Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FNY0

Protein Details
Accession V5FNY0    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-59SHDSSIGKGHPRKKRQTDRSDVRDFVHydrophilic
604-635SWQPPLPRSPPPRGPPRQPPRRGRGSDRGGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-46RK
609-665LPRSPPPRGPPRQPPRRGRGSDRGGRGGGRGRGRGGGQNGDAYRPMPSAAKKAWNKH
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MPDSPGDDNDSRTASVGLQRARTSGSSGASRASSHDSSIGKGHPRKKRQTDRSDVRDFVPQGAKFSAIPLDAEPDSTSSSGSDTSSNESGSGDEGKQNNQPPLGGSAPAINWNQGSKSAIRTTLGSRISKPDRNVTSSGFDEVNKIWRSRSASVSTVEDEEEDEGKETTSSHNQDSKVDSTDVELKDTKTASSGQGPYFVHSDDSESGEVSEGDDSIMVNVGARPGNTMESQGHMGRVNGTVTAHAHHGSITTNGTGENEKSTPHSKEDSFRSFSTKYPTPPSTLGDLVHVDLQTQVKYLFYGRDEGDLDLTLPVTCTECFQEGHLAEVCPSKEVSYPNHFTSLSSCSVVALKSLRNQENTDEVQCRHCRAWNQHESNFCPSWRRCQKCRARGHDDEACPSALKGTATEVPCDFCGSEDHLELDCDYMWKFPKRHPSPGPVLVSLSCCYCTSNHHLVGDCPSLPRPMRSSSWTLKGYDLSMVTNINAVVPSQRSGAALNGRQGGMRIRGRADARSPTPDSDDMLSRPPIRNPVGRNQGRPNIRFGSGIGKDKNLVGPQDSRRSGYDSRDTYRDRDEYPGYNTRQRSLSPNPHSYRGRDSRMKDSWQPPLPRSPPPRGPPRQPPRRGRGSDRGGRGGGRGRGRGGGQNGDAYRPMPSAAKKAWNKHRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.24
3 0.28
4 0.29
5 0.31
6 0.32
7 0.32
8 0.34
9 0.33
10 0.3
11 0.28
12 0.28
13 0.26
14 0.26
15 0.27
16 0.26
17 0.25
18 0.25
19 0.28
20 0.25
21 0.23
22 0.28
23 0.26
24 0.27
25 0.3
26 0.33
27 0.35
28 0.42
29 0.5
30 0.54
31 0.64
32 0.73
33 0.8
34 0.86
35 0.87
36 0.9
37 0.92
38 0.93
39 0.92
40 0.89
41 0.8
42 0.7
43 0.68
44 0.58
45 0.53
46 0.51
47 0.42
48 0.38
49 0.36
50 0.36
51 0.27
52 0.28
53 0.24
54 0.17
55 0.17
56 0.14
57 0.18
58 0.16
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.1
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.12
71 0.17
72 0.19
73 0.18
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.16
78 0.18
79 0.13
80 0.18
81 0.19
82 0.22
83 0.28
84 0.32
85 0.33
86 0.31
87 0.3
88 0.26
89 0.29
90 0.28
91 0.23
92 0.18
93 0.17
94 0.17
95 0.22
96 0.2
97 0.17
98 0.16
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.16
104 0.21
105 0.23
106 0.23
107 0.23
108 0.25
109 0.26
110 0.31
111 0.34
112 0.31
113 0.3
114 0.38
115 0.44
116 0.47
117 0.48
118 0.5
119 0.49
120 0.52
121 0.52
122 0.46
123 0.44
124 0.39
125 0.38
126 0.3
127 0.25
128 0.23
129 0.21
130 0.26
131 0.24
132 0.23
133 0.22
134 0.25
135 0.31
136 0.33
137 0.37
138 0.34
139 0.34
140 0.36
141 0.38
142 0.34
143 0.29
144 0.26
145 0.2
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.17
157 0.2
158 0.24
159 0.28
160 0.29
161 0.32
162 0.36
163 0.34
164 0.3
165 0.28
166 0.24
167 0.21
168 0.28
169 0.26
170 0.25
171 0.24
172 0.21
173 0.23
174 0.24
175 0.21
176 0.15
177 0.16
178 0.15
179 0.2
180 0.23
181 0.21
182 0.26
183 0.26
184 0.26
185 0.26
186 0.24
187 0.19
188 0.15
189 0.18
190 0.13
191 0.16
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.09
198 0.08
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.11
217 0.12
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.13
249 0.18
250 0.19
251 0.21
252 0.24
253 0.23
254 0.29
255 0.35
256 0.37
257 0.37
258 0.36
259 0.38
260 0.36
261 0.36
262 0.37
263 0.33
264 0.31
265 0.34
266 0.34
267 0.33
268 0.33
269 0.33
270 0.3
271 0.27
272 0.24
273 0.19
274 0.18
275 0.15
276 0.15
277 0.12
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.11
290 0.11
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.08
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.13
310 0.12
311 0.14
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.14
316 0.14
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.11
321 0.13
322 0.16
323 0.21
324 0.24
325 0.24
326 0.27
327 0.26
328 0.24
329 0.24
330 0.23
331 0.18
332 0.15
333 0.14
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.11
338 0.09
339 0.09
340 0.13
341 0.2
342 0.22
343 0.24
344 0.25
345 0.25
346 0.29
347 0.29
348 0.27
349 0.23
350 0.22
351 0.26
352 0.27
353 0.27
354 0.23
355 0.25
356 0.28
357 0.33
358 0.42
359 0.46
360 0.51
361 0.52
362 0.55
363 0.56
364 0.55
365 0.49
366 0.39
367 0.36
368 0.31
369 0.38
370 0.44
371 0.48
372 0.47
373 0.56
374 0.66
375 0.68
376 0.77
377 0.76
378 0.74
379 0.72
380 0.74
381 0.71
382 0.62
383 0.55
384 0.46
385 0.38
386 0.29
387 0.24
388 0.18
389 0.12
390 0.1
391 0.08
392 0.09
393 0.14
394 0.14
395 0.16
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.14
401 0.09
402 0.1
403 0.12
404 0.13
405 0.12
406 0.14
407 0.13
408 0.14
409 0.13
410 0.12
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.13
416 0.18
417 0.2
418 0.24
419 0.36
420 0.41
421 0.5
422 0.53
423 0.56
424 0.57
425 0.63
426 0.61
427 0.51
428 0.46
429 0.38
430 0.35
431 0.28
432 0.21
433 0.15
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.15
438 0.21
439 0.27
440 0.29
441 0.29
442 0.3
443 0.3
444 0.34
445 0.31
446 0.24
447 0.18
448 0.17
449 0.2
450 0.21
451 0.22
452 0.21
453 0.23
454 0.26
455 0.29
456 0.35
457 0.35
458 0.42
459 0.42
460 0.4
461 0.37
462 0.35
463 0.31
464 0.26
465 0.22
466 0.15
467 0.14
468 0.13
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.12
482 0.15
483 0.19
484 0.21
485 0.23
486 0.24
487 0.24
488 0.23
489 0.23
490 0.23
491 0.24
492 0.25
493 0.24
494 0.24
495 0.29
496 0.31
497 0.34
498 0.35
499 0.34
500 0.35
501 0.39
502 0.4
503 0.36
504 0.38
505 0.36
506 0.33
507 0.28
508 0.28
509 0.23
510 0.24
511 0.27
512 0.26
513 0.27
514 0.28
515 0.32
516 0.34
517 0.39
518 0.39
519 0.45
520 0.53
521 0.56
522 0.59
523 0.6
524 0.64
525 0.66
526 0.63
527 0.6
528 0.53
529 0.49
530 0.43
531 0.36
532 0.37
533 0.34
534 0.4
535 0.35
536 0.32
537 0.32
538 0.32
539 0.36
540 0.29
541 0.26
542 0.22
543 0.28
544 0.34
545 0.42
546 0.42
547 0.41
548 0.4
549 0.44
550 0.44
551 0.44
552 0.46
553 0.42
554 0.45
555 0.5
556 0.51
557 0.49
558 0.52
559 0.49
560 0.42
561 0.42
562 0.42
563 0.39
564 0.43
565 0.48
566 0.46
567 0.49
568 0.49
569 0.47
570 0.46
571 0.44
572 0.44
573 0.46
574 0.52
575 0.53
576 0.61
577 0.62
578 0.67
579 0.69
580 0.66
581 0.66
582 0.64
583 0.64
584 0.62
585 0.63
586 0.64
587 0.67
588 0.69
589 0.68
590 0.66
591 0.67
592 0.67
593 0.69
594 0.62
595 0.66
596 0.64
597 0.65
598 0.66
599 0.65
600 0.66
601 0.69
602 0.76
603 0.75
604 0.8
605 0.82
606 0.85
607 0.87
608 0.87
609 0.89
610 0.87
611 0.89
612 0.87
613 0.85
614 0.84
615 0.83
616 0.82
617 0.78
618 0.74
619 0.65
620 0.59
621 0.54
622 0.51
623 0.48
624 0.46
625 0.42
626 0.38
627 0.4
628 0.42
629 0.44
630 0.41
631 0.4
632 0.35
633 0.39
634 0.38
635 0.37
636 0.35
637 0.29
638 0.27
639 0.21
640 0.21
641 0.2
642 0.23
643 0.28
644 0.33
645 0.43
646 0.48
647 0.58