Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GBW1

Protein Details
Accession V5GBW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-374HKSILNEEPKWRRRRPGRRWTTNLAHAMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-365PKWRRRRPGRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.833, cyto 8, cyto_mito 5.333, mito 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032801  PXL2A/B/C  
IPR036249  Thioredoxin-like_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13911  AhpC-TSA_2  
CDD cd02970  PRX_like2  
Amino Acid Sequences MSVTITMQRELFPAFHQSDAHTWASDPSQQTFVRVRPIQPQKSVIPSNLVLNDISKPAFGVSIIKTDAHSIASPKSPSIADKSLPPTPFGEAFGDAGRLSPDSDRLLDESGEDVEVSSELPSQAMLAEAASLPVIDAHGVEMPFRNIYMPSCALEKKRVMVIFVRHFFCGNCQEYLRSLTSAIPSTSALPDGTELVIIGCGSPSLITMYKEETSCPFPVYADPTKRLYRALGMGRTLNLGRNDPEYIRRSLLTGMFQSVVQGVKRLGEGDAFRGGDMRQIGGEFIFEASRDWRFDYGEEDARAGSDVDLKVTWCHRMRNTRDHAEIRVICRVLGLHRESDSESNEKHKSILNEEPKWRRRRPGRRWTTNLAHAMAVANGHRHSWSRLNKSVDAGRTGIFGGKSSKGQDCPCDNTSST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.24
4 0.25
5 0.27
6 0.3
7 0.3
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.24
12 0.27
13 0.26
14 0.23
15 0.28
16 0.28
17 0.32
18 0.35
19 0.35
20 0.4
21 0.41
22 0.41
23 0.45
24 0.56
25 0.58
26 0.58
27 0.61
28 0.55
29 0.6
30 0.61
31 0.52
32 0.47
33 0.41
34 0.41
35 0.36
36 0.33
37 0.25
38 0.23
39 0.23
40 0.19
41 0.18
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.13
48 0.12
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.19
54 0.19
55 0.17
56 0.17
57 0.15
58 0.17
59 0.22
60 0.22
61 0.21
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.26
66 0.27
67 0.23
68 0.28
69 0.33
70 0.37
71 0.37
72 0.36
73 0.31
74 0.3
75 0.3
76 0.26
77 0.23
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.17
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.11
89 0.12
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.15
139 0.18
140 0.19
141 0.24
142 0.24
143 0.22
144 0.25
145 0.25
146 0.24
147 0.25
148 0.3
149 0.32
150 0.36
151 0.36
152 0.31
153 0.32
154 0.3
155 0.29
156 0.29
157 0.23
158 0.2
159 0.19
160 0.2
161 0.21
162 0.24
163 0.22
164 0.15
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.03
191 0.04
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.18
207 0.22
208 0.22
209 0.24
210 0.28
211 0.29
212 0.3
213 0.29
214 0.24
215 0.2
216 0.23
217 0.24
218 0.22
219 0.22
220 0.22
221 0.21
222 0.22
223 0.2
224 0.18
225 0.15
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.17
230 0.16
231 0.22
232 0.21
233 0.22
234 0.22
235 0.21
236 0.2
237 0.21
238 0.22
239 0.18
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.15
258 0.14
259 0.13
260 0.14
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.11
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.05
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.08
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.17
283 0.19
284 0.22
285 0.22
286 0.21
287 0.19
288 0.19
289 0.19
290 0.16
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.23
300 0.21
301 0.27
302 0.33
303 0.43
304 0.5
305 0.58
306 0.65
307 0.64
308 0.68
309 0.65
310 0.61
311 0.6
312 0.56
313 0.49
314 0.46
315 0.39
316 0.32
317 0.29
318 0.28
319 0.22
320 0.25
321 0.24
322 0.21
323 0.22
324 0.24
325 0.26
326 0.28
327 0.29
328 0.26
329 0.25
330 0.29
331 0.31
332 0.3
333 0.29
334 0.3
335 0.3
336 0.31
337 0.39
338 0.42
339 0.48
340 0.56
341 0.65
342 0.71
343 0.76
344 0.77
345 0.77
346 0.79
347 0.83
348 0.85
349 0.85
350 0.88
351 0.89
352 0.91
353 0.89
354 0.86
355 0.83
356 0.77
357 0.67
358 0.56
359 0.46
360 0.38
361 0.3
362 0.23
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.14
367 0.15
368 0.17
369 0.21
370 0.29
371 0.38
372 0.44
373 0.51
374 0.57
375 0.57
376 0.61
377 0.63
378 0.57
379 0.51
380 0.44
381 0.37
382 0.31
383 0.29
384 0.27
385 0.2
386 0.18
387 0.19
388 0.2
389 0.23
390 0.27
391 0.32
392 0.34
393 0.38
394 0.45
395 0.47
396 0.51
397 0.51