Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5G232

Protein Details
Accession V5G232    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-77DHAPASVERERKRKHKNKDHASPAKKRKHRDADAADLISAEASPKKEKKSKDKKKKKETFSEVPEPSBasic
382-413DAQSATTKTKKEKKEKDKDKPKSKSKSKKKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-42RERKRKHKNKDHASPAKKRKHRDA
51-67EASPKKEKKSKDKKKKK
389-413KTKKEKKEKDKDKPKSKSKSKKKEK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSVDAMDIDSDHAPASVERERKRKHKNKDHASPAKKRKHRDADAADLISAEASPKKEKKSKDKKKKKETFSEVPEPSDSPFNLVTSTLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYYPPLKGIVLAYSNASISSRPGSNSDRDSDNPQPLTLATTANEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQVLEGWVNVQSEGFLGAVVYNLFSVGIERRRLPADWKWIPPGDEDGSADAEGNNKRSKSAPTSAENSGDEEDSFDPEKEHFTPVRLPLTVETQDNGPDMDAEDSAATGYFQSASGHRVRGMIRFRVRDIDVIPGADRERGFISIEGTMLSPEEEDKLVADERRGVTSYRRGDSLTMSGGVARAPSSAPSEQTAPAPQESQVDAQSATTKTKKEKKEKDKDKPKSKSKSKKKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.15
3 0.2
4 0.27
5 0.34
6 0.44
7 0.52
8 0.61
9 0.72
10 0.77
11 0.81
12 0.85
13 0.89
14 0.9
15 0.93
16 0.94
17 0.93
18 0.93
19 0.93
20 0.92
21 0.92
22 0.88
23 0.86
24 0.86
25 0.86
26 0.85
27 0.84
28 0.81
29 0.8
30 0.79
31 0.72
32 0.6
33 0.49
34 0.41
35 0.3
36 0.22
37 0.14
38 0.1
39 0.12
40 0.2
41 0.25
42 0.33
43 0.4
44 0.49
45 0.59
46 0.68
47 0.77
48 0.81
49 0.87
50 0.9
51 0.94
52 0.96
53 0.94
54 0.94
55 0.92
56 0.91
57 0.88
58 0.87
59 0.77
60 0.7
61 0.62
62 0.51
63 0.43
64 0.38
65 0.29
66 0.22
67 0.21
68 0.18
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.08
81 0.08
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.08
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.13
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.15
126 0.18
127 0.22
128 0.25
129 0.26
130 0.27
131 0.27
132 0.33
133 0.34
134 0.36
135 0.33
136 0.29
137 0.27
138 0.24
139 0.24
140 0.19
141 0.15
142 0.09
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.17
165 0.2
166 0.2
167 0.21
168 0.16
169 0.22
170 0.22
171 0.19
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.14
176 0.13
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.06
193 0.09
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.2
200 0.22
201 0.29
202 0.32
203 0.33
204 0.35
205 0.35
206 0.35
207 0.31
208 0.3
209 0.21
210 0.17
211 0.16
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.13
220 0.15
221 0.15
222 0.16
223 0.17
224 0.21
225 0.23
226 0.29
227 0.31
228 0.32
229 0.36
230 0.37
231 0.38
232 0.34
233 0.3
234 0.24
235 0.19
236 0.15
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.14
245 0.13
246 0.17
247 0.15
248 0.16
249 0.21
250 0.24
251 0.26
252 0.24
253 0.23
254 0.2
255 0.25
256 0.24
257 0.21
258 0.18
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.09
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.11
281 0.13
282 0.15
283 0.15
284 0.18
285 0.19
286 0.25
287 0.3
288 0.35
289 0.39
290 0.41
291 0.41
292 0.43
293 0.43
294 0.39
295 0.34
296 0.32
297 0.26
298 0.24
299 0.23
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.18
304 0.14
305 0.14
306 0.15
307 0.16
308 0.14
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.1
314 0.1
315 0.08
316 0.08
317 0.06
318 0.06
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.1
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.18
328 0.2
329 0.22
330 0.23
331 0.22
332 0.25
333 0.33
334 0.39
335 0.36
336 0.36
337 0.34
338 0.34
339 0.36
340 0.34
341 0.27
342 0.21
343 0.19
344 0.18
345 0.17
346 0.16
347 0.13
348 0.09
349 0.08
350 0.07
351 0.09
352 0.14
353 0.15
354 0.17
355 0.19
356 0.21
357 0.22
358 0.24
359 0.27
360 0.25
361 0.25
362 0.24
363 0.23
364 0.24
365 0.25
366 0.24
367 0.22
368 0.2
369 0.18
370 0.18
371 0.22
372 0.21
373 0.25
374 0.27
375 0.31
376 0.39
377 0.48
378 0.58
379 0.64
380 0.73
381 0.78
382 0.85
383 0.92
384 0.93
385 0.95
386 0.96
387 0.96
388 0.95
389 0.95
390 0.94
391 0.94
392 0.94
393 0.94