FuNGI

V5FXQ7

Protein Details

Accession

V5FXQ7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
924-943	SAVTHRSKERTQRPSRGGSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
898-934	REQRRRMWKGLREAAGLGLKKPRERHSAVTHRSKERT

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034101 Lsm4 IPR010920 LSM_dom_sf IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0043229 C:intracellular organelle GO:0003723 F:RNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM PF13812 PPR_3
PROSITE	View protein in PROSITE PS52002 SM
CDD	cd01723 LSm4

Amino Acid Sequences

MMDEDNQNEERAISNSTTEQLKQNPEVRLRPGGARGAAAREKLQNDSSRRPCLGAALSPAPGAKLGTCESERVQLGRELQSIARYNVSTCSRAVHVVTKAQLPLGLLTAAQGHPMLVELKNGETLNGHLVQCDNWMNLTLKEVVQTSPEGDRFFRLPEVYVRGNNTLSENSSRTNPQIAAAVAHNVVKAENGVGAVAVVEEDVAGEEVAARGSHLEWRGWKYTPLEVVLTAAAQMLQSIDNDDNASSRVNSLIPFSALNDAQSLAMPPRGLMVDGLWHCLCPSFNLSTFRNAAAVSTSLRGTRPLRAIKTASVRSQSAFTQRAYSTNLASDGSYTGSSNLESSGVPHTYESKQEEEQARERIQNEAPELKFKRISIRKPLRATFGVPKDLEKQSTADLENLLQELVTQSPNIRGATQILRILIRDRNVRPEVRHYRALILANTDARYGSPENVRNLLKEMETNGIPADSGTLHAALQAVAVHPDYLLRQEILHTLRDRWLSLSPSGWHHVVAGLVREHQFELALDHIAHMERKDIPVESWLHSLLVYNLCEMEEFDDVLTLMRNRVNQGHEMTLNLWLHVLDLASEALHHELTSYVWTRVVELGYLNPPKGVCSNVLTLASRTGDTEVAASVLRFLEKTGVPFSLEDYEKFVETHLMAGDLYTAFNILCGMHESGTELEQSSTRGILTYMIRTGTQPRDAWAMLKRIKSSGKSVPVGCANVVIELCEHVSAEDVSAVDQAVGFYKELYALCPGGADVATYNSLIQICRNAKETQACMFAIKEMASLEVSPNATTFERLIQMSLDSGNFQSGLMYFRDMAERGFTLNKAVETDIWKRCQQSNDEFASLLRSNLQTDMDRKRRESRTEMMSELAGLIDLDSTEEDASSRTQKPRNASELREQRRRMWKGLREAAGLGLKKPRERHSAVTHRSKERTQRPSRGGSLTDMDEWETNEELTQK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.21
4	0.24
5	0.24
6	0.28
7	0.31
8	0.37
9	0.42
10	0.47
11	0.51
12	0.55
13	0.59
14	0.58
15	0.59
16	0.55
17	0.52
18	0.5
19	0.48
20	0.41
21	0.39
22	0.35
23	0.35
24	0.36
25	0.35
26	0.34
27	0.34
28	0.35
29	0.37
30	0.42
31	0.42
32	0.46
33	0.54
34	0.58
35	0.6
36	0.59
37	0.56
38	0.5
39	0.47
40	0.43
41	0.37
42	0.35
43	0.31
44	0.3
45	0.29
46	0.29
47	0.23
48	0.2
49	0.17
50	0.12
51	0.12
52	0.13
53	0.18
54	0.19
55	0.22
56	0.23
57	0.28
58	0.29
59	0.27
60	0.28
61	0.26
62	0.3
63	0.31
64	0.31
65	0.27
66	0.27
67	0.32
68	0.33
69	0.31
70	0.3
71	0.26
72	0.25
73	0.3
74	0.33
75	0.28
76	0.25
77	0.26
78	0.24
79	0.27
80	0.28
81	0.27
82	0.27
83	0.3
84	0.32
85	0.33
86	0.31
87	0.29
88	0.28
89	0.22
90	0.19
91	0.16
92	0.13
93	0.09
94	0.09
95	0.12
96	0.11
97	0.11
98	0.1
99	0.08
100	0.08
101	0.09
102	0.12
103	0.09
104	0.11
105	0.12
106	0.12
107	0.17
108	0.17
109	0.16
110	0.14
111	0.15
112	0.17
113	0.21
114	0.19
115	0.16
116	0.17
117	0.17
118	0.2
119	0.21
120	0.17
121	0.13
122	0.16
123	0.17
124	0.17
125	0.19
126	0.18
127	0.16
128	0.17
129	0.18
130	0.15
131	0.15
132	0.16
133	0.16
134	0.19
135	0.21
136	0.21
137	0.2
138	0.23
139	0.22
140	0.23
141	0.24
142	0.2
143	0.2
144	0.23
145	0.28
146	0.29
147	0.31
148	0.32
149	0.32
150	0.32
151	0.3
152	0.28
153	0.24
154	0.23
155	0.25
156	0.23
157	0.22
158	0.25
159	0.26
160	0.25
161	0.27
162	0.25
163	0.21
164	0.23
165	0.21
166	0.2
167	0.18
168	0.18
169	0.15
170	0.15
171	0.14
172	0.11
173	0.11
174	0.09
175	0.09
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.03
186	0.02
187	0.02
188	0.02
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.04
194	0.04
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.1
201	0.12
202	0.14
203	0.18
204	0.24
205	0.27
206	0.28
207	0.31
208	0.29
209	0.31
210	0.32
211	0.29
212	0.25
213	0.21
214	0.21
215	0.18
216	0.15
217	0.11
218	0.08
219	0.06
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.08
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.12
243	0.14
244	0.13
245	0.13
246	0.12
247	0.11
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.08
259	0.07
260	0.12
261	0.13
262	0.17
263	0.16
264	0.15
265	0.15
266	0.16
267	0.16
268	0.11
269	0.15
270	0.14
271	0.18
272	0.23
273	0.24
274	0.28
275	0.29
276	0.27
277	0.25
278	0.21
279	0.18
280	0.14
281	0.14
282	0.1
283	0.1
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.16
288	0.16
289	0.2
290	0.26
291	0.31
292	0.33
293	0.37
294	0.39
295	0.39
296	0.45
297	0.44
298	0.41
299	0.37
300	0.36
301	0.32
302	0.32
303	0.29
304	0.28
305	0.27
306	0.24
307	0.25
308	0.24
309	0.26
310	0.28
311	0.27
312	0.21
313	0.19
314	0.19
315	0.15
316	0.15
317	0.13
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.08
330	0.1
331	0.1
332	0.11
333	0.11
334	0.14
335	0.14
336	0.19
337	0.2
338	0.2
339	0.21
340	0.26
341	0.3
342	0.31
343	0.34
344	0.35
345	0.34
346	0.34
347	0.34
348	0.32
349	0.29
350	0.27
351	0.26
352	0.27
353	0.26
354	0.31
355	0.32
356	0.32
357	0.32
358	0.3
359	0.37
360	0.38
361	0.43
362	0.47
363	0.55
364	0.6
365	0.64
366	0.66
367	0.61
368	0.55
369	0.53
370	0.5
371	0.44
372	0.41
373	0.35
374	0.35
375	0.35
376	0.34
377	0.32
378	0.24
379	0.21
380	0.18
381	0.2
382	0.19
383	0.15
384	0.13
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.09
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.06
396	0.08
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.1
401	0.12
402	0.14
403	0.16
404	0.15
405	0.14
406	0.14
407	0.14
408	0.16
409	0.16
410	0.17
411	0.21
412	0.21
413	0.28
414	0.31
415	0.33
416	0.32
417	0.4
418	0.45
419	0.44
420	0.47
421	0.4
422	0.39
423	0.4
424	0.4
425	0.3
426	0.23
427	0.2
428	0.17
429	0.16
430	0.14
431	0.11
432	0.09
433	0.11
434	0.1
435	0.11
436	0.15
437	0.18
438	0.2
439	0.24
440	0.24
441	0.22
442	0.23
443	0.22
444	0.17
445	0.14
446	0.14
447	0.12
448	0.12
449	0.11
450	0.09
451	0.08
452	0.08
453	0.07
454	0.06
455	0.04
456	0.04
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.05
473	0.06
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.1
478	0.11
479	0.14
480	0.14
481	0.15
482	0.18
483	0.19
484	0.18
485	0.17
486	0.18
487	0.16
488	0.16
489	0.17
490	0.15
491	0.17
492	0.18
493	0.17
494	0.14
495	0.12
496	0.12
497	0.11
498	0.1
499	0.09
500	0.07
501	0.09
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.07
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.08
518	0.08
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.13
524	0.15
525	0.15
526	0.16
527	0.15
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.11
532	0.11
533	0.1
534	0.09
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.05
548	0.06
549	0.08
550	0.09
551	0.1
552	0.14
553	0.16
554	0.18
555	0.2
556	0.21
557	0.19
558	0.19
559	0.18
560	0.2
561	0.18
562	0.15
563	0.13
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.08
581	0.09
582	0.09
583	0.1
584	0.1
585	0.11
586	0.12
587	0.12
588	0.1
589	0.09
590	0.1
591	0.15
592	0.16
593	0.15
594	0.14
595	0.14
596	0.15
597	0.16
598	0.15
599	0.11
600	0.13
601	0.14
602	0.15
603	0.17
604	0.16
605	0.16
606	0.16
607	0.15
608	0.12
609	0.11
610	0.11
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.05
622	0.06
623	0.09
624	0.09
625	0.11
626	0.12
627	0.13
628	0.14
629	0.14
630	0.15
631	0.17
632	0.17
633	0.16
634	0.18
635	0.18
636	0.18
637	0.17
638	0.16
639	0.13
640	0.12
641	0.13
642	0.09
643	0.08
644	0.08
645	0.07
646	0.08
647	0.06
648	0.06
649	0.05
650	0.05
651	0.04
652	0.04
653	0.05
654	0.04
655	0.04
656	0.07
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.1
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.08
665	0.08
666	0.09
667	0.1
668	0.09
669	0.09
670	0.08
671	0.08
672	0.07
673	0.1
674	0.12
675	0.12
676	0.13
677	0.14
678	0.14
679	0.15
680	0.21
681	0.22
682	0.25
683	0.23
684	0.23
685	0.26
686	0.26
687	0.28
688	0.27
689	0.31
690	0.31
691	0.34
692	0.34
693	0.35
694	0.39
695	0.39
696	0.4
697	0.4
698	0.42
699	0.43
700	0.43
701	0.42
702	0.41
703	0.4
704	0.33
705	0.27
706	0.2
707	0.17
708	0.16
709	0.12
710	0.09
711	0.08
712	0.09
713	0.07
714	0.07
715	0.05
716	0.07
717	0.06
718	0.06
719	0.07
720	0.06
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.09
733	0.09
734	0.11
735	0.11
736	0.11
737	0.1
738	0.1
739	0.1
740	0.09
741	0.08
742	0.07
743	0.05
744	0.07
745	0.08
746	0.08
747	0.08
748	0.08
749	0.09
750	0.09
751	0.1
752	0.17
753	0.19
754	0.21
755	0.25
756	0.24
757	0.28
758	0.33
759	0.35
760	0.3
761	0.31
762	0.29
763	0.27
764	0.27
765	0.23
766	0.19
767	0.16
768	0.13
769	0.1
770	0.1
771	0.1
772	0.1
773	0.1
774	0.12
775	0.12
776	0.12
777	0.12
778	0.13
779	0.13
780	0.14
781	0.14
782	0.13
783	0.15
784	0.16
785	0.16
786	0.14
787	0.14
788	0.14
789	0.14
790	0.12
791	0.1
792	0.1
793	0.1
794	0.1
795	0.09
796	0.09
797	0.08
798	0.1
799	0.1
800	0.11
801	0.11
802	0.12
803	0.15
804	0.14
805	0.14
806	0.15
807	0.14
808	0.15
809	0.17
810	0.16
811	0.17
812	0.18
813	0.18
814	0.17
815	0.18
816	0.19
817	0.22
818	0.3
819	0.33
820	0.36
821	0.38
822	0.41
823	0.45
824	0.48
825	0.5
826	0.5
827	0.52
828	0.52
829	0.51
830	0.47
831	0.42
832	0.42
833	0.35
834	0.27
835	0.22
836	0.18
837	0.18
838	0.2
839	0.23
840	0.2
841	0.26
842	0.36
843	0.42
844	0.47
845	0.5
846	0.58
847	0.64
848	0.67
849	0.67
850	0.64
851	0.64
852	0.63
853	0.6
854	0.51
855	0.43
856	0.36
857	0.29
858	0.22
859	0.13
860	0.08
861	0.06
862	0.05
863	0.04
864	0.05
865	0.05
866	0.06
867	0.06
868	0.06
869	0.07
870	0.08
871	0.11
872	0.16
873	0.22
874	0.29
875	0.35
876	0.41
877	0.48
878	0.56
879	0.62
880	0.63
881	0.63
882	0.66
883	0.71
884	0.75
885	0.77
886	0.72
887	0.71
888	0.75
889	0.75
890	0.73
891	0.73
892	0.72
893	0.73
894	0.78
895	0.73
896	0.65
897	0.6
898	0.56
899	0.52
900	0.44
901	0.37
902	0.35
903	0.35
904	0.38
905	0.44
906	0.47
907	0.49
908	0.54
909	0.59
910	0.63
911	0.7
912	0.74
913	0.78
914	0.79
915	0.79
916	0.79
917	0.78
918	0.78
919	0.77
920	0.79
921	0.78
922	0.8
923	0.79
924	0.81
925	0.8
926	0.74
927	0.66
928	0.6
929	0.54
930	0.47
931	0.42
932	0.34
933	0.3
934	0.26
935	0.25
936	0.23
937	0.19
938	0.16

V5FXQ7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer