Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5HRG7

Protein Details
Accession V5HRG7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
416-442NEGEKKTKKIIRRKRRPARPQVDPSTIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
420-434KKTKKIIRRKRRPAR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012675  Beta-grasp_dom_sf  
IPR034181  Cwc2_RRM  
IPR045001  DRG  
IPR031167  G_OBG  
IPR006073  GTP-bd  
IPR031662  GTP-binding_2  
IPR006074  GTP1-OBG_CS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR005225  Small_GTP-bd_dom  
IPR004095  TGS  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01926  MMR_HSR1  
PF16897  MMR_HSR1_Xtn  
PF00076  RRM_1  
PF02824  TGS  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51710  G_OBG  
PS00905  GTP1_OBG  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd01896  DRG  
cd12360  RRM_cwf2  
Amino Acid Sequences MVNITEKIKEIEDEMRRTQKNKATEYHLGLLKGKLARLRAQLLEPTGGAGSGGGAGFDVSKSGDARVALVGFPSVGKSTFLSKITKTKSEVAAYSFTTLTAIPGVLEYGGAEIQILDLPGIIEGAAEGKGRGRQVISAAKTSDLIMMVLDATKRAEQRALLEAELEAVGIRLNREPPNIYLKPKKAGGMKITFQTPPKNIDEKMIYNILKDYKILNCEVLIRDEYATVDDLIDVIMKDHRKYIKCLYVYNKIDSVSLDFLDKLAREPHTIVMSCELDLGIQDVVERVWKELRLIRIYTKRKGVDPDFSEALIVRSNSTIEDVCDHIHRSLKETFKYALASSKLRNSLHKHDTTPDYHDFIESRNLTDESQAATMASTTSPPPVEREESTLDQVATDENALTTQSAENAVVSTDGGNEGEKKTKKIIRRKRRPARPQVDPSTIKSEPPPQTGTVFNIWYNKWSGGDREDKYLSKHHAPSRCNVAKDSGYTRADKVPGSYFCLFFARGVCPKGHECEYLHRLPTIHDLFNPNVDCFGRDKFSDYRDDMGGVGSFMRQNRTLYVGRIHVTDDIEEVVSRHFAEWGQVERIRVLTSRGVAFVTYSNEANAQFAKEAMAHQSLDHNEVLNVRWATVDPNPLAQKREAQRIDEQAAEAVRRALPAEFVAELEGRDPEARKRKKIEGTFGLDGYEPPDEVWYARTKELEATDESKQLEAPEERRLLEGAPVPAFTEQPRQQADGGGIISSSTLAALKGIAGGSVTTQAPQKAAGPLVAYGSDDESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.51
3 0.53
4 0.55
5 0.6
6 0.58
7 0.59
8 0.6
9 0.59
10 0.58
11 0.62
12 0.66
13 0.64
14 0.6
15 0.54
16 0.49
17 0.44
18 0.41
19 0.36
20 0.33
21 0.29
22 0.3
23 0.34
24 0.38
25 0.42
26 0.39
27 0.4
28 0.42
29 0.41
30 0.39
31 0.32
32 0.27
33 0.22
34 0.19
35 0.15
36 0.1
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.05
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.15
54 0.15
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.16
66 0.21
67 0.24
68 0.26
69 0.29
70 0.37
71 0.42
72 0.47
73 0.46
74 0.48
75 0.51
76 0.51
77 0.5
78 0.44
79 0.41
80 0.36
81 0.35
82 0.28
83 0.22
84 0.18
85 0.16
86 0.13
87 0.1
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.08
116 0.11
117 0.12
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.2
122 0.28
123 0.29
124 0.3
125 0.31
126 0.29
127 0.29
128 0.28
129 0.24
130 0.16
131 0.13
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.11
140 0.12
141 0.14
142 0.16
143 0.15
144 0.19
145 0.24
146 0.25
147 0.22
148 0.21
149 0.19
150 0.18
151 0.17
152 0.13
153 0.07
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.13
160 0.16
161 0.18
162 0.21
163 0.23
164 0.32
165 0.35
166 0.4
167 0.44
168 0.46
169 0.49
170 0.49
171 0.51
172 0.48
173 0.5
174 0.51
175 0.48
176 0.47
177 0.45
178 0.45
179 0.43
180 0.4
181 0.4
182 0.35
183 0.34
184 0.36
185 0.38
186 0.35
187 0.38
188 0.39
189 0.35
190 0.36
191 0.37
192 0.31
193 0.28
194 0.3
195 0.28
196 0.23
197 0.22
198 0.21
199 0.18
200 0.2
201 0.2
202 0.18
203 0.16
204 0.19
205 0.19
206 0.19
207 0.17
208 0.15
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.17
226 0.23
227 0.25
228 0.3
229 0.37
230 0.41
231 0.41
232 0.47
233 0.47
234 0.51
235 0.52
236 0.5
237 0.44
238 0.36
239 0.35
240 0.3
241 0.27
242 0.18
243 0.15
244 0.13
245 0.11
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.18
255 0.2
256 0.2
257 0.19
258 0.19
259 0.19
260 0.17
261 0.16
262 0.13
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.1
276 0.12
277 0.16
278 0.21
279 0.22
280 0.24
281 0.29
282 0.37
283 0.43
284 0.46
285 0.49
286 0.46
287 0.45
288 0.5
289 0.47
290 0.45
291 0.42
292 0.42
293 0.36
294 0.34
295 0.31
296 0.24
297 0.22
298 0.15
299 0.13
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.16
314 0.15
315 0.18
316 0.23
317 0.27
318 0.27
319 0.28
320 0.28
321 0.25
322 0.27
323 0.23
324 0.22
325 0.2
326 0.21
327 0.2
328 0.24
329 0.27
330 0.27
331 0.32
332 0.33
333 0.39
334 0.43
335 0.45
336 0.41
337 0.41
338 0.44
339 0.4
340 0.4
341 0.34
342 0.29
343 0.26
344 0.25
345 0.21
346 0.18
347 0.23
348 0.17
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.09
369 0.11
370 0.14
371 0.14
372 0.17
373 0.2
374 0.2
375 0.21
376 0.2
377 0.18
378 0.15
379 0.14
380 0.11
381 0.07
382 0.06
383 0.04
384 0.03
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.06
405 0.13
406 0.14
407 0.16
408 0.22
409 0.27
410 0.35
411 0.44
412 0.55
413 0.59
414 0.7
415 0.8
416 0.84
417 0.9
418 0.93
419 0.93
420 0.9
421 0.88
422 0.86
423 0.81
424 0.78
425 0.69
426 0.62
427 0.58
428 0.5
429 0.41
430 0.34
431 0.36
432 0.31
433 0.33
434 0.32
435 0.26
436 0.27
437 0.28
438 0.29
439 0.22
440 0.2
441 0.18
442 0.19
443 0.18
444 0.17
445 0.18
446 0.16
447 0.15
448 0.14
449 0.15
450 0.17
451 0.24
452 0.24
453 0.27
454 0.29
455 0.28
456 0.3
457 0.33
458 0.33
459 0.32
460 0.37
461 0.39
462 0.43
463 0.44
464 0.46
465 0.51
466 0.51
467 0.46
468 0.4
469 0.38
470 0.33
471 0.34
472 0.34
473 0.3
474 0.28
475 0.28
476 0.29
477 0.28
478 0.28
479 0.25
480 0.24
481 0.22
482 0.21
483 0.26
484 0.26
485 0.23
486 0.23
487 0.24
488 0.22
489 0.17
490 0.18
491 0.16
492 0.17
493 0.19
494 0.18
495 0.2
496 0.21
497 0.25
498 0.25
499 0.24
500 0.23
501 0.3
502 0.35
503 0.36
504 0.35
505 0.32
506 0.29
507 0.28
508 0.34
509 0.29
510 0.24
511 0.23
512 0.25
513 0.25
514 0.3
515 0.29
516 0.21
517 0.2
518 0.19
519 0.18
520 0.16
521 0.18
522 0.16
523 0.15
524 0.19
525 0.2
526 0.23
527 0.28
528 0.27
529 0.28
530 0.26
531 0.26
532 0.22
533 0.19
534 0.17
535 0.11
536 0.09
537 0.07
538 0.09
539 0.1
540 0.12
541 0.13
542 0.14
543 0.15
544 0.21
545 0.21
546 0.22
547 0.24
548 0.25
549 0.24
550 0.23
551 0.23
552 0.2
553 0.19
554 0.17
555 0.14
556 0.11
557 0.11
558 0.1
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.1
567 0.12
568 0.15
569 0.2
570 0.21
571 0.22
572 0.22
573 0.22
574 0.21
575 0.19
576 0.18
577 0.16
578 0.17
579 0.17
580 0.17
581 0.16
582 0.15
583 0.15
584 0.14
585 0.15
586 0.14
587 0.14
588 0.13
589 0.15
590 0.15
591 0.15
592 0.14
593 0.12
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.09
598 0.1
599 0.13
600 0.14
601 0.13
602 0.13
603 0.18
604 0.19
605 0.21
606 0.2
607 0.17
608 0.16
609 0.17
610 0.17
611 0.19
612 0.18
613 0.15
614 0.15
615 0.15
616 0.17
617 0.19
618 0.24
619 0.18
620 0.24
621 0.29
622 0.31
623 0.34
624 0.32
625 0.37
626 0.37
627 0.47
628 0.44
629 0.43
630 0.46
631 0.49
632 0.5
633 0.43
634 0.39
635 0.31
636 0.29
637 0.26
638 0.2
639 0.16
640 0.14
641 0.13
642 0.13
643 0.11
644 0.11
645 0.11
646 0.13
647 0.11
648 0.11
649 0.12
650 0.11
651 0.11
652 0.11
653 0.1
654 0.09
655 0.12
656 0.13
657 0.21
658 0.31
659 0.39
660 0.46
661 0.52
662 0.6
663 0.68
664 0.74
665 0.75
666 0.73
667 0.73
668 0.69
669 0.62
670 0.54
671 0.44
672 0.37
673 0.29
674 0.21
675 0.13
676 0.1
677 0.11
678 0.1
679 0.1
680 0.13
681 0.17
682 0.2
683 0.22
684 0.23
685 0.23
686 0.26
687 0.28
688 0.29
689 0.27
690 0.27
691 0.28
692 0.31
693 0.31
694 0.27
695 0.25
696 0.22
697 0.25
698 0.26
699 0.26
700 0.3
701 0.32
702 0.33
703 0.33
704 0.33
705 0.27
706 0.27
707 0.29
708 0.25
709 0.23
710 0.22
711 0.22
712 0.22
713 0.23
714 0.21
715 0.26
716 0.26
717 0.32
718 0.35
719 0.36
720 0.36
721 0.37
722 0.36
723 0.3
724 0.26
725 0.19
726 0.16
727 0.13
728 0.13
729 0.1
730 0.09
731 0.05
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.06
741 0.07
742 0.07
743 0.1
744 0.1
745 0.11
746 0.14
747 0.15
748 0.16
749 0.17
750 0.19
751 0.2
752 0.21
753 0.21
754 0.19
755 0.19
756 0.2
757 0.19
758 0.17
759 0.14