Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2YC60

Protein Details
Accession V2YC60    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-253INNHLHKCELEKKKDRKPKDTRVDSPESDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 9.166, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
KEGG mrr:Moror_1212  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MSVPSNFDGTNQQQSQFIPPRWMPSTEHSNPPAVSWTDLYSIYAITAHLTQLQVLDEGPKGIPKFKEPNVFNSKASSVTQFLQDIRNMIQLSHHSLVSDHNKCLYFSTYLGSRAPKEWYNSVELNNKELLNYFGKFMESFKKHFRDSNIVATAQNKLDKMYQTGSAAQYIARFNEWVVHLDLTNASKIHMLYHHLKASIKDAISFVSKSTRPTKFKDYCEFIIGINNHLHKCELEKKKDRKPKDTRVDSPESDPVPPSTSTATPSLSTDSTLPLSTPIEIDAMKSKHHS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.43
3 0.44
4 0.41
5 0.39
6 0.39
7 0.45
8 0.46
9 0.48
10 0.42
11 0.4
12 0.48
13 0.45
14 0.51
15 0.46
16 0.47
17 0.44
18 0.41
19 0.4
20 0.31
21 0.28
22 0.22
23 0.22
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.15
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.11
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.13
47 0.13
48 0.17
49 0.19
50 0.23
51 0.31
52 0.35
53 0.45
54 0.43
55 0.52
56 0.56
57 0.57
58 0.52
59 0.47
60 0.43
61 0.35
62 0.35
63 0.28
64 0.21
65 0.19
66 0.2
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.19
71 0.18
72 0.17
73 0.2
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.16
78 0.22
79 0.22
80 0.2
81 0.16
82 0.16
83 0.22
84 0.28
85 0.3
86 0.24
87 0.26
88 0.27
89 0.27
90 0.28
91 0.25
92 0.18
93 0.15
94 0.17
95 0.15
96 0.16
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.2
102 0.2
103 0.22
104 0.23
105 0.23
106 0.26
107 0.26
108 0.28
109 0.31
110 0.29
111 0.27
112 0.26
113 0.24
114 0.2
115 0.19
116 0.18
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.18
125 0.18
126 0.21
127 0.26
128 0.3
129 0.31
130 0.34
131 0.36
132 0.35
133 0.36
134 0.39
135 0.35
136 0.31
137 0.31
138 0.29
139 0.27
140 0.21
141 0.2
142 0.13
143 0.12
144 0.14
145 0.14
146 0.16
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.15
153 0.14
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.11
170 0.12
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.15
178 0.18
179 0.23
180 0.25
181 0.25
182 0.26
183 0.25
184 0.28
185 0.27
186 0.23
187 0.19
188 0.17
189 0.17
190 0.19
191 0.18
192 0.15
193 0.17
194 0.18
195 0.21
196 0.29
197 0.37
198 0.38
199 0.44
200 0.54
201 0.55
202 0.61
203 0.65
204 0.64
205 0.57
206 0.56
207 0.51
208 0.41
209 0.41
210 0.34
211 0.28
212 0.26
213 0.27
214 0.24
215 0.24
216 0.24
217 0.17
218 0.23
219 0.31
220 0.36
221 0.43
222 0.53
223 0.62
224 0.71
225 0.81
226 0.84
227 0.85
228 0.86
229 0.87
230 0.87
231 0.88
232 0.86
233 0.84
234 0.83
235 0.75
236 0.69
237 0.65
238 0.55
239 0.47
240 0.4
241 0.33
242 0.29
243 0.26
244 0.24
245 0.21
246 0.2
247 0.22
248 0.23
249 0.23
250 0.21
251 0.22
252 0.24
253 0.21
254 0.21
255 0.19
256 0.19
257 0.19
258 0.18
259 0.17
260 0.15
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.15
268 0.2
269 0.21