FuNGI

V5GDR6

Protein Details

Accession

V5GDR6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-135	DTKTWLIQAKKKQKKIEKERARKLAEE	Hydrophilic
281-306	DISEVKIKKPKKKKAKSTRQKVVDDD	Basic
361-385	ALQRRAAFKKRKKMRPEDLARQLRE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
71-87	AKRRREEKNAAIKKARE
118-131	KKKQKKIEKERARK
286-299	KIKKPKKKKAKSTR
365-375	RAAFKKRKKMR
629-636	KTEKHLKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.666, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MADALSIEQNNKIRVALGLKPLPVPGAAPATESKSDDAGSGSEQEDPGSTLESRSAQAGDNWKRHLEEADAKRRREEKNAAIKKAREAAQRNRQLEGQTLGELDDASVDTKTWLIQAKKKQKKIEKERARKLAEELAERERIAEYTTADLAGVKVGHDIGELEAGGEQILTLKDTTIDENEEEGDELENLNLREQEKLKEKLELKKKRTAYDPTEESSGILGHYDDEIEGKKRKRFTLDGQGSTAEEREAKRQDVSEKLKTHAISLDIAPEPAAPVSDYMDISEVKIKKPKKKKAKSTRQKVVDDDDIFPTADSTASPAGGTSNGDSMDVDSAANWAAPAVRRRSEETSFVDDEDLQASLALQRRAAFKKRKKMRPEDLARQLREEESQTPMETGEEEEPGLVIDETSEFVSNLQKPTLPERRERQSTTPAAREPSVKRESPDEEDVDMERVYNDVEDEEELKERIKREDSIKQEGSAPPEISVTGLDEESTLDQGLGATLSMLKQRGLVKQTDATELNSLHRDRQRFLQEKYRRETEAEKRARLQRERNRTSGKLDRMSAREREEYAQWENRQRDQQESRQMAEIFNREYKPDVQLKYVDDHGRLMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGRMKTEKHLKKIEEEKKREAMSALDSSQHTGMNNAMGDAARRNRQAGVRLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.26
4	0.31
5	0.33
6	0.34
7	0.35
8	0.34
9	0.32
10	0.27
11	0.22
12	0.17
13	0.17
14	0.16
15	0.18
16	0.19
17	0.23
18	0.25
19	0.26
20	0.24
21	0.21
22	0.22
23	0.2
24	0.19
25	0.15
26	0.14
27	0.16
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.15
32	0.14
33	0.14
34	0.13
35	0.13
36	0.13
37	0.12
38	0.14
39	0.16
40	0.16
41	0.16
42	0.17
43	0.15
44	0.2
45	0.29
46	0.35
47	0.39
48	0.42
49	0.43
50	0.43
51	0.43
52	0.41
53	0.37
54	0.38
55	0.43
56	0.51
57	0.56
58	0.55
59	0.61
60	0.66
61	0.64
62	0.63
63	0.62
64	0.61
65	0.65
66	0.73
67	0.74
68	0.74
69	0.72
70	0.68
71	0.67
72	0.62
73	0.6
74	0.59
75	0.62
76	0.65
77	0.72
78	0.69
79	0.63
80	0.6
81	0.53
82	0.49
83	0.42
84	0.33
85	0.24
86	0.22
87	0.2
88	0.17
89	0.16
90	0.11
91	0.08
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.1
100	0.16
101	0.2
102	0.28
103	0.39
104	0.5
105	0.59
106	0.67
107	0.74
108	0.77
109	0.83
110	0.87
111	0.88
112	0.88
113	0.89
114	0.91
115	0.91
116	0.85
117	0.76
118	0.69
119	0.64
120	0.57
121	0.51
122	0.44
123	0.39
124	0.38
125	0.35
126	0.32
127	0.26
128	0.22
129	0.18
130	0.16
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.12
135	0.11
136	0.11
137	0.1
138	0.1
139	0.09
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.07
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.05
153	0.05
154	0.04
155	0.05
156	0.05
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.07
161	0.08
162	0.1
163	0.1
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.13
168	0.12
169	0.11
170	0.1
171	0.09
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.08
176	0.08
177	0.09
178	0.11
179	0.11
180	0.15
181	0.16
182	0.22
183	0.28
184	0.33
185	0.33
186	0.38
187	0.43
188	0.48
189	0.57
190	0.61
191	0.59
192	0.63
193	0.66
194	0.62
195	0.64
196	0.64
197	0.6
198	0.58
199	0.56
200	0.5
201	0.48
202	0.43
203	0.36
204	0.28
205	0.22
206	0.13
207	0.09
208	0.07
209	0.05
210	0.06
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.07
215	0.11
216	0.18
217	0.22
218	0.26
219	0.31
220	0.34
221	0.39
222	0.43
223	0.46
224	0.52
225	0.55
226	0.53
227	0.5
228	0.47
229	0.42
230	0.36
231	0.29
232	0.18
233	0.13
234	0.11
235	0.16
236	0.18
237	0.19
238	0.2
239	0.22
240	0.25
241	0.31
242	0.37
243	0.38
244	0.38
245	0.39
246	0.41
247	0.39
248	0.37
249	0.29
250	0.24
251	0.18
252	0.16
253	0.17
254	0.13
255	0.13
256	0.12
257	0.1
258	0.09
259	0.08
260	0.08
261	0.04
262	0.04
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.09
268	0.08
269	0.09
270	0.14
271	0.14
272	0.15
273	0.21
274	0.27
275	0.35
276	0.46
277	0.55
278	0.61
279	0.71
280	0.8
281	0.85
282	0.91
283	0.92
284	0.93
285	0.92
286	0.89
287	0.82
288	0.73
289	0.66
290	0.61
291	0.53
292	0.43
293	0.35
294	0.27
295	0.24
296	0.21
297	0.16
298	0.1
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.03
324	0.04
325	0.06
326	0.1
327	0.13
328	0.16
329	0.18
330	0.22
331	0.26
332	0.28
333	0.3
334	0.31
335	0.33
336	0.3
337	0.29
338	0.26
339	0.21
340	0.19
341	0.15
342	0.11
343	0.05
344	0.05
345	0.04
346	0.07
347	0.1
348	0.1
349	0.1
350	0.12
351	0.17
352	0.21
353	0.3
354	0.37
355	0.42
356	0.52
357	0.62
358	0.69
359	0.74
360	0.8
361	0.81
362	0.81
363	0.82
364	0.81
365	0.81
366	0.8
367	0.71
368	0.63
369	0.54
370	0.44
371	0.37
372	0.3
373	0.21
374	0.17
375	0.17
376	0.16
377	0.15
378	0.14
379	0.13
380	0.11
381	0.11
382	0.08
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.03
391	0.03
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.1
399	0.12
400	0.13
401	0.13
402	0.14
403	0.15
404	0.24
405	0.32
406	0.31
407	0.36
408	0.42
409	0.49
410	0.54
411	0.57
412	0.53
413	0.53
414	0.57
415	0.55
416	0.53
417	0.47
418	0.43
419	0.41
420	0.42
421	0.36
422	0.37
423	0.37
424	0.34
425	0.33
426	0.35
427	0.38
428	0.38
429	0.39
430	0.32
431	0.28
432	0.28
433	0.27
434	0.24
435	0.19
436	0.14
437	0.1
438	0.08
439	0.08
440	0.06
441	0.06
442	0.04
443	0.05
444	0.06
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.09
449	0.11
450	0.13
451	0.14
452	0.18
453	0.2
454	0.23
455	0.28
456	0.36
457	0.41
458	0.47
459	0.47
460	0.43
461	0.45
462	0.42
463	0.41
464	0.37
465	0.31
466	0.22
467	0.21
468	0.2
469	0.16
470	0.14
471	0.11
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.04
486	0.03
487	0.04
488	0.05
489	0.07
490	0.08
491	0.08
492	0.12
493	0.16
494	0.21
495	0.24
496	0.26
497	0.27
498	0.31
499	0.33
500	0.33
501	0.31
502	0.27
503	0.27
504	0.26
505	0.25
506	0.26
507	0.25
508	0.28
509	0.32
510	0.33
511	0.32
512	0.39
513	0.47
514	0.49
515	0.52
516	0.56
517	0.59
518	0.64
519	0.69
520	0.66
521	0.57
522	0.54
523	0.58
524	0.57
525	0.59
526	0.59
527	0.56
528	0.58
529	0.64
530	0.69
531	0.69
532	0.7
533	0.69
534	0.73
535	0.75
536	0.77
537	0.76
538	0.7
539	0.7
540	0.69
541	0.67
542	0.61
543	0.59
544	0.57
545	0.55
546	0.57
547	0.55
548	0.5
549	0.46
550	0.43
551	0.42
552	0.38
553	0.38
554	0.39
555	0.42
556	0.42
557	0.47
558	0.48
559	0.52
560	0.56
561	0.53
562	0.56
563	0.56
564	0.59
565	0.61
566	0.61
567	0.57
568	0.55
569	0.54
570	0.46
571	0.44
572	0.4
573	0.34
574	0.36
575	0.35
576	0.3
577	0.33
578	0.33
579	0.35
580	0.38
581	0.36
582	0.34
583	0.37
584	0.38
585	0.38
586	0.43
587	0.39
588	0.33
589	0.33
590	0.31
591	0.33
592	0.35
593	0.34
594	0.34
595	0.35
596	0.37
597	0.37
598	0.42
599	0.39
600	0.36
601	0.42
602	0.43
603	0.46
604	0.46
605	0.51
606	0.48
607	0.47
608	0.54
609	0.5
610	0.49
611	0.47
612	0.5
613	0.47
614	0.5
615	0.49
616	0.51
617	0.58
618	0.6
619	0.63
620	0.66
621	0.64
622	0.67
623	0.76
624	0.76
625	0.77
626	0.75
627	0.74
628	0.73
629	0.72
630	0.64
631	0.54
632	0.48
633	0.42
634	0.4
635	0.34
636	0.3
637	0.29
638	0.3
639	0.3
640	0.28
641	0.22
642	0.18
643	0.18
644	0.18
645	0.17
646	0.14
647	0.14
648	0.13
649	0.15
650	0.2
651	0.25
652	0.28
653	0.3
654	0.32
655	0.36
656	0.41

V5GDR6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer