Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5HTS0

Protein Details
Accession V5HTS0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MRPRCQSHRPRVMRQNEYLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
Amino Acid Sequences MRPRCQSHRPRVMRQNEYLVEDGGPFRNSLLSSGAREQLEASSRFPGCLNLIMLRSNFLGFAVPQRPPGHGDQPPVKRRRPDDNATPSSSTADLSSEPRDVSTLSFTSGLMPGREQSQVYTDWIKAGKPHNFICHECRKPNNLLLCKTCCRGYHASCLPASPVPENLEDFHCPSCKEKHWDTSPPRILPSAPPSDISRSVSPSITEAERRTASMNHIHSEHGSPATRVSTPQLQFPADVGDLWPNPTIPFRPNIDPAARAKDFLAEYDGHHANREYGSDFLLQLGRMIQQAESSSQSLREAESLREENAKLKRENSQLRLNLSSRLSSRDPALSLRRSPSATRTYTSSNNSVASLIPPDVSERSWDRIISDVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.79
3 0.71
4 0.67
5 0.58
6 0.49
7 0.39
8 0.32
9 0.29
10 0.23
11 0.2
12 0.16
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.18
18 0.18
19 0.21
20 0.25
21 0.3
22 0.27
23 0.27
24 0.27
25 0.25
26 0.29
27 0.26
28 0.25
29 0.26
30 0.26
31 0.27
32 0.26
33 0.25
34 0.21
35 0.22
36 0.23
37 0.19
38 0.21
39 0.23
40 0.22
41 0.22
42 0.21
43 0.17
44 0.15
45 0.12
46 0.12
47 0.09
48 0.16
49 0.18
50 0.19
51 0.24
52 0.25
53 0.27
54 0.29
55 0.34
56 0.36
57 0.35
58 0.41
59 0.44
60 0.53
61 0.61
62 0.65
63 0.66
64 0.65
65 0.67
66 0.71
67 0.7
68 0.68
69 0.69
70 0.72
71 0.72
72 0.68
73 0.64
74 0.54
75 0.48
76 0.4
77 0.3
78 0.2
79 0.16
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.15
96 0.15
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.16
107 0.17
108 0.15
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.25
114 0.28
115 0.31
116 0.33
117 0.37
118 0.41
119 0.43
120 0.46
121 0.49
122 0.49
123 0.49
124 0.51
125 0.5
126 0.5
127 0.52
128 0.54
129 0.49
130 0.48
131 0.48
132 0.49
133 0.46
134 0.44
135 0.42
136 0.34
137 0.34
138 0.36
139 0.34
140 0.38
141 0.38
142 0.39
143 0.36
144 0.36
145 0.31
146 0.26
147 0.24
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.16
161 0.19
162 0.21
163 0.27
164 0.28
165 0.35
166 0.39
167 0.47
168 0.5
169 0.56
170 0.56
171 0.51
172 0.49
173 0.42
174 0.37
175 0.31
176 0.31
177 0.25
178 0.2
179 0.21
180 0.21
181 0.24
182 0.25
183 0.25
184 0.2
185 0.19
186 0.2
187 0.19
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.14
192 0.15
193 0.13
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.16
199 0.18
200 0.22
201 0.23
202 0.21
203 0.21
204 0.21
205 0.21
206 0.21
207 0.19
208 0.15
209 0.14
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.14
216 0.19
217 0.19
218 0.23
219 0.24
220 0.23
221 0.23
222 0.22
223 0.22
224 0.14
225 0.13
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.14
235 0.12
236 0.16
237 0.19
238 0.22
239 0.25
240 0.29
241 0.29
242 0.3
243 0.31
244 0.35
245 0.32
246 0.28
247 0.26
248 0.26
249 0.24
250 0.21
251 0.21
252 0.14
253 0.15
254 0.2
255 0.23
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.18
260 0.17
261 0.18
262 0.13
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.09
276 0.09
277 0.11
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.16
284 0.15
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.16
289 0.22
290 0.23
291 0.23
292 0.26
293 0.26
294 0.3
295 0.34
296 0.39
297 0.35
298 0.36
299 0.42
300 0.48
301 0.56
302 0.55
303 0.59
304 0.57
305 0.59
306 0.63
307 0.56
308 0.52
309 0.45
310 0.43
311 0.35
312 0.36
313 0.34
314 0.3
315 0.32
316 0.3
317 0.3
318 0.32
319 0.38
320 0.38
321 0.4
322 0.42
323 0.44
324 0.43
325 0.44
326 0.45
327 0.46
328 0.44
329 0.42
330 0.42
331 0.43
332 0.47
333 0.5
334 0.47
335 0.41
336 0.39
337 0.37
338 0.33
339 0.28
340 0.23
341 0.2
342 0.17
343 0.14
344 0.13
345 0.16
346 0.17
347 0.17
348 0.21
349 0.22
350 0.27
351 0.29
352 0.29
353 0.27