FuNGI

V5FG21

Protein Details

Accession

V5FG21

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAQ	Hydrophilic
406-436	DAIFRRRRQTEERRHRNQQRRKEEDRMRNDE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-456	RRRRQTEERRHRNQQRRKEEDRMRNDERARKRRRSSPTYDSPGKSRK

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 8, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSSKYPKIISPVIEELPYEVGDEVIPVDATGPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEQEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAREADEKKEEFRKLQARQNGNKQDMELEEEVIKKTWDSNVITPGTPFMDILSASLRYWIAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRSSPEHDPNTRHVMYGLDADLIMLGLATHEPYFRVLREDVFFQESKGRNCHLCGQPGHKAAECRGQAKEKNGEFDEKGKGTPLKPFIWLHVSILREYLAAEMYVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPIMGGYLTKDGHVDLKKAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERRHRNQQRRKEEDRMRNDERARKRRRSSPTYDSPGKSRKGGPDAGPPADLPLITPGRGHLSKENRELTHNMVVNRGAIYKANMANKSAAAALKSQLLKGPTAEAGEDEATPAADNEDPSNAEEEQTSPSVLGKRKVDMVEDENVEPGTPGRDTPIVDNTPKDEDELPPDSVRLWEEGYADRYYEQKFGVDPKDHEFRHKVARAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGDMEINFDKGSPFRPFEQLMGVLPASSNHALPEVFHDLMSDPSSEIIDFYPEDFPVDLNGKKFAWQGVVLLPFIDEKRLLAAMEKKYPLLSEDERARNTMGREVLLISDRHPLYKELVSNLYSKKQNESQFKLNMRVSEGLAGKVERSEAYIPHSSLVSPLEDNGLPSLDEDHSMTVNYEIPKSSHVHKSMLLRGVKLPSPVLDRAEIEVVRSKAAHSGRQYGGAPLRNGNGGGRGGRINYANDRPNPFAAHINPGFVPPPNMGAPMPPSGWAPPAPGTMGYSQGPPPPPRGGYNDSYRPSYPGGPQQSGGQQGGYYGQGNYYNQSSYGQQGYNQGHYGQGGHQGQNYGSGRNDRRDGGYGGGYRDQRGGRDGYGSRRNDGYGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.49
4	0.51
5	0.47
6	0.46
7	0.44
8	0.41
9	0.37
10	0.35
11	0.3
12	0.27
13	0.23
14	0.18
15	0.12
16	0.1
17	0.09
18	0.1
19	0.08
20	0.07
21	0.07
22	0.06
23	0.07
24	0.08
25	0.1
26	0.14
27	0.15
28	0.15
29	0.16
30	0.17
31	0.17
32	0.17
33	0.18
34	0.17
35	0.18
36	0.17
37	0.17
38	0.16
39	0.15
40	0.14
41	0.12
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.36
54	0.44
55	0.5
56	0.5
57	0.54
58	0.57
59	0.6
60	0.52
61	0.46
62	0.39
63	0.34
64	0.32
65	0.24
66	0.18
67	0.14
68	0.14
69	0.12
70	0.12
71	0.11
72	0.14
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.46
80	0.45
81	0.46
82	0.45
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.36
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.8
105	0.77
106	0.73
107	0.75
108	0.74
109	0.68
110	0.69
111	0.62
112	0.57
113	0.61
114	0.56
115	0.47
116	0.46
117	0.42
118	0.38
119	0.43
120	0.44
121	0.38
122	0.45
123	0.53
124	0.51
125	0.59
126	0.62
127	0.64
128	0.7
129	0.78
130	0.78
131	0.73
132	0.67
133	0.59
134	0.54
135	0.45
136	0.42
137	0.32
138	0.25
139	0.22
140	0.23
141	0.23
142	0.2
143	0.19
144	0.13
145	0.14
146	0.16
147	0.2
148	0.22
149	0.25
150	0.31
151	0.33
152	0.33
153	0.31
154	0.3
155	0.25
156	0.21
157	0.17
158	0.11
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.11
163	0.11
164	0.1
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.12
169	0.14
170	0.15
171	0.16
172	0.19
173	0.22
174	0.29
175	0.28
176	0.31
177	0.3
178	0.32
179	0.36
180	0.33
181	0.29
182	0.26
183	0.32
184	0.28
185	0.29
186	0.26
187	0.21
188	0.24
189	0.24
190	0.21
191	0.16
192	0.15
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.13
203	0.17
204	0.25
205	0.27
206	0.27
207	0.31
208	0.35
209	0.4
210	0.44
211	0.5
212	0.48
213	0.53
214	0.57
215	0.56
216	0.6
217	0.53
218	0.47
219	0.37
220	0.31
221	0.25
222	0.24
223	0.19
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.06
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.04
236	0.05
237	0.06
238	0.08
239	0.1
240	0.11
241	0.15
242	0.15
243	0.17
244	0.19
245	0.21
246	0.21
247	0.24
248	0.23
249	0.2
250	0.27
251	0.29
252	0.3
253	0.32
254	0.33
255	0.3
256	0.32
257	0.4
258	0.37
259	0.4
260	0.4
261	0.42
262	0.47
263	0.49
264	0.49
265	0.43
266	0.4
267	0.35
268	0.4
269	0.36
270	0.31
271	0.31
272	0.36
273	0.37
274	0.42
275	0.48
276	0.41
277	0.45
278	0.44
279	0.44
280	0.38
281	0.39
282	0.38
283	0.3
284	0.29
285	0.27
286	0.28
287	0.25
288	0.3
289	0.31
290	0.27
291	0.3
292	0.31
293	0.3
294	0.32
295	0.31
296	0.27
297	0.26
298	0.25
299	0.21
300	0.21
301	0.18
302	0.13
303	0.13
304	0.11
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.08
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.13
315	0.14
316	0.16
317	0.16
318	0.13
319	0.15
320	0.16
321	0.17
322	0.17
323	0.17
324	0.13
325	0.11
326	0.11
327	0.1
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.08
344	0.12
345	0.15
346	0.16
347	0.15
348	0.16
349	0.16
350	0.15
351	0.15
352	0.1
353	0.06
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.13
375	0.14
376	0.15
377	0.15
378	0.2
379	0.21
380	0.21
381	0.21
382	0.19
383	0.18
384	0.18
385	0.19
386	0.17
387	0.16
388	0.17
389	0.16
390	0.13
391	0.12
392	0.15
393	0.14
394	0.2
395	0.26
396	0.29
397	0.37
398	0.4
399	0.44
400	0.5
401	0.59
402	0.62
403	0.67
404	0.75
405	0.75
406	0.83
407	0.88
408	0.89
409	0.87
410	0.87
411	0.86
412	0.84
413	0.83
414	0.83
415	0.82
416	0.81
417	0.81
418	0.79
419	0.72
420	0.7
421	0.69
422	0.67
423	0.68
424	0.68
425	0.68
426	0.69
427	0.71
428	0.73
429	0.77
430	0.77
431	0.74
432	0.73
433	0.73
434	0.72
435	0.72
436	0.64
437	0.61
438	0.59
439	0.52
440	0.46
441	0.4
442	0.37
443	0.35
444	0.38
445	0.34
446	0.37
447	0.38
448	0.36
449	0.33
450	0.28
451	0.24
452	0.21
453	0.18
454	0.1
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.14
461	0.15
462	0.16
463	0.18
464	0.25
465	0.3
466	0.36
467	0.4
468	0.36
469	0.38
470	0.38
471	0.35
472	0.34
473	0.32
474	0.26
475	0.23
476	0.22
477	0.2
478	0.19
479	0.15
480	0.1
481	0.08
482	0.08
483	0.11
484	0.14
485	0.18
486	0.18
487	0.18
488	0.19
489	0.18
490	0.18
491	0.15
492	0.12
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.12
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.13
501	0.13
502	0.12
503	0.13
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.07
508	0.07
509	0.08
510	0.07
511	0.06
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.04
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.09
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.09
530	0.09
531	0.07
532	0.09
533	0.13
534	0.15
535	0.18
536	0.18
537	0.18
538	0.22
539	0.22
540	0.22
541	0.2
542	0.21
543	0.2
544	0.2
545	0.2
546	0.16
547	0.16
548	0.14
549	0.12
550	0.09
551	0.07
552	0.05
553	0.05
554	0.06
555	0.08
556	0.09
557	0.11
558	0.16
559	0.17
560	0.18
561	0.19
562	0.19
563	0.2
564	0.19
565	0.19
566	0.15
567	0.13
568	0.17
569	0.2
570	0.19
571	0.17
572	0.17
573	0.16
574	0.15
575	0.15
576	0.11
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.11
581	0.14
582	0.13
583	0.13
584	0.12
585	0.14
586	0.14
587	0.14
588	0.13
589	0.11
590	0.12
591	0.16
592	0.21
593	0.21
594	0.22
595	0.25
596	0.32
597	0.32
598	0.35
599	0.34
600	0.32
601	0.38
602	0.4
603	0.37
604	0.33
605	0.36
606	0.33
607	0.33
608	0.3
609	0.21
610	0.17
611	0.15
612	0.12
613	0.09
614	0.07
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.06
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.08
623	0.09
624	0.14
625	0.17
626	0.16
627	0.19
628	0.2
629	0.25
630	0.28
631	0.3
632	0.28
633	0.24
634	0.24
635	0.21
636	0.2
637	0.15
638	0.12
639	0.09
640	0.07
641	0.07
642	0.07
643	0.06
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.05
651	0.05
652	0.06
653	0.06
654	0.1
655	0.13
656	0.15
657	0.17
658	0.2
659	0.21
660	0.22
661	0.23
662	0.21
663	0.17
664	0.17
665	0.15
666	0.11
667	0.1
668	0.09
669	0.1
670	0.1
671	0.09
672	0.08
673	0.09
674	0.09
675	0.09
676	0.14
677	0.15
678	0.15
679	0.14
680	0.15
681	0.14
682	0.16
683	0.16
684	0.12
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.08
689	0.08
690	0.06
691	0.07
692	0.07
693	0.08
694	0.09
695	0.09
696	0.1
697	0.09
698	0.09
699	0.1
700	0.13
701	0.14
702	0.13
703	0.16
704	0.15
705	0.17
706	0.18
707	0.16
708	0.15
709	0.14
710	0.14
711	0.16
712	0.17
713	0.15
714	0.14
715	0.13
716	0.12
717	0.12
718	0.12
719	0.08
720	0.07
721	0.09
722	0.09
723	0.09
724	0.12
725	0.19
726	0.22
727	0.27
728	0.28
729	0.27
730	0.26
731	0.27
732	0.24
733	0.23
734	0.21
735	0.22
736	0.29
737	0.34
738	0.35
739	0.36
740	0.35
741	0.32
742	0.31
743	0.3
744	0.23
745	0.18
746	0.18
747	0.17
748	0.17
749	0.17
750	0.16
751	0.13
752	0.19
753	0.19
754	0.19
755	0.2
756	0.2
757	0.21
758	0.24
759	0.25
760	0.21
761	0.24
762	0.25
763	0.28
764	0.29
765	0.32
766	0.33
767	0.32
768	0.35
769	0.39
770	0.45
771	0.5
772	0.54
773	0.55
774	0.58
775	0.6
776	0.62
777	0.57
778	0.5
779	0.44
780	0.4
781	0.33
782	0.3
783	0.28
784	0.21
785	0.21
786	0.19
787	0.16
788	0.14
789	0.15
790	0.09
791	0.11
792	0.12
793	0.12
794	0.17
795	0.21
796	0.21
797	0.21
798	0.21
799	0.18
800	0.18
801	0.18
802	0.14
803	0.11
804	0.11
805	0.13
806	0.13
807	0.13
808	0.12
809	0.12
810	0.1
811	0.1
812	0.12
813	0.09
814	0.1
815	0.1
816	0.11
817	0.11
818	0.11
819	0.11
820	0.1
821	0.13
822	0.13
823	0.14
824	0.14
825	0.14
826	0.17
827	0.19
828	0.24
829	0.28
830	0.3
831	0.31
832	0.34
833	0.4
834	0.44
835	0.48
836	0.45
837	0.38
838	0.39
839	0.4
840	0.39
841	0.34
842	0.28
843	0.23
844	0.27
845	0.28
846	0.26
847	0.24
848	0.23
849	0.24
850	0.27
851	0.24
852	0.21
853	0.25
854	0.23
855	0.22
856	0.21
857	0.19
858	0.22
859	0.25
860	0.29
861	0.27
862	0.34
863	0.34
864	0.38
865	0.38
866	0.37
867	0.4
868	0.39
869	0.37
870	0.31
871	0.32
872	0.29
873	0.29
874	0.24
875	0.21
876	0.18
877	0.17
878	0.17
879	0.17
880	0.17
881	0.19
882	0.2
883	0.21
884	0.25
885	0.31
886	0.36
887	0.4
888	0.44
889	0.45
890	0.45
891	0.44
892	0.4
893	0.39
894	0.34
895	0.38
896	0.33
897	0.32
898	0.3
899	0.29
900	0.28
901	0.23
902	0.23
903	0.15
904	0.18
905	0.17
906	0.19
907	0.17
908	0.18
909	0.2
910	0.21
911	0.2
912	0.18
913	0.18
914	0.18
915	0.2
916	0.19
917	0.19
918	0.18
919	0.19
920	0.19
921	0.18
922	0.2
923	0.18
924	0.21
925	0.19
926	0.19
927	0.2
928	0.24
929	0.29
930	0.29
931	0.33
932	0.35
933	0.37
934	0.38
935	0.43
936	0.44
937	0.44
938	0.51
939	0.55
940	0.52
941	0.54
942	0.51
943	0.47
944	0.44
945	0.41
946	0.38
947	0.39
948	0.43
949	0.41
950	0.41
951	0.42
952	0.43
953	0.44
954	0.39
955	0.3
956	0.22
957	0.21
958	0.21
959	0.19
960	0.16
961	0.11
962	0.13
963	0.16
964	0.17
965	0.19
966	0.2
967	0.19
968	0.18
969	0.2
970	0.19
971	0.2
972	0.24
973	0.22
974	0.22
975	0.3
976	0.33
977	0.35
978	0.35
979	0.31
980	0.27
981	0.27
982	0.27
983	0.2
984	0.25
985	0.26
986	0.26
987	0.28
988	0.28
989	0.28
990	0.35
991	0.34
992	0.28
993	0.27
994	0.35
995	0.38
996	0.43
997	0.47
998	0.41
999	0.44
1000	0.46
1001	0.44
1002	0.39
1003	0.4
1004	0.36
1005	0.36
1006	0.4
1007	0.37
1008	0.34
1009	0.38
1010	0.36
1011	0.31
1012	0.32
1013	0.32
1014	0.27
1015	0.33
1016	0.35
1017	0.39
1018	0.46
1019	0.47
1020	0.46
1021	0.45
1022	0.46

V5FG21

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer