FuNGI

V5GD10

Protein Details

Accession

V5GD10

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
155-177	AFSLAKYTLRKRKKYLRRFTILP	Hydrophilic
358-383	QALKPNKRSSYYRKRNRWARVRAVVD	Hydrophilic
532-552	VEARGHASRKKRKVVTADTSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
540-542	RKK

Subcellular Location(s)

cyto_mito 9.666, mito 9.5, cyto 9.5, cyto_nucl 8.833, mito_nucl 8.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MQSFVRPHEHVALRLPSDQTKVVQLVPNTTISLGKYGSFPANQIVGRPFYLTFEILDQPDEKHGHVLRLVPATELHAEALISEGSGEADGEGDELEPNGDADVNMRTNRETVDDVSSQKLTLAEIEALKKESSGAGREIIAKLLESHSAIDQKTAFSLAKYTLRKRKKYLRRFTILPMDVNLLTEWMLNEKDASKVMELRDELIGLIGCWGNVHHSGDMSLDDAVASKPNGRYLVVDDTGGLVVAAMAERMGILYPPHDDDADLDLETSQQAQGHHPKRQSDRPAPMSASSNTITVLHPYSQPNVSLLKYFGFEQNTPDPSHPLTTHLKTISWLQLVDPNADSIYGSEPEVLSDEALQALKPNKRSSYYRKRNRWARVRAVVDETRAGEFDGLIVATLMNPTSVLKHAVPLLAGGAPVVVYSPNVEPLVELADLYSTARKTAFINIKRELEEKEQESAESAQTPSAGTSSLPDLSTEFPVDPTLLLAPTLQTSRVRQWQVLPGRTHPLMSGRGGAEGYIFHGNRVLPAQAHVEARGHASRKKRKVVTADTSQGVEVQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.43
3	0.37
4	0.38
5	0.38
6	0.32
7	0.31
8	0.3
9	0.31
10	0.32
11	0.3
12	0.32
13	0.32
14	0.32
15	0.27
16	0.26
17	0.24
18	0.19
19	0.21
20	0.17
21	0.15
22	0.15
23	0.17
24	0.21
25	0.2
26	0.2
27	0.2
28	0.24
29	0.23
30	0.26
31	0.26
32	0.25
33	0.25
34	0.26
35	0.23
36	0.21
37	0.23
38	0.2
39	0.17
40	0.18
41	0.2
42	0.19
43	0.21
44	0.19
45	0.18
46	0.23
47	0.24
48	0.21
49	0.25
50	0.26
51	0.27
52	0.28
53	0.31
54	0.3
55	0.32
56	0.32
57	0.26
58	0.24
59	0.24
60	0.23
61	0.2
62	0.16
63	0.12
64	0.11
65	0.1
66	0.11
67	0.08
68	0.06
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.04
75	0.04
76	0.04
77	0.04
78	0.04
79	0.05
80	0.05
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.05
88	0.06
89	0.1
90	0.13
91	0.14
92	0.15
93	0.15
94	0.16
95	0.17
96	0.19
97	0.18
98	0.17
99	0.21
100	0.23
101	0.24
102	0.26
103	0.25
104	0.22
105	0.21
106	0.19
107	0.14
108	0.12
109	0.12
110	0.11
111	0.13
112	0.15
113	0.16
114	0.17
115	0.17
116	0.16
117	0.14
118	0.15
119	0.15
120	0.15
121	0.16
122	0.15
123	0.17
124	0.19
125	0.19
126	0.18
127	0.15
128	0.13
129	0.12
130	0.12
131	0.12
132	0.1
133	0.11
134	0.12
135	0.16
136	0.16
137	0.16
138	0.16
139	0.15
140	0.15
141	0.16
142	0.14
143	0.1
144	0.12
145	0.13
146	0.2
147	0.26
148	0.34
149	0.42
150	0.51
151	0.57
152	0.64
153	0.72
154	0.75
155	0.8
156	0.83
157	0.83
158	0.81
159	0.77
160	0.75
161	0.74
162	0.66
163	0.55
164	0.45
165	0.38
166	0.31
167	0.28
168	0.22
169	0.12
170	0.1
171	0.09
172	0.08
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.09
179	0.1
180	0.11
181	0.1
182	0.13
183	0.13
184	0.17
185	0.16
186	0.17
187	0.16
188	0.15
189	0.13
190	0.11
191	0.1
192	0.06
193	0.07
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.08
200	0.1
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.07
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.06
214	0.08
215	0.09
216	0.11
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.15
221	0.19
222	0.17
223	0.16
224	0.14
225	0.14
226	0.13
227	0.12
228	0.09
229	0.04
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.02
234	0.02
235	0.02
236	0.02
237	0.02
238	0.02
239	0.03
240	0.03
241	0.04
242	0.05
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.1
249	0.1
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.1
260	0.2
261	0.24
262	0.29
263	0.31
264	0.36
265	0.4
266	0.47
267	0.52
268	0.5
269	0.54
270	0.54
271	0.54
272	0.49
273	0.45
274	0.41
275	0.33
276	0.28
277	0.21
278	0.17
279	0.14
280	0.14
281	0.13
282	0.12
283	0.12
284	0.1
285	0.12
286	0.13
287	0.15
288	0.14
289	0.14
290	0.14
291	0.15
292	0.14
293	0.13
294	0.12
295	0.11
296	0.11
297	0.12
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.17
302	0.21
303	0.23
304	0.23
305	0.23
306	0.21
307	0.2
308	0.22
309	0.18
310	0.18
311	0.22
312	0.22
313	0.25
314	0.24
315	0.23
316	0.22
317	0.25
318	0.24
319	0.19
320	0.17
321	0.14
322	0.18
323	0.18
324	0.19
325	0.16
326	0.12
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.07
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.09
338	0.08
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.08
346	0.13
347	0.17
348	0.21
349	0.24
350	0.26
351	0.31
352	0.38
353	0.46
354	0.52
355	0.6
356	0.66
357	0.73
358	0.8
359	0.85
360	0.88
361	0.88
362	0.86
363	0.84
364	0.82
365	0.76
366	0.69
367	0.66
368	0.57
369	0.48
370	0.41
371	0.33
372	0.24
373	0.21
374	0.18
375	0.12
376	0.1
377	0.08
378	0.06
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.03
387	0.04
388	0.04
389	0.06
390	0.07
391	0.1
392	0.1
393	0.12
394	0.13
395	0.14
396	0.13
397	0.12
398	0.12
399	0.09
400	0.08
401	0.07
402	0.05
403	0.05
404	0.04
405	0.05
406	0.04
407	0.03
408	0.06
409	0.06
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.1
417	0.09
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.11
423	0.08
424	0.09
425	0.1
426	0.11
427	0.12
428	0.21
429	0.3
430	0.34
431	0.4
432	0.44
433	0.48
434	0.49
435	0.5
436	0.45
437	0.42
438	0.42
439	0.38
440	0.36
441	0.33
442	0.31
443	0.31
444	0.29
445	0.23
446	0.19
447	0.17
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.11
452	0.1
453	0.09
454	0.07
455	0.08
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.13
461	0.15
462	0.17
463	0.17
464	0.15
465	0.14
466	0.14
467	0.14
468	0.13
469	0.12
470	0.11
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.11
476	0.12
477	0.13
478	0.15
479	0.19
480	0.26
481	0.35
482	0.37
483	0.38
484	0.42
485	0.48
486	0.54
487	0.58
488	0.54
489	0.5
490	0.53
491	0.52
492	0.47
493	0.4
494	0.35
495	0.32
496	0.29
497	0.3
498	0.23
499	0.24
500	0.23
501	0.22
502	0.17
503	0.13
504	0.15
505	0.18
506	0.18
507	0.16
508	0.19
509	0.19
510	0.21
511	0.23
512	0.22
513	0.15
514	0.17
515	0.21
516	0.22
517	0.24
518	0.23
519	0.23
520	0.21
521	0.26
522	0.29
523	0.3
524	0.31
525	0.41
526	0.5
527	0.58
528	0.67
529	0.69
530	0.71
531	0.77
532	0.82
533	0.8
534	0.8
535	0.76
536	0.68
537	0.63
538	0.54

V5GD10

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer