Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5F9F3

Protein Details
Accession V5F9F3    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-77SAVQKSATSKSKKDRKKQRNRKLTQPSATQKKPLSKSKRNQKQALQQASKHydrophilic
200-228RGDREEETKEKKKKKKKKQQMSAPTPDIRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-67TSKSKKDRKKQRNRKLTQPSATQKKPLSKSKRN
200-217RGDREEETKEKKKKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029404  CDIN1  
Pfam View protein in Pfam  
PF14811  TPD  
Amino Acid Sequences MVSHRARKGTSRGEGPKMGQSKNQAQSSAVQKSATSKSKKDRKKQRNRKLTQPSATQKKPLSKSKRNQKQALQQASKPITLNPKALHAKPSDDVYNGVPSAAVGEVFSLALEFRRMKPTVDVIVKVTKTELDREIVSSLIEAALRLLPPATTPQGIKEQQEISRRKGELSRRAENEFIDALRKRRLLFLTEKEQQKGQGRGDREEETKEKKKKKKKKQQMSAPTPDIRFKSPVDISGHTCLWLEYKNFFGFRKNPFVAKKNRKQLGRYATEIGPGAVVYRLGYEMGHLDIEGVRVFRQSDLLAQLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.61
3 0.61
4 0.58
5 0.53
6 0.48
7 0.48
8 0.52
9 0.55
10 0.56
11 0.48
12 0.44
13 0.48
14 0.51
15 0.49
16 0.41
17 0.33
18 0.3
19 0.35
20 0.42
21 0.44
22 0.42
23 0.44
24 0.53
25 0.63
26 0.73
27 0.77
28 0.8
29 0.83
30 0.89
31 0.93
32 0.93
33 0.94
34 0.91
35 0.91
36 0.91
37 0.9
38 0.85
39 0.84
40 0.83
41 0.82
42 0.78
43 0.74
44 0.69
45 0.68
46 0.68
47 0.69
48 0.69
49 0.7
50 0.77
51 0.81
52 0.86
53 0.87
54 0.86
55 0.85
56 0.84
57 0.84
58 0.84
59 0.78
60 0.69
61 0.69
62 0.63
63 0.57
64 0.47
65 0.4
66 0.38
67 0.36
68 0.39
69 0.3
70 0.36
71 0.39
72 0.4
73 0.42
74 0.34
75 0.35
76 0.32
77 0.34
78 0.28
79 0.23
80 0.24
81 0.2
82 0.21
83 0.17
84 0.15
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.08
89 0.07
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.06
99 0.08
100 0.1
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.19
105 0.22
106 0.26
107 0.27
108 0.26
109 0.23
110 0.27
111 0.26
112 0.24
113 0.21
114 0.17
115 0.16
116 0.18
117 0.17
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.13
123 0.12
124 0.09
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.1
141 0.17
142 0.19
143 0.19
144 0.2
145 0.22
146 0.25
147 0.34
148 0.35
149 0.33
150 0.37
151 0.36
152 0.35
153 0.38
154 0.41
155 0.42
156 0.46
157 0.49
158 0.46
159 0.48
160 0.48
161 0.42
162 0.37
163 0.28
164 0.21
165 0.19
166 0.17
167 0.18
168 0.21
169 0.22
170 0.21
171 0.24
172 0.26
173 0.26
174 0.3
175 0.34
176 0.37
177 0.43
178 0.45
179 0.42
180 0.41
181 0.42
182 0.42
183 0.41
184 0.38
185 0.37
186 0.36
187 0.38
188 0.41
189 0.39
190 0.35
191 0.35
192 0.35
193 0.37
194 0.44
195 0.5
196 0.56
197 0.63
198 0.72
199 0.78
200 0.85
201 0.88
202 0.9
203 0.92
204 0.93
205 0.95
206 0.95
207 0.94
208 0.91
209 0.86
210 0.8
211 0.7
212 0.64
213 0.55
214 0.47
215 0.4
216 0.32
217 0.33
218 0.29
219 0.32
220 0.32
221 0.33
222 0.34
223 0.35
224 0.34
225 0.27
226 0.26
227 0.21
228 0.18
229 0.19
230 0.17
231 0.14
232 0.18
233 0.21
234 0.23
235 0.23
236 0.28
237 0.31
238 0.35
239 0.43
240 0.42
241 0.46
242 0.5
243 0.58
244 0.63
245 0.68
246 0.72
247 0.73
248 0.78
249 0.77
250 0.75
251 0.76
252 0.75
253 0.7
254 0.64
255 0.58
256 0.52
257 0.48
258 0.44
259 0.35
260 0.25
261 0.18
262 0.15
263 0.1
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.11
282 0.13
283 0.12
284 0.14
285 0.14
286 0.17