Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2B4V3

Protein Details
Accession B2B4V3    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-209EFNRGKYRDRDDRPRRRRRESRSEERNTFBasic
240-265SADFRRERRVRSRSRERPNRNKELFPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-202RRRRGEFNRGKYRDRDDRPRRRRRESR
243-271FRRERRVRSRSRERPNRNKELFPERRRPA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
KEGG pan:PODANSg8045  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDLDIEMDVDDVQEVPQHIPEAYTHDIITGEEQEPGEVDDIPDEQNGSSAESVRVPNKVHIRGLDTFTPNDVKGYLSEHYGMMEFERVEWINDSSANYIFKSESAAQNALLSLAAVEIADLSQLSPLEMLPAKNFSQKPESNLLVRFAVAGDRKVQGAAAYSRFYLINPEYDPEERRRRGEFNRGKYRDRDDRPRRRRRESRSEERNTFDVNLYDDDPKALSNRVTTSPRPRYRSRSVNSADFRRERRVRSRSRERPNRNKELFPERRRPAVGLRDRSASPVRDGDGDAQMDLEEDARAVAVQRSRERGRELRERLSRDTKDKELFPSKVTAKKELFPEKAGLAVGSKAQMDQVTNSSTILATASLADRITTRPTASGGEGGLNIRGMAGKQGTGQGIAIKGTGAKVKELFPGKFGSGGNAGKELFAEKLEGRGRRRQRAEDSWN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.12
4 0.14
5 0.13
6 0.14
7 0.15
8 0.19
9 0.21
10 0.22
11 0.2
12 0.19
13 0.2
14 0.19
15 0.21
16 0.18
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.14
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.14
38 0.16
39 0.2
40 0.21
41 0.24
42 0.24
43 0.31
44 0.38
45 0.41
46 0.41
47 0.4
48 0.43
49 0.43
50 0.46
51 0.45
52 0.4
53 0.36
54 0.35
55 0.36
56 0.3
57 0.27
58 0.22
59 0.16
60 0.14
61 0.17
62 0.15
63 0.14
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.11
70 0.13
71 0.1
72 0.09
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.15
80 0.16
81 0.14
82 0.16
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.16
89 0.18
90 0.2
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.22
95 0.22
96 0.17
97 0.14
98 0.1
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.14
119 0.15
120 0.22
121 0.23
122 0.24
123 0.31
124 0.32
125 0.36
126 0.38
127 0.4
128 0.36
129 0.37
130 0.35
131 0.27
132 0.25
133 0.2
134 0.14
135 0.16
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.16
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.18
159 0.21
160 0.24
161 0.32
162 0.32
163 0.35
164 0.37
165 0.41
166 0.44
167 0.53
168 0.54
169 0.55
170 0.64
171 0.65
172 0.65
173 0.64
174 0.66
175 0.64
176 0.62
177 0.64
178 0.63
179 0.71
180 0.78
181 0.85
182 0.86
183 0.86
184 0.89
185 0.87
186 0.88
187 0.86
188 0.86
189 0.86
190 0.85
191 0.78
192 0.72
193 0.64
194 0.53
195 0.45
196 0.35
197 0.25
198 0.18
199 0.16
200 0.14
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.11
211 0.14
212 0.18
213 0.21
214 0.3
215 0.39
216 0.45
217 0.5
218 0.53
219 0.57
220 0.61
221 0.67
222 0.6
223 0.59
224 0.56
225 0.59
226 0.58
227 0.55
228 0.53
229 0.48
230 0.48
231 0.48
232 0.49
233 0.47
234 0.52
235 0.57
236 0.61
237 0.67
238 0.75
239 0.76
240 0.82
241 0.88
242 0.88
243 0.9
244 0.89
245 0.9
246 0.83
247 0.76
248 0.7
249 0.71
250 0.71
251 0.66
252 0.67
253 0.59
254 0.59
255 0.57
256 0.53
257 0.48
258 0.48
259 0.5
260 0.46
261 0.45
262 0.44
263 0.43
264 0.45
265 0.43
266 0.34
267 0.27
268 0.23
269 0.22
270 0.2
271 0.21
272 0.19
273 0.18
274 0.17
275 0.14
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.07
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.07
288 0.09
289 0.14
290 0.18
291 0.25
292 0.27
293 0.31
294 0.36
295 0.4
296 0.45
297 0.5
298 0.53
299 0.55
300 0.6
301 0.62
302 0.62
303 0.66
304 0.63
305 0.6
306 0.59
307 0.57
308 0.54
309 0.51
310 0.52
311 0.51
312 0.48
313 0.42
314 0.44
315 0.42
316 0.44
317 0.45
318 0.45
319 0.4
320 0.43
321 0.49
322 0.51
323 0.49
324 0.45
325 0.44
326 0.37
327 0.35
328 0.31
329 0.23
330 0.15
331 0.13
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.14
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.14
345 0.13
346 0.12
347 0.1
348 0.08
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.11
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.16
361 0.17
362 0.19
363 0.2
364 0.19
365 0.16
366 0.15
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.12
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.15
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.13
387 0.1
388 0.1
389 0.12
390 0.15
391 0.14
392 0.16
393 0.18
394 0.2
395 0.27
396 0.33
397 0.32
398 0.3
399 0.34
400 0.31
401 0.33
402 0.31
403 0.27
404 0.27
405 0.29
406 0.28
407 0.27
408 0.26
409 0.22
410 0.22
411 0.2
412 0.15
413 0.13
414 0.15
415 0.12
416 0.2
417 0.27
418 0.33
419 0.37
420 0.46
421 0.55
422 0.63
423 0.7
424 0.71
425 0.74