FuNGI

V2XT20

Protein Details

Accession

V2XT20

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-33	PSMALLFHPKKNKKQTPAASPRPKAST	Hydrophilic
159-180	SGGANGKKKFQKKTKQVFIVPE	Hydrophilic
580-605	TSPNVAGQQPKPKKRKNQNGAVATPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-30	KKNKKQTPAASPRPK
154-171	KGKGGSGGANGKKKFQKK
591-594	PKKR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 9.5, mito 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	mrr:Moror_7351 -

Amino Acid Sequences

MAPAREPSMALLFHPKKNKKQTPAASPRPKASTSPRPTIKPASPSQNDDDTDTFKLPEGPYQEYKLMSSALKGWKFDVMKFDTRKVVDLNSWIQPVKLNRKDLRREDPSASTAGQAVRPMLGLDGQQVFGADGKPVMVDAEGRPVVESNQANGKGKGGSGGANGKKKFQKKTKQVFIVPEEIRALRKEERYPWVMEDSGGQETWVGQLDELSKSETHAFFMPAAAGDTLKFVPSHRWYRFQKKLKHDLPTDTQTVESAYQQSQKRDPAAWLRQRNGKGPSSATAAMFKAEAEGHIPNGGSGSLVQHSSQSLGPGGRRLKTVESGGGGLFGDDDEDGGARRRREREYGGEGDLDENEYEEEFADDDEKIEVDNDDQETKELEERLKREYKSANKTREGYIDESDEEEKPNISKSGKAMKKMLKNREGEAYDSEEEDNPYASSQEEEEEEEIPPPTNEPAVQQQPQQIKPKTEPTEPSLSKAGSPPPQSGTQSSAQPASPTSPSLGGHSVVAKRATSPPPPKAPKLKTNMSRASSPLAGGSGSRAGSPVTGPGSRASSPVANGQKKRKAEDSVPSPTSPSGTSPNVAGQQPKPKKRKNQNGAVATPTGPLEDWMLIDWLKNTPNASTRECIQYFTPYLTDEKEKSRFTGLVKEFATLKNGVLTLRSSYANRGSTPSTTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.53
3	0.59
4	0.7
5	0.79
6	0.77
7	0.82
8	0.85
9	0.86
10	0.88
11	0.89
12	0.89
13	0.84
14	0.81
15	0.76
16	0.69
17	0.64
18	0.63
19	0.63
20	0.6
21	0.65
22	0.66
23	0.65
24	0.69
25	0.71
26	0.68
27	0.64
28	0.64
29	0.64
30	0.62
31	0.63
32	0.62
33	0.61
34	0.55
35	0.52
36	0.47
37	0.4
38	0.38
39	0.34
40	0.29
41	0.23
42	0.27
43	0.23
44	0.25
45	0.26
46	0.29
47	0.32
48	0.36
49	0.38
50	0.33
51	0.34
52	0.3
53	0.28
54	0.22
55	0.2
56	0.22
57	0.28
58	0.3
59	0.3
60	0.3
61	0.34
62	0.36
63	0.36
64	0.38
65	0.35
66	0.41
67	0.44
68	0.47
69	0.47
70	0.46
71	0.47
72	0.41
73	0.37
74	0.31
75	0.33
76	0.33
77	0.3
78	0.32
79	0.3
80	0.28
81	0.3
82	0.35
83	0.41
84	0.43
85	0.49
86	0.52
87	0.62
88	0.71
89	0.75
90	0.76
91	0.73
92	0.71
93	0.67
94	0.65
95	0.57
96	0.5
97	0.43
98	0.33
99	0.28
100	0.25
101	0.21
102	0.18
103	0.16
104	0.13
105	0.13
106	0.12
107	0.1
108	0.1
109	0.08
110	0.11
111	0.11
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.11
118	0.08
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.05
125	0.07
126	0.07
127	0.14
128	0.14
129	0.14
130	0.15
131	0.15
132	0.16
133	0.2
134	0.2
135	0.16
136	0.23
137	0.26
138	0.28
139	0.28
140	0.29
141	0.23
142	0.22
143	0.22
144	0.15
145	0.13
146	0.14
147	0.22
148	0.26
149	0.33
150	0.34
151	0.39
152	0.45
153	0.51
154	0.58
155	0.6
156	0.65
157	0.69
158	0.79
159	0.83
160	0.84
161	0.82
162	0.79
163	0.73
164	0.71
165	0.6
166	0.51
167	0.43
168	0.36
169	0.32
170	0.26
171	0.26
172	0.22
173	0.26
174	0.29
175	0.33
176	0.38
177	0.4
178	0.41
179	0.39
180	0.37
181	0.32
182	0.28
183	0.24
184	0.2
185	0.18
186	0.16
187	0.13
188	0.1
189	0.1
190	0.11
191	0.1
192	0.08
193	0.06
194	0.08
195	0.1
196	0.11
197	0.11
198	0.12
199	0.1
200	0.12
201	0.16
202	0.15
203	0.15
204	0.15
205	0.15
206	0.13
207	0.14
208	0.12
209	0.09
210	0.1
211	0.08
212	0.07
213	0.06
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.15
220	0.21
221	0.3
222	0.32
223	0.41
224	0.47
225	0.57
226	0.67
227	0.69
228	0.71
229	0.72
230	0.79
231	0.76
232	0.77
233	0.71
234	0.66
235	0.63
236	0.59
237	0.51
238	0.41
239	0.35
240	0.27
241	0.24
242	0.19
243	0.14
244	0.12
245	0.12
246	0.18
247	0.21
248	0.24
249	0.26
250	0.29
251	0.3
252	0.29
253	0.31
254	0.33
255	0.4
256	0.46
257	0.48
258	0.48
259	0.53
260	0.54
261	0.56
262	0.52
263	0.45
264	0.38
265	0.34
266	0.32
267	0.3
268	0.29
269	0.24
270	0.21
271	0.18
272	0.16
273	0.14
274	0.12
275	0.09
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.15
301	0.17
302	0.17
303	0.17
304	0.18
305	0.19
306	0.2
307	0.21
308	0.16
309	0.14
310	0.14
311	0.13
312	0.12
313	0.1
314	0.07
315	0.06
316	0.05
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.02
321	0.03
322	0.03
323	0.07
324	0.1
325	0.11
326	0.15
327	0.19
328	0.22
329	0.26
330	0.3
331	0.33
332	0.37
333	0.38
334	0.35
335	0.32
336	0.29
337	0.25
338	0.21
339	0.16
340	0.09
341	0.06
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.11
366	0.1
367	0.12
368	0.16
369	0.17
370	0.23
371	0.28
372	0.28
373	0.3
374	0.37
375	0.43
376	0.49
377	0.57
378	0.58
379	0.57
380	0.59
381	0.56
382	0.53
383	0.47
384	0.39
385	0.32
386	0.27
387	0.22
388	0.22
389	0.21
390	0.17
391	0.15
392	0.13
393	0.11
394	0.1
395	0.11
396	0.12
397	0.11
398	0.13
399	0.16
400	0.26
401	0.29
402	0.32
403	0.38
404	0.42
405	0.5
406	0.57
407	0.62
408	0.6
409	0.59
410	0.58
411	0.58
412	0.52
413	0.45
414	0.38
415	0.34
416	0.27
417	0.25
418	0.24
419	0.17
420	0.17
421	0.15
422	0.13
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.07
427	0.07
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.09
432	0.09
433	0.1
434	0.1
435	0.11
436	0.11
437	0.1
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.1
444	0.16
445	0.21
446	0.23
447	0.25
448	0.3
449	0.36
450	0.42
451	0.49
452	0.46
453	0.45
454	0.47
455	0.54
456	0.53
457	0.51
458	0.49
459	0.45
460	0.52
461	0.48
462	0.47
463	0.41
464	0.36
465	0.32
466	0.31
467	0.32
468	0.28
469	0.3
470	0.29
471	0.29
472	0.33
473	0.34
474	0.33
475	0.31
476	0.28
477	0.28
478	0.27
479	0.26
480	0.22
481	0.2
482	0.2
483	0.18
484	0.16
485	0.15
486	0.14
487	0.15
488	0.15
489	0.17
490	0.18
491	0.15
492	0.15
493	0.18
494	0.18
495	0.19
496	0.2
497	0.17
498	0.18
499	0.24
500	0.28
501	0.33
502	0.39
503	0.44
504	0.53
505	0.59
506	0.64
507	0.67
508	0.7
509	0.7
510	0.7
511	0.72
512	0.7
513	0.73
514	0.75
515	0.68
516	0.63
517	0.56
518	0.52
519	0.43
520	0.35
521	0.26
522	0.18
523	0.15
524	0.13
525	0.13
526	0.11
527	0.11
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.11
533	0.12
534	0.13
535	0.13
536	0.14
537	0.16
538	0.2
539	0.2
540	0.2
541	0.2
542	0.18
543	0.19
544	0.26
545	0.34
546	0.38
547	0.44
548	0.52
549	0.58
550	0.6
551	0.64
552	0.62
553	0.59
554	0.57
555	0.6
556	0.59
557	0.6
558	0.59
559	0.54
560	0.49
561	0.43
562	0.39
563	0.3
564	0.25
565	0.22
566	0.21
567	0.22
568	0.21
569	0.25
570	0.27
571	0.28
572	0.3
573	0.3
574	0.39
575	0.48
576	0.57
577	0.63
578	0.68
579	0.78
580	0.84
581	0.9
582	0.89
583	0.9
584	0.9
585	0.88
586	0.82
587	0.75
588	0.66
589	0.55
590	0.46
591	0.35
592	0.26
593	0.17
594	0.15
595	0.13
596	0.11
597	0.1
598	0.1
599	0.12
600	0.11
601	0.12
602	0.12
603	0.13
604	0.14
605	0.16
606	0.16
607	0.18
608	0.25
609	0.29
610	0.32
611	0.32
612	0.34
613	0.41
614	0.41
615	0.4
616	0.35
617	0.37
618	0.35
619	0.34
620	0.32
621	0.24
622	0.26
623	0.28
624	0.32
625	0.29
626	0.35
627	0.39
628	0.4
629	0.41
630	0.43
631	0.43
632	0.4
633	0.47
634	0.42
635	0.43
636	0.41
637	0.41
638	0.39
639	0.36
640	0.37
641	0.28
642	0.25
643	0.21
644	0.21
645	0.19
646	0.19
647	0.19
648	0.18
649	0.2
650	0.23
651	0.21
652	0.26
653	0.32
654	0.34
655	0.34
656	0.35
657	0.35

V2XT20

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer