Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FC30

Protein Details
Accession V5FC30    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-57VEERPVKKQRGRPRSSGHGTTBasic
81-102RAKPAAKGRPRAKKAPEPQPAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-67VKKQRGRPRSSGHGTTETKKGPTKHR
80-96ARAKPAAKGRPRAKKAP
136-154GRGKKTGRPAGTRGRKKTV
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
Amino Acid Sequences MPPKRKAVQLSGLVDSDDDDVMQMDAIEGATHSNSEVEERPVKKQRGRPRSSGHGTTETKKGPTKHRAGSVAPTQETTTARAKPAAKGRPRAKKAPEPQPAHEVESEIETGNDDSLEMDPRRDVSNDELDSPKNVGRGKKTGRPAGTRGRKKTVPEKQVSKDGEFEYTPKGSRSLKAADKAGTGAKRTAGTRQRPEVDENAVATESQEQEIDETMLSPENSVLQSRQVSPSKFRNAGKTGQRVLQESLSRWNSSRIAETEKVVGDPELKRRLSDMTKRYESLESRFRTLRDIGVVEANENMEKLKKQCETTTEASSKLIASLKEELAAQKALSQQTRTIQKTLKDRETHVGDLESRVDELTSELSSAQNEIKTLQTKLTAARNTVANVESITSKAPGSAVKNTPANRTMMAANAEAVQAAQIAQLKEDLYSDLTGLIIRDVKKRETDDVYDCIQTGANGTLHFKLVVAHEPESKTTSSLESAEFHYMPLLDENRDRDLVEILPDYLTVDITFSRQQAAKFYTRVMDSLTKRRAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.32
3 0.24
4 0.16
5 0.11
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.07
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.11
23 0.14
24 0.18
25 0.26
26 0.29
27 0.37
28 0.47
29 0.54
30 0.59
31 0.66
32 0.71
33 0.74
34 0.79
35 0.79
36 0.78
37 0.8
38 0.8
39 0.77
40 0.72
41 0.7
42 0.68
43 0.62
44 0.62
45 0.55
46 0.51
47 0.5
48 0.51
49 0.52
50 0.57
51 0.62
52 0.61
53 0.65
54 0.66
55 0.63
56 0.64
57 0.62
58 0.58
59 0.5
60 0.45
61 0.38
62 0.37
63 0.35
64 0.32
65 0.3
66 0.26
67 0.27
68 0.31
69 0.33
70 0.36
71 0.44
72 0.5
73 0.52
74 0.59
75 0.67
76 0.72
77 0.77
78 0.79
79 0.78
80 0.79
81 0.81
82 0.81
83 0.82
84 0.77
85 0.74
86 0.73
87 0.67
88 0.6
89 0.51
90 0.41
91 0.31
92 0.27
93 0.24
94 0.16
95 0.14
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.13
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.25
113 0.26
114 0.28
115 0.29
116 0.28
117 0.28
118 0.28
119 0.25
120 0.21
121 0.23
122 0.25
123 0.29
124 0.37
125 0.42
126 0.47
127 0.54
128 0.57
129 0.6
130 0.6
131 0.61
132 0.63
133 0.67
134 0.69
135 0.68
136 0.67
137 0.65
138 0.66
139 0.7
140 0.69
141 0.68
142 0.67
143 0.69
144 0.66
145 0.71
146 0.68
147 0.59
148 0.54
149 0.45
150 0.39
151 0.31
152 0.29
153 0.24
154 0.22
155 0.21
156 0.18
157 0.2
158 0.2
159 0.21
160 0.24
161 0.27
162 0.3
163 0.33
164 0.35
165 0.33
166 0.31
167 0.31
168 0.31
169 0.26
170 0.23
171 0.2
172 0.19
173 0.2
174 0.2
175 0.27
176 0.31
177 0.37
178 0.42
179 0.47
180 0.49
181 0.49
182 0.51
183 0.46
184 0.41
185 0.34
186 0.28
187 0.22
188 0.18
189 0.16
190 0.13
191 0.12
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.11
212 0.13
213 0.19
214 0.22
215 0.23
216 0.27
217 0.34
218 0.38
219 0.42
220 0.42
221 0.43
222 0.42
223 0.48
224 0.5
225 0.49
226 0.45
227 0.43
228 0.43
229 0.38
230 0.36
231 0.33
232 0.27
233 0.22
234 0.27
235 0.25
236 0.24
237 0.22
238 0.24
239 0.22
240 0.21
241 0.23
242 0.18
243 0.21
244 0.22
245 0.22
246 0.21
247 0.19
248 0.18
249 0.16
250 0.14
251 0.11
252 0.12
253 0.18
254 0.22
255 0.22
256 0.22
257 0.22
258 0.27
259 0.29
260 0.36
261 0.36
262 0.37
263 0.39
264 0.4
265 0.41
266 0.41
267 0.37
268 0.33
269 0.35
270 0.29
271 0.3
272 0.31
273 0.29
274 0.29
275 0.28
276 0.24
277 0.18
278 0.17
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.08
290 0.09
291 0.15
292 0.17
293 0.2
294 0.22
295 0.25
296 0.3
297 0.32
298 0.37
299 0.33
300 0.31
301 0.29
302 0.27
303 0.23
304 0.19
305 0.17
306 0.11
307 0.12
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.11
316 0.1
317 0.14
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.18
322 0.24
323 0.33
324 0.32
325 0.33
326 0.34
327 0.37
328 0.46
329 0.51
330 0.53
331 0.47
332 0.48
333 0.51
334 0.52
335 0.48
336 0.39
337 0.34
338 0.27
339 0.25
340 0.23
341 0.16
342 0.12
343 0.1
344 0.09
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.13
359 0.16
360 0.16
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.21
365 0.27
366 0.26
367 0.25
368 0.26
369 0.27
370 0.26
371 0.27
372 0.23
373 0.16
374 0.14
375 0.13
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.09
383 0.12
384 0.15
385 0.22
386 0.24
387 0.28
388 0.34
389 0.35
390 0.39
391 0.38
392 0.36
393 0.29
394 0.28
395 0.24
396 0.22
397 0.22
398 0.17
399 0.15
400 0.14
401 0.14
402 0.11
403 0.1
404 0.07
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.11
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.08
421 0.09
422 0.08
423 0.09
424 0.11
425 0.13
426 0.19
427 0.23
428 0.26
429 0.31
430 0.34
431 0.39
432 0.4
433 0.43
434 0.42
435 0.42
436 0.42
437 0.37
438 0.34
439 0.28
440 0.23
441 0.17
442 0.14
443 0.14
444 0.12
445 0.12
446 0.15
447 0.15
448 0.16
449 0.16
450 0.14
451 0.13
452 0.14
453 0.2
454 0.22
455 0.23
456 0.27
457 0.29
458 0.3
459 0.31
460 0.3
461 0.24
462 0.22
463 0.21
464 0.19
465 0.19
466 0.19
467 0.18
468 0.21
469 0.25
470 0.23
471 0.21
472 0.2
473 0.18
474 0.17
475 0.21
476 0.2
477 0.18
478 0.22
479 0.26
480 0.28
481 0.29
482 0.28
483 0.24
484 0.24
485 0.22
486 0.21
487 0.19
488 0.16
489 0.15
490 0.15
491 0.14
492 0.12
493 0.12
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.11
498 0.14
499 0.14
500 0.19
501 0.21
502 0.22
503 0.28
504 0.34
505 0.37
506 0.36
507 0.38
508 0.38
509 0.37
510 0.37
511 0.35
512 0.38
513 0.38
514 0.47