Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090CGE4

Protein Details
Accession A0A090CGE4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1076-1103EEDYEVEKKGRKKKGKKKEYVIVTREGKBasic
1159-1181ILYFRRKSDDKVVWDRKRRIDEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1083-1093KKGRKKKGKKK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 10, cysk 6, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036691  Endo/exonu/phosph_ase_sf  
IPR040459  MJ1316  
IPR043519  NT_sf  
IPR011068  NuclTrfase_I-like_C  
IPR007012  PolA_pol_cen_dom  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0031123  P:RNA 3'-end processing  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13563  2_5_RNA_ligase2  
PF04457  MJ1316  
PF01909  NTP_transf_2  
PF04928  PAP_central  
CDD cd09080  TDP2  
Amino Acid Sequences MATDEPSFNSSFNSYDTALAILPYESQWPTLNRIRSLYDAASHKWPPHVNLIYPFCPPSSLPAASHIISSILSTRKTTPDPFTIALTQPGHFPRRNESVCFLTSPYQDQREQLRDLVHDLVSGFKKRGVEGKNDRPFKMHLTMGQAAGEVAGKEWENLMGKLGLMSGCYFRVEELVILRRENGKMRLWGTVGVHDGKVTVLEETRGFDQGFLGETGEEKGYRDELMSGRTVYWDEEMRIWGVAQEGDYDRDDSDEGQGRKMLTVASYNVLAEFEYPQKEDRYPLLVNNILDDKADADALVLQEVTDGFLSFLLSDERVSDRYPYCSHGPPDQPGMGPLPNFLNMVVLSKVAFDWESVSFQRKHKGALVARFRHVGKWQGDEFKPVVLAVVHLSHGLTDGAVASRKGDIKRLIGYLEENYGGCPWVLAGDWNIATSKEAIQEALEKKNVSDLTVEQWKGLDTIFKDAGLVDAWEVTAEDKDGGATWDPPVNGVAVTLSGGNIWPQRYDRILVRGEDFLDVKEFNMFGQEKGHVGDAVEESFASDHWGIRAVLSIGGFGDDEKEEMEQEQEPENPLVVPAHLEKAPKALSGAGGIKACLSELNVTPGEEEAAQRREAFELLKTLLLDATTKTPAAARLQSSVVVVPVGSYALGVWTTSSDIDVCCIGPFSSNTFFSVASSSLRKAATQGVRILRRVKANTGTMLELEVQGVRMDLQYCPAASVAQQWPNVLRLPAKDPVWSLAPQTLNKLKAIRDIDYLRRSLPDLVSFRLAHRFIKTWARSRGVYSARFGYLSGIQVAILLVRVQKLLAKSKPSVEDLITSFFTHYSAFDFANNLVFDPSFHTSVPQYTRSYREPLAILGYFPPGLNTASAATLPSVLTLQREFSLAASALSSSPSWSSFLSAPATTFLTQFKTYIKLDLSYWGLSPTKGASFLGWFESRCALLLVDIGRKCSSLHARIWPARFVEAADLTEDGGSYRGCYLIGLDKASEGLGKSELLNALGQLRGVLPRFEGQIRGDEKYFNPQNRWMSASLVNQTSLPELVLDVREWGEGNAGEEETEEEEDGEEELEEGGDDGEEDYEVEKKGRKKKGKKKEYVIVTREGKLRSAIDVMNRLRWDPGMESGDFVVGYEDRFLGAQEKELDDWKTEQTDEEFIPQHRILYFRRKSDDKVVWDRKRRIDEVFGGGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.19
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.13
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.13
12 0.12
13 0.14
14 0.18
15 0.2
16 0.27
17 0.34
18 0.39
19 0.38
20 0.41
21 0.43
22 0.42
23 0.45
24 0.39
25 0.38
26 0.36
27 0.37
28 0.41
29 0.41
30 0.39
31 0.41
32 0.43
33 0.4
34 0.46
35 0.47
36 0.44
37 0.5
38 0.54
39 0.49
40 0.48
41 0.46
42 0.36
43 0.34
44 0.29
45 0.27
46 0.27
47 0.27
48 0.25
49 0.29
50 0.33
51 0.31
52 0.31
53 0.25
54 0.19
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.2
61 0.24
62 0.29
63 0.34
64 0.38
65 0.39
66 0.41
67 0.45
68 0.44
69 0.44
70 0.42
71 0.39
72 0.4
73 0.36
74 0.3
75 0.3
76 0.35
77 0.38
78 0.38
79 0.38
80 0.39
81 0.47
82 0.51
83 0.49
84 0.48
85 0.46
86 0.45
87 0.44
88 0.39
89 0.35
90 0.33
91 0.35
92 0.37
93 0.37
94 0.37
95 0.39
96 0.45
97 0.45
98 0.46
99 0.42
100 0.39
101 0.35
102 0.37
103 0.36
104 0.28
105 0.23
106 0.2
107 0.23
108 0.24
109 0.26
110 0.24
111 0.23
112 0.25
113 0.25
114 0.33
115 0.31
116 0.37
117 0.45
118 0.55
119 0.62
120 0.66
121 0.65
122 0.6
123 0.59
124 0.54
125 0.5
126 0.42
127 0.35
128 0.38
129 0.39
130 0.37
131 0.34
132 0.28
133 0.22
134 0.2
135 0.17
136 0.09
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.15
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.14
162 0.2
163 0.21
164 0.22
165 0.24
166 0.26
167 0.29
168 0.33
169 0.33
170 0.31
171 0.35
172 0.36
173 0.38
174 0.35
175 0.36
176 0.31
177 0.3
178 0.29
179 0.25
180 0.23
181 0.19
182 0.19
183 0.15
184 0.14
185 0.11
186 0.09
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.14
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.08
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.12
240 0.16
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.23
245 0.22
246 0.22
247 0.22
248 0.18
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.13
262 0.14
263 0.16
264 0.18
265 0.19
266 0.21
267 0.22
268 0.24
269 0.23
270 0.24
271 0.28
272 0.28
273 0.27
274 0.27
275 0.26
276 0.2
277 0.19
278 0.17
279 0.12
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.05
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.11
305 0.12
306 0.16
307 0.16
308 0.2
309 0.22
310 0.24
311 0.27
312 0.31
313 0.33
314 0.36
315 0.38
316 0.37
317 0.4
318 0.37
319 0.33
320 0.29
321 0.29
322 0.23
323 0.19
324 0.17
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.09
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.08
341 0.08
342 0.11
343 0.12
344 0.18
345 0.21
346 0.23
347 0.3
348 0.29
349 0.3
350 0.32
351 0.4
352 0.4
353 0.46
354 0.53
355 0.51
356 0.52
357 0.53
358 0.49
359 0.43
360 0.4
361 0.39
362 0.31
363 0.32
364 0.34
365 0.37
366 0.37
367 0.38
368 0.36
369 0.28
370 0.26
371 0.2
372 0.17
373 0.1
374 0.1
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.09
391 0.13
392 0.14
393 0.19
394 0.21
395 0.22
396 0.25
397 0.26
398 0.24
399 0.21
400 0.22
401 0.17
402 0.16
403 0.14
404 0.11
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.08
409 0.06
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.15
428 0.18
429 0.2
430 0.21
431 0.19
432 0.19
433 0.24
434 0.23
435 0.18
436 0.16
437 0.14
438 0.17
439 0.23
440 0.23
441 0.18
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.16
446 0.14
447 0.08
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.1
455 0.09
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.07
479 0.06
480 0.04
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.03
485 0.04
486 0.05
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.09
491 0.12
492 0.13
493 0.15
494 0.16
495 0.19
496 0.21
497 0.21
498 0.21
499 0.2
500 0.2
501 0.19
502 0.17
503 0.12
504 0.11
505 0.1
506 0.08
507 0.08
508 0.07
509 0.06
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.11
514 0.12
515 0.12
516 0.13
517 0.13
518 0.08
519 0.08
520 0.09
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.09
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.04
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.09
555 0.09
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.09
560 0.08
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.08
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.09
574 0.08
575 0.1
576 0.11
577 0.1
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.06
584 0.05
585 0.05
586 0.06
587 0.09
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.09
593 0.08
594 0.08
595 0.09
596 0.1
597 0.11
598 0.1
599 0.11
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.1
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.08
611 0.07
612 0.06
613 0.08
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.1
619 0.12
620 0.14
621 0.13
622 0.14
623 0.15
624 0.15
625 0.15
626 0.13
627 0.1
628 0.08
629 0.07
630 0.05
631 0.04
632 0.04
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.03
640 0.03
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.05
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.06
653 0.07
654 0.1
655 0.12
656 0.12
657 0.13
658 0.14
659 0.14
660 0.13
661 0.14
662 0.11
663 0.1
664 0.11
665 0.11
666 0.13
667 0.13
668 0.13
669 0.13
670 0.19
671 0.21
672 0.22
673 0.27
674 0.3
675 0.32
676 0.35
677 0.37
678 0.33
679 0.35
680 0.34
681 0.33
682 0.31
683 0.31
684 0.3
685 0.28
686 0.25
687 0.2
688 0.19
689 0.16
690 0.11
691 0.1
692 0.07
693 0.06
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.06
699 0.06
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.08
706 0.07
707 0.13
708 0.15
709 0.19
710 0.19
711 0.19
712 0.2
713 0.22
714 0.22
715 0.18
716 0.16
717 0.13
718 0.16
719 0.2
720 0.2
721 0.2
722 0.19
723 0.2
724 0.21
725 0.2
726 0.17
727 0.17
728 0.2
729 0.19
730 0.23
731 0.26
732 0.24
733 0.26
734 0.27
735 0.23
736 0.27
737 0.3
738 0.26
739 0.27
740 0.29
741 0.35
742 0.35
743 0.36
744 0.29
745 0.27
746 0.27
747 0.24
748 0.22
749 0.21
750 0.2
751 0.21
752 0.24
753 0.24
754 0.24
755 0.27
756 0.27
757 0.23
758 0.23
759 0.23
760 0.23
761 0.32
762 0.36
763 0.38
764 0.43
765 0.44
766 0.43
767 0.43
768 0.48
769 0.44
770 0.41
771 0.36
772 0.32
773 0.29
774 0.28
775 0.26
776 0.2
777 0.16
778 0.15
779 0.13
780 0.1
781 0.09
782 0.09
783 0.09
784 0.07
785 0.05
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.06
790 0.06
791 0.08
792 0.11
793 0.19
794 0.22
795 0.26
796 0.27
797 0.32
798 0.35
799 0.35
800 0.34
801 0.27
802 0.27
803 0.23
804 0.25
805 0.21
806 0.18
807 0.16
808 0.14
809 0.14
810 0.11
811 0.1
812 0.09
813 0.1
814 0.1
815 0.1
816 0.11
817 0.11
818 0.15
819 0.14
820 0.12
821 0.11
822 0.11
823 0.1
824 0.14
825 0.16
826 0.14
827 0.14
828 0.15
829 0.15
830 0.2
831 0.24
832 0.23
833 0.24
834 0.26
835 0.31
836 0.33
837 0.37
838 0.33
839 0.32
840 0.29
841 0.27
842 0.28
843 0.23
844 0.2
845 0.16
846 0.16
847 0.13
848 0.12
849 0.12
850 0.09
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.08
855 0.08
856 0.09
857 0.08
858 0.07
859 0.08
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.06
864 0.08
865 0.09
866 0.1
867 0.09
868 0.1
869 0.1
870 0.1
871 0.12
872 0.1
873 0.1
874 0.09
875 0.09
876 0.08
877 0.09
878 0.09
879 0.07
880 0.08
881 0.09
882 0.1
883 0.1
884 0.12
885 0.12
886 0.14
887 0.16
888 0.16
889 0.15
890 0.15
891 0.18
892 0.16
893 0.16
894 0.15
895 0.16
896 0.17
897 0.17
898 0.17
899 0.2
900 0.2
901 0.23
902 0.23
903 0.2
904 0.2
905 0.23
906 0.24
907 0.2
908 0.2
909 0.19
910 0.18
911 0.17
912 0.17
913 0.15
914 0.13
915 0.13
916 0.13
917 0.11
918 0.12
919 0.13
920 0.17
921 0.16
922 0.16
923 0.16
924 0.18
925 0.17
926 0.16
927 0.15
928 0.11
929 0.09
930 0.11
931 0.12
932 0.17
933 0.18
934 0.2
935 0.19
936 0.2
937 0.2
938 0.24
939 0.3
940 0.28
941 0.33
942 0.38
943 0.47
944 0.52
945 0.55
946 0.51
947 0.45
948 0.41
949 0.36
950 0.29
951 0.25
952 0.2
953 0.18
954 0.16
955 0.14
956 0.13
957 0.13
958 0.12
959 0.08
960 0.07
961 0.07
962 0.07
963 0.07
964 0.07
965 0.07
966 0.07
967 0.09
968 0.14
969 0.16
970 0.16
971 0.16
972 0.16
973 0.16
974 0.16
975 0.15
976 0.09
977 0.09
978 0.09
979 0.09
980 0.1
981 0.12
982 0.12
983 0.12
984 0.12
985 0.11
986 0.11
987 0.11
988 0.11
989 0.09
990 0.09
991 0.11
992 0.12
993 0.12
994 0.13
995 0.15
996 0.18
997 0.19
998 0.21
999 0.19
1000 0.26
1001 0.29
1002 0.3
1003 0.29
1004 0.29
1005 0.29
1006 0.36
1007 0.42
1008 0.39
1009 0.4
1010 0.45
1011 0.49
1012 0.49
1013 0.52
1014 0.42
1015 0.39
1016 0.39
1017 0.4
1018 0.37
1019 0.33
1020 0.31
1021 0.27
1022 0.27
1023 0.24
1024 0.19
1025 0.14
1026 0.09
1027 0.08
1028 0.1
1029 0.11
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.11
1033 0.11
1034 0.11
1035 0.11
1036 0.12
1037 0.11
1038 0.13
1039 0.13
1040 0.12
1041 0.11
1042 0.11
1043 0.12
1044 0.11
1045 0.12
1046 0.1
1047 0.08
1048 0.09
1049 0.09
1050 0.09
1051 0.08
1052 0.06
1053 0.06
1054 0.06
1055 0.05
1056 0.05
1057 0.05
1058 0.05
1059 0.04
1060 0.04
1061 0.04
1062 0.05
1063 0.05
1064 0.05
1065 0.06
1066 0.08
1067 0.09
1068 0.12
1069 0.17
1070 0.25
1071 0.35
1072 0.45
1073 0.56
1074 0.64
1075 0.75
1076 0.84
1077 0.89
1078 0.92
1079 0.93
1080 0.91
1081 0.91
1082 0.91
1083 0.84
1084 0.82
1085 0.75
1086 0.7
1087 0.65
1088 0.57
1089 0.48
1090 0.41
1091 0.37
1092 0.31
1093 0.3
1094 0.27
1095 0.27
1096 0.35
1097 0.36
1098 0.38
1099 0.38
1100 0.36
1101 0.34
1102 0.32
1103 0.3
1104 0.24
1105 0.28
1106 0.26
1107 0.25
1108 0.25
1109 0.24
1110 0.24
1111 0.21
1112 0.18
1113 0.14
1114 0.1
1115 0.1
1116 0.1
1117 0.1
1118 0.09
1119 0.1
1120 0.1
1121 0.13
1122 0.13
1123 0.17
1124 0.19
1125 0.21
1126 0.22
1127 0.26
1128 0.27
1129 0.25
1130 0.27
1131 0.26
1132 0.26
1133 0.24
1134 0.25
1135 0.24
1136 0.26
1137 0.25
1138 0.28
1139 0.28
1140 0.27
1141 0.33
1142 0.31
1143 0.3
1144 0.28
1145 0.31
1146 0.32
1147 0.39
1148 0.45
1149 0.47
1150 0.55
1151 0.57
1152 0.61
1153 0.67
1154 0.69
1155 0.68
1156 0.71
1157 0.75
1158 0.77
1159 0.82
1160 0.85
1161 0.84
1162 0.84
1163 0.78
1164 0.73
1165 0.7
1166 0.66