Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5G6C7

Protein Details
Accession V5G6C7    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-192EEETSKTKSKRGSRKNGDKAMEDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_mito 10, mito 9.5, cyto 9.5, nucl 4, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR013934  Utp13_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08625  Utp13  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSKINVKTTFEASRTIGPIYTGGSTALDASGRLLASCVGEEALIVDLETGDRLATLEGDGELITSLAITPTASHVVLCSRSQSMRIFALSPFDESSRVIQSELLRTLKPHTSPVVTTAIDETGTLLATGGADGSIKVWDIRGGYVTHTFHGHGGVVSALSFFQVPSQEVEEETSKTKSKRGSRKNGDKAMEDADASGVSSTAGFRLASGSEDGKIRVWDLHKRKSIASLDSHVSVVRSLSYSAKENALLSASRDKTVIIWDSRTWKSRRIIPVLESVEAAGFVGDSELCFAAGENGRLRVWDCNRGSEITEEQEPASDVETIVTTQYSPGLPFIMTVHADQTLRLHSTASLSNYKPGSKLEPLRVVRRISGNDDEIIDLACVGPDRSMLALATNTESIRVISMGASEKKEGAVGDFFGADVTLLEGHDDIIICVDVDWSGHWLVTGAKDNTARLWRLDPETESYTCFAVFTGHAETLGAVSLPRGAPPVGSGAYNDPLSHPPTFLLTGSQDRTIKRWDTAKLKSKTSEPHSPKAVYTRKAHEKDINALDVNSTSTLFASASQDRTVKIWSLEDGQVVGILRGHKRGVWSVRFAPKDTPIISSESGTSTSRGLVLTGSGDKTVKIWSLADYSCLLTFEGHTNSVLKVLWLPPSELANEDDDEEKKALARNAAAQARPLVASAAADGLVKIWSPYTGELETTLDNHTDRVWALASPTPSGSRADVKPSPTSHGKRAPFSLISGAADSTVTFWTDTTSATLSAAVNANSARVEQDQQLQNYIRAGAYREAITLALQLNHPGRLLSLFSAAIDAADDPSSEEHARAEGSLTGSPDIDTVLQSLDPVNLYTLILRVRDWNTNARTSRVAQRILFALVRSYPASTFVELASNPPRIPNLKPGKGAAAMKDVLQALSAYTDRHYRRIEELVDESYLVEWVLGEMDGGVGLGGLAEPGATVNGDPTDILEHDKDVIMLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.34
3 0.29
4 0.24
5 0.23
6 0.21
7 0.19
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.09
15 0.08
16 0.09
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.06
37 0.04
38 0.05
39 0.05
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.04
56 0.05
57 0.08
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.16
63 0.19
64 0.19
65 0.2
66 0.21
67 0.22
68 0.27
69 0.28
70 0.28
71 0.28
72 0.29
73 0.28
74 0.24
75 0.29
76 0.26
77 0.26
78 0.23
79 0.21
80 0.2
81 0.2
82 0.23
83 0.21
84 0.21
85 0.19
86 0.21
87 0.23
88 0.28
89 0.32
90 0.32
91 0.28
92 0.28
93 0.33
94 0.35
95 0.34
96 0.32
97 0.31
98 0.32
99 0.32
100 0.35
101 0.35
102 0.29
103 0.28
104 0.25
105 0.22
106 0.18
107 0.17
108 0.14
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.15
131 0.21
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.2
138 0.18
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.07
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.2
160 0.21
161 0.23
162 0.24
163 0.28
164 0.34
165 0.42
166 0.51
167 0.59
168 0.67
169 0.73
170 0.83
171 0.89
172 0.89
173 0.83
174 0.74
175 0.66
176 0.59
177 0.49
178 0.37
179 0.27
180 0.19
181 0.15
182 0.13
183 0.1
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.17
204 0.19
205 0.28
206 0.35
207 0.44
208 0.48
209 0.5
210 0.5
211 0.54
212 0.54
213 0.49
214 0.45
215 0.4
216 0.36
217 0.35
218 0.34
219 0.27
220 0.22
221 0.18
222 0.14
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.13
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.14
237 0.21
238 0.21
239 0.2
240 0.2
241 0.19
242 0.18
243 0.22
244 0.24
245 0.18
246 0.2
247 0.22
248 0.28
249 0.32
250 0.39
251 0.37
252 0.39
253 0.42
254 0.47
255 0.52
256 0.52
257 0.52
258 0.48
259 0.54
260 0.49
261 0.45
262 0.37
263 0.29
264 0.22
265 0.19
266 0.16
267 0.06
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.09
279 0.1
280 0.13
281 0.13
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.2
287 0.22
288 0.29
289 0.29
290 0.31
291 0.32
292 0.33
293 0.33
294 0.28
295 0.27
296 0.2
297 0.2
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.12
335 0.15
336 0.17
337 0.2
338 0.19
339 0.23
340 0.24
341 0.25
342 0.23
343 0.22
344 0.23
345 0.24
346 0.29
347 0.3
348 0.38
349 0.41
350 0.45
351 0.48
352 0.45
353 0.41
354 0.41
355 0.37
356 0.33
357 0.33
358 0.29
359 0.25
360 0.24
361 0.21
362 0.17
363 0.15
364 0.1
365 0.07
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.05
389 0.06
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.08
432 0.12
433 0.11
434 0.14
435 0.14
436 0.15
437 0.17
438 0.19
439 0.18
440 0.14
441 0.16
442 0.16
443 0.18
444 0.19
445 0.17
446 0.18
447 0.21
448 0.2
449 0.19
450 0.18
451 0.16
452 0.14
453 0.13
454 0.09
455 0.07
456 0.06
457 0.07
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.04
466 0.03
467 0.03
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.09
484 0.11
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.1
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.1
493 0.09
494 0.12
495 0.13
496 0.16
497 0.17
498 0.17
499 0.19
500 0.22
501 0.22
502 0.21
503 0.25
504 0.27
505 0.32
506 0.4
507 0.48
508 0.47
509 0.49
510 0.48
511 0.47
512 0.48
513 0.48
514 0.5
515 0.45
516 0.47
517 0.48
518 0.47
519 0.44
520 0.47
521 0.46
522 0.41
523 0.4
524 0.43
525 0.48
526 0.5
527 0.53
528 0.49
529 0.45
530 0.46
531 0.44
532 0.39
533 0.29
534 0.26
535 0.23
536 0.18
537 0.16
538 0.1
539 0.08
540 0.06
541 0.05
542 0.06
543 0.05
544 0.06
545 0.09
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.14
550 0.14
551 0.15
552 0.15
553 0.13
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.14
558 0.14
559 0.13
560 0.12
561 0.1
562 0.11
563 0.1
564 0.09
565 0.07
566 0.09
567 0.09
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.13
572 0.19
573 0.24
574 0.24
575 0.28
576 0.33
577 0.4
578 0.41
579 0.41
580 0.38
581 0.34
582 0.35
583 0.32
584 0.28
585 0.22
586 0.24
587 0.23
588 0.21
589 0.18
590 0.15
591 0.16
592 0.14
593 0.14
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.09
598 0.09
599 0.07
600 0.06
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.08
607 0.09
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.1
613 0.13
614 0.13
615 0.14
616 0.14
617 0.14
618 0.13
619 0.13
620 0.12
621 0.09
622 0.1
623 0.11
624 0.12
625 0.11
626 0.12
627 0.12
628 0.12
629 0.13
630 0.12
631 0.09
632 0.09
633 0.1
634 0.14
635 0.14
636 0.15
637 0.15
638 0.16
639 0.17
640 0.16
641 0.16
642 0.13
643 0.13
644 0.13
645 0.14
646 0.13
647 0.15
648 0.13
649 0.12
650 0.12
651 0.14
652 0.15
653 0.15
654 0.15
655 0.18
656 0.24
657 0.28
658 0.27
659 0.25
660 0.24
661 0.23
662 0.22
663 0.18
664 0.11
665 0.08
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.06
679 0.08
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.12
684 0.14
685 0.14
686 0.14
687 0.13
688 0.11
689 0.11
690 0.11
691 0.1
692 0.1
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.08
697 0.1
698 0.13
699 0.14
700 0.14
701 0.15
702 0.15
703 0.15
704 0.16
705 0.16
706 0.19
707 0.19
708 0.26
709 0.28
710 0.3
711 0.34
712 0.34
713 0.38
714 0.42
715 0.45
716 0.46
717 0.51
718 0.52
719 0.5
720 0.52
721 0.51
722 0.42
723 0.39
724 0.34
725 0.27
726 0.24
727 0.21
728 0.18
729 0.13
730 0.12
731 0.1
732 0.08
733 0.08
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.08
738 0.09
739 0.09
740 0.1
741 0.1
742 0.1
743 0.1
744 0.12
745 0.1
746 0.12
747 0.13
748 0.11
749 0.11
750 0.11
751 0.11
752 0.1
753 0.1
754 0.1
755 0.1
756 0.13
757 0.14
758 0.22
759 0.26
760 0.27
761 0.32
762 0.32
763 0.31
764 0.29
765 0.28
766 0.21
767 0.16
768 0.18
769 0.15
770 0.16
771 0.15
772 0.15
773 0.14
774 0.14
775 0.13
776 0.13
777 0.12
778 0.11
779 0.11
780 0.15
781 0.16
782 0.16
783 0.16
784 0.14
785 0.13
786 0.13
787 0.15
788 0.11
789 0.12
790 0.11
791 0.11
792 0.11
793 0.11
794 0.09
795 0.08
796 0.07
797 0.06
798 0.06
799 0.06
800 0.07
801 0.08
802 0.12
803 0.12
804 0.12
805 0.11
806 0.12
807 0.12
808 0.11
809 0.12
810 0.11
811 0.12
812 0.14
813 0.15
814 0.14
815 0.14
816 0.14
817 0.13
818 0.12
819 0.1
820 0.08
821 0.08
822 0.08
823 0.08
824 0.08
825 0.09
826 0.09
827 0.09
828 0.09
829 0.09
830 0.09
831 0.09
832 0.09
833 0.11
834 0.12
835 0.12
836 0.13
837 0.18
838 0.2
839 0.27
840 0.3
841 0.36
842 0.38
843 0.46
844 0.47
845 0.45
846 0.45
847 0.43
848 0.49
849 0.47
850 0.49
851 0.41
852 0.41
853 0.4
854 0.4
855 0.37
856 0.28
857 0.24
858 0.19
859 0.21
860 0.19
861 0.18
862 0.15
863 0.18
864 0.2
865 0.18
866 0.18
867 0.16
868 0.18
869 0.17
870 0.22
871 0.23
872 0.24
873 0.23
874 0.24
875 0.28
876 0.28
877 0.31
878 0.37
879 0.42
880 0.45
881 0.49
882 0.49
883 0.49
884 0.52
885 0.51
886 0.44
887 0.39
888 0.33
889 0.31
890 0.32
891 0.28
892 0.22
893 0.19
894 0.16
895 0.1
896 0.13
897 0.13
898 0.11
899 0.12
900 0.21
901 0.23
902 0.3
903 0.33
904 0.33
905 0.37
906 0.43
907 0.44
908 0.41
909 0.42
910 0.38
911 0.35
912 0.32
913 0.27
914 0.2
915 0.18
916 0.12
917 0.09
918 0.06
919 0.05
920 0.06
921 0.05
922 0.05
923 0.04
924 0.04
925 0.04
926 0.04
927 0.04
928 0.03
929 0.03
930 0.03
931 0.03
932 0.02
933 0.02
934 0.02
935 0.03
936 0.03
937 0.04
938 0.04
939 0.04
940 0.06
941 0.07
942 0.08
943 0.08
944 0.09
945 0.11
946 0.12
947 0.16
948 0.15
949 0.16
950 0.17
951 0.18
952 0.16