Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5F733

Protein Details
Accession V5F733    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-57PPSGIKNKVVLPKKKRKRNTTIAEPDINEHydrophilic
423-457DHLVKRTGKRKGARESAPKAKKSKARGKDDDDESEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-46VLPKKKRKR
427-450KRTGKRKGARESAPKAKKSKARGK
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_mito 12.5, cyto 10, nucl 1, extr 1, pero 1, E.R. 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MERRITRSAAAKEAAQLAAATAASIQAAPPSGIKNKVVLPKKKRKRNTTIAEPDINELPHNLGRALVPAANDTPGSSSATTVKAEETKPVVAKSKIDVIKDELQDTVDKATTTLGAKAQGGKAKINNPYGLTPGVSPFPEWSHPTPEECEEVNKLLSSVHGEVIAPAAIPEPSLTVTGCGEVPSVLDALIRTLLSGATTGNNSAMAFQGLVQKFGILQDGVGKGSVDWDAVRQAPVKDIFEAIKSGGLAELKSKRIKDILNMVYKENMQRRDALLKAKKEGTAEPPGANNENDLQKQIEIDRANEHVLSLNHVHSLSNEDAMLELVKYPGIGPKTAACVILFCLQRPCFAVDTHIFRITKWLGWIPSEKVDEVKAFSHLEVRIPDHLKYSLHQLFIRHGKSCPRCRAITGENSDGWEEGCVIDHLVKRTGKRKGARESAPKAKKSKARGKDDDDESE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.25
3 0.21
4 0.15
5 0.14
6 0.13
7 0.1
8 0.06
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.08
16 0.1
17 0.14
18 0.19
19 0.23
20 0.24
21 0.26
22 0.32
23 0.4
24 0.49
25 0.54
26 0.6
27 0.68
28 0.77
29 0.85
30 0.88
31 0.9
32 0.91
33 0.91
34 0.91
35 0.9
36 0.9
37 0.86
38 0.81
39 0.72
40 0.64
41 0.56
42 0.46
43 0.36
44 0.26
45 0.23
46 0.19
47 0.19
48 0.16
49 0.14
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.14
54 0.13
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.15
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.17
67 0.18
68 0.16
69 0.18
70 0.2
71 0.2
72 0.23
73 0.23
74 0.25
75 0.27
76 0.29
77 0.32
78 0.29
79 0.31
80 0.29
81 0.35
82 0.34
83 0.33
84 0.33
85 0.33
86 0.39
87 0.38
88 0.36
89 0.28
90 0.25
91 0.25
92 0.24
93 0.2
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.17
105 0.2
106 0.21
107 0.22
108 0.24
109 0.27
110 0.31
111 0.36
112 0.37
113 0.36
114 0.34
115 0.33
116 0.32
117 0.29
118 0.23
119 0.17
120 0.15
121 0.15
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.14
126 0.16
127 0.2
128 0.21
129 0.25
130 0.27
131 0.28
132 0.29
133 0.29
134 0.28
135 0.24
136 0.24
137 0.2
138 0.2
139 0.18
140 0.15
141 0.14
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.13
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.05
204 0.05
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.1
237 0.13
238 0.16
239 0.2
240 0.2
241 0.2
242 0.24
243 0.24
244 0.24
245 0.3
246 0.33
247 0.37
248 0.38
249 0.37
250 0.35
251 0.35
252 0.37
253 0.33
254 0.29
255 0.23
256 0.24
257 0.26
258 0.29
259 0.3
260 0.35
261 0.36
262 0.35
263 0.38
264 0.38
265 0.38
266 0.35
267 0.35
268 0.31
269 0.31
270 0.3
271 0.27
272 0.26
273 0.27
274 0.27
275 0.24
276 0.2
277 0.16
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.16
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.18
286 0.15
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.18
291 0.17
292 0.17
293 0.15
294 0.14
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.11
302 0.16
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.13
321 0.18
322 0.19
323 0.19
324 0.15
325 0.14
326 0.17
327 0.22
328 0.2
329 0.17
330 0.23
331 0.23
332 0.24
333 0.26
334 0.26
335 0.21
336 0.21
337 0.26
338 0.23
339 0.3
340 0.32
341 0.36
342 0.33
343 0.31
344 0.38
345 0.34
346 0.31
347 0.27
348 0.28
349 0.24
350 0.27
351 0.31
352 0.27
353 0.31
354 0.31
355 0.29
356 0.26
357 0.26
358 0.25
359 0.23
360 0.21
361 0.18
362 0.18
363 0.17
364 0.21
365 0.2
366 0.22
367 0.22
368 0.24
369 0.28
370 0.3
371 0.3
372 0.28
373 0.3
374 0.28
375 0.26
376 0.33
377 0.3
378 0.31
379 0.32
380 0.31
381 0.36
382 0.43
383 0.46
384 0.38
385 0.37
386 0.44
387 0.52
388 0.6
389 0.62
390 0.6
391 0.59
392 0.59
393 0.64
394 0.62
395 0.61
396 0.58
397 0.53
398 0.48
399 0.47
400 0.45
401 0.37
402 0.3
403 0.2
404 0.14
405 0.1
406 0.1
407 0.08
408 0.09
409 0.13
410 0.17
411 0.19
412 0.25
413 0.29
414 0.34
415 0.43
416 0.51
417 0.55
418 0.61
419 0.67
420 0.71
421 0.77
422 0.8
423 0.82
424 0.82
425 0.84
426 0.84
427 0.82
428 0.78
429 0.77
430 0.75
431 0.75
432 0.77
433 0.76
434 0.77
435 0.8
436 0.82
437 0.83