FuNGI

V2XC27

Protein Details

Accession

V2XC27

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-73	EEIRQRTTTTPRTRSRTRQTID	Hydrophilic
373-392	RGEKMKKTSKPETKVNRISD	Hydrophilic
413-439	IAKNCLEKPKNEQKKENPKKSTPEDAY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032567 LDOC1-rel IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
KEGG	mrr:Moror_13709 -
Pfam	View protein in Pfam PF03732 Retrotrans_gag PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MSRHRRTPAEDPELAEREQQRRAFLLVIPEDKLTFEQRIQRLELLAQEEAREEIRQRTTTTPRTRSRTRQTIDFTTGFDLSDDERRTSTQTSSQQSQEPSQEQTNSPNSETVIQTQHSGTQNSLSSSNRQLETNRPETPIITTSPSSPPPSDPMTTQQTSTSLQDLISALQTLTNGERKKENKVAVLNSYDGSPAKASTFLTEVDLYLMANDTLYPNDKDKILFTLSYMKEGHAANWMKAKMDEYKKALKEKEAEPSDTKPEDQIHVMTWEEFLEDFKKVFQPLDIGTNARLKMKLLKQNKKHVDEYITDFRLLSIDTEYDDRALIDHFLAGLHPALLKSCLMQPDQPDTIEGWYDRARKYNNAWLTMMAITRGEKMKKTSKPETKVNRISDEEAQEYHRKGLCYKCSKPGHIAKNCLEKPKNEQKKENPKKSTPEDAYHKIRAIYRDFSEEEQTQILDLMEGGGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.48
3	0.45
4	0.41
5	0.46
6	0.45
7	0.4
8	0.39
9	0.4
10	0.36
11	0.32
12	0.35
13	0.33
14	0.34
15	0.32
16	0.31
17	0.29
18	0.28
19	0.28
20	0.24
21	0.21
22	0.23
23	0.3
24	0.34
25	0.38
26	0.39
27	0.39
28	0.36
29	0.35
30	0.34
31	0.3
32	0.27
33	0.23
34	0.21
35	0.2
36	0.19
37	0.19
38	0.17
39	0.15
40	0.2
41	0.25
42	0.27
43	0.3
44	0.36
45	0.44
46	0.52
47	0.6
48	0.63
49	0.66
50	0.72
51	0.78
52	0.8
53	0.82
54	0.82
55	0.76
56	0.75
57	0.74
58	0.72
59	0.7
60	0.6
61	0.51
62	0.44
63	0.4
64	0.31
65	0.24
66	0.19
67	0.15
68	0.21
69	0.21
70	0.19
71	0.2
72	0.21
73	0.24
74	0.25
75	0.26
76	0.27
77	0.33
78	0.38
79	0.41
80	0.43
81	0.44
82	0.45
83	0.46
84	0.43
85	0.38
86	0.36
87	0.35
88	0.36
89	0.32
90	0.36
91	0.38
92	0.35
93	0.34
94	0.31
95	0.28
96	0.28
97	0.28
98	0.25
99	0.22
100	0.2
101	0.2
102	0.19
103	0.24
104	0.24
105	0.24
106	0.21
107	0.21
108	0.22
109	0.22
110	0.24
111	0.2
112	0.21
113	0.25
114	0.29
115	0.26
116	0.26
117	0.27
118	0.33
119	0.39
120	0.41
121	0.39
122	0.36
123	0.36
124	0.35
125	0.35
126	0.29
127	0.23
128	0.21
129	0.19
130	0.19
131	0.22
132	0.25
133	0.25
134	0.24
135	0.23
136	0.24
137	0.27
138	0.26
139	0.24
140	0.26
141	0.3
142	0.3
143	0.29
144	0.26
145	0.24
146	0.25
147	0.24
148	0.2
149	0.14
150	0.13
151	0.13
152	0.13
153	0.11
154	0.1
155	0.09
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.09
161	0.14
162	0.14
163	0.15
164	0.22
165	0.24
166	0.31
167	0.37
168	0.37
169	0.37
170	0.41
171	0.42
172	0.39
173	0.39
174	0.33
175	0.27
176	0.24
177	0.19
178	0.15
179	0.13
180	0.09
181	0.08
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.09
187	0.09
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.09
192	0.09
193	0.07
194	0.06
195	0.06
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.07
202	0.08
203	0.09
204	0.11
205	0.11
206	0.12
207	0.12
208	0.14
209	0.13
210	0.12
211	0.11
212	0.19
213	0.19
214	0.21
215	0.21
216	0.18
217	0.2
218	0.2
219	0.2
220	0.19
221	0.19
222	0.17
223	0.21
224	0.21
225	0.19
226	0.19
227	0.2
228	0.2
229	0.24
230	0.27
231	0.27
232	0.35
233	0.37
234	0.42
235	0.42
236	0.38
237	0.38
238	0.36
239	0.41
240	0.36
241	0.36
242	0.33
243	0.35
244	0.36
245	0.32
246	0.3
247	0.23
248	0.22
249	0.2
250	0.19
251	0.17
252	0.13
253	0.13
254	0.13
255	0.11
256	0.1
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.1
266	0.11
267	0.11
268	0.1
269	0.11
270	0.11
271	0.15
272	0.15
273	0.14
274	0.15
275	0.19
276	0.19
277	0.19
278	0.18
279	0.15
280	0.22
281	0.28
282	0.36
283	0.42
284	0.51
285	0.58
286	0.68
287	0.76
288	0.74
289	0.69
290	0.64
291	0.58
292	0.51
293	0.51
294	0.48
295	0.4
296	0.35
297	0.32
298	0.28
299	0.24
300	0.21
301	0.15
302	0.08
303	0.07
304	0.08
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.11
328	0.13
329	0.15
330	0.17
331	0.2
332	0.25
333	0.26
334	0.25
335	0.23
336	0.21
337	0.21
338	0.2
339	0.17
340	0.15
341	0.18
342	0.23
343	0.23
344	0.28
345	0.3
346	0.33
347	0.38
348	0.44
349	0.44
350	0.43
351	0.43
352	0.37
353	0.37
354	0.33
355	0.28
356	0.19
357	0.15
358	0.12
359	0.15
360	0.2
361	0.2
362	0.21
363	0.28
364	0.36
365	0.43
366	0.5
367	0.58
368	0.63
369	0.67
370	0.75
371	0.79
372	0.8
373	0.82
374	0.79
375	0.74
376	0.67
377	0.64
378	0.6
379	0.54
380	0.45
381	0.38
382	0.37
383	0.37
384	0.34
385	0.36
386	0.33
387	0.3
388	0.32
389	0.4
390	0.45
391	0.5
392	0.53
393	0.58
394	0.62
395	0.65
396	0.7
397	0.71
398	0.71
399	0.69
400	0.72
401	0.69
402	0.73
403	0.73
404	0.74
405	0.68
406	0.61
407	0.63
408	0.67
409	0.7
410	0.68
411	0.74
412	0.75
413	0.82
414	0.9
415	0.91
416	0.88
417	0.85
418	0.87
419	0.84
420	0.84
421	0.78
422	0.76
423	0.74
424	0.73
425	0.73
426	0.68
427	0.64
428	0.57
429	0.55
430	0.52
431	0.49
432	0.46
433	0.42
434	0.43
435	0.43
436	0.42
437	0.44
438	0.39
439	0.36
440	0.31
441	0.28
442	0.22
443	0.2
444	0.17
445	0.11
446	0.1

V2XC27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer