Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5HWP0

Protein Details
Accession V5HWP0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-164GPSYRLLPKRERQKPCSGRDQLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 8.5, cyto_mito 6, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013194  HDAC_interact_dom  
IPR003822  PAH  
IPR036600  PAH_sf  
IPR039774  Sin3-like  
IPR031693  Sin3_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02671  PAH  
PF08295  Sin3_corepress  
PF16879  Sin3a_C  
Amino Acid Sequences MEDRRHSFFLSFVRAKVHHTKPTQIEAPAVSPTLVPALPEPIPPTFSLTPNHDEFAFFDRVKKFIGNKQTFSEFLKLCNLYSTDLIDRNVLVKRAAGFIGSNQELMSWFKRFMHIDDPEDKIIDLKPKQESGVVNLSHCRSLGPSYRLLPKRERQKPCSGRDQLCYSVLNDEWASHPTWESEDSGFVAHRKNQFEDALHRIEEDRHDYDHHIEACTRTIQLIEPIVQQLLVMSEAERAAFKLPPGLGGQSEAIYQRVIKKIYDRQRGQKVIQDMFDRPCHILPIVLFRLKQKCEEWKASQREWDKVWREQTQKAYWRSLDHQAIASRGSDKKLFVAKHIQHEIQAKFEEIRNLRKSGYQVPKHQFELAFTDPAVIIDATHLLLIFIDRNSAGFGSDPQRVMAFIKDFIPIFYGMDRDTFHMYMNEVSSEASPGEEVDEESVAPEDISTTRSKRAVNGKKLDLLRDVLERRTERSNRGDKEGSASISRDGTPDAVLIPSTPIPDPTEPFDVAELKWMEHPGQGNFNLQREYILNESYEKKVHHLYANLNIYCFFRTFEILYSRLLRIKLHEKDAHEDVRRALQPKAAHDLGMIDKLPTEFLYDTDPKANFYQQIVRMCEEVVKGDMEASHLEETLRRYWLKSGYQLYNLEKMLSGIARFAGGIFNSDPKDKSVDIINLFFKERDREETTHNQEIQYRKQVERLVKDGDIYRITYDPTSQHAKIQLMTPEDSTLENEELSQEARWSYYVSAYTMRDPTEGVPFSQMRMPFLKRNLPPKMEQDEEYNRYYRPLVNHDGLVIRICANSYHILYEPGSYDWWWRPSAAGQESAEEKAKEEAAVKERRRDRFMEKFVNNPSWAHGLSKDEVDESNQGFRSWIKGPEAGETAPIEKAEEAQPQEKEDTEMADAEQPSASENKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.44
3 0.5
4 0.51
5 0.51
6 0.53
7 0.6
8 0.59
9 0.67
10 0.65
11 0.56
12 0.52
13 0.45
14 0.42
15 0.36
16 0.3
17 0.23
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.14
22 0.12
23 0.11
24 0.15
25 0.16
26 0.18
27 0.2
28 0.19
29 0.21
30 0.21
31 0.27
32 0.26
33 0.28
34 0.31
35 0.34
36 0.38
37 0.38
38 0.39
39 0.32
40 0.3
41 0.29
42 0.3
43 0.31
44 0.25
45 0.29
46 0.3
47 0.31
48 0.32
49 0.35
50 0.35
51 0.36
52 0.48
53 0.48
54 0.5
55 0.54
56 0.55
57 0.52
58 0.51
59 0.51
60 0.4
61 0.35
62 0.39
63 0.35
64 0.31
65 0.33
66 0.31
67 0.25
68 0.26
69 0.27
70 0.23
71 0.26
72 0.26
73 0.23
74 0.22
75 0.24
76 0.26
77 0.23
78 0.19
79 0.18
80 0.19
81 0.2
82 0.2
83 0.18
84 0.15
85 0.16
86 0.23
87 0.21
88 0.2
89 0.17
90 0.17
91 0.17
92 0.21
93 0.22
94 0.17
95 0.18
96 0.19
97 0.24
98 0.26
99 0.28
100 0.33
101 0.35
102 0.38
103 0.41
104 0.45
105 0.41
106 0.39
107 0.35
108 0.28
109 0.26
110 0.29
111 0.26
112 0.27
113 0.31
114 0.32
115 0.33
116 0.36
117 0.34
118 0.32
119 0.37
120 0.33
121 0.3
122 0.33
123 0.34
124 0.3
125 0.29
126 0.23
127 0.17
128 0.22
129 0.28
130 0.28
131 0.3
132 0.34
133 0.44
134 0.49
135 0.52
136 0.55
137 0.55
138 0.63
139 0.68
140 0.74
141 0.71
142 0.77
143 0.81
144 0.8
145 0.82
146 0.8
147 0.75
148 0.71
149 0.7
150 0.62
151 0.55
152 0.49
153 0.39
154 0.33
155 0.28
156 0.25
157 0.19
158 0.16
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.13
163 0.14
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.17
175 0.2
176 0.26
177 0.28
178 0.3
179 0.33
180 0.35
181 0.36
182 0.38
183 0.38
184 0.35
185 0.31
186 0.29
187 0.27
188 0.26
189 0.27
190 0.27
191 0.24
192 0.22
193 0.24
194 0.25
195 0.27
196 0.31
197 0.28
198 0.24
199 0.23
200 0.22
201 0.23
202 0.22
203 0.19
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.12
215 0.1
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.16
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.11
237 0.13
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.14
243 0.18
244 0.19
245 0.19
246 0.25
247 0.34
248 0.44
249 0.53
250 0.54
251 0.59
252 0.67
253 0.71
254 0.67
255 0.63
256 0.59
257 0.51
258 0.49
259 0.43
260 0.36
261 0.35
262 0.35
263 0.32
264 0.27
265 0.24
266 0.22
267 0.19
268 0.17
269 0.14
270 0.19
271 0.22
272 0.22
273 0.23
274 0.27
275 0.33
276 0.33
277 0.36
278 0.33
279 0.38
280 0.43
281 0.49
282 0.52
283 0.55
284 0.6
285 0.59
286 0.62
287 0.56
288 0.53
289 0.49
290 0.5
291 0.46
292 0.45
293 0.49
294 0.49
295 0.5
296 0.51
297 0.55
298 0.54
299 0.57
300 0.55
301 0.53
302 0.47
303 0.47
304 0.45
305 0.46
306 0.4
307 0.33
308 0.33
309 0.29
310 0.28
311 0.25
312 0.22
313 0.18
314 0.17
315 0.18
316 0.16
317 0.16
318 0.19
319 0.24
320 0.24
321 0.24
322 0.32
323 0.34
324 0.4
325 0.44
326 0.4
327 0.38
328 0.44
329 0.41
330 0.34
331 0.31
332 0.24
333 0.21
334 0.23
335 0.25
336 0.21
337 0.29
338 0.29
339 0.3
340 0.3
341 0.31
342 0.33
343 0.36
344 0.44
345 0.41
346 0.47
347 0.51
348 0.54
349 0.53
350 0.53
351 0.43
352 0.34
353 0.35
354 0.27
355 0.22
356 0.18
357 0.17
358 0.15
359 0.14
360 0.14
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.07
381 0.1
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.09
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.06
434 0.08
435 0.09
436 0.12
437 0.15
438 0.15
439 0.2
440 0.31
441 0.38
442 0.45
443 0.49
444 0.48
445 0.51
446 0.51
447 0.48
448 0.38
449 0.31
450 0.23
451 0.22
452 0.22
453 0.18
454 0.22
455 0.21
456 0.22
457 0.28
458 0.29
459 0.29
460 0.36
461 0.44
462 0.41
463 0.46
464 0.45
465 0.37
466 0.4
467 0.37
468 0.29
469 0.22
470 0.21
471 0.16
472 0.15
473 0.15
474 0.11
475 0.1
476 0.09
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.1
489 0.11
490 0.12
491 0.14
492 0.17
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.15
497 0.14
498 0.18
499 0.15
500 0.12
501 0.13
502 0.13
503 0.13
504 0.14
505 0.16
506 0.12
507 0.15
508 0.15
509 0.19
510 0.2
511 0.21
512 0.2
513 0.18
514 0.18
515 0.15
516 0.16
517 0.13
518 0.12
519 0.11
520 0.13
521 0.15
522 0.16
523 0.18
524 0.16
525 0.17
526 0.19
527 0.21
528 0.22
529 0.23
530 0.24
531 0.29
532 0.36
533 0.33
534 0.31
535 0.29
536 0.27
537 0.24
538 0.22
539 0.15
540 0.09
541 0.1
542 0.11
543 0.13
544 0.16
545 0.16
546 0.17
547 0.19
548 0.19
549 0.2
550 0.2
551 0.18
552 0.19
553 0.27
554 0.29
555 0.34
556 0.37
557 0.36
558 0.4
559 0.44
560 0.46
561 0.39
562 0.37
563 0.31
564 0.33
565 0.34
566 0.31
567 0.27
568 0.25
569 0.25
570 0.26
571 0.32
572 0.26
573 0.23
574 0.21
575 0.22
576 0.19
577 0.19
578 0.16
579 0.09
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.08
584 0.09
585 0.08
586 0.08
587 0.14
588 0.15
589 0.16
590 0.21
591 0.21
592 0.2
593 0.22
594 0.23
595 0.19
596 0.2
597 0.25
598 0.26
599 0.32
600 0.32
601 0.31
602 0.3
603 0.28
604 0.28
605 0.22
606 0.17
607 0.12
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.11
619 0.13
620 0.15
621 0.18
622 0.16
623 0.17
624 0.2
625 0.26
626 0.27
627 0.31
628 0.35
629 0.34
630 0.39
631 0.42
632 0.41
633 0.4
634 0.37
635 0.31
636 0.24
637 0.21
638 0.18
639 0.15
640 0.12
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.06
648 0.08
649 0.09
650 0.12
651 0.14
652 0.16
653 0.16
654 0.16
655 0.2
656 0.17
657 0.18
658 0.19
659 0.23
660 0.24
661 0.26
662 0.27
663 0.25
664 0.27
665 0.26
666 0.23
667 0.22
668 0.22
669 0.26
670 0.29
671 0.3
672 0.36
673 0.45
674 0.51
675 0.54
676 0.52
677 0.47
678 0.46
679 0.48
680 0.48
681 0.47
682 0.45
683 0.38
684 0.42
685 0.47
686 0.49
687 0.49
688 0.47
689 0.42
690 0.38
691 0.4
692 0.37
693 0.35
694 0.29
695 0.25
696 0.22
697 0.19
698 0.2
699 0.18
700 0.17
701 0.15
702 0.18
703 0.24
704 0.23
705 0.25
706 0.28
707 0.29
708 0.29
709 0.31
710 0.31
711 0.28
712 0.28
713 0.26
714 0.22
715 0.22
716 0.21
717 0.18
718 0.17
719 0.14
720 0.12
721 0.12
722 0.11
723 0.11
724 0.12
725 0.1
726 0.08
727 0.08
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.1
732 0.12
733 0.13
734 0.14
735 0.18
736 0.19
737 0.22
738 0.23
739 0.23
740 0.21
741 0.2
742 0.2
743 0.24
744 0.23
745 0.2
746 0.23
747 0.23
748 0.24
749 0.27
750 0.26
751 0.22
752 0.26
753 0.31
754 0.31
755 0.37
756 0.44
757 0.46
758 0.55
759 0.6
760 0.59
761 0.59
762 0.61
763 0.63
764 0.57
765 0.53
766 0.51
767 0.52
768 0.51
769 0.5
770 0.44
771 0.37
772 0.35
773 0.36
774 0.32
775 0.28
776 0.31
777 0.35
778 0.36
779 0.36
780 0.36
781 0.35
782 0.32
783 0.28
784 0.21
785 0.15
786 0.12
787 0.12
788 0.11
789 0.12
790 0.15
791 0.14
792 0.16
793 0.16
794 0.18
795 0.18
796 0.19
797 0.18
798 0.16
799 0.17
800 0.15
801 0.19
802 0.22
803 0.25
804 0.24
805 0.23
806 0.23
807 0.26
808 0.34
809 0.32
810 0.32
811 0.29
812 0.32
813 0.34
814 0.35
815 0.35
816 0.26
817 0.24
818 0.22
819 0.22
820 0.2
821 0.21
822 0.25
823 0.29
824 0.39
825 0.42
826 0.49
827 0.56
828 0.62
829 0.63
830 0.63
831 0.64
832 0.64
833 0.7
834 0.71
835 0.66
836 0.66
837 0.68
838 0.69
839 0.61
840 0.51
841 0.45
842 0.39
843 0.37
844 0.32
845 0.28
846 0.26
847 0.27
848 0.28
849 0.25
850 0.22
851 0.22
852 0.23
853 0.25
854 0.22
855 0.26
856 0.25
857 0.24
858 0.24
859 0.24
860 0.25
861 0.25
862 0.28
863 0.26
864 0.28
865 0.29
866 0.33
867 0.36
868 0.31
869 0.3
870 0.27
871 0.24
872 0.22
873 0.21
874 0.17
875 0.14
876 0.17
877 0.18
878 0.23
879 0.26
880 0.31
881 0.32
882 0.34
883 0.36
884 0.34
885 0.34
886 0.28
887 0.26
888 0.22
889 0.21
890 0.19
891 0.22
892 0.22
893 0.19
894 0.19
895 0.16
896 0.16