Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5I387

Protein Details
Accession V5I387    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-249ILERRDGEKRKRLDRLEKAIERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-245RRDGEKRKRLDRLEK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040351  RAB3IL/RAB3IP/Sec2  
IPR009449  Sec2_N  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF06428  Sec2p  
Amino Acid Sequences MSTTATTTTKTTLVGALPPMTGTVVVASGVHCPHCGQDVPVSTEQSNEEARRRIQELESQVKFLTARQAQTAEKLADYEDEINVLRSQTPAYSQKNSSISSTSSAPAAVLGPPSVAGTTSTLASSAPEPLPAQPQTSRLSSFTSFLPYRRNIATSAGPNTASSNHTHSNSELQDALSREQNLRKAAESRLSQANSELEDLTAQLFSQANEMVAEERKARAKLEERVEILERRDGEKRKRLDRLEKAIERVERVRGLVGMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.13
8 0.12
9 0.09
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.16
22 0.16
23 0.15
24 0.2
25 0.23
26 0.29
27 0.31
28 0.33
29 0.3
30 0.3
31 0.3
32 0.26
33 0.27
34 0.24
35 0.26
36 0.28
37 0.3
38 0.33
39 0.34
40 0.34
41 0.31
42 0.35
43 0.38
44 0.43
45 0.42
46 0.39
47 0.36
48 0.34
49 0.32
50 0.26
51 0.27
52 0.21
53 0.21
54 0.22
55 0.25
56 0.24
57 0.27
58 0.3
59 0.22
60 0.19
61 0.18
62 0.16
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.08
76 0.12
77 0.19
78 0.23
79 0.26
80 0.27
81 0.32
82 0.35
83 0.36
84 0.33
85 0.27
86 0.24
87 0.22
88 0.22
89 0.17
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.12
118 0.12
119 0.14
120 0.13
121 0.16
122 0.18
123 0.19
124 0.19
125 0.17
126 0.19
127 0.18
128 0.19
129 0.16
130 0.19
131 0.18
132 0.18
133 0.23
134 0.2
135 0.23
136 0.22
137 0.23
138 0.19
139 0.21
140 0.23
141 0.21
142 0.23
143 0.21
144 0.21
145 0.2
146 0.2
147 0.18
148 0.16
149 0.14
150 0.16
151 0.18
152 0.19
153 0.2
154 0.2
155 0.24
156 0.23
157 0.23
158 0.19
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.22
167 0.26
168 0.25
169 0.25
170 0.26
171 0.25
172 0.27
173 0.32
174 0.3
175 0.29
176 0.34
177 0.33
178 0.31
179 0.3
180 0.29
181 0.23
182 0.23
183 0.19
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.08
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.2
204 0.21
205 0.22
206 0.27
207 0.32
208 0.39
209 0.45
210 0.48
211 0.45
212 0.48
213 0.51
214 0.47
215 0.42
216 0.39
217 0.34
218 0.31
219 0.37
220 0.41
221 0.47
222 0.53
223 0.59
224 0.63
225 0.7
226 0.76
227 0.79
228 0.8
229 0.81
230 0.83
231 0.8
232 0.75
233 0.73
234 0.67
235 0.61
236 0.54
237 0.5
238 0.41
239 0.37
240 0.35