Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V5FVA1

Protein Details
Accession V5FVA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-65SWSAQKAHKSKRTYERSPRMSDSHydrophilic
75-103ADTYWRESKRRHSRSRSGSRSRSRGRSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-100SKRRHSRSRSGSRSRSRGR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MEVRIYNSKRRRTDNGYVDPANDSSSDELAAVSDHEMDRRRASWSAQKAHKSKRTYERSPRMSDSGSSDELAVDADTYWRESKRRHSRSRSGSRSRSRGRSSSHDGRAGESGLPEEKSEQQSEEYDERQGDSGAGDRNIQPVARTPSPLPPPPPPKPERLNYKVRSILKGHLRGVSAAKFSPDGSMVASGGADAAVKVWDTLSGKLIHTFEGHLAGISTLSWSPDGEIIASGSDDKTIRLWNVLTGKAHPIPFVGHHNYVYAIAFSPKGNMLVSGSYDEAVFLWDVRSATVMRSLPAHSDPVGGIDVVHDGTLIASCASDGLIRIWDTATGQCLRTIVHEDNPPVMSVKFSPNGKFVLAWTLDNCVRLWNYVEGRCIKTYQGHVNLKYGLCGGFGIYGAPGGKPEAFAVSGSEDGAILCWDVVSKKVLQRIDAHADVVLGVDTCCIGDKRLMVSCGLDRTVRIWEEYPEGAEAENEVAAPEAKMNGVEEETIDSSMPASVAEPDKDAQSNGDGMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.78
4 0.71
5 0.65
6 0.59
7 0.5
8 0.41
9 0.3
10 0.23
11 0.17
12 0.16
13 0.15
14 0.12
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.08
20 0.1
21 0.1
22 0.14
23 0.18
24 0.21
25 0.24
26 0.25
27 0.28
28 0.28
29 0.33
30 0.38
31 0.44
32 0.51
33 0.56
34 0.64
35 0.68
36 0.77
37 0.79
38 0.76
39 0.76
40 0.77
41 0.79
42 0.8
43 0.82
44 0.83
45 0.83
46 0.84
47 0.79
48 0.73
49 0.65
50 0.57
51 0.52
52 0.46
53 0.4
54 0.33
55 0.28
56 0.23
57 0.21
58 0.19
59 0.12
60 0.07
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.1
65 0.13
66 0.16
67 0.2
68 0.24
69 0.36
70 0.46
71 0.56
72 0.64
73 0.71
74 0.78
75 0.85
76 0.92
77 0.91
78 0.9
79 0.9
80 0.88
81 0.89
82 0.87
83 0.85
84 0.81
85 0.77
86 0.72
87 0.7
88 0.71
89 0.7
90 0.67
91 0.64
92 0.57
93 0.53
94 0.49
95 0.42
96 0.33
97 0.23
98 0.19
99 0.16
100 0.16
101 0.14
102 0.15
103 0.18
104 0.21
105 0.22
106 0.21
107 0.21
108 0.22
109 0.27
110 0.28
111 0.24
112 0.23
113 0.22
114 0.21
115 0.2
116 0.19
117 0.14
118 0.11
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.13
128 0.17
129 0.23
130 0.23
131 0.25
132 0.25
133 0.32
134 0.39
135 0.42
136 0.4
137 0.42
138 0.49
139 0.53
140 0.61
141 0.57
142 0.58
143 0.61
144 0.64
145 0.65
146 0.63
147 0.67
148 0.61
149 0.65
150 0.65
151 0.61
152 0.58
153 0.5
154 0.51
155 0.49
156 0.51
157 0.46
158 0.42
159 0.39
160 0.36
161 0.36
162 0.32
163 0.25
164 0.19
165 0.18
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.12
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.15
193 0.16
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.11
198 0.12
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.11
229 0.14
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.18
234 0.2
235 0.2
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.14
240 0.19
241 0.19
242 0.17
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.15
248 0.1
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.16
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.17
324 0.16
325 0.19
326 0.22
327 0.22
328 0.24
329 0.24
330 0.23
331 0.19
332 0.17
333 0.14
334 0.13
335 0.16
336 0.18
337 0.2
338 0.22
339 0.23
340 0.24
341 0.23
342 0.22
343 0.18
344 0.2
345 0.18
346 0.17
347 0.16
348 0.19
349 0.19
350 0.2
351 0.19
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.17
356 0.18
357 0.22
358 0.23
359 0.28
360 0.3
361 0.32
362 0.33
363 0.31
364 0.27
365 0.27
366 0.3
367 0.34
368 0.39
369 0.43
370 0.43
371 0.45
372 0.47
373 0.43
374 0.38
375 0.31
376 0.21
377 0.15
378 0.13
379 0.11
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.08
403 0.06
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.07
410 0.09
411 0.13
412 0.17
413 0.23
414 0.25
415 0.27
416 0.32
417 0.37
418 0.42
419 0.38
420 0.35
421 0.3
422 0.28
423 0.25
424 0.2
425 0.13
426 0.07
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.1
435 0.13
436 0.17
437 0.21
438 0.22
439 0.21
440 0.24
441 0.26
442 0.27
443 0.26
444 0.23
445 0.19
446 0.2
447 0.25
448 0.23
449 0.23
450 0.21
451 0.22
452 0.26
453 0.26
454 0.26
455 0.2
456 0.2
457 0.17
458 0.15
459 0.14
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.14
477 0.15
478 0.15
479 0.14
480 0.12
481 0.11
482 0.12
483 0.11
484 0.07
485 0.07
486 0.11
487 0.15
488 0.16
489 0.18
490 0.19
491 0.22
492 0.23
493 0.23
494 0.2
495 0.19
496 0.19