Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5HS23

Protein Details
Accession V5HS23    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-102NTPGRDRRKSGRPQRETPFDIHydrophilic
343-364RDEPFRQGRKEKKISRHGHPVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-93TPGRDRRKSGR
350-358GRKEKKISR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035425  CENP-T/H4_C  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF15511  CENP-T_C  
Amino Acid Sequences MSTPNPRGRRSPPGSGTPGQETGRRAAASPAFTERSRLPTTPGRFTGFATPSANRSATRRTPRTGAPSTPFGLRAIQRRAANTPGRDRRKSGRPQRETPFDILRNLGKALAPISAPIRSSPQEEPEPPKKDEIDELDNEPEIPKPRLSLPIEADEDEDDGPDIPPPRLSLAFEEEDITQASIEYPRRAMADADRARLERMSFGDVRLSENFGDLSRLENVDDMSEAGDYTTLQQDDERGDVTGISGFDAGGETDDLGRFNFDFNFPSPNAAATGPELGQDDDDGFMLDTADMQHEPELQPLSDRGDNDDDEDATGGFGLDVYMGDQTSEAGSIRQAPLGGGLRDEPFRQGRKEKKISRHGHPVPNLPAAMVKKLATRFARTSAGAKTKLSKETLAAIEQASEWYFEQASDDLAAYAKHAGRKTIDEGDIMTLMRRQRHTNNATTIFSLAQKHLPKELLQDMRLAMPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.67
3 0.65
4 0.59
5 0.57
6 0.49
7 0.47
8 0.41
9 0.37
10 0.39
11 0.34
12 0.3
13 0.31
14 0.33
15 0.31
16 0.32
17 0.34
18 0.33
19 0.33
20 0.36
21 0.32
22 0.35
23 0.37
24 0.35
25 0.35
26 0.4
27 0.46
28 0.5
29 0.52
30 0.49
31 0.45
32 0.46
33 0.49
34 0.42
35 0.4
36 0.36
37 0.34
38 0.31
39 0.35
40 0.34
41 0.27
42 0.29
43 0.34
44 0.39
45 0.49
46 0.52
47 0.52
48 0.55
49 0.61
50 0.65
51 0.62
52 0.6
53 0.54
54 0.53
55 0.5
56 0.47
57 0.42
58 0.34
59 0.33
60 0.31
61 0.34
62 0.36
63 0.4
64 0.41
65 0.43
66 0.45
67 0.48
68 0.5
69 0.48
70 0.53
71 0.57
72 0.63
73 0.64
74 0.65
75 0.66
76 0.69
77 0.74
78 0.74
79 0.75
80 0.74
81 0.79
82 0.83
83 0.83
84 0.77
85 0.71
86 0.69
87 0.6
88 0.53
89 0.47
90 0.41
91 0.34
92 0.3
93 0.25
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.17
105 0.17
106 0.21
107 0.22
108 0.26
109 0.3
110 0.34
111 0.41
112 0.46
113 0.5
114 0.47
115 0.48
116 0.44
117 0.4
118 0.4
119 0.38
120 0.34
121 0.3
122 0.31
123 0.29
124 0.28
125 0.27
126 0.22
127 0.19
128 0.18
129 0.17
130 0.15
131 0.16
132 0.18
133 0.26
134 0.28
135 0.3
136 0.29
137 0.33
138 0.34
139 0.33
140 0.31
141 0.24
142 0.22
143 0.17
144 0.14
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.17
158 0.18
159 0.17
160 0.18
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.12
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.09
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.22
178 0.23
179 0.25
180 0.26
181 0.25
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.14
186 0.13
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.17
191 0.16
192 0.18
193 0.17
194 0.17
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.12
258 0.12
259 0.09
260 0.1
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.14
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.18
293 0.18
294 0.19
295 0.2
296 0.16
297 0.14
298 0.14
299 0.1
300 0.07
301 0.07
302 0.05
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.09
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.13
325 0.16
326 0.16
327 0.13
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.18
332 0.18
333 0.21
334 0.25
335 0.3
336 0.38
337 0.45
338 0.55
339 0.65
340 0.69
341 0.73
342 0.8
343 0.82
344 0.8
345 0.82
346 0.8
347 0.78
348 0.74
349 0.72
350 0.65
351 0.61
352 0.53
353 0.42
354 0.39
355 0.31
356 0.29
357 0.23
358 0.19
359 0.21
360 0.22
361 0.29
362 0.28
363 0.33
364 0.33
365 0.36
366 0.39
367 0.36
368 0.38
369 0.38
370 0.42
371 0.38
372 0.37
373 0.4
374 0.41
375 0.44
376 0.43
377 0.37
378 0.32
379 0.35
380 0.36
381 0.31
382 0.27
383 0.22
384 0.2
385 0.19
386 0.18
387 0.13
388 0.11
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.1
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.08
402 0.13
403 0.15
404 0.19
405 0.2
406 0.23
407 0.26
408 0.3
409 0.35
410 0.37
411 0.36
412 0.31
413 0.31
414 0.3
415 0.29
416 0.24
417 0.2
418 0.16
419 0.19
420 0.25
421 0.27
422 0.31
423 0.38
424 0.48
425 0.54
426 0.59
427 0.64
428 0.64
429 0.62
430 0.57
431 0.51
432 0.42
433 0.38
434 0.33
435 0.26
436 0.29
437 0.32
438 0.34
439 0.37
440 0.38
441 0.36
442 0.4
443 0.47
444 0.46
445 0.41
446 0.41
447 0.37