Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5I5D8

Protein Details
Accession V5I5D8    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-70ARKLAAKEEKSSRKNKKKAPSPSSSDSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-62ASQTPKAKGKEIARKLAAKEEKSSRKNKKKAP
131-145KTETKKAEPKKAEAK
171-187KAPAKAKKAEPAKKAKK
232-233KR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTKATKVAKGADKTEKALTKVKDAGVTKASQTPKAKGKEIARKLAAKEEKSSRKNKKKAPSPSSSDSESDSDEEMKSASSSSESESESEDEKPAKKETKKATKPAESSSESESESESEESSSEEEAPKKTETKKAEPKKAEAKKESSDSESESESESDSDSDSSESEAKAPAKAKKAEPAKKAKKDASSSESEESDSSEKSGSDSESGSDSDSDSDSEETEDSAKESPKKRKADEQEAPAAKKSKTQEEIPGASANLFVGNLSWNVDEEWLRSEFDGFGELSGVRIVTERDTGRSRGFGYVEFTNVADAVKAYEAKKGAEVDGRKINLDYANARPANNNEGGQRDRAQARARSFGDQTSPESDTLFIGNLPFSASEDAINETFAEKGSILGIRLPTDPESGRPKGFGYIQFSSVDEARAALNDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.6
3 0.6
4 0.55
5 0.51
6 0.54
7 0.49
8 0.46
9 0.48
10 0.47
11 0.46
12 0.43
13 0.44
14 0.41
15 0.4
16 0.36
17 0.38
18 0.39
19 0.39
20 0.42
21 0.44
22 0.49
23 0.53
24 0.55
25 0.55
26 0.62
27 0.65
28 0.68
29 0.71
30 0.68
31 0.67
32 0.65
33 0.67
34 0.65
35 0.57
36 0.57
37 0.58
38 0.62
39 0.64
40 0.73
41 0.74
42 0.77
43 0.84
44 0.85
45 0.86
46 0.86
47 0.89
48 0.88
49 0.85
50 0.83
51 0.8
52 0.76
53 0.68
54 0.59
55 0.51
56 0.44
57 0.36
58 0.3
59 0.24
60 0.21
61 0.18
62 0.17
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.22
81 0.24
82 0.28
83 0.35
84 0.38
85 0.45
86 0.53
87 0.61
88 0.66
89 0.73
90 0.76
91 0.76
92 0.75
93 0.72
94 0.69
95 0.61
96 0.55
97 0.49
98 0.41
99 0.33
100 0.3
101 0.25
102 0.18
103 0.17
104 0.15
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.11
113 0.13
114 0.14
115 0.17
116 0.18
117 0.22
118 0.25
119 0.32
120 0.36
121 0.44
122 0.54
123 0.61
124 0.69
125 0.68
126 0.71
127 0.74
128 0.75
129 0.74
130 0.7
131 0.65
132 0.6
133 0.6
134 0.56
135 0.48
136 0.41
137 0.35
138 0.3
139 0.26
140 0.22
141 0.18
142 0.16
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.11
157 0.11
158 0.14
159 0.18
160 0.22
161 0.27
162 0.31
163 0.31
164 0.36
165 0.46
166 0.51
167 0.54
168 0.61
169 0.65
170 0.68
171 0.73
172 0.7
173 0.67
174 0.63
175 0.6
176 0.54
177 0.49
178 0.45
179 0.4
180 0.35
181 0.3
182 0.25
183 0.22
184 0.18
185 0.13
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.08
213 0.1
214 0.16
215 0.23
216 0.32
217 0.4
218 0.45
219 0.47
220 0.55
221 0.6
222 0.65
223 0.64
224 0.6
225 0.6
226 0.58
227 0.56
228 0.5
229 0.45
230 0.35
231 0.34
232 0.31
233 0.3
234 0.3
235 0.32
236 0.36
237 0.38
238 0.4
239 0.36
240 0.34
241 0.27
242 0.23
243 0.21
244 0.14
245 0.08
246 0.06
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.11
278 0.12
279 0.16
280 0.19
281 0.21
282 0.22
283 0.23
284 0.23
285 0.22
286 0.22
287 0.19
288 0.2
289 0.19
290 0.19
291 0.18
292 0.16
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.1
301 0.1
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.18
306 0.18
307 0.19
308 0.22
309 0.24
310 0.26
311 0.31
312 0.31
313 0.29
314 0.28
315 0.29
316 0.24
317 0.25
318 0.24
319 0.21
320 0.29
321 0.29
322 0.29
323 0.3
324 0.3
325 0.33
326 0.32
327 0.3
328 0.24
329 0.28
330 0.3
331 0.31
332 0.31
333 0.31
334 0.3
335 0.34
336 0.38
337 0.39
338 0.41
339 0.46
340 0.46
341 0.44
342 0.44
343 0.41
344 0.39
345 0.35
346 0.34
347 0.3
348 0.3
349 0.26
350 0.25
351 0.23
352 0.19
353 0.18
354 0.15
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.08
375 0.08
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.14
380 0.15
381 0.16
382 0.17
383 0.2
384 0.2
385 0.23
386 0.23
387 0.26
388 0.32
389 0.35
390 0.35
391 0.34
392 0.33
393 0.34
394 0.38
395 0.38
396 0.38
397 0.37
398 0.38
399 0.37
400 0.36
401 0.35
402 0.31
403 0.26
404 0.18
405 0.15
406 0.14