FuNGI

V5FDU2

Protein Details

Accession

V5FDU2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
670-695	DSRSDDKRGRKGFQKRDQRGAQRGDR	Basic
706-727	QRGDRGDRRDRRDQKGPPGKPS	Basic
731-750	KQGLKRKRSESSSNDKKPGD	Basic
761-785	DNGVAKRNRIIAKKRMQRKTRKGKA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
676-785	KRGRKGFQKRDQRGAQRGDRGDRRGDQRGGQRGDRGDRRDRRDQKGPPGKPSQDFKQGLKRKRSESSSNDKKPGDKENSRNGGEKDNGVAKRNRIIAKKRMQRKTRKGKA

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034809 Nop4_RRM4 IPR034808 Nop4p_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12676 RRM3_Nop4p cd12677 RRM4_Nop4p

Amino Acid Sequences

MEETRKRRRLSESGSFQVEDAVKEAIKNDTVAAEQHNEQQTASSSAAASRQPRKTLFVRSLPASATTESLTEYFSQSYVIKHATVVLDPETKQSKGYGFVSFADLEDAQRALEEFNGSDFDGKKIKVDYAEPRHREVDETVGKSHPTAEALRLKEERERRRAETQPPRLIVRNLPWSIKEPDDLAVLFRSYGKVKHVVLPKKGNQLAGFGFVVLRGKKNAEKALEGVNGKEVDGRTIAVDWAVEKEAWENAQKSAEDDADAKPEADGEEDATPAQDEEHQWEDVGSGSEAEDSEEEDEDVDMEDVEDEDEEEEEQEDERNASTVFIRNLPFTSTDELLYEHFTRFGPVRYARIVLDYETERPKGTGFVCFYKVEDAISCVRNAPKQTEVLAEKDKSKPQTIVKHSVLQNENADPTGQYTMDGRVLQVTRAVSKTQASRLQEEGVNKRLTRDTDKRRLYLLSEGTIPSNSALYKKLSPSEVKMREDSLKQRQTLIKNNPTLHLSLTRLSIRNIPRHITSKDLKALAREAVVGFAKDVKAGLRQPLSKEELKRSSEEMREAEQERKLKGKGIVKQAKIVFEGRDGSKIEEKSGAGRSRGYGFIEYATHRNALMGLRWLNGHAVDMKPENGVKEKKKRLIVEFAIENAQVVKRRSEHQAKVRTSDKTDKADDDSRSDDKRGRKGFQKRDQRGAQRGDRGDRRGDQRGGQRGDRGDRRDRRDQKGPPGKPSQDFKQGLKRKRSESSSNDKKPGDKENSRNGGEKDNGVAKRNRIIAKKRMQRKTRKGKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.63
3	0.55
4	0.5
5	0.42
6	0.32
7	0.25
8	0.21
9	0.17
10	0.17
11	0.19
12	0.16
13	0.16
14	0.16
15	0.15
16	0.15
17	0.15
18	0.17
19	0.18
20	0.19
21	0.2
22	0.27
23	0.3
24	0.29
25	0.28
26	0.28
27	0.27
28	0.27
29	0.26
30	0.19
31	0.15
32	0.16
33	0.2
34	0.23
35	0.28
36	0.33
37	0.39
38	0.44
39	0.46
40	0.51
41	0.54
42	0.58
43	0.59
44	0.58
45	0.57
46	0.54
47	0.54
48	0.49
49	0.46
50	0.39
51	0.32
52	0.26
53	0.21
54	0.18
55	0.17
56	0.16
57	0.14
58	0.13
59	0.14
60	0.13
61	0.12
62	0.14
63	0.14
64	0.15
65	0.17
66	0.18
67	0.16
68	0.16
69	0.19
70	0.18
71	0.18
72	0.19
73	0.19
74	0.21
75	0.21
76	0.27
77	0.28
78	0.26
79	0.26
80	0.26
81	0.25
82	0.26
83	0.28
84	0.25
85	0.23
86	0.24
87	0.26
88	0.24
89	0.22
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.15
94	0.13
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.08
102	0.09
103	0.11
104	0.11
105	0.14
106	0.14
107	0.16
108	0.19
109	0.19
110	0.21
111	0.21
112	0.24
113	0.23
114	0.28
115	0.35
116	0.41
117	0.51
118	0.52
119	0.54
120	0.54
121	0.52
122	0.49
123	0.4
124	0.39
125	0.37
126	0.36
127	0.34
128	0.33
129	0.33
130	0.3
131	0.3
132	0.21
133	0.17
134	0.16
135	0.2
136	0.26
137	0.27
138	0.32
139	0.33
140	0.34
141	0.38
142	0.46
143	0.49
144	0.51
145	0.56
146	0.56
147	0.63
148	0.68
149	0.71
150	0.73
151	0.74
152	0.73
153	0.7
154	0.68
155	0.63
156	0.59
157	0.53
158	0.49
159	0.48
160	0.42
161	0.41
162	0.39
163	0.4
164	0.4
165	0.37
166	0.31
167	0.23
168	0.22
169	0.21
170	0.2
171	0.16
172	0.14
173	0.12
174	0.12
175	0.11
176	0.12
177	0.12
178	0.14
179	0.16
180	0.2
181	0.21
182	0.28
183	0.36
184	0.42
185	0.48
186	0.55
187	0.57
188	0.61
189	0.62
190	0.58
191	0.5
192	0.46
193	0.39
194	0.33
195	0.27
196	0.18
197	0.15
198	0.13
199	0.16
200	0.14
201	0.14
202	0.13
203	0.16
204	0.19
205	0.25
206	0.3
207	0.28
208	0.29
209	0.29
210	0.33
211	0.35
212	0.32
213	0.27
214	0.25
215	0.23
216	0.21
217	0.22
218	0.16
219	0.13
220	0.13
221	0.13
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.07
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.09
234	0.11
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.16
239	0.16
240	0.17
241	0.18
242	0.16
243	0.14
244	0.15
245	0.14
246	0.14
247	0.15
248	0.13
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.06
261	0.07
262	0.06
263	0.07
264	0.1
265	0.13
266	0.13
267	0.13
268	0.13
269	0.12
270	0.11
271	0.12
272	0.08
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.06
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.1
311	0.11
312	0.14
313	0.15
314	0.15
315	0.15
316	0.16
317	0.16
318	0.15
319	0.16
320	0.14
321	0.13
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.14
326	0.14
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.12
331	0.12
332	0.13
333	0.15
334	0.16
335	0.18
336	0.18
337	0.2
338	0.19
339	0.19
340	0.18
341	0.14
342	0.15
343	0.13
344	0.15
345	0.16
346	0.17
347	0.15
348	0.15
349	0.15
350	0.15
351	0.14
352	0.16
353	0.16
354	0.18
355	0.21
356	0.21
357	0.21
358	0.19
359	0.19
360	0.14
361	0.12
362	0.11
363	0.12
364	0.12
365	0.12
366	0.12
367	0.13
368	0.15
369	0.16
370	0.16
371	0.15
372	0.16
373	0.16
374	0.19
375	0.19
376	0.2
377	0.23
378	0.22
379	0.23
380	0.25
381	0.27
382	0.25
383	0.26
384	0.27
385	0.29
386	0.37
387	0.4
388	0.45
389	0.44
390	0.49
391	0.48
392	0.51
393	0.46
394	0.39
395	0.35
396	0.27
397	0.25
398	0.19
399	0.17
400	0.1
401	0.1
402	0.09
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.1
408	0.1
409	0.09
410	0.11
411	0.11
412	0.11
413	0.12
414	0.12
415	0.12
416	0.13
417	0.13
418	0.11
419	0.14
420	0.16
421	0.19
422	0.23
423	0.24
424	0.25
425	0.26
426	0.27
427	0.27
428	0.29
429	0.28
430	0.28
431	0.29
432	0.26
433	0.27
434	0.27
435	0.28
436	0.31
437	0.37
438	0.42
439	0.49
440	0.53
441	0.53
442	0.52
443	0.5
444	0.44
445	0.4
446	0.32
447	0.23
448	0.21
449	0.2
450	0.19
451	0.18
452	0.16
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.11
459	0.14
460	0.15
461	0.17
462	0.2
463	0.21
464	0.25
465	0.33
466	0.37
467	0.37
468	0.37
469	0.37
470	0.37
471	0.39
472	0.42
473	0.42
474	0.41
475	0.39
476	0.43
477	0.46
478	0.48
479	0.54
480	0.56
481	0.54
482	0.54
483	0.55
484	0.52
485	0.48
486	0.43
487	0.35
488	0.29
489	0.23
490	0.18
491	0.2
492	0.21
493	0.21
494	0.21
495	0.26
496	0.28
497	0.33
498	0.34
499	0.34
500	0.34
501	0.39
502	0.39
503	0.39
504	0.37
505	0.36
506	0.38
507	0.38
508	0.35
509	0.31
510	0.32
511	0.27
512	0.24
513	0.19
514	0.14
515	0.13
516	0.13
517	0.11
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.08
524	0.11
525	0.13
526	0.18
527	0.21
528	0.23
529	0.26
530	0.31
531	0.35
532	0.36
533	0.39
534	0.42
535	0.44
536	0.44
537	0.44
538	0.43
539	0.44
540	0.42
541	0.42
542	0.36
543	0.32
544	0.34
545	0.35
546	0.35
547	0.34
548	0.34
549	0.32
550	0.35
551	0.32
552	0.32
553	0.37
554	0.4
555	0.41
556	0.49
557	0.55
558	0.52
559	0.58
560	0.55
561	0.51
562	0.46
563	0.41
564	0.31
565	0.25
566	0.28
567	0.22
568	0.23
569	0.22
570	0.23
571	0.27
572	0.26
573	0.25
574	0.24
575	0.23
576	0.24
577	0.3
578	0.3
579	0.26
580	0.26
581	0.27
582	0.27
583	0.29
584	0.27
585	0.2
586	0.18
587	0.18
588	0.19
589	0.2
590	0.19
591	0.19
592	0.18
593	0.16
594	0.16
595	0.16
596	0.14
597	0.14
598	0.17
599	0.16
600	0.16
601	0.17
602	0.17
603	0.16
604	0.15
605	0.15
606	0.12
607	0.12
608	0.14
609	0.16
610	0.16
611	0.17
612	0.18
613	0.19
614	0.23
615	0.31
616	0.37
617	0.46
618	0.54
619	0.6
620	0.66
621	0.7
622	0.69
623	0.7
624	0.65
625	0.61
626	0.53
627	0.47
628	0.42
629	0.35
630	0.3
631	0.21
632	0.2
633	0.18
634	0.18
635	0.21
636	0.22
637	0.26
638	0.36
639	0.44
640	0.5
641	0.55
642	0.63
643	0.63
644	0.66
645	0.68
646	0.64
647	0.61
648	0.61
649	0.59
650	0.55
651	0.55
652	0.51
653	0.52
654	0.54
655	0.49
656	0.44
657	0.43
658	0.42
659	0.42
660	0.42
661	0.42
662	0.42
663	0.5
664	0.52
665	0.53
666	0.58
667	0.66
668	0.73
669	0.78
670	0.82
671	0.79
672	0.82
673	0.85
674	0.85
675	0.83
676	0.81
677	0.79
678	0.76
679	0.74
680	0.73
681	0.71
682	0.66
683	0.64
684	0.61
685	0.61
686	0.6
687	0.58
688	0.55
689	0.57
690	0.63
691	0.62
692	0.58
693	0.56
694	0.54
695	0.6
696	0.61
697	0.59
698	0.6
699	0.63
700	0.68
701	0.74
702	0.77
703	0.76
704	0.78
705	0.8
706	0.81
707	0.82
708	0.81
709	0.78
710	0.79
711	0.77
712	0.74
713	0.73
714	0.69
715	0.69
716	0.67
717	0.64
718	0.65
719	0.68
720	0.7
721	0.74
722	0.74
723	0.7
724	0.75
725	0.77
726	0.76
727	0.75
728	0.77
729	0.78
730	0.79
731	0.8
732	0.74
733	0.72
734	0.67
735	0.68
736	0.68
737	0.66
738	0.66
739	0.69
740	0.75
741	0.73
742	0.74
743	0.66
744	0.63
745	0.57
746	0.5
747	0.44
748	0.44
749	0.44
750	0.44
751	0.47
752	0.43
753	0.47
754	0.53
755	0.55
756	0.56
757	0.61
758	0.65
759	0.71
760	0.77
761	0.8
762	0.83
763	0.86
764	0.88
765	0.91

V5FDU2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer