FuNGI

V5FMF4

Protein Details

Accession

V5FMF4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
603-629	TDLTSDDKARSKRRRNPNPHRRVDIII	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
102-110	AKRRRLENG
112-114	EKR
612-621	RSKRRRNPNP

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001357 BRCT_dom IPR002054 DNA-dir_DNA_pol_X IPR010996 DNA_pol_b-like_N IPR028207 DNA_pol_B_palm_palm IPR018944 DNA_pol_lambd_fingers_domain IPR027421 DNA_pol_lamdba_lyase_dom_sf IPR037160 DNA_Pol_thumb_sf IPR022312 DNA_pol_X IPR043519 NT_sf IPR029398 PolB_thumb
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0003677 F:DNA binding GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0006281 P:DNA repair
Pfam	View protein in Pfam PF14792 DNA_pol_B_palm PF14791 DNA_pol_B_thumb PF10391 DNA_pol_lambd_f PF14716 HHH_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS50172 BRCT
CDD	cd00141 NT_POLXc

Amino Acid Sequences

MDHTPSMSRTSPEDPDDELPAKRPSFAGFPPIFVLPTHLTLDELHQVEETLADCRAPLTYDVSEAKLVLGKVSQKKRAALELRSRGLWTEEVFRTPSPEPPAKRRRLENGVEKRLKVRAKDTEVIDLDTESENEADGETSHHAPAMHLIKRRSPSPAAVSTTSSATTSSSLAVGPAGELKVVKLEWFHVCMKAGKSIPPEPYVVYHARVVPRPENLMVTAVTKLDSRSVSSASPSPTRIKDPDARHILDRAKEDAASRPPPPSFMKPYITARRSREHEDGPQSQFHPPKLYRQTTSEHDEAVPLPPTPDWVKNNIKYACMRSAPLHPPNEKFMEQLIKIRRARELTLDEIGVRAYSTSIAAIAAYPYEFRTPLEVLTLPGCDTKIANLFAEFRESPDGTVAAAQVIDTDPVLRTVHTFYNIRGVGAKTAREFYYLREWRDLDDVVEHGWDTLSRVQQIGLKYYDEFSKGIPRAEVEEIGRIVHRHANRVRPGCDYDGRGVECIIVGGYRRGKDVSGDVDLVLSHRDETITKNLVVDIVRSLEEEGWITHTLSLHMTTSHRDQQTLPFRGDDPPGQTFDSLDKALVVWQDPHFDEGNHDPSTETDLTSDDKARSKRRRNPNPHRRVDIIISPWRTVGCAVLGWSGDTTFERDLRRYAKKAHGWKFDSSGVRERTSGGQVIDLERGGATWEEREKLVMEGLGVGWRPATERCTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.35
3	0.39
4	0.37
5	0.33
6	0.33
7	0.36
8	0.34
9	0.31
10	0.3
11	0.27
12	0.3
13	0.3
14	0.36
15	0.3
16	0.31
17	0.32
18	0.32
19	0.3
20	0.24
21	0.27
22	0.2
23	0.22
24	0.22
25	0.2
26	0.2
27	0.2
28	0.24
29	0.25
30	0.23
31	0.2
32	0.18
33	0.18
34	0.17
35	0.18
36	0.15
37	0.1
38	0.09
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.09
43	0.1
44	0.11
45	0.14
46	0.14
47	0.19
48	0.21
49	0.23
50	0.23
51	0.21
52	0.2
53	0.19
54	0.18
55	0.14
56	0.16
57	0.22
58	0.31
59	0.39
60	0.46
61	0.48
62	0.52
63	0.55
64	0.61
65	0.6
66	0.6
67	0.62
68	0.63
69	0.62
70	0.58
71	0.55
72	0.47
73	0.42
74	0.36
75	0.27
76	0.26
77	0.24
78	0.26
79	0.27
80	0.27
81	0.29
82	0.28
83	0.32
84	0.32
85	0.38
86	0.41
87	0.49
88	0.6
89	0.64
90	0.7
91	0.71
92	0.73
93	0.74
94	0.77
95	0.77
96	0.78
97	0.79
98	0.77
99	0.72
100	0.66
101	0.65
102	0.6
103	0.53
104	0.51
105	0.49
106	0.52
107	0.56
108	0.55
109	0.56
110	0.52
111	0.5
112	0.42
113	0.32
114	0.26
115	0.2
116	0.19
117	0.11
118	0.1
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.06
123	0.06
124	0.08
125	0.1
126	0.11
127	0.11
128	0.13
129	0.13
130	0.12
131	0.19
132	0.24
133	0.26
134	0.3
135	0.33
136	0.37
137	0.41
138	0.43
139	0.42
140	0.38
141	0.38
142	0.39
143	0.43
144	0.42
145	0.4
146	0.4
147	0.36
148	0.34
149	0.29
150	0.23
151	0.17
152	0.13
153	0.12
154	0.1
155	0.1
156	0.09
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.06
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.07
166	0.06
167	0.08
168	0.08
169	0.09
170	0.08
171	0.11
172	0.13
173	0.17
174	0.18
175	0.18
176	0.2
177	0.23
178	0.24
179	0.27
180	0.26
181	0.26
182	0.3
183	0.33
184	0.35
185	0.33
186	0.33
187	0.28
188	0.28
189	0.29
190	0.26
191	0.23
192	0.22
193	0.23
194	0.25
195	0.28
196	0.31
197	0.29
198	0.29
199	0.3
200	0.29
201	0.27
202	0.24
203	0.22
204	0.18
205	0.16
206	0.14
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.12
214	0.13
215	0.15
216	0.14
217	0.16
218	0.19
219	0.19
220	0.21
221	0.22
222	0.25
223	0.26
224	0.3
225	0.3
226	0.32
227	0.37
228	0.39
229	0.46
230	0.48
231	0.47
232	0.44
233	0.47
234	0.45
235	0.41
236	0.38
237	0.32
238	0.26
239	0.25
240	0.25
241	0.25
242	0.27
243	0.26
244	0.25
245	0.26
246	0.25
247	0.28
248	0.32
249	0.32
250	0.33
251	0.35
252	0.37
253	0.37
254	0.45
255	0.51
256	0.5
257	0.51
258	0.49
259	0.51
260	0.52
261	0.54
262	0.51
263	0.45
264	0.49
265	0.49
266	0.51
267	0.46
268	0.44
269	0.39
270	0.4
271	0.39
272	0.33
273	0.33
274	0.28
275	0.35
276	0.41
277	0.44
278	0.41
279	0.41
280	0.44
281	0.42
282	0.47
283	0.38
284	0.3
285	0.26
286	0.25
287	0.22
288	0.2
289	0.16
290	0.1
291	0.1
292	0.08
293	0.11
294	0.13
295	0.17
296	0.17
297	0.24
298	0.31
299	0.33
300	0.41
301	0.4
302	0.4
303	0.37
304	0.39
305	0.36
306	0.3
307	0.28
308	0.22
309	0.28
310	0.32
311	0.36
312	0.38
313	0.36
314	0.37
315	0.39
316	0.41
317	0.34
318	0.28
319	0.24
320	0.24
321	0.21
322	0.26
323	0.27
324	0.31
325	0.33
326	0.33
327	0.34
328	0.32
329	0.32
330	0.31
331	0.29
332	0.23
333	0.23
334	0.22
335	0.18
336	0.16
337	0.15
338	0.1
339	0.07
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.08
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.11
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.07
369	0.06
370	0.07
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.12
376	0.11
377	0.16
378	0.14
379	0.12
380	0.15
381	0.15
382	0.14
383	0.13
384	0.13
385	0.09
386	0.1
387	0.09
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.09
402	0.11
403	0.14
404	0.15
405	0.13
406	0.21
407	0.21
408	0.2
409	0.2
410	0.19
411	0.2
412	0.21
413	0.22
414	0.15
415	0.17
416	0.17
417	0.18
418	0.18
419	0.17
420	0.26
421	0.29
422	0.3
423	0.32
424	0.32
425	0.3
426	0.33
427	0.3
428	0.19
429	0.16
430	0.14
431	0.11
432	0.11
433	0.09
434	0.06
435	0.06
436	0.05
437	0.06
438	0.1
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.13
443	0.16
444	0.17
445	0.19
446	0.16
447	0.16
448	0.16
449	0.17
450	0.17
451	0.16
452	0.15
453	0.13
454	0.2
455	0.2
456	0.2
457	0.2
458	0.19
459	0.21
460	0.22
461	0.23
462	0.15
463	0.16
464	0.16
465	0.16
466	0.16
467	0.12
468	0.13
469	0.17
470	0.17
471	0.23
472	0.27
473	0.35
474	0.43
475	0.48
476	0.49
477	0.47
478	0.5
479	0.46
480	0.45
481	0.39
482	0.34
483	0.33
484	0.31
485	0.27
486	0.24
487	0.19
488	0.15
489	0.13
490	0.09
491	0.06
492	0.06
493	0.1
494	0.13
495	0.14
496	0.15
497	0.16
498	0.16
499	0.17
500	0.2
501	0.19
502	0.18
503	0.18
504	0.16
505	0.16
506	0.16
507	0.14
508	0.12
509	0.09
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.11
515	0.17
516	0.2
517	0.2
518	0.2
519	0.2
520	0.21
521	0.21
522	0.18
523	0.13
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.12
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.09
532	0.11
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.12
537	0.13
538	0.13
539	0.14
540	0.11
541	0.12
542	0.13
543	0.15
544	0.2
545	0.27
546	0.27
547	0.27
548	0.28
549	0.36
550	0.45
551	0.46
552	0.41
553	0.35
554	0.36
555	0.38
556	0.39
557	0.33
558	0.28
559	0.27
560	0.28
561	0.27
562	0.26
563	0.23
564	0.22
565	0.22
566	0.18
567	0.15
568	0.13
569	0.12
570	0.14
571	0.14
572	0.13
573	0.13
574	0.14
575	0.18
576	0.18
577	0.21
578	0.2
579	0.19
580	0.22
581	0.24
582	0.28
583	0.24
584	0.24
585	0.21
586	0.21
587	0.28
588	0.24
589	0.19
590	0.14
591	0.15
592	0.18
593	0.2
594	0.23
595	0.19
596	0.25
597	0.32
598	0.42
599	0.52
600	0.6
601	0.67
602	0.76
603	0.84
604	0.89
605	0.93
606	0.94
607	0.94
608	0.93
609	0.89
610	0.82
611	0.75
612	0.69
613	0.64
614	0.6
615	0.57
616	0.51
617	0.45
618	0.42
619	0.37
620	0.32
621	0.26
622	0.2
623	0.13
624	0.11
625	0.12
626	0.13
627	0.13
628	0.13
629	0.12
630	0.11
631	0.11
632	0.11
633	0.13
634	0.14
635	0.18
636	0.21
637	0.22
638	0.29
639	0.36
640	0.43
641	0.45
642	0.5
643	0.56
644	0.62
645	0.71
646	0.74
647	0.77
648	0.72
649	0.71
650	0.68
651	0.66
652	0.62
653	0.57
654	0.57
655	0.51
656	0.49
657	0.45
658	0.43
659	0.4
660	0.38
661	0.36
662	0.27
663	0.26
664	0.26
665	0.27
666	0.27
667	0.22
668	0.18
669	0.15
670	0.14
671	0.12
672	0.12
673	0.11
674	0.14
675	0.18
676	0.19
677	0.2
678	0.21
679	0.21
680	0.21
681	0.22
682	0.17
683	0.14
684	0.13
685	0.13
686	0.15
687	0.14
688	0.12
689	0.11
690	0.1
691	0.13
692	0.14

V5FMF4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer