FuNGI

V2YDP4

Protein Details

Accession

V2YDP4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
201-237	HRIKDCPDSPKKDEKKDEKKREEPKKLSKEERFAKIR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
210-233	PKKDEKKDEKKREEPKKLSKEERF

Subcellular Location(s)

mito 17, mito_nucl 11.833, cyto_mito 10.333, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	mrr:Moror_867 -
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MGARREAKRFLREVLIYVALNPKAFPDDRLKKLFLLSYMTNGPGEFWKNDKTDLLLAFDPEAEKVTWVDFLEDFKTSFEPLDPALKAQLELKDLKMMDRANEYTYQFTYLAKQTGYNDAAQIVAFKQGLPRSLALKIMTRPEEAPTTIKDWMNAAILFDESYKQAQEYGKKEEVAIKQISDIDRKEYMAKGLCFQCGRNGHRIKDCPDSPKKDEKKDEKKREEPKKLSKEERFAKIRALVNEMGEEKDLLLDLMEQEAKLDRNSMHIPLQYKVGTKIIETKVLLDSGAGGRFISTTLTQSLERKWVQLPEKIKVFNVDGTANKTAWITHVVELEFNIAGKGFRENFMISGIGDEEMILGLPWLRYYNPAINWETEEIQFPPQRKIQIKRFRGVLDNNEPEVLIGAKITASQEMAHQQQTKGKAERFPPARTYDHAIDLKLDFVPRNCKLYPLSPTEQIEQDKFLEENLQKGYVRKLKSPMASPFFFVAKKEKGALRPTQDYRELNKGTIKNAYPLPLISELLDKLKGATVFTKLDLRNGYNNVRIKDGDQWKAAFKTNRRLFKPTVMFFGLSNSPATFQAFMNNILSDFIDEGWCVVYMDDILLFSKDQTEHRERTKQLMCRLQTHDLFLKPEKCKFDVTEVVFLGMVIWPGYIAMDPVKLAGIAEWEPLQTVKGVRMFLGFGNFYRKFIGKYMQLTRPLNDLLQKNRKFEWTREYVDKPFIIEANASKWAMGAVLRQKGTDGEWHPCRYLSKSLSPPERNYEIYDRELLAIYRALMEWRHYLMGGKFKVVILSDHKNLTYFRTAQKLNRQQARWSLFLSEFDLGLVHVPGKSITQADALSRRSNEQDKVDTDNEDIVMLPDQLFIKGIDLGMKDDIIERLGLDNFHKSALEQLLEQGMPPIKSALSDWKIEGGLLFFRDRVYVPNDTDLHHRMVQSIHKTPGVGHPGQWNTVEQVQWDFWWLGMAKFVRSFVDGCVICQQSKVNTHPTRTPIQPIHATPNAFPFQVCTMDLITDLPECDGMDSILVVVDHSSTKGVIFIPCTKTTDATKIAELLIQYLYKRFGLPDRIISDRDPRFAAEVFQEMGKQFSIKHSMSTAFHPQTDGETERVNQEIKVYLRAFCSKEQTRWKEYLPLAEFTHNNQTHSVLKKSPFFMMMGYHPHPLPTVFEKTTIPSVEERLQELKRIREETASLLELARQQMIRREKQKLDTFEGGQKVWLEAKNLATGYPSKKLAPKREGPFKILEVLGPVTYRLELLHQWKIHPVFHAALLSPFKQTEAHGPSFTEPPPDLIEGFEEYEVEAVRLVPQPMDLNGGNG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.42
3	0.34
4	0.32
5	0.34
6	0.28
7	0.27
8	0.24
9	0.2
10	0.23
11	0.24
12	0.26
13	0.3
14	0.38
15	0.45
16	0.52
17	0.53
18	0.48
19	0.51
20	0.5
21	0.42
22	0.39
23	0.32
24	0.31
25	0.32
26	0.31
27	0.28
28	0.24
29	0.24
30	0.22
31	0.25
32	0.22
33	0.24
34	0.29
35	0.3
36	0.33
37	0.32
38	0.31
39	0.32
40	0.32
41	0.33
42	0.27
43	0.26
44	0.24
45	0.24
46	0.21
47	0.16
48	0.17
49	0.12
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.14
54	0.14
55	0.16
56	0.14
57	0.16
58	0.18
59	0.18
60	0.18
61	0.17
62	0.18
63	0.16
64	0.16
65	0.15
66	0.15
67	0.15
68	0.21
69	0.2
70	0.2
71	0.23
72	0.23
73	0.22
74	0.24
75	0.26
76	0.24
77	0.25
78	0.25
79	0.28
80	0.27
81	0.28
82	0.29
83	0.28
84	0.26
85	0.31
86	0.31
87	0.28
88	0.33
89	0.33
90	0.31
91	0.31
92	0.31
93	0.25
94	0.24
95	0.26
96	0.25
97	0.27
98	0.24
99	0.26
100	0.25
101	0.32
102	0.33
103	0.29
104	0.25
105	0.22
106	0.22
107	0.19
108	0.18
109	0.11
110	0.13
111	0.12
112	0.11
113	0.16
114	0.18
115	0.21
116	0.23
117	0.24
118	0.23
119	0.25
120	0.28
121	0.25
122	0.28
123	0.29
124	0.34
125	0.35
126	0.34
127	0.33
128	0.33
129	0.35
130	0.32
131	0.31
132	0.26
133	0.27
134	0.3
135	0.3
136	0.27
137	0.25
138	0.25
139	0.25
140	0.22
141	0.19
142	0.14
143	0.14
144	0.14
145	0.13
146	0.12
147	0.1
148	0.12
149	0.12
150	0.11
151	0.15
152	0.19
153	0.27
154	0.3
155	0.37
156	0.39
157	0.39
158	0.4
159	0.44
160	0.43
161	0.41
162	0.39
163	0.31
164	0.29
165	0.32
166	0.34
167	0.32
168	0.29
169	0.27
170	0.27
171	0.28
172	0.29
173	0.27
174	0.29
175	0.31
176	0.3
177	0.32
178	0.33
179	0.37
180	0.35
181	0.34
182	0.37
183	0.38
184	0.42
185	0.46
186	0.5
187	0.51
188	0.58
189	0.63
190	0.6
191	0.61
192	0.61
193	0.61
194	0.64
195	0.66
196	0.64
197	0.7
198	0.73
199	0.74
200	0.8
201	0.81
202	0.82
203	0.86
204	0.9
205	0.89
206	0.91
207	0.91
208	0.92
209	0.92
210	0.91
211	0.9
212	0.9
213	0.89
214	0.89
215	0.86
216	0.85
217	0.82
218	0.82
219	0.76
220	0.66
221	0.62
222	0.59
223	0.57
224	0.49
225	0.46
226	0.38
227	0.34
228	0.35
229	0.31
230	0.25
231	0.2
232	0.18
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.07
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.07
241	0.08
242	0.07
243	0.08
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.14
248	0.12
249	0.17
250	0.19
251	0.21
252	0.23
253	0.25
254	0.27
255	0.26
256	0.3
257	0.26
258	0.26
259	0.25
260	0.25
261	0.22
262	0.21
263	0.29
264	0.26
265	0.3
266	0.28
267	0.28
268	0.26
269	0.26
270	0.24
271	0.15
272	0.15
273	0.12
274	0.12
275	0.1
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.09
283	0.1
284	0.13
285	0.14
286	0.17
287	0.19
288	0.24
289	0.24
290	0.25
291	0.26
292	0.32
293	0.34
294	0.38
295	0.41
296	0.39
297	0.44
298	0.43
299	0.41
300	0.37
301	0.35
302	0.31
303	0.28
304	0.25
305	0.21
306	0.25
307	0.27
308	0.23
309	0.22
310	0.19
311	0.17
312	0.16
313	0.18
314	0.15
315	0.15
316	0.18
317	0.17
318	0.17
319	0.17
320	0.18
321	0.14
322	0.11
323	0.09
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.11
328	0.1
329	0.11
330	0.14
331	0.14
332	0.15
333	0.16
334	0.16
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.08
339	0.07
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.08
352	0.13
353	0.18
354	0.2
355	0.25
356	0.26
357	0.27
358	0.28
359	0.28
360	0.26
361	0.21
362	0.2
363	0.17
364	0.2
365	0.22
366	0.21
367	0.24
368	0.25
369	0.32
370	0.37
371	0.45
372	0.5
373	0.58
374	0.62
375	0.62
376	0.63
377	0.58
378	0.58
379	0.54
380	0.52
381	0.5
382	0.48
383	0.44
384	0.4
385	0.37
386	0.31
387	0.26
388	0.18
389	0.09
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.08
399	0.12
400	0.14
401	0.18
402	0.2
403	0.2
404	0.24
405	0.29
406	0.34
407	0.35
408	0.36
409	0.37
410	0.38
411	0.46
412	0.47
413	0.46
414	0.44
415	0.44
416	0.43
417	0.4
418	0.43
419	0.36
420	0.38
421	0.35
422	0.31
423	0.27
424	0.25
425	0.24
426	0.18
427	0.17
428	0.12
429	0.13
430	0.2
431	0.2
432	0.25
433	0.24
434	0.26
435	0.27
436	0.31
437	0.34
438	0.34
439	0.35
440	0.35
441	0.37
442	0.36
443	0.38
444	0.35
445	0.3
446	0.25
447	0.22
448	0.19
449	0.17
450	0.15
451	0.17
452	0.15
453	0.18
454	0.17
455	0.19
456	0.18
457	0.19
458	0.26
459	0.26
460	0.28
461	0.29
462	0.33
463	0.36
464	0.39
465	0.43
466	0.44
467	0.43
468	0.41
469	0.39
470	0.36
471	0.32
472	0.29
473	0.25
474	0.24
475	0.2
476	0.21
477	0.22
478	0.24
479	0.27
480	0.32
481	0.36
482	0.36
483	0.41
484	0.43
485	0.44
486	0.47
487	0.44
488	0.43
489	0.46
490	0.41
491	0.35
492	0.38
493	0.35
494	0.31
495	0.34
496	0.31
497	0.25
498	0.25
499	0.26
500	0.2
501	0.19
502	0.19
503	0.16
504	0.15
505	0.12
506	0.13
507	0.11
508	0.12
509	0.12
510	0.09
511	0.08
512	0.1
513	0.1
514	0.09
515	0.1
516	0.12
517	0.13
518	0.14
519	0.2
520	0.17
521	0.21
522	0.22
523	0.23
524	0.24
525	0.27
526	0.28
527	0.28
528	0.32
529	0.3
530	0.3
531	0.28
532	0.25
533	0.3
534	0.34
535	0.31
536	0.29
537	0.29
538	0.3
539	0.32
540	0.35
541	0.32
542	0.29
543	0.36
544	0.42
545	0.48
546	0.49
547	0.53
548	0.5
549	0.54
550	0.57
551	0.48
552	0.45
553	0.38
554	0.35
555	0.3
556	0.3
557	0.22
558	0.16
559	0.15
560	0.11
561	0.1
562	0.1
563	0.11
564	0.09
565	0.08
566	0.11
567	0.12
568	0.13
569	0.13
570	0.12
571	0.11
572	0.1
573	0.1
574	0.07
575	0.06
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.03
589	0.03
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.06
594	0.07
595	0.09
596	0.15
597	0.21
598	0.24
599	0.29
600	0.36
601	0.35
602	0.42
603	0.47
604	0.45
605	0.47
606	0.5
607	0.47
608	0.46
609	0.5
610	0.47
611	0.41
612	0.39
613	0.35
614	0.29
615	0.3
616	0.27
617	0.3
618	0.27
619	0.31
620	0.31
621	0.3
622	0.3
623	0.29
624	0.31
625	0.3
626	0.3
627	0.29
628	0.26
629	0.25
630	0.22
631	0.21
632	0.16
633	0.09
634	0.07
635	0.04
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.03
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.05
659	0.05
660	0.07
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.1
665	0.11
666	0.1
667	0.12
668	0.1
669	0.08
670	0.16
671	0.16
672	0.16
673	0.17
674	0.17
675	0.16
676	0.18
677	0.21
678	0.17
679	0.23
680	0.28
681	0.31
682	0.37
683	0.37
684	0.36
685	0.34
686	0.31
687	0.27
688	0.26
689	0.25
690	0.27
691	0.36
692	0.38
693	0.38
694	0.38
695	0.45
696	0.42
697	0.42
698	0.41
699	0.37
700	0.39
701	0.41
702	0.44
703	0.39
704	0.38
705	0.36
706	0.29
707	0.23
708	0.19
709	0.15
710	0.12
711	0.1
712	0.1
713	0.12
714	0.11
715	0.1
716	0.1
717	0.09
718	0.09
719	0.08
720	0.09
721	0.12
722	0.16
723	0.17
724	0.17
725	0.17
726	0.17
727	0.18
728	0.2
729	0.18
730	0.21
731	0.25
732	0.27
733	0.27
734	0.27
735	0.28
736	0.25
737	0.29
738	0.26
739	0.28
740	0.33
741	0.39
742	0.47
743	0.49
744	0.48
745	0.48
746	0.47
747	0.42
748	0.39
749	0.37
750	0.31
751	0.29
752	0.28
753	0.23
754	0.2
755	0.19
756	0.16
757	0.12
758	0.1
759	0.08
760	0.07
761	0.06
762	0.06
763	0.07
764	0.09
765	0.09
766	0.1
767	0.1
768	0.1
769	0.12
770	0.13
771	0.2
772	0.19
773	0.18
774	0.17
775	0.17
776	0.18
777	0.16
778	0.16
779	0.14
780	0.18
781	0.2
782	0.2
783	0.2
784	0.21
785	0.21
786	0.22
787	0.21
788	0.19
789	0.2
790	0.25
791	0.27
792	0.31
793	0.41
794	0.47
795	0.51
796	0.56
797	0.55
798	0.52
799	0.58
800	0.57
801	0.49
802	0.4
803	0.35
804	0.28
805	0.27
806	0.26
807	0.18
808	0.13
809	0.12
810	0.11
811	0.08
812	0.08
813	0.07
814	0.05
815	0.04
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.06
820	0.06
821	0.07
822	0.08
823	0.09
824	0.11
825	0.15
826	0.17
827	0.19
828	0.2
829	0.21
830	0.23
831	0.27
832	0.28
833	0.28
834	0.3
835	0.29
836	0.34
837	0.34
838	0.31
839	0.27
840	0.24
841	0.2
842	0.16
843	0.14
844	0.09
845	0.08
846	0.07
847	0.06
848	0.07
849	0.07
850	0.07
851	0.08
852	0.07
853	0.07
854	0.08
855	0.08
856	0.08
857	0.08
858	0.1
859	0.09
860	0.09
861	0.08
862	0.09
863	0.09
864	0.08
865	0.07
866	0.06
867	0.07
868	0.08
869	0.09
870	0.09
871	0.11
872	0.11
873	0.12
874	0.11
875	0.1
876	0.13
877	0.14
878	0.14
879	0.11
880	0.12
881	0.13
882	0.13
883	0.13
884	0.12
885	0.12
886	0.11
887	0.12
888	0.11
889	0.09
890	0.1
891	0.12
892	0.18
893	0.18
894	0.19
895	0.19
896	0.2
897	0.2
898	0.2
899	0.19
900	0.11
901	0.1
902	0.1
903	0.1
904	0.09
905	0.09
906	0.1
907	0.1
908	0.12
909	0.15
910	0.17
911	0.18
912	0.24
913	0.25
914	0.25
915	0.3
916	0.29
917	0.29
918	0.27
919	0.26
920	0.21
921	0.24
922	0.29
923	0.3
924	0.32
925	0.3
926	0.29
927	0.29
928	0.29
929	0.33
930	0.33
931	0.28
932	0.25
933	0.29
934	0.3
935	0.32
936	0.31
937	0.25
938	0.21
939	0.23
940	0.21
941	0.15
942	0.16
943	0.14
944	0.14
945	0.15
946	0.13
947	0.1
948	0.12
949	0.12
950	0.1
951	0.14
952	0.15
953	0.14
954	0.15
955	0.16
956	0.14
957	0.15
958	0.16
959	0.12
960	0.19
961	0.18
962	0.18
963	0.24
964	0.25
965	0.23
966	0.23
967	0.24
968	0.21
969	0.26
970	0.29
971	0.33
972	0.35
973	0.39
974	0.43
975	0.46
976	0.47
977	0.44
978	0.48
979	0.41
980	0.42
981	0.44
982	0.41
983	0.44
984	0.42
985	0.41
986	0.34
987	0.38
988	0.34
989	0.28
990	0.26
991	0.21
992	0.19
993	0.19
994	0.19
995	0.14
996	0.13
997	0.13
998	0.13
999	0.11
1000	0.1
1001	0.09
1002	0.09
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.07
1007	0.07
1008	0.06
1009	0.05
1010	0.05
1011	0.05
1012	0.05
1013	0.05
1014	0.04
1015	0.04
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.07
1020	0.06
1021	0.06
1022	0.08
1023	0.09
1024	0.1
1025	0.13
1026	0.19
1027	0.24
1028	0.26
1029	0.29
1030	0.28
1031	0.3
1032	0.31
1033	0.33
1034	0.31
1035	0.28
1036	0.27
1037	0.26
1038	0.25
1039	0.24
1040	0.21
1041	0.16
1042	0.13
1043	0.13
1044	0.12
1045	0.13
1046	0.14
1047	0.14
1048	0.14
1049	0.14
1050	0.18
1051	0.25
1052	0.27
1053	0.32
1054	0.34
1055	0.37
1056	0.38
1057	0.39
1058	0.42
1059	0.38
1060	0.37
1061	0.31
1062	0.29
1063	0.28
1064	0.27
1065	0.26
1066	0.19
1067	0.19
1068	0.17
1069	0.16
1070	0.17
1071	0.14
1072	0.15
1073	0.14
1074	0.12
1075	0.11
1076	0.14
1077	0.21
1078	0.2
1079	0.22
1080	0.23
1081	0.26
1082	0.28
1083	0.32
1084	0.37
1085	0.32
1086	0.32
1087	0.31
1088	0.29
1089	0.28
1090	0.31
1091	0.28
1092	0.2
1093	0.2
1094	0.2
1095	0.21
1096	0.23
1097	0.21
1098	0.17
1099	0.16
1100	0.2
1101	0.2
1102	0.26
1103	0.25
1104	0.25
1105	0.29
1106	0.34
1107	0.35
1108	0.33
1109	0.41
1110	0.39
1111	0.47
1112	0.55
1113	0.59
1114	0.59
1115	0.6
1116	0.59
1117	0.58
1118	0.55
1119	0.56
1120	0.49
1121	0.45
1122	0.41
1123	0.42
1124	0.4
1125	0.36
1126	0.44
1127	0.36
1128	0.34
1129	0.31
1130	0.32
1131	0.34
1132	0.38
1133	0.39
1134	0.34
1135	0.37
1136	0.42
1137	0.43
1138	0.43
1139	0.38
1140	0.33
1141	0.3
1142	0.27
1143	0.26
1144	0.28
1145	0.28
1146	0.28
1147	0.26
1148	0.26
1149	0.26
1150	0.23
1151	0.24
1152	0.22
1153	0.27
1154	0.25
1155	0.28
1156	0.28
1157	0.31
1158	0.35
1159	0.31
1160	0.28
1161	0.23
1162	0.27
1163	0.3
1164	0.31
1165	0.31
1166	0.32
1167	0.32
1168	0.37
1169	0.4
1170	0.42
1171	0.44
1172	0.45
1173	0.43
1174	0.4
1175	0.41
1176	0.39
1177	0.38
1178	0.33
1179	0.26
1180	0.24
1181	0.24
1182	0.23
1183	0.23
1184	0.21
1185	0.18
1186	0.18
1187	0.26
1188	0.35
1189	0.42
1190	0.47
1191	0.54
1192	0.57
1193	0.66
1194	0.73
1195	0.71
1196	0.7
1197	0.67
1198	0.63
1199	0.61
1200	0.58
1201	0.49
1202	0.42
1203	0.36
1204	0.3
1205	0.29
1206	0.27
1207	0.24
1208	0.23
1209	0.25
1210	0.27
1211	0.27
1212	0.25
1213	0.23
1214	0.27
1215	0.28
1216	0.31
1217	0.31
1218	0.31
1219	0.38
1220	0.47
1221	0.54
1222	0.58
1223	0.62
1224	0.66
1225	0.75
1226	0.75
1227	0.73
1228	0.69
1229	0.61
1230	0.57
1231	0.48
1232	0.38
1233	0.31
1234	0.28
1235	0.24
1236	0.19
1237	0.18
1238	0.14
1239	0.14
1240	0.13
1241	0.11
1242	0.12
1243	0.17
1244	0.22
1245	0.3
1246	0.31
1247	0.32
1248	0.4
1249	0.42
1250	0.42
1251	0.39
1252	0.37
1253	0.3
1254	0.31
1255	0.32
1256	0.25
1257	0.27
1258	0.29
1259	0.27
1260	0.26
1261	0.24
1262	0.23
1263	0.22
1264	0.23
1265	0.27
1266	0.3
1267	0.34
1268	0.33
1269	0.35
1270	0.36
1271	0.39
1272	0.38
1273	0.34
1274	0.27
1275	0.26
1276	0.28
1277	0.27
1278	0.25
1279	0.21
1280	0.23
1281	0.2
1282	0.21
1283	0.18
1284	0.15
1285	0.13
1286	0.14
1287	0.13
1288	0.11
1289	0.09
1290	0.07
1291	0.11
1292	0.14
1293	0.15
1294	0.14
1295	0.16
1296	0.18
1297	0.18
1298	0.24

V2YDP4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer