Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XTM6

Protein Details
Accession V2XTM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-276PSTPTSEEPAKKKKKARKKKNKKAAAEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-271AKKKKKARKKKNKKA
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 12.666, cyto_nucl 10.166, mito 8, cyto_mito 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG mrr:Moror_7181  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MSASTSATTTAANETRKAKSRLANLSASLDELEGHLQPLLSKTLPETLLALEPLQQAKLLTDIPYLVYDLVFIYLKSRGVDPKTHPVVPELERVKSYFDKIKNAESPATRPTQIDKAAANRFIKHAISQAQSQVNQHSTPSTSTTEVPGSPSTTVPVKMTKKMIERAEYEKRLREEDDEGEDDGLEVYAGEERMEAEPANKRKRLAVDHFAGYGDPDPVSSTSNPASNPPKKLKTISDSTSVVSSPAPSTPTSEEPAKKKKKARKKKNKKAAAEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.44
4 0.48
5 0.48
6 0.5
7 0.57
8 0.62
9 0.62
10 0.59
11 0.53
12 0.52
13 0.45
14 0.39
15 0.3
16 0.21
17 0.16
18 0.13
19 0.12
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.1
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.15
35 0.16
36 0.17
37 0.15
38 0.13
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.11
44 0.11
45 0.13
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.07
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.16
66 0.19
67 0.25
68 0.29
69 0.37
70 0.41
71 0.41
72 0.4
73 0.37
74 0.38
75 0.35
76 0.38
77 0.3
78 0.27
79 0.26
80 0.26
81 0.29
82 0.25
83 0.26
84 0.26
85 0.26
86 0.32
87 0.33
88 0.38
89 0.38
90 0.38
91 0.39
92 0.33
93 0.33
94 0.3
95 0.31
96 0.26
97 0.23
98 0.23
99 0.24
100 0.24
101 0.24
102 0.22
103 0.25
104 0.27
105 0.32
106 0.3
107 0.26
108 0.25
109 0.25
110 0.24
111 0.19
112 0.19
113 0.17
114 0.18
115 0.18
116 0.21
117 0.21
118 0.22
119 0.22
120 0.21
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.13
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.18
144 0.19
145 0.22
146 0.25
147 0.28
148 0.31
149 0.37
150 0.39
151 0.36
152 0.37
153 0.41
154 0.46
155 0.48
156 0.46
157 0.44
158 0.42
159 0.41
160 0.38
161 0.34
162 0.28
163 0.25
164 0.27
165 0.24
166 0.22
167 0.2
168 0.19
169 0.16
170 0.12
171 0.1
172 0.05
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.07
183 0.09
184 0.17
185 0.26
186 0.33
187 0.34
188 0.35
189 0.38
190 0.44
191 0.5
192 0.5
193 0.49
194 0.46
195 0.46
196 0.45
197 0.41
198 0.35
199 0.28
200 0.21
201 0.14
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.12
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.18
211 0.18
212 0.23
213 0.32
214 0.35
215 0.43
216 0.48
217 0.52
218 0.54
219 0.59
220 0.6
221 0.57
222 0.59
223 0.55
224 0.53
225 0.48
226 0.45
227 0.41
228 0.34
229 0.27
230 0.2
231 0.18
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.13
236 0.17
237 0.21
238 0.24
239 0.27
240 0.34
241 0.39
242 0.45
243 0.56
244 0.62
245 0.66
246 0.72
247 0.78
248 0.82
249 0.87
250 0.9
251 0.9
252 0.92
253 0.95
254 0.96
255 0.96
256 0.95