FuNGI

V5F963

Protein Details

Accession

V5F963

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
72-103	RKSGRASKSGSKARSRRKPKHKDHQVSPDAQA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
72-93	RKSGRASKSGSKARSRRKPKHK

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 10, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR006594 LisH IPR007582 TFIID_NTD2 IPR037264 TFIID_NTD2_sf IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003743 F:translation initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF04494 TFIID_NTD2 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50896 LISH PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd08044 TAF5_NTD2 cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSAPGGAPSPAPRSASIGPGGGMPIPPQQPMPSPQVGSGTPGPATGSTGVMSQQNLNQITRYLAPITSKMTRKSGRASKSGSKARSRRKPKHKDHQVSPDAQANVQPAPGVAAAEDPGDVAVTKASSVTSDESTIKADSRRQSTSTLQDFEIHESAESLEHFSEMAAASQEDFLAGPSRTDRFRYRRLDQTKDSAQDEIRALTEQRQARESVALAIQKDNSPAKASEPSASLAPPDGFPVAPDGDSSVVTPSKKKSASGSGKKSTNETCSANPRSQGSIFPASQSVSSASAPPQRAPRQAASSQSTRALVQEYFASQVSDPGYDPAPGEQPKQRASGRRRPKSSTTDPTVGLSVYPEDDPLLSGFPPSCIQRPIRPRPDKQTNVPPTTDEPAILSPQGNSPVQGTDSQLNSVIDYLAKKGYSRTEAMLRMESANQEIDGRPLPPLGEDARPKYRAGFELLKSWVEDNLDLYKPELRRVLWPLFVYSFLSLVTSFYPQDAKQFFASNKNLFLPEHNEDIRALEPISLPEHAQDNSVAKIYRGNKYRLILSNPAFSNLMQFLENKQKEGGSVMSAILSSYCTVITKERTADDRFSFAAMLGKSSDAQTFPLEDEGIPGHHPGSAYTGDNPAMTGTLPRLKLGKLAPDSQLEEDVRGELADEDAKNPPAAGRNTLVQEYDQMIKKEEEDDAPTRAEIPYPPSTARDVAMEVQKVKENRDRFKIEGRTGGVGPAVSVCMFTFHNTYDGITCLDFSDDNMLVAAGMQESYIRVWSLDGQKIKPTHEGIDDKPLANSHRLIGHSGPIYAVAFAPSATPADGSLAPTNVRFLLSSSADKTIRLWSLDLWQCMVVYKGHDHPVWDLSWGPYGYYFVSGGHDKTARLWATDRIRQQRIFAGHDQDVDCVCFHPNSAYIFTGSCDRTVRMWAVTTGNAVRMFTGHTGNITALACSKNGKILASADDQGSIILWDLAPGRQLKRMRGHGKGGIWSLSWSAESTVLVSGGADGTVRVWDVAGPAQDPAATQGRVVGEGGAGTKIDAGNASAAGAQPSASVGPGANKKKGKDVVVTPDQISAFPTKKSPVYKVKFTNMNLIVAGGAYLP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.33
3	0.31
4	0.27
5	0.24
6	0.23
7	0.23
8	0.18
9	0.16
10	0.14
11	0.18
12	0.18
13	0.19
14	0.2
15	0.22
16	0.26
17	0.3
18	0.35
19	0.34
20	0.33
21	0.34
22	0.36
23	0.34
24	0.34
25	0.32
26	0.28
27	0.23
28	0.22
29	0.21
30	0.18
31	0.2
32	0.16
33	0.14
34	0.12
35	0.13
36	0.14
37	0.15
38	0.16
39	0.16
40	0.17
41	0.23
42	0.26
43	0.26
44	0.25
45	0.24
46	0.26
47	0.25
48	0.25
49	0.2
50	0.2
51	0.21
52	0.23
53	0.28
54	0.33
55	0.37
56	0.38
57	0.46
58	0.49
59	0.51
60	0.58
61	0.61
62	0.6
63	0.62
64	0.66
65	0.65
66	0.71
67	0.75
68	0.72
69	0.74
70	0.76
71	0.8
72	0.83
73	0.85
74	0.86
75	0.88
76	0.92
77	0.93
78	0.95
79	0.95
80	0.95
81	0.93
82	0.93
83	0.9
84	0.83
85	0.76
86	0.72
87	0.61
88	0.51
89	0.44
90	0.35
91	0.28
92	0.23
93	0.19
94	0.12
95	0.13
96	0.13
97	0.1
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.08
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.05
108	0.06
109	0.05
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.07
114	0.09
115	0.12
116	0.13
117	0.16
118	0.17
119	0.17
120	0.19
121	0.2
122	0.2
123	0.21
124	0.26
125	0.3
126	0.35
127	0.38
128	0.38
129	0.42
130	0.45
131	0.51
132	0.51
133	0.47
134	0.42
135	0.42
136	0.41
137	0.42
138	0.37
139	0.28
140	0.21
141	0.18
142	0.18
143	0.15
144	0.14
145	0.11
146	0.1
147	0.09
148	0.09
149	0.08
150	0.09
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.13
165	0.16
166	0.18
167	0.23
168	0.31
169	0.35
170	0.45
171	0.52
172	0.56
173	0.64
174	0.7
175	0.73
176	0.69
177	0.7
178	0.68
179	0.65
180	0.6
181	0.53
182	0.45
183	0.41
184	0.37
185	0.29
186	0.23
187	0.19
188	0.19
189	0.2
190	0.27
191	0.26
192	0.27
193	0.28
194	0.29
195	0.28
196	0.3
197	0.25
198	0.21
199	0.2
200	0.21
201	0.2
202	0.21
203	0.21
204	0.2
205	0.23
206	0.23
207	0.2
208	0.21
209	0.2
210	0.22
211	0.26
212	0.26
213	0.24
214	0.24
215	0.24
216	0.22
217	0.22
218	0.19
219	0.16
220	0.15
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.11
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.13
236	0.14
237	0.17
238	0.19
239	0.26
240	0.27
241	0.28
242	0.3
243	0.38
244	0.48
245	0.55
246	0.61
247	0.61
248	0.65
249	0.64
250	0.64
251	0.57
252	0.51
253	0.46
254	0.4
255	0.37
256	0.41
257	0.45
258	0.43
259	0.41
260	0.38
261	0.37
262	0.35
263	0.32
264	0.29
265	0.3
266	0.28
267	0.27
268	0.26
269	0.23
270	0.22
271	0.2
272	0.16
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.15
277	0.2
278	0.21
279	0.23
280	0.31
281	0.34
282	0.38
283	0.42
284	0.43
285	0.43
286	0.45
287	0.48
288	0.45
289	0.43
290	0.39
291	0.37
292	0.33
293	0.27
294	0.25
295	0.21
296	0.16
297	0.14
298	0.13
299	0.12
300	0.13
301	0.12
302	0.13
303	0.1
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.15
314	0.16
315	0.19
316	0.22
317	0.26
318	0.28
319	0.34
320	0.36
321	0.4
322	0.48
323	0.55
324	0.61
325	0.66
326	0.69
327	0.7
328	0.74
329	0.74
330	0.74
331	0.72
332	0.68
333	0.62
334	0.57
335	0.52
336	0.45
337	0.35
338	0.26
339	0.18
340	0.11
341	0.09
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.1
354	0.11
355	0.13
356	0.16
357	0.19
358	0.26
359	0.36
360	0.45
361	0.54
362	0.6
363	0.64
364	0.7
365	0.78
366	0.76
367	0.73
368	0.74
369	0.71
370	0.67
371	0.62
372	0.54
373	0.46
374	0.44
375	0.37
376	0.26
377	0.19
378	0.16
379	0.17
380	0.15
381	0.12
382	0.09
383	0.11
384	0.14
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.12
389	0.12
390	0.13
391	0.13
392	0.13
393	0.14
394	0.14
395	0.15
396	0.14
397	0.13
398	0.12
399	0.11
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.11
407	0.14
408	0.16
409	0.17
410	0.19
411	0.22
412	0.25
413	0.26
414	0.26
415	0.23
416	0.21
417	0.2
418	0.18
419	0.14
420	0.12
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.08
431	0.1
432	0.1
433	0.14
434	0.17
435	0.21
436	0.27
437	0.28
438	0.28
439	0.28
440	0.28
441	0.25
442	0.27
443	0.28
444	0.23
445	0.27
446	0.28
447	0.27
448	0.25
449	0.24
450	0.19
451	0.14
452	0.13
453	0.1
454	0.12
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.15
459	0.15
460	0.18
461	0.18
462	0.15
463	0.19
464	0.24
465	0.26
466	0.24
467	0.24
468	0.23
469	0.22
470	0.21
471	0.19
472	0.13
473	0.11
474	0.08
475	0.08
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.09
483	0.09
484	0.14
485	0.14
486	0.16
487	0.15
488	0.19
489	0.19
490	0.25
491	0.29
492	0.25
493	0.26
494	0.25
495	0.25
496	0.22
497	0.22
498	0.2
499	0.18
500	0.21
501	0.2
502	0.19
503	0.18
504	0.19
505	0.18
506	0.13
507	0.11
508	0.07
509	0.07
510	0.08
511	0.09
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.11
522	0.1
523	0.09
524	0.14
525	0.17
526	0.22
527	0.25
528	0.27
529	0.3
530	0.31
531	0.35
532	0.33
533	0.34
534	0.34
535	0.31
536	0.33
537	0.3
538	0.3
539	0.26
540	0.22
541	0.2
542	0.15
543	0.14
544	0.09
545	0.09
546	0.1
547	0.2
548	0.2
549	0.19
550	0.19
551	0.18
552	0.18
553	0.19
554	0.17
555	0.08
556	0.08
557	0.08
558	0.07
559	0.07
560	0.07
561	0.05
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.05
568	0.08
569	0.1
570	0.12
571	0.13
572	0.15
573	0.19
574	0.21
575	0.24
576	0.22
577	0.22
578	0.2
579	0.19
580	0.17
581	0.14
582	0.15
583	0.11
584	0.11
585	0.09
586	0.09
587	0.09
588	0.1
589	0.11
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.07
598	0.08
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.06
607	0.09
608	0.1
609	0.1
610	0.11
611	0.12
612	0.12
613	0.12
614	0.11
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.07
620	0.11
621	0.11
622	0.12
623	0.13
624	0.13
625	0.17
626	0.18
627	0.23
628	0.21
629	0.24
630	0.25
631	0.26
632	0.28
633	0.24
634	0.27
635	0.2
636	0.17
637	0.15
638	0.13
639	0.11
640	0.09
641	0.08
642	0.05
643	0.05
644	0.07
645	0.07
646	0.08
647	0.1
648	0.11
649	0.1
650	0.1
651	0.11
652	0.14
653	0.15
654	0.16
655	0.16
656	0.18
657	0.2
658	0.2
659	0.2
660	0.14
661	0.15
662	0.14
663	0.17
664	0.18
665	0.17
666	0.18
667	0.18
668	0.19
669	0.18
670	0.18
671	0.15
672	0.16
673	0.18
674	0.17
675	0.17
676	0.17
677	0.16
678	0.15
679	0.14
680	0.11
681	0.15
682	0.16
683	0.18
684	0.19
685	0.2
686	0.22
687	0.22
688	0.22
689	0.17
690	0.14
691	0.16
692	0.18
693	0.18
694	0.17
695	0.18
696	0.21
697	0.21
698	0.24
699	0.28
700	0.31
701	0.35
702	0.42
703	0.45
704	0.44
705	0.52
706	0.55
707	0.5
708	0.49
709	0.45
710	0.4
711	0.35
712	0.33
713	0.24
714	0.17
715	0.14
716	0.09
717	0.08
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.06
722	0.07
723	0.08
724	0.09
725	0.09
726	0.11
727	0.11
728	0.12
729	0.11
730	0.11
731	0.11
732	0.09
733	0.09
734	0.08
735	0.09
736	0.08
737	0.07
738	0.11
739	0.1
740	0.1
741	0.09
742	0.09
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.03
747	0.03
748	0.03
749	0.03
750	0.04
751	0.04
752	0.05
753	0.05
754	0.05
755	0.06
756	0.11
757	0.16
758	0.22
759	0.25
760	0.26
761	0.31
762	0.33
763	0.35
764	0.34
765	0.31
766	0.28
767	0.31
768	0.34
769	0.3
770	0.37
771	0.37
772	0.33
773	0.32
774	0.31
775	0.27
776	0.25
777	0.24
778	0.17
779	0.19
780	0.19
781	0.21
782	0.2
783	0.22
784	0.2
785	0.19
786	0.17
787	0.14
788	0.13
789	0.11
790	0.11
791	0.07
792	0.06
793	0.06
794	0.07
795	0.06
796	0.07
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.08
801	0.09
802	0.11
803	0.12
804	0.12
805	0.13
806	0.13
807	0.14
808	0.12
809	0.12
810	0.09
811	0.09
812	0.13
813	0.15
814	0.18
815	0.18
816	0.23
817	0.23
818	0.23
819	0.23
820	0.23
821	0.23
822	0.22
823	0.2
824	0.16
825	0.25
826	0.29
827	0.28
828	0.25
829	0.23
830	0.21
831	0.21
832	0.21
833	0.13
834	0.11
835	0.14
836	0.17
837	0.22
838	0.22
839	0.23
840	0.24
841	0.26
842	0.24
843	0.21
844	0.19
845	0.15
846	0.19
847	0.17
848	0.15
849	0.13
850	0.14
851	0.13
852	0.14
853	0.13
854	0.09
855	0.12
856	0.14
857	0.14
858	0.17
859	0.18
860	0.16
861	0.18
862	0.25
863	0.22
864	0.22
865	0.24
866	0.28
867	0.34
868	0.41
869	0.47
870	0.49
871	0.55
872	0.54
873	0.54
874	0.53
875	0.5
876	0.49
877	0.45
878	0.42
879	0.38
880	0.4
881	0.38
882	0.33
883	0.29
884	0.24
885	0.2
886	0.15
887	0.15
888	0.11
889	0.11
890	0.11
891	0.14
892	0.15
893	0.18
894	0.18
895	0.17
896	0.17
897	0.18
898	0.22
899	0.2
900	0.19
901	0.19
902	0.19
903	0.19
904	0.23
905	0.24
906	0.2
907	0.21
908	0.21
909	0.21
910	0.21
911	0.23
912	0.2
913	0.22
914	0.21
915	0.19
916	0.16
917	0.14
918	0.16
919	0.15
920	0.17
921	0.13
922	0.13
923	0.14
924	0.14
925	0.17
926	0.14
927	0.13
928	0.13
929	0.13
930	0.13
931	0.15
932	0.15
933	0.17
934	0.18
935	0.18
936	0.17
937	0.19
938	0.22
939	0.24
940	0.25
941	0.21
942	0.2
943	0.19
944	0.17
945	0.15
946	0.11
947	0.08
948	0.06
949	0.06
950	0.06
951	0.08
952	0.08
953	0.12
954	0.15
955	0.17
956	0.24
957	0.28
958	0.35
959	0.43
960	0.53
961	0.57
962	0.6
963	0.64
964	0.63
965	0.63
966	0.6
967	0.54
968	0.45
969	0.38
970	0.33
971	0.27
972	0.21
973	0.18
974	0.14
975	0.12
976	0.12
977	0.11
978	0.11
979	0.11
980	0.1
981	0.09
982	0.08
983	0.07
984	0.06
985	0.06
986	0.05
987	0.04
988	0.05
989	0.06
990	0.06
991	0.06
992	0.06
993	0.06
994	0.08
995	0.11
996	0.12
997	0.12
998	0.12
999	0.12
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.15
1003	0.17
1004	0.16
1005	0.15
1006	0.18
1007	0.19
1008	0.2
1009	0.2
1010	0.16
1011	0.1
1012	0.11
1013	0.12
1014	0.09
1015	0.08
1016	0.07
1017	0.09
1018	0.08
1019	0.09
1020	0.09
1021	0.09
1022	0.09
1023	0.09
1024	0.1
1025	0.08
1026	0.09
1027	0.1
1028	0.09
1029	0.08
1030	0.07
1031	0.08
1032	0.08
1033	0.07
1034	0.08
1035	0.07
1036	0.15
1037	0.24
1038	0.3
1039	0.37
1040	0.42
1041	0.44
1042	0.52
1043	0.58
1044	0.56
1045	0.55
1046	0.56
1047	0.58
1048	0.61
1049	0.63
1050	0.54
1051	0.52
1052	0.47
1053	0.4
1054	0.35
1055	0.32
1056	0.26
1057	0.24
1058	0.27
1059	0.27
1060	0.33
1061	0.39
1062	0.46
1063	0.5
1064	0.56
1065	0.64
1066	0.68
1067	0.72
1068	0.74
1069	0.7
1070	0.72
1071	0.63
1072	0.57
1073	0.48
1074	0.4
1075	0.31
1076	0.22

V5F963

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer