPGDWRTRQKEERRRTNMAHydrophilic
261-281STAGKKAKGKGKRGARRDSDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-132LKKPGDWRTRQKEERRRTNMAEPRARAARHK
264-296GKKAKGKGKRGARRDSDATEGTASKKRKVGKGE
Subcellular Location(s) mito 18, cyto 6, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MADPTRSGGSRHVHFAAVPTTSPYRINNNNPPPLPRPVSRPPTGHVAGVLAPAWPFNPEETALIRAGYKPCYTPKTAAASSGSVEESGSESGASSSIPKSALKKPGDWRTRQKEERRRTNMAEPRARAARHKGQMNFAPELRLLLLAYGDPSPHPSFPSEPLPETVRVLDEIVTDFVLEMCHTAAQYATYSRRQKIKVDDFRFALRRDPNKLGRVQELLRMERELKEARKAFDQNDDQVGALKDAGKKGLENVDESVDGMSTAGKKAKGKGKRGARRDSDATEGTASKKRKVGKGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.3
4 0.25
5 0.22
6 0.21
7 0.22
8 0.23
9 0.25
10 0.25
11 0.3
12 0.37
13 0.45
14 0.51
15 0.58
16 0.65
17 0.64
18 0.67
19 0.63
20 0.63
21 0.6
22 0.52
23 0.51
24 0.52
25 0.58
26 0.58
27 0.56
28 0.51
29 0.54
30 0.53
31 0.45
32 0.35
33 0.29
34 0.24
35 0.22
36 0.19
37 0.11
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.14
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.16
53 0.18
54 0.19
55 0.18
56 0.19
57 0.24
58 0.29
59 0.31
60 0.31
61 0.34
62 0.39
63 0.38
64 0.37
65 0.33
66 0.3
67 0.27
68 0.25
69 0.2
70 0.12
71 0.12
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.09
85 0.1
86 0.15
87 0.21
88 0.3
89 0.3
90 0.36
91 0.43
92 0.52
93 0.58
94 0.61
95 0.65
96 0.65
97 0.73
98 0.76
99 0.78
100 0.78
101 0.81
102 0.85
103 0.82
104 0.78
105 0.73
106 0.74
107 0.71
108 0.69
109 0.65
110 0.55
111 0.52
112 0.5
113 0.46
114 0.4
115 0.4
116 0.39
117 0.39
118 0.44
119 0.41
120 0.42
121 0.45
122 0.46
123 0.41
124 0.32
125 0.28
126 0.22
127 0.2
128 0.16
129 0.12
130 0.08
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.16
145 0.22
146 0.2
147 0.2
148 0.21
149 0.23
150 0.22
151 0.21
152 0.19
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.08
175 0.12
176 0.2
177 0.25
178 0.28
179 0.35
180 0.37
181 0.42
182 0.49
183 0.56
184 0.59
185 0.59
186 0.6
187 0.55
188 0.59
189 0.57
190 0.48
191 0.44
192 0.41
193 0.41
194 0.43
195 0.49
196 0.49
197 0.51
198 0.54
199 0.51
200 0.46
201 0.46
202 0.4
203 0.39
204 0.37
205 0.34
206 0.31
207 0.3
208 0.28
209 0.25
210 0.29
211 0.29
212 0.27
213 0.34
214 0.36
215 0.36
216 0.41
217 0.43
218 0.4
219 0.44
220 0.45
221 0.39
222 0.39
223 0.37
224 0.3
225 0.3
226 0.29
227 0.2
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.19
233 0.16
234 0.16
235 0.19
236 0.25
237 0.23
238 0.22
239 0.23
240 0.23
241 0.22
242 0.22
243 0.19
244 0.12
245 0.11
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.1
250 0.14
251 0.17
252 0.2
253 0.28
254 0.37
255 0.44
256 0.52
257 0.59
258 0.67
259 0.73
260 0.79
261 0.82
262 0.8
263 0.79
264 0.77
265 0.71
266 0.66
267 0.58
268 0.51
269 0.44
270 0.38
271 0.35
272 0.36
273 0.35
274 0.34
275 0.38
276 0.43