FuNGI

V5FX40

Protein Details

Accession

V5FX40

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-36	EAASKRGKTQGKKTFVCKKT	Hydrophilic
596-621	KDLSHNFKSNKQQKDKKNAEQPQKLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, nucl 10, cyto_mito 7, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR019039 T4-Rnl1-like_N IPR012387 Trl1_fun IPR015966 tRNA_lig_kin_fungi IPR015965 tRNA_lig_PDEase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0051730 F:GTP-dependent polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0008081 F:phosphoric diester hydrolase activity GO:0003972 F:RNA ligase (ATP) activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF09511 RNA_lig_T4_1 PF08302 tRNA_lig_CPD PF08303 tRNA_lig_kinase

Amino Acid Sequences

MVQQDVQEVARLVDSLEAASKRGKTQGKKTFVCKKTTFAVARSDNISVDSWRFNDWDYKRRDLPTYARGLFTTRTRSGRPEIAVRGYDKFFNVDEVGNTKWEQIEQYTRGPYELSVKENGCIIFISGLEDGSLLVCSKHSTGVRADTNLSHAQAGERWVERHVTSVGKTVKELAQQLRKMNVTAVGELCDDSFEEHVLAYDEKAAGIYLHGMNYNVPEFATMPSSEVHKFADEWGFKKAQFIVMDDIRAVKEFLDQCAETGSWNGRDTEGFVIRCQQRDGENGSYRDWFFKYKFEEPYLMYRQWRECTKAVIAGKLPKIRKHQKITEEYLQYARRQLVKDPSIGKLYNQNHGIISMREGFLRERGLKGSDIIQMENEGRAEGVTKNVILVPIASIGCGKTTLSLALARLFGWGHVQNDNIPKQKNRPKRFAFEVTNELANHPAVIADRNNHQRRERKQLMEDISPVLTDARYVALHYVHEPKGLLLDDIREVTRKRVLERGDNHQTIRAGSKNSDEIIGIMEGFLNRFEAVDTDRDPDDNFDEVIDLDVAASSRENLEKVVTALHSFYPKIVPGVPTSQELDNAIEAAMTDYQVAKDLSHNFKSNKQQKDKKNAEQPQKLDPEYCVKKAEYFCISLPTPRINDILSSLFTPSTPPEKAKLYKQLANSRRIQPTFHVTLIHRASSKDHQDIWKRYTDLYLTKMYEKPETDPNITPLLAPARVRIERLVWDNRVMAFVARILPPEDKEQACWPCANDIAHITVGTASPDVKPKESNDLLKRWIEAGSGPNTGIWEEEVPGVVVLDGTVKVVMTRGKW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.09
3	0.14
4	0.14
5	0.15
6	0.2
7	0.22
8	0.23
9	0.31
10	0.39
11	0.42
12	0.52
13	0.61
14	0.67
15	0.71
16	0.78
17	0.8
18	0.78
19	0.79
20	0.71
21	0.65
22	0.61
23	0.64
24	0.59
25	0.51
26	0.55
27	0.49
28	0.5
29	0.48
30	0.44
31	0.34
32	0.32
33	0.3
34	0.23
35	0.22
36	0.23
37	0.21
38	0.22
39	0.22
40	0.22
41	0.3
42	0.33
43	0.39
44	0.42
45	0.48
46	0.52
47	0.55
48	0.59
49	0.56
50	0.58
51	0.57
52	0.6
53	0.55
54	0.5
55	0.47
56	0.45
57	0.42
58	0.4
59	0.4
60	0.37
61	0.4
62	0.41
63	0.46
64	0.49
65	0.51
66	0.49
67	0.49
68	0.48
69	0.48
70	0.49
71	0.46
72	0.44
73	0.4
74	0.38
75	0.31
76	0.28
77	0.23
78	0.23
79	0.22
80	0.19
81	0.19
82	0.2
83	0.2
84	0.2
85	0.2
86	0.18
87	0.17
88	0.16
89	0.16
90	0.18
91	0.25
92	0.26
93	0.31
94	0.34
95	0.33
96	0.33
97	0.32
98	0.28
99	0.28
100	0.28
101	0.26
102	0.28
103	0.28
104	0.28
105	0.31
106	0.29
107	0.22
108	0.18
109	0.16
110	0.11
111	0.1
112	0.12
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.07
119	0.08
120	0.05
121	0.05
122	0.06
123	0.07
124	0.08
125	0.14
126	0.15
127	0.17
128	0.2
129	0.28
130	0.3
131	0.31
132	0.32
133	0.27
134	0.31
135	0.31
136	0.28
137	0.21
138	0.18
139	0.17
140	0.17
141	0.19
142	0.18
143	0.17
144	0.17
145	0.18
146	0.21
147	0.2
148	0.21
149	0.21
150	0.2
151	0.19
152	0.26
153	0.29
154	0.27
155	0.27
156	0.28
157	0.28
158	0.29
159	0.34
160	0.34
161	0.38
162	0.42
163	0.45
164	0.47
165	0.45
166	0.41
167	0.37
168	0.33
169	0.26
170	0.24
171	0.22
172	0.18
173	0.17
174	0.17
175	0.15
176	0.11
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.06
183	0.07
184	0.08
185	0.08
186	0.07
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.06
193	0.06
194	0.09
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.11
201	0.12
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.09
207	0.11
208	0.09
209	0.1
210	0.11
211	0.14
212	0.14
213	0.14
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.14
218	0.21
219	0.21
220	0.21
221	0.25
222	0.26
223	0.25
224	0.27
225	0.25
226	0.22
227	0.21
228	0.22
229	0.23
230	0.22
231	0.22
232	0.2
233	0.2
234	0.16
235	0.15
236	0.13
237	0.08
238	0.12
239	0.13
240	0.14
241	0.17
242	0.17
243	0.16
244	0.18
245	0.18
246	0.12
247	0.13
248	0.15
249	0.13
250	0.14
251	0.14
252	0.13
253	0.13
254	0.15
255	0.17
256	0.19
257	0.18
258	0.17
259	0.24
260	0.26
261	0.27
262	0.26
263	0.24
264	0.21
265	0.24
266	0.3
267	0.29
268	0.33
269	0.33
270	0.34
271	0.34
272	0.33
273	0.32
274	0.28
275	0.24
276	0.19
277	0.23
278	0.28
279	0.31
280	0.35
281	0.34
282	0.36
283	0.34
284	0.4
285	0.4
286	0.36
287	0.32
288	0.32
289	0.34
290	0.35
291	0.36
292	0.34
293	0.3
294	0.31
295	0.3
296	0.33
297	0.3
298	0.28
299	0.28
300	0.29
301	0.32
302	0.34
303	0.36
304	0.35
305	0.44
306	0.51
307	0.58
308	0.6
309	0.63
310	0.66
311	0.71
312	0.72
313	0.69
314	0.62
315	0.54
316	0.52
317	0.46
318	0.38
319	0.34
320	0.3
321	0.26
322	0.25
323	0.27
324	0.3
325	0.3
326	0.34
327	0.34
328	0.33
329	0.33
330	0.32
331	0.28
332	0.29
333	0.29
334	0.3
335	0.29
336	0.27
337	0.24
338	0.24
339	0.24
340	0.15
341	0.16
342	0.12
343	0.11
344	0.1
345	0.11
346	0.11
347	0.12
348	0.15
349	0.14
350	0.13
351	0.14
352	0.16
353	0.15
354	0.15
355	0.16
356	0.16
357	0.16
358	0.15
359	0.14
360	0.13
361	0.13
362	0.13
363	0.11
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.05
376	0.05
377	0.04
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.04
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.09
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.13
404	0.18
405	0.22
406	0.23
407	0.24
408	0.24
409	0.33
410	0.42
411	0.5
412	0.52
413	0.58
414	0.59
415	0.63
416	0.67
417	0.66
418	0.61
419	0.54
420	0.52
421	0.43
422	0.4
423	0.35
424	0.28
425	0.21
426	0.17
427	0.13
428	0.08
429	0.07
430	0.05
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.14
435	0.24
436	0.28
437	0.32
438	0.38
439	0.45
440	0.49
441	0.58
442	0.6
443	0.56
444	0.55
445	0.58
446	0.56
447	0.5
448	0.46
449	0.37
450	0.29
451	0.24
452	0.2
453	0.13
454	0.08
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.07
461	0.07
462	0.08
463	0.1
464	0.15
465	0.14
466	0.15
467	0.15
468	0.14
469	0.15
470	0.15
471	0.13
472	0.07
473	0.08
474	0.09
475	0.1
476	0.1
477	0.11
478	0.11
479	0.13
480	0.18
481	0.18
482	0.2
483	0.24
484	0.27
485	0.33
486	0.37
487	0.43
488	0.47
489	0.47
490	0.46
491	0.43
492	0.4
493	0.33
494	0.32
495	0.26
496	0.19
497	0.18
498	0.2
499	0.19
500	0.18
501	0.18
502	0.15
503	0.12
504	0.11
505	0.1
506	0.08
507	0.06
508	0.06
509	0.05
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.06
517	0.07
518	0.1
519	0.11
520	0.13
521	0.13
522	0.13
523	0.14
524	0.14
525	0.15
526	0.14
527	0.12
528	0.1
529	0.1
530	0.09
531	0.1
532	0.08
533	0.05
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.06
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.1
548	0.1
549	0.09
550	0.1
551	0.12
552	0.13
553	0.12
554	0.13
555	0.13
556	0.12
557	0.13
558	0.14
559	0.14
560	0.14
561	0.18
562	0.19
563	0.2
564	0.21
565	0.2
566	0.19
567	0.19
568	0.17
569	0.13
570	0.12
571	0.1
572	0.07
573	0.07
574	0.07
575	0.06
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.08
581	0.09
582	0.08
583	0.12
584	0.19
585	0.25
586	0.29
587	0.35
588	0.35
589	0.42
590	0.52
591	0.56
592	0.6
593	0.64
594	0.69
595	0.73
596	0.82
597	0.84
598	0.83
599	0.85
600	0.84
601	0.84
602	0.83
603	0.76
604	0.74
605	0.71
606	0.62
607	0.53
608	0.46
609	0.45
610	0.42
611	0.42
612	0.36
613	0.31
614	0.35
615	0.36
616	0.39
617	0.33
618	0.3
619	0.29
620	0.31
621	0.31
622	0.28
623	0.29
624	0.28
625	0.26
626	0.26
627	0.26
628	0.21
629	0.21
630	0.21
631	0.2
632	0.16
633	0.16
634	0.15
635	0.14
636	0.13
637	0.14
638	0.14
639	0.17
640	0.19
641	0.2
642	0.23
643	0.3
644	0.34
645	0.41
646	0.48
647	0.49
648	0.52
649	0.58
650	0.64
651	0.64
652	0.67
653	0.67
654	0.65
655	0.67
656	0.63
657	0.57
658	0.51
659	0.52
660	0.49
661	0.43
662	0.4
663	0.32
664	0.4
665	0.4
666	0.39
667	0.32
668	0.29
669	0.33
670	0.36
671	0.42
672	0.37
673	0.4
674	0.45
675	0.53
676	0.59
677	0.58
678	0.58
679	0.52
680	0.48
681	0.47
682	0.43
683	0.38
684	0.35
685	0.37
686	0.32
687	0.35
688	0.38
689	0.37
690	0.38
691	0.35
692	0.35
693	0.37
694	0.4
695	0.41
696	0.41
697	0.41
698	0.39
699	0.37
700	0.33
701	0.28
702	0.26
703	0.25
704	0.22
705	0.22
706	0.26
707	0.28
708	0.29
709	0.28
710	0.27
711	0.3
712	0.36
713	0.4
714	0.35
715	0.37
716	0.37
717	0.36
718	0.34
719	0.29
720	0.23
721	0.16
722	0.15
723	0.16
724	0.14
725	0.15
726	0.17
727	0.19
728	0.21
729	0.25
730	0.3
731	0.27
732	0.3
733	0.36
734	0.38
735	0.38
736	0.38
737	0.34
738	0.31
739	0.34
740	0.32
741	0.26
742	0.24
743	0.25
744	0.23
745	0.22
746	0.19
747	0.15
748	0.15
749	0.14
750	0.12
751	0.1
752	0.12
753	0.19
754	0.22
755	0.24
756	0.27
757	0.29
758	0.38
759	0.43
760	0.51
761	0.51
762	0.54
763	0.57
764	0.55
765	0.54
766	0.45
767	0.4
768	0.31
769	0.27
770	0.27
771	0.25
772	0.24
773	0.23
774	0.22
775	0.22
776	0.21
777	0.19
778	0.15
779	0.12
780	0.12
781	0.12
782	0.12
783	0.12
784	0.12
785	0.11
786	0.09
787	0.07
788	0.06
789	0.07
790	0.06
791	0.07
792	0.07
793	0.07
794	0.07
795	0.1

V5FX40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer