FuNGI

V2WM98

Protein Details

Accession

V2WM98

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-53	WRNGEIKFPPKRKLNIKCFRGIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	mrr:Moror_11167 -
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MMEDLMVSGLGGEQLILGMPWLRHYNPQIDWRNGEIKFPPKRKLNIKCFRGILDQTPVEVLIRAKTSVSQTLEHNQKTEEKKPVEELIPDFLISYKRQFEKHASERFPESRPYDHAIDLKPGMETLNCKVYPLSLIEQQLQGEFLTDNLRKGYIRPSKSPMASPFFFVSKKEKGTFRPCQDYRELNKGTIKNAYPLPLVSDLIDKLKEAQYFTKLDLRNGYNNIRIKDGDQWKAAFKTNKGLFEPMVMFFGLSNSPAMFQSFMDDIFADYIEEGWIVIYMDDILIFSPDLESHWKRTIKVLERLRLHDLFLKLEKCRFDVTEIDFLGMIIRPGYIGMDPVKLAGIQDWKPPTMVRGVRSFLGFGNFYQKFIRRFSELARPLNELTKKDKKFKWTNECQVAFDALKRKFLSEPVLIMPDTEKPFLIECDASKWAMGAVLRQQGTDGEWHPCGYISHSLTPTERNYEIYDQELFSIVRALESWQHYLMGGKHLITILSDHKNLMFFKMAQKLNRRQARWSLFLSQFDLQLIHTAGTKMTQSDTLSRRPDHIDNNENDNDNVVMLPDKFFLRAIDVKLQNDLLGNLKGETLYNDAMRTILKEGPPLIKSALEDWTTRDGLLFYKNRCYVPNRGNLRRDIVKVIYEAKGIGHPGQFNTLEQVSREYWWPGMAKFVKMFVDGCARCQESKINTHLTKTPLIPIEGEKDMLPFSKITMDLITDLPESNGYDTILVVVDHSSTKGVIFTPCNKTIDAEQTATLILNNVYKRFGLPDKIISDRDSRFATKVFQELGKQLEIKHMMSTAFHPQTDGESERVNQELEVFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.04
2	0.04
3	0.04
4	0.04
5	0.07
6	0.07
7	0.11
8	0.16
9	0.17
10	0.24
11	0.29
12	0.35
13	0.38
14	0.48
15	0.53
16	0.54
17	0.56
18	0.55
19	0.58
20	0.52
21	0.5
22	0.47
23	0.48
24	0.53
25	0.56
26	0.59
27	0.6
28	0.69
29	0.75
30	0.8
31	0.81
32	0.82
33	0.81
34	0.8
35	0.75
36	0.69
37	0.66
38	0.6
39	0.53
40	0.51
41	0.45
42	0.38
43	0.36
44	0.32
45	0.25
46	0.23
47	0.19
48	0.14
49	0.15
50	0.15
51	0.15
52	0.18
53	0.22
54	0.27
55	0.29
56	0.27
57	0.3
58	0.38
59	0.47
60	0.45
61	0.42
62	0.38
63	0.43
64	0.48
65	0.51
66	0.52
67	0.46
68	0.48
69	0.51
70	0.54
71	0.49
72	0.46
73	0.41
74	0.37
75	0.34
76	0.31
77	0.26
78	0.22
79	0.22
80	0.2
81	0.22
82	0.25
83	0.28
84	0.3
85	0.34
86	0.41
87	0.48
88	0.55
89	0.6
90	0.57
91	0.57
92	0.63
93	0.62
94	0.57
95	0.54
96	0.49
97	0.43
98	0.44
99	0.45
100	0.4
101	0.4
102	0.42
103	0.37
104	0.38
105	0.34
106	0.3
107	0.25
108	0.22
109	0.19
110	0.16
111	0.17
112	0.16
113	0.23
114	0.22
115	0.23
116	0.23
117	0.23
118	0.23
119	0.24
120	0.24
121	0.2
122	0.23
123	0.25
124	0.26
125	0.26
126	0.23
127	0.2
128	0.16
129	0.13
130	0.1
131	0.09
132	0.14
133	0.15
134	0.16
135	0.16
136	0.18
137	0.17
138	0.19
139	0.28
140	0.31
141	0.35
142	0.4
143	0.45
144	0.51
145	0.53
146	0.57
147	0.54
148	0.52
149	0.47
150	0.45
151	0.41
152	0.37
153	0.35
154	0.32
155	0.32
156	0.3
157	0.35
158	0.37
159	0.39
160	0.45
161	0.54
162	0.61
163	0.61
164	0.66
165	0.62
166	0.62
167	0.64
168	0.65
169	0.6
170	0.6
171	0.55
172	0.48
173	0.53
174	0.5
175	0.46
176	0.43
177	0.39
178	0.33
179	0.33
180	0.32
181	0.26
182	0.24
183	0.25
184	0.2
185	0.2
186	0.16
187	0.16
188	0.15
189	0.16
190	0.16
191	0.13
192	0.14
193	0.18
194	0.18
195	0.19
196	0.21
197	0.23
198	0.25
199	0.27
200	0.32
201	0.29
202	0.3
203	0.34
204	0.34
205	0.35
206	0.38
207	0.39
208	0.38
209	0.42
210	0.41
211	0.37
212	0.34
213	0.3
214	0.35
215	0.38
216	0.36
217	0.34
218	0.34
219	0.35
220	0.37
221	0.41
222	0.36
223	0.31
224	0.36
225	0.37
226	0.4
227	0.38
228	0.38
229	0.32
230	0.31
231	0.31
232	0.22
233	0.19
234	0.14
235	0.13
236	0.1
237	0.11
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.04
263	0.04
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.12
278	0.14
279	0.17
280	0.24
281	0.26
282	0.27
283	0.33
284	0.4
285	0.41
286	0.49
287	0.52
288	0.53
289	0.54
290	0.57
291	0.57
292	0.49
293	0.43
294	0.39
295	0.32
296	0.28
297	0.28
298	0.27
299	0.23
300	0.26
301	0.26
302	0.22
303	0.23
304	0.21
305	0.2
306	0.21
307	0.24
308	0.26
309	0.25
310	0.23
311	0.21
312	0.2
313	0.18
314	0.14
315	0.1
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.05
321	0.04
322	0.05
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.11
332	0.11
333	0.16
334	0.17
335	0.17
336	0.18
337	0.18
338	0.17
339	0.2
340	0.22
341	0.2
342	0.22
343	0.24
344	0.24
345	0.24
346	0.24
347	0.17
348	0.16
349	0.14
350	0.11
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.19
355	0.22
356	0.23
357	0.25
358	0.27
359	0.21
360	0.22
361	0.24
362	0.32
363	0.34
364	0.35
365	0.35
366	0.34
367	0.32
368	0.37
369	0.36
370	0.28
371	0.31
372	0.36
373	0.38
374	0.44
375	0.47
376	0.5
377	0.57
378	0.65
379	0.67
380	0.67
381	0.72
382	0.73
383	0.71
384	0.62
385	0.53
386	0.46
387	0.35
388	0.29
389	0.27
390	0.19
391	0.22
392	0.21
393	0.22
394	0.21
395	0.22
396	0.25
397	0.18
398	0.19
399	0.16
400	0.17
401	0.16
402	0.15
403	0.14
404	0.13
405	0.14
406	0.13
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.12
411	0.12
412	0.09
413	0.08
414	0.11
415	0.12
416	0.11
417	0.1
418	0.1
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.06
423	0.09
424	0.14
425	0.14
426	0.14
427	0.14
428	0.13
429	0.14
430	0.15
431	0.13
432	0.11
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.15
440	0.14
441	0.17
442	0.18
443	0.19
444	0.19
445	0.22
446	0.21
447	0.2
448	0.18
449	0.17
450	0.18
451	0.19
452	0.19
453	0.18
454	0.18
455	0.14
456	0.14
457	0.13
458	0.11
459	0.09
460	0.1
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.1
466	0.12
467	0.14
468	0.12
469	0.13
470	0.13
471	0.14
472	0.15
473	0.14
474	0.12
475	0.11
476	0.11
477	0.11
478	0.11
479	0.09
480	0.1
481	0.12
482	0.15
483	0.15
484	0.15
485	0.15
486	0.18
487	0.18
488	0.18
489	0.15
490	0.12
491	0.17
492	0.25
493	0.28
494	0.3
495	0.39
496	0.46
497	0.53
498	0.59
499	0.56
500	0.52
501	0.59
502	0.59
503	0.55
504	0.49
505	0.47
506	0.42
507	0.42
508	0.41
509	0.33
510	0.27
511	0.23
512	0.2
513	0.13
514	0.12
515	0.12
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.09
522	0.07
523	0.08
524	0.1
525	0.1
526	0.17
527	0.21
528	0.27
529	0.31
530	0.31
531	0.33
532	0.35
533	0.38
534	0.38
535	0.42
536	0.44
537	0.42
538	0.48
539	0.47
540	0.44
541	0.39
542	0.33
543	0.25
544	0.18
545	0.15
546	0.08
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.13
556	0.16
557	0.18
558	0.25
559	0.27
560	0.27
561	0.28
562	0.28
563	0.24
564	0.21
565	0.19
566	0.14
567	0.12
568	0.12
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.1
573	0.1
574	0.11
575	0.11
576	0.12
577	0.12
578	0.11
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.12
583	0.13
584	0.13
585	0.15
586	0.17
587	0.22
588	0.22
589	0.22
590	0.2
591	0.18
592	0.18
593	0.18
594	0.21
595	0.17
596	0.17
597	0.19
598	0.23
599	0.22
600	0.21
601	0.19
602	0.15
603	0.15
604	0.23
605	0.25
606	0.22
607	0.3
608	0.34
609	0.34
610	0.37
611	0.41
612	0.42
613	0.45
614	0.52
615	0.53
616	0.58
617	0.62
618	0.62
619	0.63
620	0.59
621	0.54
622	0.49
623	0.41
624	0.35
625	0.32
626	0.33
627	0.28
628	0.23
629	0.21
630	0.17
631	0.16
632	0.16
633	0.17
634	0.16
635	0.16
636	0.17
637	0.21
638	0.21
639	0.19
640	0.21
641	0.2
642	0.18
643	0.17
644	0.2
645	0.17
646	0.18
647	0.19
648	0.17
649	0.16
650	0.19
651	0.2
652	0.16
653	0.24
654	0.25
655	0.26
656	0.25
657	0.27
658	0.25
659	0.25
660	0.25
661	0.19
662	0.27
663	0.24
664	0.25
665	0.28
666	0.3
667	0.29
668	0.3
669	0.34
670	0.29
671	0.35
672	0.38
673	0.42
674	0.41
675	0.44
676	0.48
677	0.45
678	0.44
679	0.39
680	0.39
681	0.32
682	0.32
683	0.3
684	0.28
685	0.29
686	0.26
687	0.25
688	0.19
689	0.18
690	0.18
691	0.17
692	0.16
693	0.11
694	0.11
695	0.14
696	0.14
697	0.14
698	0.14
699	0.14
700	0.15
701	0.15
702	0.16
703	0.13
704	0.13
705	0.13
706	0.13
707	0.13
708	0.12
709	0.12
710	0.11
711	0.1
712	0.1
713	0.1
714	0.09
715	0.08
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.09
725	0.1
726	0.14
727	0.19
728	0.26
729	0.34
730	0.38
731	0.4
732	0.39
733	0.39
734	0.4
735	0.42
736	0.39
737	0.33
738	0.29
739	0.28
740	0.28
741	0.25
742	0.21
743	0.14
744	0.11
745	0.14
746	0.16
747	0.17
748	0.18
749	0.18
750	0.19
751	0.24
752	0.27
753	0.29
754	0.3
755	0.36
756	0.39
757	0.44
758	0.45
759	0.42
760	0.44
761	0.4
762	0.4
763	0.38
764	0.36
765	0.34
766	0.34
767	0.36
768	0.33
769	0.35
770	0.34
771	0.33
772	0.33
773	0.34
774	0.36
775	0.35
776	0.33
777	0.29
778	0.34
779	0.34
780	0.32
781	0.3
782	0.28
783	0.24
784	0.25
785	0.28
786	0.29
787	0.29
788	0.28
789	0.27
790	0.26
791	0.29
792	0.33
793	0.32
794	0.24
795	0.23
796	0.25
797	0.27
798	0.28
799	0.25
800	0.19

V2WM98

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer