Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XSM3

Protein Details
Accession V2XSM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-62GSSSNSHNKKSSKKRKRKGRNQSNNRSNRQLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-50NKKSSKKRKRKGR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG mrr:Moror_12629  -  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MRQIVSYEDIALPYDVTAKAAEEISKLTTAGSSSNSHNKKSSKKRKRKGRNQSNNRSNRQLASEDEDQDEGDMELSRELTHEEIWDDSALIEAWNAATEEYEAYHGPDKGWKSGPIHKSALWYNVPPAKKAKTSHDVTNIEVDDEETDSRPIDFETFVPSHDPGVFKPQLNGPGADNSTWSTTLPEPPGGMVSQDEAFNRALGAMYWCGYWTAVYHCHKHMDNKGMVDNVGDEEAQDDGPIEDFSEEEIDGVEADSVTELDTLSTQAVPVLGPEIPQGFVSTQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.11
4 0.11
5 0.1
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.14
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.14
19 0.14
20 0.19
21 0.29
22 0.32
23 0.35
24 0.4
25 0.46
26 0.53
27 0.62
28 0.68
29 0.7
30 0.78
31 0.85
32 0.9
33 0.95
34 0.95
35 0.96
36 0.96
37 0.96
38 0.96
39 0.97
40 0.96
41 0.94
42 0.89
43 0.85
44 0.76
45 0.67
46 0.6
47 0.51
48 0.43
49 0.4
50 0.38
51 0.32
52 0.31
53 0.29
54 0.24
55 0.22
56 0.19
57 0.12
58 0.09
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.14
95 0.16
96 0.18
97 0.2
98 0.22
99 0.23
100 0.31
101 0.35
102 0.36
103 0.36
104 0.34
105 0.35
106 0.33
107 0.34
108 0.27
109 0.24
110 0.23
111 0.26
112 0.25
113 0.24
114 0.26
115 0.24
116 0.27
117 0.29
118 0.32
119 0.35
120 0.38
121 0.41
122 0.46
123 0.44
124 0.4
125 0.41
126 0.34
127 0.27
128 0.23
129 0.18
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.1
151 0.17
152 0.19
153 0.18
154 0.19
155 0.21
156 0.24
157 0.24
158 0.25
159 0.18
160 0.2
161 0.2
162 0.19
163 0.17
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.15
171 0.16
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.12
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.1
200 0.18
201 0.21
202 0.25
203 0.27
204 0.31
205 0.34
206 0.4
207 0.44
208 0.44
209 0.44
210 0.43
211 0.44
212 0.4
213 0.37
214 0.3
215 0.24
216 0.17
217 0.14
218 0.11
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.14