Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2YYQ9

Protein Details
Accession V2YYQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
405-435PDVILVKKTYPNRRKKNKPRNWKLRSIGKEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-432PNRRKKNKPRNWKLRSIG
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 12.833, nucl 11.5, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG mrr:Moror_6630  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MEFVPAPAVHRVLCADCGTPIVPNSANLCVACLRNTVDVTEGIPKQSSLSYCRNCERFLTPPHAWVIARPESPELLAICLKRLKGLTKVRLTDAHFIWTEPHSKRLRVSVTIQKEVLTNTILEQTFEIEYLVQYGQCPDCAKLAAKNTWKALVQVRQKVSHKRTFLFLEQLILKHNAQKDTISVKEVRDGLDFFYSSRSHAIKMVEFLNGVVPIKSKSSEQLLSADTHSNTANFKYTYSVEITPICKDDLICLPKQLARQLSNICPLVVCTRVGNSLTFVDPATLQHTEVTAPVYWRAPFESLANVMDLVEFTVLDIEPDYNRTKGKHTVADAQVALAGAFRSSSHTKDEDGMDFESTGLTNQIFHTRTHLGSILQPGDTALGYFLTNANFNSDEFASLSSSRIPDVILVKKTYPNRRKKNKPRNWKLRSIGKEAGEEGETGSGRGVVGRMGGRDQKKVEEDYELFLRDLEEDPEMRGAVNLYKTTTDVKMKSEDAGLRRNQYAMDVDDRQAAGEEEEGDEADFPEVQLDELLEGFDEMTLGTDEVAEEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.17
4 0.19
5 0.18
6 0.18
7 0.17
8 0.19
9 0.17
10 0.19
11 0.22
12 0.22
13 0.24
14 0.21
15 0.22
16 0.21
17 0.22
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.22
22 0.23
23 0.21
24 0.2
25 0.19
26 0.2
27 0.25
28 0.23
29 0.21
30 0.21
31 0.2
32 0.2
33 0.23
34 0.24
35 0.23
36 0.32
37 0.37
38 0.43
39 0.51
40 0.53
41 0.51
42 0.52
43 0.5
44 0.48
45 0.47
46 0.5
47 0.43
48 0.44
49 0.44
50 0.43
51 0.39
52 0.34
53 0.35
54 0.33
55 0.32
56 0.3
57 0.3
58 0.27
59 0.28
60 0.28
61 0.21
62 0.17
63 0.19
64 0.18
65 0.2
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.25
70 0.26
71 0.32
72 0.41
73 0.47
74 0.52
75 0.55
76 0.55
77 0.58
78 0.58
79 0.56
80 0.47
81 0.42
82 0.34
83 0.32
84 0.31
85 0.28
86 0.31
87 0.26
88 0.33
89 0.32
90 0.34
91 0.37
92 0.41
93 0.43
94 0.4
95 0.46
96 0.47
97 0.5
98 0.52
99 0.49
100 0.42
101 0.39
102 0.35
103 0.3
104 0.22
105 0.15
106 0.11
107 0.17
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.07
116 0.07
117 0.09
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.1
122 0.1
123 0.12
124 0.14
125 0.13
126 0.14
127 0.16
128 0.17
129 0.19
130 0.25
131 0.3
132 0.35
133 0.38
134 0.38
135 0.39
136 0.38
137 0.36
138 0.37
139 0.38
140 0.4
141 0.44
142 0.46
143 0.5
144 0.55
145 0.62
146 0.63
147 0.63
148 0.59
149 0.53
150 0.54
151 0.51
152 0.48
153 0.44
154 0.36
155 0.32
156 0.29
157 0.28
158 0.26
159 0.24
160 0.22
161 0.21
162 0.24
163 0.22
164 0.21
165 0.21
166 0.22
167 0.24
168 0.25
169 0.23
170 0.22
171 0.21
172 0.24
173 0.25
174 0.23
175 0.2
176 0.19
177 0.17
178 0.17
179 0.16
180 0.12
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.17
185 0.16
186 0.15
187 0.18
188 0.2
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.11
205 0.15
206 0.16
207 0.16
208 0.18
209 0.18
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.16
214 0.16
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.14
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.17
226 0.16
227 0.15
228 0.17
229 0.18
230 0.17
231 0.17
232 0.15
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.16
237 0.19
238 0.18
239 0.18
240 0.19
241 0.21
242 0.22
243 0.24
244 0.21
245 0.2
246 0.24
247 0.26
248 0.27
249 0.29
250 0.28
251 0.24
252 0.2
253 0.18
254 0.16
255 0.14
256 0.12
257 0.08
258 0.08
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.1
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.04
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.12
310 0.13
311 0.17
312 0.23
313 0.27
314 0.29
315 0.3
316 0.37
317 0.37
318 0.39
319 0.35
320 0.28
321 0.25
322 0.2
323 0.17
324 0.09
325 0.07
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.09
330 0.1
331 0.12
332 0.15
333 0.17
334 0.18
335 0.2
336 0.22
337 0.19
338 0.2
339 0.19
340 0.16
341 0.15
342 0.14
343 0.11
344 0.09
345 0.08
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.18
354 0.2
355 0.2
356 0.21
357 0.22
358 0.17
359 0.18
360 0.22
361 0.19
362 0.16
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.12
367 0.1
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.13
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.1
392 0.11
393 0.16
394 0.21
395 0.22
396 0.24
397 0.26
398 0.32
399 0.39
400 0.48
401 0.52
402 0.57
403 0.65
404 0.74
405 0.84
406 0.9
407 0.93
408 0.93
409 0.95
410 0.95
411 0.96
412 0.93
413 0.91
414 0.88
415 0.87
416 0.82
417 0.79
418 0.74
419 0.65
420 0.59
421 0.49
422 0.43
423 0.33
424 0.27
425 0.19
426 0.16
427 0.13
428 0.12
429 0.11
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.05
435 0.08
436 0.09
437 0.1
438 0.14
439 0.22
440 0.24
441 0.29
442 0.31
443 0.33
444 0.36
445 0.38
446 0.36
447 0.35
448 0.34
449 0.33
450 0.34
451 0.3
452 0.27
453 0.24
454 0.22
455 0.17
456 0.17
457 0.14
458 0.13
459 0.12
460 0.14
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.12
465 0.11
466 0.13
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.17
471 0.19
472 0.22
473 0.25
474 0.29
475 0.27
476 0.3
477 0.33
478 0.34
479 0.34
480 0.36
481 0.36
482 0.34
483 0.4
484 0.41
485 0.41
486 0.41
487 0.4
488 0.35
489 0.32
490 0.31
491 0.26
492 0.28
493 0.26
494 0.26
495 0.29
496 0.29
497 0.26
498 0.24
499 0.21
500 0.15
501 0.13
502 0.13
503 0.1
504 0.11
505 0.11
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.09
510 0.08
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.05
525 0.04
526 0.06
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.06