Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GDB0

Protein Details
Accession V5GDB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-107SDSIATKRKAYKTKGRRRRRHDDGTEELGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-98KRKAYKTKGRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028133  Dynamitin  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005869  C:dynactin complex  
GO:0007017  P:microtubule-based process  
Pfam View protein in Pfam  
PF04912  Dynamitin  
Amino Acid Sequences MAFNKKYAGLPDLDLAPDIYETPDLTDEASTLPTATVRTADSDEDAGSNSDIDRHGVNADEARAHFMGATVDAREANFSDSIATKRKAYKTKGRRRRRHDDGTEELGDLSDGEEESLERKLARLRREAEELKTELEKRQAEGTEEKKEGADAGHEGLSDGVKELSRALDSLHASARGAASGSLSPDAILSQKLAASSKLDGPDESQKNGTAGAEATASSPGLLAHAATFDARLALIEAAMGISSSSNPFVAEPNSDSLQPVLPTLDHLTSRLTTLTSTLLGPAPASALPTIGSAPASTTVTTPHIEALTTRIRKLTADAEALATARKRAVDAAKAAQAARIAAANIDVTDDLSMTSSSATEADPAAAQRDEQAAKIQALYATLPTIQSLHPLLPSVLERLRSLRAIHAGAAQASQSLDQLETRQAEMNKEIEQWREGLKIVEEKVVEGEQAMKSNLDVVGPWVKDLEKRLEKLEGGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.15
4 0.13
5 0.12
6 0.1
7 0.1
8 0.09
9 0.11
10 0.12
11 0.11
12 0.12
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.14
26 0.15
27 0.16
28 0.17
29 0.18
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.14
34 0.12
35 0.12
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.17
48 0.17
49 0.2
50 0.2
51 0.18
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.17
69 0.23
70 0.24
71 0.26
72 0.33
73 0.42
74 0.49
75 0.55
76 0.62
77 0.67
78 0.76
79 0.82
80 0.86
81 0.88
82 0.89
83 0.92
84 0.91
85 0.9
86 0.88
87 0.85
88 0.81
89 0.77
90 0.69
91 0.58
92 0.48
93 0.37
94 0.28
95 0.19
96 0.13
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.09
107 0.15
108 0.2
109 0.26
110 0.33
111 0.36
112 0.4
113 0.48
114 0.5
115 0.48
116 0.48
117 0.43
118 0.38
119 0.37
120 0.34
121 0.29
122 0.32
123 0.29
124 0.25
125 0.29
126 0.27
127 0.27
128 0.33
129 0.35
130 0.35
131 0.35
132 0.33
133 0.29
134 0.27
135 0.24
136 0.17
137 0.14
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.09
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.16
189 0.24
190 0.25
191 0.25
192 0.22
193 0.21
194 0.2
195 0.21
196 0.18
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.02
229 0.02
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.09
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.09
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.13
295 0.19
296 0.2
297 0.21
298 0.21
299 0.21
300 0.21
301 0.24
302 0.23
303 0.18
304 0.18
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.16
310 0.12
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.12
316 0.15
317 0.18
318 0.22
319 0.24
320 0.26
321 0.27
322 0.27
323 0.24
324 0.21
325 0.17
326 0.14
327 0.11
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.18
360 0.18
361 0.18
362 0.19
363 0.18
364 0.14
365 0.14
366 0.14
367 0.11
368 0.09
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.09
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.14
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.16
383 0.18
384 0.18
385 0.19
386 0.21
387 0.24
388 0.25
389 0.25
390 0.25
391 0.27
392 0.26
393 0.26
394 0.26
395 0.24
396 0.22
397 0.21
398 0.17
399 0.13
400 0.12
401 0.11
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.11
407 0.15
408 0.16
409 0.18
410 0.22
411 0.23
412 0.26
413 0.28
414 0.29
415 0.26
416 0.29
417 0.3
418 0.28
419 0.27
420 0.26
421 0.26
422 0.25
423 0.24
424 0.21
425 0.22
426 0.25
427 0.25
428 0.27
429 0.25
430 0.24
431 0.26
432 0.24
433 0.2
434 0.15
435 0.18
436 0.15
437 0.18
438 0.18
439 0.15
440 0.15
441 0.17
442 0.17
443 0.13
444 0.12
445 0.13
446 0.2
447 0.2
448 0.2
449 0.19
450 0.2
451 0.24
452 0.29
453 0.35
454 0.36
455 0.39
456 0.42
457 0.46