Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FAH6

Protein Details
Accession V5FAH6    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
548-568AQEKANKKREQLKRELEAKSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-365PRKSPTKSPSPSPEKPAPKPTSKGLGVIGGPKPTKKEPPRP
466-486SPQKPKPRGKLGTIGGGARSK
550-577EKANKKREQLKRELEAKSKAPAKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MPQNWRKLPLPETDGLPPLLFKYISSSRGYEIYLTDLTYIWTERLNHKQALKRAEDEEASIDPSEDAEQFKVLLQKIEDALCGAEGSSLTLNAGAKSNSLELTTKTRLPAPLHALEWTLYMTRGPQSSLTRELLLPLLIGEASRERRQKSLLDHLKEKDWVIGKVFDKIESSGLDLSTVFPGTASLRAGKRGTTRTQAEKLIRGVAPFDEKSWKSETSKDDVDTELAPKLVEELLNTTGSSDLRSFEPASDAWWEDLTVESRAPQSRGEKKKISQEELVPSSKKMKDTEYHEDSDDEFQRQATPPHLKRTKYDRHQRSPSVTNAPRKSPTKSPSPSPEKPAPKPTSKGLGVIGGPKPTKKEPPRPPSSTASEVSEPSHRSPVPEPDLDQETAPEDEEDAEPQPIPKPQQVEKEPVSKLHSRGLGVIGGKKAKAPSPSLSPSPSPPPEKSTTKSPSAAPDAGPASHSPQKPKPRGKLGTIGGGARSKPIPSRPAQDVGAAAAESTESDAEDDLDRVSAAPKTKAPSRSSSPAAQPAVKQEKEPGRELTAQEKANKKREQLKRELEAKSKAPAKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.39
3 0.35
4 0.27
5 0.22
6 0.22
7 0.18
8 0.14
9 0.19
10 0.24
11 0.28
12 0.3
13 0.31
14 0.3
15 0.32
16 0.33
17 0.27
18 0.22
19 0.23
20 0.2
21 0.19
22 0.17
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.11
28 0.14
29 0.17
30 0.23
31 0.33
32 0.38
33 0.41
34 0.48
35 0.55
36 0.58
37 0.63
38 0.61
39 0.56
40 0.52
41 0.52
42 0.45
43 0.39
44 0.36
45 0.28
46 0.25
47 0.21
48 0.19
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.12
53 0.13
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.14
58 0.18
59 0.18
60 0.2
61 0.19
62 0.21
63 0.23
64 0.23
65 0.21
66 0.16
67 0.16
68 0.13
69 0.12
70 0.09
71 0.07
72 0.06
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.21
90 0.24
91 0.25
92 0.25
93 0.28
94 0.32
95 0.33
96 0.38
97 0.37
98 0.37
99 0.36
100 0.35
101 0.33
102 0.28
103 0.26
104 0.2
105 0.14
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.17
113 0.21
114 0.24
115 0.29
116 0.3
117 0.28
118 0.27
119 0.27
120 0.23
121 0.19
122 0.15
123 0.1
124 0.08
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.1
129 0.15
130 0.21
131 0.26
132 0.27
133 0.3
134 0.33
135 0.37
136 0.39
137 0.45
138 0.49
139 0.5
140 0.54
141 0.54
142 0.54
143 0.51
144 0.45
145 0.39
146 0.32
147 0.28
148 0.24
149 0.28
150 0.25
151 0.3
152 0.3
153 0.25
154 0.24
155 0.23
156 0.22
157 0.16
158 0.18
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.12
173 0.13
174 0.17
175 0.18
176 0.2
177 0.25
178 0.29
179 0.32
180 0.35
181 0.39
182 0.41
183 0.45
184 0.49
185 0.46
186 0.44
187 0.41
188 0.39
189 0.34
190 0.28
191 0.25
192 0.2
193 0.21
194 0.18
195 0.18
196 0.2
197 0.2
198 0.23
199 0.25
200 0.27
201 0.24
202 0.3
203 0.33
204 0.32
205 0.34
206 0.32
207 0.3
208 0.27
209 0.27
210 0.21
211 0.19
212 0.14
213 0.11
214 0.1
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.1
249 0.12
250 0.13
251 0.15
252 0.21
253 0.3
254 0.37
255 0.43
256 0.45
257 0.47
258 0.55
259 0.57
260 0.54
261 0.48
262 0.44
263 0.43
264 0.43
265 0.42
266 0.34
267 0.29
268 0.31
269 0.29
270 0.28
271 0.24
272 0.23
273 0.25
274 0.32
275 0.4
276 0.38
277 0.38
278 0.36
279 0.35
280 0.33
281 0.32
282 0.26
283 0.18
284 0.14
285 0.12
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.23
291 0.25
292 0.35
293 0.41
294 0.4
295 0.44
296 0.53
297 0.58
298 0.58
299 0.66
300 0.66
301 0.7
302 0.76
303 0.75
304 0.72
305 0.66
306 0.61
307 0.6
308 0.56
309 0.55
310 0.51
311 0.5
312 0.5
313 0.48
314 0.48
315 0.46
316 0.44
317 0.46
318 0.46
319 0.48
320 0.52
321 0.58
322 0.57
323 0.56
324 0.61
325 0.59
326 0.6
327 0.64
328 0.6
329 0.56
330 0.56
331 0.52
332 0.5
333 0.44
334 0.41
335 0.31
336 0.28
337 0.24
338 0.25
339 0.23
340 0.2
341 0.2
342 0.19
343 0.22
344 0.23
345 0.32
346 0.36
347 0.46
348 0.52
349 0.62
350 0.7
351 0.72
352 0.74
353 0.7
354 0.67
355 0.61
356 0.52
357 0.45
358 0.38
359 0.33
360 0.3
361 0.28
362 0.25
363 0.22
364 0.26
365 0.22
366 0.24
367 0.26
368 0.32
369 0.33
370 0.32
371 0.31
372 0.3
373 0.33
374 0.31
375 0.27
376 0.2
377 0.17
378 0.16
379 0.15
380 0.11
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.12
390 0.14
391 0.16
392 0.18
393 0.22
394 0.26
395 0.36
396 0.39
397 0.44
398 0.45
399 0.49
400 0.47
401 0.45
402 0.46
403 0.41
404 0.4
405 0.38
406 0.36
407 0.3
408 0.3
409 0.28
410 0.26
411 0.23
412 0.24
413 0.22
414 0.21
415 0.2
416 0.21
417 0.21
418 0.22
419 0.24
420 0.25
421 0.26
422 0.32
423 0.36
424 0.37
425 0.39
426 0.37
427 0.37
428 0.41
429 0.43
430 0.41
431 0.39
432 0.42
433 0.45
434 0.49
435 0.49
436 0.51
437 0.5
438 0.5
439 0.51
440 0.46
441 0.46
442 0.46
443 0.45
444 0.35
445 0.34
446 0.3
447 0.28
448 0.27
449 0.22
450 0.21
451 0.27
452 0.29
453 0.32
454 0.39
455 0.5
456 0.59
457 0.67
458 0.71
459 0.74
460 0.78
461 0.76
462 0.76
463 0.68
464 0.66
465 0.58
466 0.5
467 0.42
468 0.39
469 0.33
470 0.27
471 0.25
472 0.19
473 0.22
474 0.27
475 0.3
476 0.33
477 0.39
478 0.41
479 0.45
480 0.44
481 0.41
482 0.35
483 0.3
484 0.26
485 0.2
486 0.14
487 0.09
488 0.08
489 0.06
490 0.07
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.08
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.1
503 0.12
504 0.15
505 0.18
506 0.21
507 0.26
508 0.34
509 0.41
510 0.43
511 0.48
512 0.52
513 0.56
514 0.58
515 0.58
516 0.57
517 0.58
518 0.58
519 0.53
520 0.47
521 0.5
522 0.54
523 0.49
524 0.44
525 0.45
526 0.5
527 0.51
528 0.54
529 0.48
530 0.44
531 0.48
532 0.5
533 0.49
534 0.47
535 0.47
536 0.5
537 0.55
538 0.58
539 0.62
540 0.66
541 0.65
542 0.68
543 0.74
544 0.77
545 0.78
546 0.79
547 0.79
548 0.82
549 0.82
550 0.79
551 0.75
552 0.69
553 0.67
554 0.65
555 0.62
556 0.64
557 0.68