FuNGI

V5GEN1

Protein Details

Accession

V5GEN1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
376-402	APEGQRTWKKKGQKRTTRRVVMRPVLS	Hydrophilic
502-527	EAHANYRSLKIRNKNSKGRGRFGRRR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
79-100	RADKTERHSKVEKDVSKKRKHG
384-394	KKKGQKRTTRR
490-527	KAKKPVARKVNPEAHANYRSLKIRNKNSKGRGRFGRRR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021110 DNA_rep_checkpnt_protein IPR040203 Sld2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0007049 P:cell cycle GO:0006270 P:DNA replication initiation
Pfam	View protein in Pfam PF11719 Drc1-Sld2
CDD	cd22289 RecQL4_SLD2_NTD

Amino Acid Sequences

MMANADVLLPMGSADVAVESTALRAELKEWERTFAAANGGKKAGREDIKQNPEIAAKYKAYSRLRSEESSASRHGKEDRADKTERHSKVEKDVSKKRKHGSPTGPGNALNALTPRKAARGDMLTPQKSRSLNGHPSQLDPYDSPSTLRRLFSPSTHRQTSSSPMPLKTAIGPTPQRDGKALGLFDLLSASGGSTATPSAKRMSAVPTANIQTPSRKRMDAIKEGDEDDDDEDNFLFKRTPASESKRFLLSSFFATPTTMRYAAMVEDEEGLQKEDASQANARAAEEQTSETPSFLRRSTSGRMGPPNAAAGASGMSPVAVRKPQRLFGKSLSALVQGLRDMEEEQMEDDWEILKEIEAEQAAEAAANDVEEGDSQAPEGQRTWKKKGQKRTTRRVVMRPVLSKPKLAPETKAGNEADDVPEAQTESREDENADDAASEPDQDSDPDYEGDARSLKKTSSFSEKMKAAFSSVVNIKNNDKSSAPAAPEDAKAKKPVARKVNPEAHANYRSLKIRNKNSKGRGRFGRRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.04
2	0.04
3	0.04
4	0.05
5	0.05
6	0.05
7	0.05
8	0.06
9	0.06
10	0.06
11	0.07
12	0.08
13	0.17
14	0.2
15	0.29
16	0.29
17	0.33
18	0.33
19	0.34
20	0.35
21	0.28
22	0.32
23	0.28
24	0.3
25	0.3
26	0.32
27	0.31
28	0.3
29	0.31
30	0.31
31	0.32
32	0.35
33	0.4
34	0.48
35	0.55
36	0.56
37	0.54
38	0.48
39	0.47
40	0.44
41	0.39
42	0.35
43	0.28
44	0.28
45	0.32
46	0.38
47	0.41
48	0.45
49	0.48
50	0.5
51	0.54
52	0.55
53	0.55
54	0.54
55	0.52
56	0.5
57	0.48
58	0.46
59	0.41
60	0.42
61	0.41
62	0.39
63	0.41
64	0.45
65	0.46
66	0.47
67	0.5
68	0.48
69	0.53
70	0.56
71	0.53
72	0.51
73	0.5
74	0.47
75	0.54
76	0.62
77	0.6
78	0.6
79	0.68
80	0.71
81	0.75
82	0.8
83	0.76
84	0.74
85	0.74
86	0.75
87	0.74
88	0.74
89	0.74
90	0.71
91	0.67
92	0.59
93	0.53
94	0.44
95	0.35
96	0.26
97	0.19
98	0.16
99	0.14
100	0.16
101	0.16
102	0.18
103	0.18
104	0.18
105	0.21
106	0.23
107	0.26
108	0.32
109	0.41
110	0.42
111	0.42
112	0.42
113	0.43
114	0.38
115	0.38
116	0.36
117	0.35
118	0.41
119	0.43
120	0.49
121	0.44
122	0.45
123	0.46
124	0.41
125	0.35
126	0.26
127	0.28
128	0.23
129	0.22
130	0.22
131	0.22
132	0.26
133	0.27
134	0.28
135	0.24
136	0.27
137	0.28
138	0.32
139	0.39
140	0.43
141	0.47
142	0.49
143	0.49
144	0.45
145	0.46
146	0.47
147	0.44
148	0.42
149	0.38
150	0.36
151	0.37
152	0.35
153	0.34
154	0.29
155	0.27
156	0.21
157	0.24
158	0.26
159	0.26
160	0.32
161	0.32
162	0.31
163	0.28
164	0.29
165	0.26
166	0.27
167	0.24
168	0.18
169	0.17
170	0.16
171	0.14
172	0.12
173	0.08
174	0.05
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.07
183	0.07
184	0.09
185	0.1
186	0.11
187	0.12
188	0.13
189	0.17
190	0.21
191	0.22
192	0.22
193	0.23
194	0.24
195	0.26
196	0.26
197	0.23
198	0.25
199	0.28
200	0.31
201	0.31
202	0.3
203	0.29
204	0.35
205	0.41
206	0.41
207	0.42
208	0.4
209	0.39
210	0.39
211	0.38
212	0.3
213	0.23
214	0.16
215	0.13
216	0.09
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.05
224	0.09
225	0.1
226	0.14
227	0.21
228	0.29
229	0.35
230	0.38
231	0.4
232	0.39
233	0.38
234	0.34
235	0.29
236	0.23
237	0.2
238	0.18
239	0.17
240	0.15
241	0.15
242	0.15
243	0.14
244	0.16
245	0.12
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.09
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.08
262	0.08
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.12
267	0.13
268	0.13
269	0.11
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.09
275	0.12
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.12
280	0.14
281	0.13
282	0.14
283	0.13
284	0.17
285	0.21
286	0.27
287	0.29
288	0.31
289	0.34
290	0.34
291	0.34
292	0.3
293	0.27
294	0.2
295	0.16
296	0.12
297	0.08
298	0.07
299	0.05
300	0.05
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.06
306	0.1
307	0.12
308	0.18
309	0.21
310	0.28
311	0.36
312	0.38
313	0.4
314	0.39
315	0.46
316	0.4
317	0.39
318	0.33
319	0.27
320	0.24
321	0.2
322	0.17
323	0.1
324	0.09
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.11
366	0.18
367	0.26
368	0.32
369	0.4
370	0.44
371	0.54
372	0.61
373	0.71
374	0.73
375	0.77
376	0.81
377	0.85
378	0.89
379	0.89
380	0.89
381	0.86
382	0.84
383	0.81
384	0.78
385	0.71
386	0.67
387	0.67
388	0.61
389	0.56
390	0.48
391	0.49
392	0.49
393	0.46
394	0.42
395	0.39
396	0.45
397	0.44
398	0.48
399	0.38
400	0.32
401	0.32
402	0.3
403	0.25
404	0.18
405	0.17
406	0.12
407	0.12
408	0.12
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.13
413	0.13
414	0.14
415	0.14
416	0.15
417	0.17
418	0.15
419	0.14
420	0.11
421	0.1
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.12
430	0.12
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.15
435	0.15
436	0.16
437	0.17
438	0.17
439	0.18
440	0.2
441	0.2
442	0.23
443	0.26
444	0.29
445	0.35
446	0.4
447	0.42
448	0.48
449	0.5
450	0.47
451	0.47
452	0.42
453	0.35
454	0.32
455	0.28
456	0.27
457	0.29
458	0.34
459	0.34
460	0.36
461	0.38
462	0.42
463	0.44
464	0.39
465	0.35
466	0.32
467	0.33
468	0.36
469	0.33
470	0.27
471	0.29
472	0.29
473	0.32
474	0.35
475	0.34
476	0.33
477	0.35
478	0.37
479	0.39
480	0.44
481	0.5
482	0.55
483	0.6
484	0.64
485	0.71
486	0.76
487	0.74
488	0.73
489	0.69
490	0.66
491	0.61
492	0.55
493	0.48
494	0.45
495	0.48
496	0.48
497	0.52
498	0.54
499	0.61
500	0.7
501	0.76
502	0.81
503	0.85
504	0.89
505	0.88
506	0.87
507	0.87

V5GEN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer