FuNGI

V5FQX5

Protein Details

Accession

V5FQX5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
498-521	QDVCHEGHRRKNPKRSRPSEQDIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
507-512	RKNPKR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012310 DNA_ligase_ATP-dep_cent IPR012308 DNA_ligase_ATP-dep_N IPR036599 DNA_ligase_N_sf IPR029710 LIG4 IPR012340 NA-bd_OB-fold
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0003677 F:DNA binding GO:0003910 F:DNA ligase (ATP) activity GO:0051103 P:DNA ligation involved in DNA repair GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006260 P:DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF04675 DNA_ligase_A_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50160 DNA_LIGASE_A3

Amino Acid Sequences

MGFKFSFLCDLLSDLEANRIVKASTAARGRDLDISTITSFVKLHRRQIHEKGTDLLALLSCFFPEKRTDRVYWLQDASLARIIARCLLLGVSRKGELDGWRASGGSDLGQCVENVMRQAENCIPNGQELTVEEIDAAMDKLASRCRFSGPRLRRQHTAVDVEDTLGPLYRRVSSRDAKWLTRLILKSYYPVVLPVRFILHKIHFLLPHLLLLQDSFEAAANQTFGRWIKLKKDYIPGLGDTVDLLLIGATYKSRDANALKNIQGLLWTHFHVGCLENKTAVSQLHALPKFKVVDVIDRHSLSQKSMHILNSIGRFRACDADSNPPFIVQKGHTGLPDMDAIFKVPFVVELLGSGFDKPSNASYFTLRFPRVLKIHVDRAFDETVSFAELQDLAEKARSVPTDELLQETITWKRRLQHKDKKSEFIIDKSPETTASCCSTPSRASLSAASVSPSLRQISQTSPSASRRSLVTAIPGTSPLCQEIQTTQDIKRRLSTAVQDVCHEGHRRKNPKRSRPSEQDIVIFMDTAQVSPLGCQKIPSPNYPLGSLDNIQPRKESTETGSRDSIMTPSVENENTVPRQAVSHEPTEKTELLKRDRRTAMHETVTTSVPQGPDQTISLQIDLQSPLTTIPMCLGRSFRLRAASGKDLAETEVCQFTSDLGHFIEKLTSMNIHKALSRSNPAAASANMALGIVLVDGARLKKYLDDISTIATVLTNRISSVQAGSPKLPPRGRLFVLDWRILIDWRDIDSMKLCLRDTWKPMAIDHFRSCIAWGRNPTAENGDKLQDEVQGQTEPKDPLPDQTDVTSRDDNGLSTVRTAWDYTMLHEFGEFISLEPLVHVNGDRYVNATAST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.17
3	0.19
4	0.19
5	0.17
6	0.16
7	0.15
8	0.15
9	0.19
10	0.18
11	0.22
12	0.28
13	0.29
14	0.32
15	0.34
16	0.35
17	0.36
18	0.35
19	0.3
20	0.25
21	0.27
22	0.24
23	0.24
24	0.22
25	0.17
26	0.17
27	0.19
28	0.28
29	0.3
30	0.39
31	0.46
32	0.54
33	0.62
34	0.71
35	0.77
36	0.71
37	0.68
38	0.62
39	0.55
40	0.47
41	0.39
42	0.31
43	0.21
44	0.17
45	0.15
46	0.12
47	0.1
48	0.12
49	0.11
50	0.12
51	0.19
52	0.23
53	0.29
54	0.35
55	0.38
56	0.43
57	0.51
58	0.55
59	0.53
60	0.51
61	0.44
62	0.43
63	0.41
64	0.37
65	0.32
66	0.26
67	0.21
68	0.2
69	0.2
70	0.19
71	0.18
72	0.14
73	0.11
74	0.12
75	0.15
76	0.19
77	0.22
78	0.21
79	0.22
80	0.23
81	0.23
82	0.26
83	0.25
84	0.25
85	0.25
86	0.24
87	0.24
88	0.23
89	0.22
90	0.2
91	0.17
92	0.14
93	0.13
94	0.11
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.12
99	0.13
100	0.12
101	0.12
102	0.14
103	0.14
104	0.13
105	0.18
106	0.23
107	0.25
108	0.25
109	0.25
110	0.24
111	0.24
112	0.25
113	0.21
114	0.15
115	0.13
116	0.18
117	0.16
118	0.15
119	0.14
120	0.12
121	0.12
122	0.12
123	0.11
124	0.04
125	0.05
126	0.05
127	0.08
128	0.15
129	0.17
130	0.2
131	0.21
132	0.27
133	0.32
134	0.37
135	0.46
136	0.48
137	0.57
138	0.65
139	0.68
140	0.67
141	0.65
142	0.67
143	0.63
144	0.6
145	0.51
146	0.45
147	0.4
148	0.36
149	0.33
150	0.25
151	0.19
152	0.15
153	0.13
154	0.1
155	0.12
156	0.15
157	0.16
158	0.2
159	0.27
160	0.32
161	0.36
162	0.45
163	0.49
164	0.47
165	0.49
166	0.49
167	0.45
168	0.45
169	0.43
170	0.36
171	0.37
172	0.35
173	0.33
174	0.31
175	0.29
176	0.22
177	0.24
178	0.24
179	0.19
180	0.2
181	0.18
182	0.2
183	0.19
184	0.21
185	0.23
186	0.22
187	0.25
188	0.27
189	0.3
190	0.27
191	0.29
192	0.32
193	0.27
194	0.25
195	0.21
196	0.18
197	0.14
198	0.13
199	0.11
200	0.07
201	0.06
202	0.06
203	0.05
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.09
211	0.09
212	0.13
213	0.17
214	0.2
215	0.27
216	0.35
217	0.4
218	0.42
219	0.5
220	0.49
221	0.49
222	0.48
223	0.41
224	0.34
225	0.3
226	0.25
227	0.16
228	0.13
229	0.09
230	0.06
231	0.05
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.12
242	0.15
243	0.22
244	0.28
245	0.32
246	0.31
247	0.33
248	0.32
249	0.27
250	0.26
251	0.21
252	0.17
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.15
258	0.14
259	0.15
260	0.16
261	0.18
262	0.18
263	0.17
264	0.16
265	0.17
266	0.18
267	0.16
268	0.14
269	0.12
270	0.15
271	0.23
272	0.25
273	0.26
274	0.25
275	0.28
276	0.28
277	0.25
278	0.26
279	0.18
280	0.24
281	0.26
282	0.3
283	0.3
284	0.29
285	0.3
286	0.3
287	0.29
288	0.23
289	0.23
290	0.2
291	0.19
292	0.21
293	0.22
294	0.18
295	0.19
296	0.21
297	0.24
298	0.23
299	0.21
300	0.19
301	0.18
302	0.18
303	0.22
304	0.19
305	0.17
306	0.19
307	0.28
308	0.29
309	0.32
310	0.31
311	0.27
312	0.26
313	0.23
314	0.23
315	0.14
316	0.18
317	0.17
318	0.19
319	0.18
320	0.19
321	0.19
322	0.17
323	0.18
324	0.13
325	0.11
326	0.1
327	0.1
328	0.08
329	0.08
330	0.07
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.08
346	0.09
347	0.11
348	0.12
349	0.14
350	0.16
351	0.18
352	0.23
353	0.21
354	0.21
355	0.21
356	0.26
357	0.25
358	0.25
359	0.28
360	0.27
361	0.35
362	0.37
363	0.38
364	0.33
365	0.35
366	0.33
367	0.28
368	0.23
369	0.15
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.09
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.14
389	0.14
390	0.15
391	0.13
392	0.12
393	0.1
394	0.11
395	0.15
396	0.17
397	0.18
398	0.19
399	0.23
400	0.32
401	0.41
402	0.5
403	0.57
404	0.61
405	0.7
406	0.73
407	0.72
408	0.65
409	0.63
410	0.54
411	0.47
412	0.44
413	0.35
414	0.32
415	0.27
416	0.26
417	0.19
418	0.18
419	0.16
420	0.12
421	0.13
422	0.12
423	0.12
424	0.13
425	0.14
426	0.14
427	0.15
428	0.17
429	0.15
430	0.16
431	0.16
432	0.17
433	0.16
434	0.15
435	0.14
436	0.11
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.1
441	0.09
442	0.1
443	0.11
444	0.13
445	0.16
446	0.18
447	0.19
448	0.22
449	0.25
450	0.26
451	0.25
452	0.23
453	0.21
454	0.21
455	0.21
456	0.17
457	0.17
458	0.16
459	0.16
460	0.16
461	0.16
462	0.13
463	0.12
464	0.12
465	0.1
466	0.09
467	0.08
468	0.09
469	0.09
470	0.11
471	0.13
472	0.15
473	0.18
474	0.22
475	0.24
476	0.24
477	0.26
478	0.25
479	0.23
480	0.24
481	0.24
482	0.27
483	0.3
484	0.29
485	0.28
486	0.28
487	0.27
488	0.28
489	0.28
490	0.22
491	0.26
492	0.35
493	0.44
494	0.52
495	0.61
496	0.68
497	0.76
498	0.84
499	0.84
500	0.84
501	0.82
502	0.81
503	0.77
504	0.68
505	0.59
506	0.5
507	0.44
508	0.34
509	0.25
510	0.17
511	0.14
512	0.11
513	0.09
514	0.08
515	0.06
516	0.06
517	0.07
518	0.12
519	0.11
520	0.11
521	0.12
522	0.14
523	0.23
524	0.26
525	0.28
526	0.29
527	0.31
528	0.33
529	0.33
530	0.31
531	0.24
532	0.24
533	0.22
534	0.21
535	0.26
536	0.27
537	0.26
538	0.25
539	0.25
540	0.27
541	0.27
542	0.24
543	0.2
544	0.27
545	0.3
546	0.33
547	0.33
548	0.29
549	0.28
550	0.27
551	0.23
552	0.15
553	0.13
554	0.09
555	0.1
556	0.12
557	0.12
558	0.12
559	0.12
560	0.16
561	0.16
562	0.17
563	0.15
564	0.13
565	0.13
566	0.15
567	0.21
568	0.19
569	0.25
570	0.28
571	0.28
572	0.3
573	0.34
574	0.32
575	0.28
576	0.3
577	0.31
578	0.35
579	0.42
580	0.43
581	0.47
582	0.51
583	0.51
584	0.53
585	0.54
586	0.52
587	0.49
588	0.47
589	0.4
590	0.38
591	0.37
592	0.3
593	0.23
594	0.19
595	0.15
596	0.15
597	0.14
598	0.13
599	0.13
600	0.14
601	0.14
602	0.15
603	0.16
604	0.15
605	0.14
606	0.14
607	0.14
608	0.14
609	0.14
610	0.1
611	0.1
612	0.09
613	0.1
614	0.09
615	0.07
616	0.08
617	0.11
618	0.12
619	0.13
620	0.15
621	0.17
622	0.22
623	0.25
624	0.26
625	0.26
626	0.27
627	0.3
628	0.34
629	0.36
630	0.33
631	0.31
632	0.29
633	0.25
634	0.25
635	0.22
636	0.16
637	0.14
638	0.13
639	0.13
640	0.12
641	0.12
642	0.11
643	0.13
644	0.13
645	0.12
646	0.11
647	0.12
648	0.11
649	0.12
650	0.12
651	0.1
652	0.1
653	0.1
654	0.13
655	0.13
656	0.18
657	0.19
658	0.19
659	0.21
660	0.22
661	0.25
662	0.27
663	0.31
664	0.28
665	0.29
666	0.28
667	0.28
668	0.29
669	0.25
670	0.23
671	0.18
672	0.16
673	0.13
674	0.12
675	0.1
676	0.08
677	0.07
678	0.03
679	0.03
680	0.03
681	0.03
682	0.05
683	0.06
684	0.07
685	0.07
686	0.08
687	0.1
688	0.14
689	0.18
690	0.18
691	0.21
692	0.21
693	0.23
694	0.23
695	0.21
696	0.18
697	0.14
698	0.13
699	0.11
700	0.12
701	0.09
702	0.09
703	0.11
704	0.12
705	0.12
706	0.14
707	0.17
708	0.2
709	0.23
710	0.24
711	0.29
712	0.34
713	0.42
714	0.42
715	0.43
716	0.45
717	0.5
718	0.5
719	0.49
720	0.48
721	0.48
722	0.51
723	0.48
724	0.41
725	0.35
726	0.34
727	0.3
728	0.27
729	0.21
730	0.17
731	0.17
732	0.2
733	0.18
734	0.19
735	0.2
736	0.23
737	0.23
738	0.24
739	0.22
740	0.23
741	0.29
742	0.34
743	0.38
744	0.41
745	0.44
746	0.42
747	0.43
748	0.48
749	0.5
750	0.5
751	0.47
752	0.42
753	0.38
754	0.37
755	0.37
756	0.36
757	0.34
758	0.33
759	0.36
760	0.38
761	0.42
762	0.42
763	0.43
764	0.42
765	0.41
766	0.37
767	0.35
768	0.33
769	0.29
770	0.3
771	0.29
772	0.24
773	0.22
774	0.21
775	0.2
776	0.2
777	0.21
778	0.22
779	0.26
780	0.25
781	0.25
782	0.3
783	0.28
784	0.31
785	0.35
786	0.35
787	0.32
788	0.34
789	0.38
790	0.34
791	0.39
792	0.35
793	0.3
794	0.32
795	0.3
796	0.27
797	0.25
798	0.25
799	0.2
800	0.19
801	0.2
802	0.18
803	0.19
804	0.19
805	0.17
806	0.2
807	0.19
808	0.21
809	0.26
810	0.24
811	0.23
812	0.22
813	0.21
814	0.15
815	0.17
816	0.14
817	0.09
818	0.1
819	0.1
820	0.1
821	0.1
822	0.11
823	0.09
824	0.1
825	0.1
826	0.11
827	0.15
828	0.17
829	0.17
830	0.18
831	0.19

V5FQX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer