Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2X0A5

Protein Details
Accession V2X0A5    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-135DEPVSKKGRKGNKDDRRPTVSTBasic
149-173RHTHHSSSHSHKRKRSRSRSSSLSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-123RK
159-190HKRKRSRSRSSSLSLSRSRSSSPARSPRRGAR
486-494KRGGGRTRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, plas 4, cyto 2.5, mito 1, extr 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG mrr:Moror_4352  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
Amino Acid Sequences MGRRKIEIQPITHERNRSVTFLKRKNGLFKKAYELGVLCSVDVAVIIFDEKPGQQQKLYEYSSSNIRDIVKRHVRYIGDRDSRVPSDFSGEGGAGSKVDDHDEDGEADEEELEDEPVSKKGRKGNKDDRRPTVSTTQKSSTTIPTSSSRHTHHSSSHSHKRKRSRSRSSSLSLSRSRSSSPARSPRRGAREPNPLSLPTSIPTPRSEHNDYQLPSRGSINSPHETSRPGFDYGSRGMGGPGYQGSGNGYQFPAFHQSASHPPNMGGAYNFTPPSPAPSSGGGVPSAILQGGGSFNDIMDSRGVFGPPDRGVFEAPNRPVFGGGGGGVGVIGGITIPNGEVLDVKMYRQMLLDQQMQAQSQQQQTQSTMHDLFSIFSERGGQQQQQQHQHQQPPPYSLSNVSLPVDWPSSQSSGRHVQATASNPSHNWLDFLSGPPQPTGPPPPPSSQQQYRADNISMLGDIFGASAPAPQDDDSGSEYDPSSRISKRGGGRTRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.56
3 0.55
4 0.5
5 0.47
6 0.49
7 0.54
8 0.59
9 0.63
10 0.62
11 0.65
12 0.71
13 0.74
14 0.74
15 0.69
16 0.65
17 0.66
18 0.65
19 0.6
20 0.53
21 0.44
22 0.38
23 0.38
24 0.34
25 0.25
26 0.19
27 0.18
28 0.14
29 0.13
30 0.1
31 0.04
32 0.04
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.08
37 0.08
38 0.15
39 0.21
40 0.23
41 0.24
42 0.27
43 0.32
44 0.39
45 0.41
46 0.36
47 0.32
48 0.33
49 0.38
50 0.39
51 0.34
52 0.29
53 0.3
54 0.32
55 0.33
56 0.41
57 0.43
58 0.43
59 0.45
60 0.48
61 0.48
62 0.5
63 0.56
64 0.56
65 0.53
66 0.52
67 0.53
68 0.52
69 0.51
70 0.46
71 0.39
72 0.29
73 0.27
74 0.25
75 0.23
76 0.18
77 0.16
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.11
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.11
104 0.15
105 0.17
106 0.2
107 0.28
108 0.38
109 0.45
110 0.54
111 0.62
112 0.7
113 0.78
114 0.83
115 0.82
116 0.8
117 0.74
118 0.69
119 0.67
120 0.66
121 0.59
122 0.56
123 0.52
124 0.46
125 0.47
126 0.44
127 0.4
128 0.35
129 0.31
130 0.29
131 0.31
132 0.32
133 0.33
134 0.36
135 0.34
136 0.36
137 0.39
138 0.38
139 0.38
140 0.41
141 0.45
142 0.49
143 0.57
144 0.61
145 0.65
146 0.69
147 0.75
148 0.8
149 0.83
150 0.85
151 0.85
152 0.84
153 0.84
154 0.84
155 0.78
156 0.75
157 0.69
158 0.65
159 0.58
160 0.53
161 0.47
162 0.42
163 0.38
164 0.35
165 0.36
166 0.36
167 0.4
168 0.47
169 0.52
170 0.56
171 0.6
172 0.63
173 0.67
174 0.66
175 0.64
176 0.61
177 0.65
178 0.62
179 0.61
180 0.55
181 0.47
182 0.43
183 0.37
184 0.3
185 0.19
186 0.2
187 0.17
188 0.17
189 0.18
190 0.19
191 0.2
192 0.27
193 0.32
194 0.3
195 0.33
196 0.38
197 0.36
198 0.37
199 0.4
200 0.34
201 0.28
202 0.28
203 0.25
204 0.2
205 0.24
206 0.26
207 0.23
208 0.24
209 0.25
210 0.24
211 0.25
212 0.25
213 0.22
214 0.19
215 0.18
216 0.17
217 0.16
218 0.19
219 0.17
220 0.18
221 0.15
222 0.13
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.13
244 0.21
245 0.23
246 0.23
247 0.18
248 0.18
249 0.2
250 0.2
251 0.18
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.19
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.05
274 0.04
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.15
299 0.19
300 0.22
301 0.23
302 0.24
303 0.24
304 0.23
305 0.22
306 0.2
307 0.16
308 0.1
309 0.08
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.19
338 0.22
339 0.2
340 0.22
341 0.24
342 0.23
343 0.23
344 0.22
345 0.22
346 0.23
347 0.26
348 0.25
349 0.26
350 0.27
351 0.29
352 0.28
353 0.27
354 0.25
355 0.21
356 0.21
357 0.19
358 0.18
359 0.16
360 0.18
361 0.13
362 0.11
363 0.14
364 0.13
365 0.17
366 0.2
367 0.21
368 0.25
369 0.32
370 0.4
371 0.46
372 0.51
373 0.56
374 0.6
375 0.67
376 0.65
377 0.65
378 0.61
379 0.57
380 0.55
381 0.48
382 0.42
383 0.36
384 0.35
385 0.3
386 0.28
387 0.24
388 0.21
389 0.19
390 0.2
391 0.2
392 0.17
393 0.16
394 0.17
395 0.19
396 0.21
397 0.21
398 0.24
399 0.29
400 0.31
401 0.31
402 0.29
403 0.28
404 0.32
405 0.35
406 0.37
407 0.32
408 0.32
409 0.3
410 0.32
411 0.32
412 0.27
413 0.23
414 0.16
415 0.18
416 0.17
417 0.2
418 0.21
419 0.21
420 0.22
421 0.22
422 0.22
423 0.19
424 0.23
425 0.28
426 0.3
427 0.34
428 0.37
429 0.42
430 0.46
431 0.52
432 0.57
433 0.57
434 0.61
435 0.63
436 0.64
437 0.63
438 0.63
439 0.57
440 0.48
441 0.4
442 0.32
443 0.24
444 0.18
445 0.14
446 0.09
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.1
456 0.1
457 0.12
458 0.12
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.16
463 0.16
464 0.16
465 0.17
466 0.17
467 0.18
468 0.21
469 0.22
470 0.25
471 0.28
472 0.35
473 0.41
474 0.51