Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GB13

Protein Details
Accession V5GB13    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-58YVTAPTPQNPKPQRKQWTEEDERRFVHydrophilic
744-768VLYIWRVDKIRKRRDVKRVYHEAWGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
666-679KRIAKRFHAPKGKR
Subcellular Location(s) plas 11, cyto 7.5, cyto_nucl 6.5, nucl 4.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003807  DUF202  
IPR004331  SPX_dom  
IPR018966  VTC_domain  
IPR042267  VTC_sf  
Gene Ontology GO:0005774  C:vacuolar membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF02656  DUF202  
PF09359  VTC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51382  SPX  
CDD cd07751  PolyPPase_VTC4_like  
cd14480  SPX_VTC2_like  
Amino Acid Sequences MRFGEQLQSSLIKEWTWHYIAYDDLKKALKTDYVTAPTPQNPKPQRKQWTEEDERRFVALLEGDLDKVFTFQKLKSNEIVRRIQASEEDVNEVVARLEEGDPPTDEEFLCLEEDLSDIIADVHDLAKFTQLNYTGFQKIIKKHDKQTGWYLKPVFAARLKAKPFFQDNYDAFVVKLSKLYDVVRTKGNPVKGDSAAGGEQQNFVRQTTKYWVHPDNITELKLIILKHLPVLVFNPSKEFEEKDTAITSIYYDNTETWELYTGRLKKTEGAEAIRLRWYGGMENDQIFVERKTHREDWTGEKSVKARFPMKEKHVNAYLSGEMSVESIFEKVRKQGKKSEKEIAEWEQLAREVQYRVITRKLVPVTRTFYHRTAFQLPGDARVRISLDTELTMVREDNLDGRRRAGDNWRRTDIGIDWPFSQLPPEDVERFPYAVLEVKLQTQAGQEPPQWIRELVASHLVEAVPKFSKFIHGTATLFPDRIKLLPFWMPQMDVDIRKPRTRAFGIQRPPPSTNLSTSDDPEDDETEDDDQPDTPGRNGRPRADVSPGGYLRPPTDSRTAAQQRASSGLFEENGNSLDVEERIAAQWPENEDDYPLYDSDYESEGSEELEEARRIGGMHYRKLLVKHYAQKAGNLVLSAAQAIIPRPRATQFPPQDETNRISVLGNKRIAKRFHAPKGKRIHVPIRVEPKVYFAAERTFLSWLEFSIILGSIAAALLNFGNDTVTLSSSWAFTILAALALLYSLVLYIWRVDKIRKRRDVKRVYHEAWGPTILCLGLVAAVCVNFGLRFRGGHFALPENGGKLGDGLRDRTEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.24
4 0.23
5 0.21
6 0.21
7 0.25
8 0.3
9 0.33
10 0.28
11 0.3
12 0.33
13 0.32
14 0.33
15 0.33
16 0.3
17 0.28
18 0.32
19 0.36
20 0.38
21 0.4
22 0.41
23 0.43
24 0.45
25 0.49
26 0.48
27 0.5
28 0.55
29 0.64
30 0.71
31 0.75
32 0.79
33 0.81
34 0.83
35 0.83
36 0.84
37 0.83
38 0.83
39 0.81
40 0.76
41 0.68
42 0.62
43 0.52
44 0.41
45 0.34
46 0.26
47 0.18
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.14
52 0.15
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.14
58 0.16
59 0.24
60 0.28
61 0.32
62 0.38
63 0.46
64 0.49
65 0.54
66 0.58
67 0.53
68 0.54
69 0.51
70 0.45
71 0.39
72 0.38
73 0.34
74 0.29
75 0.29
76 0.24
77 0.23
78 0.22
79 0.19
80 0.14
81 0.1
82 0.09
83 0.07
84 0.08
85 0.11
86 0.13
87 0.15
88 0.15
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.17
117 0.19
118 0.2
119 0.22
120 0.26
121 0.24
122 0.24
123 0.28
124 0.29
125 0.33
126 0.42
127 0.49
128 0.51
129 0.57
130 0.66
131 0.66
132 0.65
133 0.69
134 0.7
135 0.63
136 0.64
137 0.57
138 0.5
139 0.5
140 0.46
141 0.4
142 0.33
143 0.37
144 0.35
145 0.41
146 0.43
147 0.43
148 0.44
149 0.45
150 0.47
151 0.42
152 0.41
153 0.42
154 0.39
155 0.4
156 0.4
157 0.34
158 0.28
159 0.28
160 0.25
161 0.17
162 0.18
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.22
168 0.25
169 0.27
170 0.3
171 0.3
172 0.35
173 0.38
174 0.42
175 0.36
176 0.36
177 0.38
178 0.34
179 0.34
180 0.28
181 0.25
182 0.21
183 0.2
184 0.18
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.18
189 0.17
190 0.17
191 0.18
192 0.17
193 0.2
194 0.26
195 0.3
196 0.31
197 0.37
198 0.39
199 0.39
200 0.41
201 0.39
202 0.37
203 0.35
204 0.31
205 0.25
206 0.21
207 0.19
208 0.19
209 0.17
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.14
218 0.18
219 0.18
220 0.18
221 0.2
222 0.2
223 0.22
224 0.23
225 0.23
226 0.2
227 0.24
228 0.25
229 0.24
230 0.24
231 0.21
232 0.2
233 0.18
234 0.15
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.1
244 0.14
245 0.13
246 0.14
247 0.21
248 0.22
249 0.23
250 0.25
251 0.26
252 0.26
253 0.28
254 0.32
255 0.29
256 0.28
257 0.32
258 0.31
259 0.32
260 0.3
261 0.28
262 0.23
263 0.2
264 0.18
265 0.14
266 0.14
267 0.16
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.15
272 0.16
273 0.14
274 0.13
275 0.15
276 0.15
277 0.17
278 0.23
279 0.27
280 0.28
281 0.32
282 0.34
283 0.37
284 0.43
285 0.45
286 0.39
287 0.38
288 0.38
289 0.38
290 0.38
291 0.34
292 0.32
293 0.31
294 0.38
295 0.44
296 0.48
297 0.54
298 0.53
299 0.54
300 0.53
301 0.5
302 0.43
303 0.37
304 0.31
305 0.21
306 0.19
307 0.14
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.13
318 0.22
319 0.26
320 0.29
321 0.38
322 0.49
323 0.56
324 0.6
325 0.64
326 0.57
327 0.56
328 0.57
329 0.51
330 0.44
331 0.35
332 0.3
333 0.22
334 0.2
335 0.17
336 0.13
337 0.11
338 0.08
339 0.09
340 0.13
341 0.15
342 0.16
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.25
347 0.27
348 0.26
349 0.26
350 0.29
351 0.31
352 0.31
353 0.35
354 0.33
355 0.32
356 0.3
357 0.3
358 0.29
359 0.28
360 0.28
361 0.24
362 0.26
363 0.23
364 0.28
365 0.28
366 0.24
367 0.2
368 0.18
369 0.19
370 0.14
371 0.15
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.09
384 0.13
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.19
389 0.19
390 0.21
391 0.28
392 0.33
393 0.37
394 0.42
395 0.43
396 0.42
397 0.41
398 0.41
399 0.32
400 0.32
401 0.26
402 0.22
403 0.21
404 0.21
405 0.21
406 0.19
407 0.18
408 0.09
409 0.08
410 0.09
411 0.11
412 0.13
413 0.13
414 0.16
415 0.16
416 0.16
417 0.15
418 0.13
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.09
429 0.11
430 0.11
431 0.13
432 0.13
433 0.17
434 0.18
435 0.19
436 0.19
437 0.17
438 0.15
439 0.14
440 0.14
441 0.11
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.12
449 0.13
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.15
455 0.16
456 0.17
457 0.18
458 0.19
459 0.2
460 0.21
461 0.26
462 0.2
463 0.19
464 0.18
465 0.16
466 0.15
467 0.14
468 0.14
469 0.1
470 0.12
471 0.17
472 0.18
473 0.19
474 0.18
475 0.18
476 0.16
477 0.2
478 0.2
479 0.16
480 0.2
481 0.25
482 0.28
483 0.3
484 0.31
485 0.29
486 0.34
487 0.35
488 0.4
489 0.4
490 0.46
491 0.5
492 0.56
493 0.59
494 0.57
495 0.55
496 0.49
497 0.46
498 0.39
499 0.35
500 0.33
501 0.33
502 0.3
503 0.29
504 0.29
505 0.24
506 0.23
507 0.21
508 0.17
509 0.13
510 0.12
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.16
522 0.19
523 0.27
524 0.31
525 0.33
526 0.37
527 0.39
528 0.4
529 0.4
530 0.39
531 0.33
532 0.36
533 0.33
534 0.29
535 0.27
536 0.25
537 0.21
538 0.23
539 0.23
540 0.19
541 0.23
542 0.24
543 0.24
544 0.33
545 0.39
546 0.37
547 0.39
548 0.37
549 0.33
550 0.35
551 0.34
552 0.24
553 0.19
554 0.17
555 0.14
556 0.13
557 0.13
558 0.1
559 0.11
560 0.11
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.12
573 0.13
574 0.16
575 0.16
576 0.16
577 0.15
578 0.15
579 0.16
580 0.15
581 0.13
582 0.11
583 0.1
584 0.1
585 0.11
586 0.12
587 0.1
588 0.09
589 0.1
590 0.09
591 0.09
592 0.09
593 0.07
594 0.07
595 0.1
596 0.1
597 0.09
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.11
602 0.17
603 0.19
604 0.23
605 0.26
606 0.28
607 0.3
608 0.32
609 0.36
610 0.35
611 0.38
612 0.43
613 0.47
614 0.53
615 0.51
616 0.51
617 0.49
618 0.45
619 0.37
620 0.28
621 0.22
622 0.15
623 0.14
624 0.12
625 0.09
626 0.07
627 0.07
628 0.09
629 0.12
630 0.15
631 0.16
632 0.18
633 0.19
634 0.23
635 0.27
636 0.37
637 0.4
638 0.45
639 0.48
640 0.49
641 0.52
642 0.51
643 0.49
644 0.42
645 0.35
646 0.28
647 0.25
648 0.28
649 0.31
650 0.35
651 0.38
652 0.41
653 0.47
654 0.53
655 0.56
656 0.55
657 0.57
658 0.6
659 0.64
660 0.69
661 0.67
662 0.68
663 0.75
664 0.76
665 0.73
666 0.71
667 0.7
668 0.67
669 0.71
670 0.71
671 0.71
672 0.66
673 0.62
674 0.54
675 0.49
676 0.45
677 0.38
678 0.31
679 0.23
680 0.25
681 0.25
682 0.26
683 0.23
684 0.2
685 0.2
686 0.21
687 0.18
688 0.14
689 0.15
690 0.14
691 0.12
692 0.12
693 0.12
694 0.09
695 0.09
696 0.08
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.03
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.05
707 0.05
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.09
712 0.1
713 0.1
714 0.11
715 0.11
716 0.1
717 0.08
718 0.07
719 0.08
720 0.08
721 0.07
722 0.06
723 0.06
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.03
728 0.03
729 0.03
730 0.03
731 0.03
732 0.04
733 0.07
734 0.09
735 0.13
736 0.16
737 0.24
738 0.34
739 0.44
740 0.54
741 0.62
742 0.69
743 0.76
744 0.85
745 0.88
746 0.88
747 0.88
748 0.88
749 0.81
750 0.79
751 0.74
752 0.66
753 0.58
754 0.51
755 0.41
756 0.31
757 0.29
758 0.2
759 0.15
760 0.12
761 0.09
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.07
766 0.07
767 0.07
768 0.07
769 0.08
770 0.07
771 0.08
772 0.11
773 0.12
774 0.13
775 0.16
776 0.23
777 0.24
778 0.28
779 0.29
780 0.3
781 0.31
782 0.33
783 0.32
784 0.26
785 0.26
786 0.22
787 0.19
788 0.16
789 0.16
790 0.18
791 0.2
792 0.22