FuNGI

V2WM50

Protein Details

Accession

V2WM50

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
354-382	KDCPDTPRKDERKQKEPKKLSKEDRFAKI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
361-375	RKDERKQKEPKKLSK

Subcellular Location(s)

mito 10.5, cyto_mito 10, cyto 8.5, nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR032567 LDOC1-rel IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase
KEGG	mrr:Moror_8458 -
Pfam	View protein in Pfam PF03732 Retrotrans_gag
CDD	cd00303 retropepsin_like cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MRASHRELLTPLHSPFPTSQPLTEIPKEDPGIRRTLTPSSILTGSRLIEFEEKSLPSTLRLPELDTLNTSANLPEELDPFQRLLQGLKNSPQSPKTQLETMAEDKKLSGSRPKKEELKVEEAVIGSAMPVQVVSAVKEVKAALPRAFTGTWKDAKKFLQEVLIYIALNPKAFPNDRSKKLFLLSYMTDGLGEFWKNDKTDLLLAFDPEAEKVTWLEFIDDFRTSFEPLDPALKAQLELKDLRMKDRADEYTYQFTYLAKQTGYNDAVQIVAFKRGLPRSLVLKIMTRLEGAPTTIKNWMNAAILFDESYKQALEYGKMWDEEHGGKKPQRNFRKKEDVAIKQIVDINQKEHRIKDCPDTPRKDERKQKEPKKLSKEDRFAKIRVLVNEQTEEEKNLLLDLMEQEAKMDQNSMHIPLQYKVGMKTIETKALLDSGAGGQFISTGLVKTLGKRWIQLPEKIKVFNVDGMANKTAWITHIVELEFRIAGKEFRENFMISDLKPDFVLRNCKLYPLSPAEQAEQDKFLEENLWKGYIRKSKSPMASPFFFVARKEKGALRPTQDYRELNKGTVKNTYLLPLISELLDKLKGATVFTKLDLRNGYNNVRIKDRDQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.34
3	0.34
4	0.38
5	0.35
6	0.34
7	0.32
8	0.37
9	0.42
10	0.43
11	0.4
12	0.36
13	0.4
14	0.41
15	0.42
16	0.44
17	0.4
18	0.42
19	0.4
20	0.41
21	0.38
22	0.41
23	0.38
24	0.35
25	0.33
26	0.3
27	0.32
28	0.29
29	0.27
30	0.24
31	0.23
32	0.21
33	0.19
34	0.18
35	0.2
36	0.2
37	0.21
38	0.23
39	0.22
40	0.23
41	0.25
42	0.23
43	0.22
44	0.26
45	0.26
46	0.27
47	0.27
48	0.27
49	0.28
50	0.31
51	0.3
52	0.27
53	0.27
54	0.23
55	0.23
56	0.21
57	0.17
58	0.15
59	0.14
60	0.14
61	0.13
62	0.13
63	0.15
64	0.17
65	0.18
66	0.18
67	0.18
68	0.18
69	0.17
70	0.18
71	0.21
72	0.26
73	0.29
74	0.34
75	0.41
76	0.41
77	0.46
78	0.47
79	0.45
80	0.45
81	0.47
82	0.45
83	0.41
84	0.42
85	0.4
86	0.42
87	0.43
88	0.43
89	0.38
90	0.34
91	0.31
92	0.31
93	0.3
94	0.28
95	0.32
96	0.35
97	0.43
98	0.49
99	0.55
100	0.59
101	0.63
102	0.69
103	0.65
104	0.64
105	0.57
106	0.52
107	0.47
108	0.39
109	0.33
110	0.24
111	0.16
112	0.09
113	0.08
114	0.07
115	0.05
116	0.04
117	0.04
118	0.06
119	0.07
120	0.08
121	0.1
122	0.11
123	0.11
124	0.13
125	0.13
126	0.14
127	0.19
128	0.21
129	0.19
130	0.21
131	0.21
132	0.24
133	0.24
134	0.22
135	0.23
136	0.26
137	0.31
138	0.33
139	0.34
140	0.35
141	0.38
142	0.42
143	0.39
144	0.34
145	0.34
146	0.31
147	0.3
148	0.29
149	0.27
150	0.21
151	0.19
152	0.21
153	0.15
154	0.15
155	0.14
156	0.12
157	0.16
158	0.17
159	0.2
160	0.27
161	0.35
162	0.42
163	0.48
164	0.49
165	0.47
166	0.48
167	0.46
168	0.36
169	0.33
170	0.27
171	0.24
172	0.22
173	0.2
174	0.18
175	0.16
176	0.15
177	0.12
178	0.11
179	0.09
180	0.1
181	0.13
182	0.13
183	0.14
184	0.13
185	0.13
186	0.16
187	0.17
188	0.18
189	0.15
190	0.16
191	0.15
192	0.15
193	0.13
194	0.1
195	0.11
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.12
209	0.13
210	0.12
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.11
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.12
222	0.14
223	0.14
224	0.15
225	0.17
226	0.21
227	0.21
228	0.24
229	0.26
230	0.24
231	0.24
232	0.29
233	0.28
234	0.26
235	0.29
236	0.3
237	0.32
238	0.31
239	0.29
240	0.24
241	0.22
242	0.21
243	0.2
244	0.18
245	0.12
246	0.13
247	0.14
248	0.19
249	0.2
250	0.17
251	0.15
252	0.14
253	0.14
254	0.12
255	0.12
256	0.08
257	0.09
258	0.08
259	0.09
260	0.13
261	0.14
262	0.15
263	0.15
264	0.16
265	0.18
266	0.2
267	0.21
268	0.18
269	0.19
270	0.2
271	0.2
272	0.18
273	0.15
274	0.13
275	0.12
276	0.11
277	0.1
278	0.1
279	0.09
280	0.1
281	0.15
282	0.15
283	0.14
284	0.14
285	0.15
286	0.14
287	0.14
288	0.13
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.06
297	0.05
298	0.07
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.11
303	0.12
304	0.13
305	0.13
306	0.11
307	0.13
308	0.15
309	0.18
310	0.18
311	0.21
312	0.24
313	0.29
314	0.36
315	0.43
316	0.51
317	0.58
318	0.61
319	0.66
320	0.74
321	0.69
322	0.7
323	0.7
324	0.64
325	0.6
326	0.58
327	0.49
328	0.39
329	0.4
330	0.34
331	0.29
332	0.24
333	0.22
334	0.22
335	0.27
336	0.27
337	0.28
338	0.29
339	0.29
340	0.31
341	0.35
342	0.38
343	0.43
344	0.5
345	0.53
346	0.56
347	0.62
348	0.67
349	0.69
350	0.71
351	0.7
352	0.72
353	0.77
354	0.8
355	0.8
356	0.83
357	0.84
358	0.84
359	0.86
360	0.86
361	0.85
362	0.85
363	0.8
364	0.79
365	0.73
366	0.64
367	0.58
368	0.54
369	0.48
370	0.41
371	0.41
372	0.35
373	0.32
374	0.33
375	0.3
376	0.27
377	0.23
378	0.22
379	0.16
380	0.14
381	0.11
382	0.1
383	0.09
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.08
389	0.07
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.09
395	0.06
396	0.09
397	0.11
398	0.14
399	0.14
400	0.16
401	0.17
402	0.17
403	0.2
404	0.19
405	0.19
406	0.17
407	0.19
408	0.18
409	0.17
410	0.24
411	0.23
412	0.26
413	0.25
414	0.24
415	0.21
416	0.22
417	0.21
418	0.13
419	0.12
420	0.08
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.08
432	0.09
433	0.1
434	0.16
435	0.21
436	0.22
437	0.24
438	0.26
439	0.34
440	0.38
441	0.44
442	0.44
443	0.45
444	0.48
445	0.47
446	0.45
447	0.38
448	0.35
449	0.31
450	0.27
451	0.23
452	0.21
453	0.24
454	0.24
455	0.21
456	0.19
457	0.16
458	0.15
459	0.13
460	0.14
461	0.13
462	0.14
463	0.17
464	0.17
465	0.18
466	0.18
467	0.18
468	0.15
469	0.12
470	0.11
471	0.09
472	0.1
473	0.12
474	0.19
475	0.2
476	0.22
477	0.25
478	0.25
479	0.24
480	0.28
481	0.28
482	0.2
483	0.26
484	0.24
485	0.22
486	0.21
487	0.22
488	0.21
489	0.24
490	0.34
491	0.28
492	0.34
493	0.34
494	0.37
495	0.38
496	0.36
497	0.37
498	0.35
499	0.36
500	0.34
501	0.36
502	0.35
503	0.38
504	0.39
505	0.34
506	0.29
507	0.26
508	0.22
509	0.2
510	0.18
511	0.18
512	0.15
513	0.17
514	0.17
515	0.19
516	0.19
517	0.21
518	0.29
519	0.33
520	0.38
521	0.42
522	0.46
523	0.52
524	0.58
525	0.65
526	0.65
527	0.64
528	0.61
529	0.56
530	0.53
531	0.48
532	0.43
533	0.37
534	0.35
535	0.33
536	0.33
537	0.33
538	0.36
539	0.41
540	0.47
541	0.51
542	0.51
543	0.55
544	0.57
545	0.61
546	0.63
547	0.59
548	0.57
549	0.6
550	0.56
551	0.49
552	0.53
553	0.5
554	0.45
555	0.47
556	0.43
557	0.36
558	0.35
559	0.36
560	0.3
561	0.26
562	0.25
563	0.19
564	0.18
565	0.16
566	0.16
567	0.13
568	0.14
569	0.15
570	0.14
571	0.13
572	0.16
573	0.16
574	0.17
575	0.2
576	0.21
577	0.23
578	0.25
579	0.32
580	0.28
581	0.34
582	0.37
583	0.38
584	0.4
585	0.44
586	0.47
587	0.47
588	0.53
589	0.5
590	0.52

V2WM50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer